MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	AT	3	6	126	131	50 %	50 %	0 %	0 %	339501436
2	NC_015729	GC	3	6	546	551	0 %	0 %	50 %	50 %	339501436
3	NC_015729	GC	3	6	1909	1914	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
4	NC_015729	CG	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
5	NC_015729	CG	4	8	2221	2228	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
6	NC_015729	GC	3	6	2386	2391	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
7	NC_015729	CG	3	6	2584	2589	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
8	NC_015729	GC	3	6	3637	3642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015729	CG	3	6	4898	4903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015729	CG	4	8	4913	4920	0 %	0 %	50 %	50 %	339501440
11	NC_015729	GC	3	6	5309	5314	0 %	0 %	50 %	50 %	339501440
12	NC_015729	GT	3	6	6556	6561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015729	AC	4	8	7754	7761	50 %	0 %	0 %	50 %	339501441
14	NC_015729	GT	3	6	8278	8283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015729	GT	3	6	8344	8349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015729	CG	3	6	8952	8957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015729	CG	3	6	10899	10904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015729	GC	3	6	11829	11834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015729	CA	3	6	12391	12396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015729	CG	3	6	14163	14168	0 %	0 %	50 %	50 %	339501444
21	NC_015729	TC	3	6	15058	15063	0 %	50 %	0 %	50 %	339501445
22	NC_015729	GC	3	6	15300	15305	0 %	0 %	50 %	50 %	339501446
23	NC_015729	CG	4	8	15434	15441	0 %	0 %	50 %	50 %	339501446
24	NC_015729	CG	3	6	16836	16841	0 %	0 %	50 %	50 %	339501447
25	NC_015729	AT	3	6	17765	17770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015729	CT	3	6	17848	17853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015729	TC	3	6	17903	17908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015729	CG	3	6	18101	18106	0 %	0 %	50 %	50 %	339501449
29	NC_015729	GT	3	6	18259	18264	0 %	50 %	50 %	0 %	339501449
30	NC_015729	GC	4	8	19514	19521	0 %	0 %	50 %	50 %	339501450
31	NC_015729	AC	3	6	19659	19664	50 %	0 %	0 %	50 %	339501450
32	NC_015729	TA	3	6	20451	20456	50 %	50 %	0 %	0 %	339501451
33	NC_015729	GC	3	6	20948	20953	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
34	NC_015729	GC	3	6	21258	21263	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
35	NC_015729	CG	3	6	21325	21330	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
36	NC_015729	CG	3	6	21664	21669	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
37	NC_015729	GC	3	6	22282	22287	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
38	NC_015729	CG	3	6	24171	24176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015729	TG	3	6	24936	24941	0 %	50 %	50 %	0 %	339501453
40	NC_015729	CA	3	6	25223	25228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015729	GC	3	6	25952	25957	0 %	0 %	50 %	50 %	339501454
42	NC_015729	GT	3	6	26133	26138	0 %	50 %	50 %	0 %	339501454
43	NC_015729	GT	3	6	26244	26249	0 %	50 %	50 %	0 %	339501454
44	NC_015729	CG	3	6	26466	26471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015729	TC	3	6	26589	26594	0 %	50 %	0 %	50 %	339501455
46	NC_015729	GC	3	6	26940	26945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015729	CG	3	6	29242	29247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015729	CA	3	6	29863	29868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015729	AT	3	6	29964	29969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015729	GC	3	6	30235	30240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015729	CA	3	6	32341	32346	50 %	0 %	0 %	50 %	339501457
52	NC_015729	GC	3	6	32401	32406	0 %	0 %	50 %	50 %	339501457
53	NC_015729	TA	3	6	32748	32753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015729	AG	3	6	33269	33274	50 %	0 %	50 %	0 %	339501458
55	NC_015729	TG	3	6	33479	33484	0 %	50 %	50 %	0 %	339501458
56	NC_015729	TA	3	6	33489	33494	50 %	50 %	0 %	0 %	339501458
57	NC_015729	GC	3	6	33613	33618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015729	AC	3	6	33653	33658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015729	TA	3	6	33824	33829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015729	TA	3	6	33834	33839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015729	CG	3	6	34361	34366	0 %	0 %	50 %	50 %	339501459
62	NC_015729	CG	3	6	35497	35502	0 %	0 %	50 %	50 %	339501459
63	NC_015729	GC	3	6	36155	36160	0 %	0 %	50 %	50 %	339501460
64	NC_015729	GC	3	6	36318	36323	0 %	0 %	50 %	50 %	339501460
65	NC_015729	CG	4	8	36884	36891	0 %	0 %	50 %	50 %	339501460
66	NC_015729	AC	3	6	38403	38408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015729	GA	3	6	38817	38822	50 %	0 %	50 %	0 %	339501462
68	NC_015729	GC	3	6	39028	39033	0 %	0 %	50 %	50 %	339501462
69	NC_015729	GC	3	6	39241	39246	0 %	0 %	50 %	50 %	339501462
70	NC_015729	CG	3	6	40940	40945	0 %	0 %	50 %	50 %	339501464
71	NC_015729	CG	3	6	41386	41391	0 %	0 %	50 %	50 %	339501464
72	NC_015729	CG	3	6	41940	41945	0 %	0 %	50 %	50 %	339501465
73	NC_015729	GC	3	6	42459	42464	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
74	NC_015729	GC	5	10	42507	42516	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
75	NC_015729	CG	3	6	42890	42895	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
76	NC_015729	GC	3	6	43285	43290	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
77	NC_015729	GC	3	6	44217	44222	0 %	0 %	50 %	50 %	339501467
78	NC_015729	CG	3	6	44307	44312	0 %	0 %	50 %	50 %	339501467
79	NC_015729	CT	3	6	44461	44466	0 %	50 %	0 %	50 %	339501467
80	NC_015729	GC	3	6	45097	45102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015729	CG	3	6	45295	45300	0 %	0 %	50 %	50 %	339501468
82	NC_015729	GA	4	8	45605	45612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015729	CG	3	6	45815	45820	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
84	NC_015729	CT	3	6	45867	45872	0 %	50 %	0 %	50 %	339501469
85	NC_015729	CG	3	6	46169	46174	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
86	NC_015729	GC	4	8	46239	46246	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
87	NC_015729	GC	3	6	46943	46948	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
88	NC_015729	GT	3	6	47094	47099	0 %	50 %	50 %	0 %	339501469
89	NC_015729	CA	3	6	47320	47325	50 %	0 %	0 %	50 %	339501469
90	NC_015729	GC	3	6	47500	47505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015729	GA	3	6	47697	47702	50 %	0 %	50 %	0 %	339501470
92	NC_015729	GC	3	6	47993	47998	0 %	0 %	50 %	50 %	339501470
93	NC_015729	CG	3	6	48452	48457	0 %	0 %	50 %	50 %	339501470
94	NC_015729	CG	3	6	48774	48779	0 %	0 %	50 %	50 %	339501470
95	NC_015729	TA	3	6	48999	49004	50 %	50 %	0 %	0 %	339501471
96	NC_015729	GC	3	6	49682	49687	0 %	0 %	50 %	50 %	339501471
97	NC_015729	AT	3	6	49720	49725	50 %	50 %	0 %	0 %	339501471
98	NC_015729	AC	3	6	51958	51963	50 %	0 %	0 %	50 %	339501473
99	NC_015729	AG	3	6	52087	52092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015729	GA	3	6	52281	52286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015729	GC	3	6	52288	52293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015729	CA	3	6	52492	52497	50 %	0 %	0 %	50 %	339501474
103	NC_015729	CG	3	6	52498	52503	0 %	0 %	50 %	50 %	339501474
104	NC_015729	CG	3	6	52988	52993	0 %	0 %	50 %	50 %	339501474
105	NC_015729	CG	3	6	53515	53520	0 %	0 %	50 %	50 %	339501475
106	NC_015729	GC	3	6	54125	54130	0 %	0 %	50 %	50 %	339501475
107	NC_015729	GA	3	6	54138	54143	50 %	0 %	50 %	0 %	339501475
108	NC_015729	TA	3	6	54753	54758	50 %	50 %	0 %	0 %	339501475
109	NC_015729	GC	3	6	55205	55210	0 %	0 %	50 %	50 %	339501476
110	NC_015729	AC	3	6	55492	55497	50 %	0 %	0 %	50 %	339501476
111	NC_015729	CG	3	6	55535	55540	0 %	0 %	50 %	50 %	339501476
112	NC_015729	CA	3	6	56024	56029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015729	CA	3	6	56534	56539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015729	CG	3	6	57127	57132	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
115	NC_015729	GC	3	6	57826	57831	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
116	NC_015729	GC	3	6	58499	58504	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
117	NC_015729	GC	3	6	58779	58784	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
118	NC_015729	CG	4	8	60003	60010	0 %	0 %	50 %	50 %	339501480
119	NC_015729	TC	3	6	62104	62109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015729	GC	3	6	62117	62122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015729	CG	3	6	62313	62318	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482
122	NC_015729	CG	3	6	62427	62432	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482
123	NC_015729	CA	3	6	62494	62499	50 %	0 %	0 %	50 %	339501482
124	NC_015729	GC	3	6	62520	62525	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482
125	NC_015729	GC	3	6	62720	62725	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.