MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	TGATC	2	10	826	835	20 %	40 %	20 %	20 %	339501436
2	NC_015729	GTTGA	2	10	4392	4401	20 %	40 %	40 %	0 %	339501439
3	NC_015729	CGTGC	2	10	5092	5101	0 %	20 %	40 %	40 %	339501440
4	NC_015729	TCCGG	2	10	5473	5482	0 %	20 %	40 %	40 %	339501440
5	NC_015729	ACCGC	2	10	8962	8971	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015729	CTGCC	2	10	11677	11686	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015729	CCGCC	2	10	14081	14090	0 %	0 %	20 %	80 %	339501444
8	NC_015729	TGCAG	2	10	16134	16143	20 %	20 %	40 %	20 %	339501447
9	NC_015729	GCTTG	2	10	17519	17528	0 %	40 %	40 %	20 %	339501448
10	NC_015729	CCCAG	2	10	18036	18045	20 %	0 %	20 %	60 %	339501449
11	NC_015729	GCCAT	2	10	18569	18578	20 %	20 %	20 %	40 %	339501449
12	NC_015729	GAAGA	2	10	18593	18602	60 %	0 %	40 %	0 %	339501449
13	NC_015729	CGCAT	2	10	18626	18635	20 %	20 %	20 %	40 %	339501449
14	NC_015729	CTCAG	2	10	22039	22048	20 %	20 %	20 %	40 %	339501452
15	NC_015729	GTGCG	2	10	22175	22184	0 %	20 %	60 %	20 %	339501452
16	NC_015729	ATGCG	2	10	24093	24102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015729	GATTT	2	10	25574	25583	20 %	60 %	20 %	0 %	339501454
18	NC_015729	CGTCT	2	10	26887	26896	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015729	GCACG	2	10	27160	27169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015729	TGACG	2	10	28595	28604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015729	ACAAA	2	10	28960	28969	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015729	TTTTA	2	10	31504	31513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015729	CATGC	2	10	31840	31849	20 %	20 %	20 %	40 %	339501457
24	NC_015729	GGATA	2	10	32450	32459	40 %	20 %	40 %	0 %	339501457
25	NC_015729	GTGCC	2	10	37844	37853	0 %	20 %	40 %	40 %	339501461
26	NC_015729	CTGCG	2	10	39618	39627	0 %	20 %	40 %	40 %	339501462
27	NC_015729	CATGA	2	10	39742	39751	40 %	20 %	20 %	20 %	339501462
28	NC_015729	CCCCG	2	10	39757	39766	0 %	0 %	20 %	80 %	339501463
29	NC_015729	AGTGG	2	10	41590	41599	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015729	AATGT	2	10	41866	41875	40 %	40 %	20 %	0 %	339501465
31	NC_015729	TGGCT	2	10	46273	46282	0 %	40 %	40 %	20 %	339501469
32	NC_015729	AAGGT	2	10	47811	47820	40 %	20 %	40 %	0 %	339501470
33	NC_015729	GCTGG	2	10	48074	48083	0 %	20 %	60 %	20 %	339501470
34	NC_015729	TCTGG	2	10	49162	49171	0 %	40 %	40 %	20 %	339501471
35	NC_015729	CTTTT	2	10	50130	50139	0 %	80 %	0 %	20 %	339501471
36	NC_015729	GATCA	2	10	50526	50535	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015729	CGACC	2	10	50860	50869	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_015729	GTACG	2	10	51251	51260	20 %	20 %	40 %	20 %	339501473
39	NC_015729	AATGT	2	10	51905	51914	40 %	40 %	20 %	0 %	339501473
40	NC_015729	GATCT	2	10	52915	52924	20 %	40 %	20 %	20 %	339501474
41	NC_015729	CCCTG	2	10	53061	53070	0 %	20 %	20 %	60 %	339501474
42	NC_015729	TTTTG	2	10	54569	54578	0 %	80 %	20 %	0 %	339501475
43	NC_015729	GCCGA	2	10	55720	55729	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015729	TTTTA	2	10	56703	56712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015729	CCCTG	2	10	58151	58160	0 %	20 %	20 %	60 %	339501478
46	NC_015729	CCCTG	2	10	58904	58913	0 %	20 %	20 %	60 %	339501478
47	NC_015729	CGGCG	2	10	58941	58950	0 %	0 %	60 %	40 %	339501478
48	NC_015729	GCCCT	2	10	58962	58971	0 %	20 %	20 %	60 %	339501478
49	NC_015729	GCGCA	2	10	58981	58990	20 %	0 %	40 %	40 %	339501478
50	NC_015729	TTGGC	2	10	61993	62002	0 %	40 %	40 %	20 %	339501481
51	NC_015729	CCCAG	2	10	62165	62174	20 %	0 %	20 %	60 %	339501482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.