MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 1598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015728	ATCC	2	8	52042	52049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_015728	CGA	3	9	52110	52118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015728	ATTGA	2	10	52148	52157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015728	T	6	6	52158	52163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015728	ACGA	2	8	52212	52219	50 %	0 %	25 %	25 %	339501544
1006	NC_015728	AAG	2	6	52317	52322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501544
1007	NC_015728	GCC	2	6	52473	52478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501544
1008	NC_015728	GCT	2	6	52587	52592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501544
1009	NC_015728	GCCC	2	8	52690	52697	0 %	0 %	25 %	75 %	339501544
1010	NC_015728	TCGC	2	8	52715	52722	0 %	25 %	25 %	50 %	339501544
1011	NC_015728	CGCCAA	2	12	52843	52854	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501544
1012	NC_015728	CGCA	2	8	52946	52953	25 %	0 %	25 %	50 %	339501544
1013	NC_015728	CCG	2	6	52990	52995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501544
1014	NC_015728	GTT	2	6	53046	53051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501544
1015	NC_015728	GTC	2	6	53052	53057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501544
1016	NC_015728	CAG	2	6	53088	53093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015728	ATC	2	6	53109	53114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015728	TCGA	2	8	53128	53135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_015728	GCC	2	6	53234	53239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_015728	GCC	2	6	53264	53269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_015728	CACC	2	8	53346	53353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1022	NC_015728	TAC	2	6	53379	53384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501545
1023	NC_015728	GAA	2	6	53439	53444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501545
1024	NC_015728	ATA	2	6	53490	53495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501545
1025	NC_015728	TG	3	6	53531	53536	0 %	50 %	50 %	0 %	339501545
1026	NC_015728	CAGCA	2	10	53541	53550	40 %	0 %	20 %	40 %	339501545
1027	NC_015728	CCT	2	6	53593	53598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501545
1028	NC_015728	GTT	2	6	53637	53642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501545
1029	NC_015728	CTC	2	6	53747	53752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501545
1030	NC_015728	CAGCG	2	10	53871	53880	20 %	0 %	40 %	40 %	339501545
1031	NC_015728	CATGAA	2	12	53901	53912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339501545
1032	NC_015728	C	6	6	53935	53940	0 %	0 %	0 %	100 %	339501545
1033	NC_015728	ATG	2	6	53944	53949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501545
1034	NC_015728	CCT	2	6	53993	53998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501545
1035	NC_015728	AAT	2	6	54067	54072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501545
1036	NC_015728	ATG	2	6	54148	54153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501545
1037	NC_015728	CA	3	6	54170	54175	50 %	0 %	0 %	50 %	339501545
1038	NC_015728	AGG	2	6	54181	54186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501545
1039	NC_015728	ATC	2	6	54319	54324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501545
1040	NC_015728	TGT	2	6	54331	54336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501545
1041	NC_015728	GCG	2	6	54401	54406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501545
1042	NC_015728	CAG	2	6	54467	54472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501545
1043	NC_015728	GTGATA	2	12	54540	54551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501545
1044	NC_015728	CGT	2	6	54581	54586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501545
1045	NC_015728	TGCC	2	8	54673	54680	0 %	25 %	25 %	50 %	339501546
1046	NC_015728	AC	3	6	54701	54706	50 %	0 %	0 %	50 %	339501546
1047	NC_015728	TTG	2	6	54821	54826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501546
1048	NC_015728	TCA	2	6	54840	54845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501546
1049	NC_015728	CTA	2	6	54889	54894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501546
1050	NC_015728	CAC	2	6	54902	54907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501546
1051	NC_015728	CGG	2	6	55006	55011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501546
1052	NC_015728	GTT	2	6	55039	55044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501546
1053	NC_015728	GGC	2	6	55101	55106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501546
1054	NC_015728	GGCT	2	8	55108	55115	0 %	25 %	50 %	25 %	339501546
1055	NC_015728	AAC	2	6	55140	55145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501546
1056	NC_015728	CGAGG	2	10	55220	55229	20 %	0 %	60 %	20 %	339501546
1057	NC_015728	CCT	2	6	55255	55260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501546
1058	NC_015728	TGAGT	2	10	55272	55281	20 %	40 %	40 %	0 %	339501547
1059	NC_015728	ATC	2	6	55349	55354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501547
1060	NC_015728	TCG	2	6	55358	55363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501547
1061	NC_015728	GAT	2	6	55417	55422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501547
1062	NC_015728	TCT	2	6	55449	55454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501547
1063	NC_015728	GAC	2	6	55591	55596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501547
1064	NC_015728	GTC	2	6	55636	55641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501547
1065	NC_015728	TCGT	2	8	55730	55737	0 %	50 %	25 %	25 %	339501547
1066	NC_015728	GTT	2	6	55892	55897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501547
1067	NC_015728	T	7	7	55900	55906	0 %	100 %	0 %	0 %	339501547
1068	NC_015728	AGT	2	6	55967	55972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501547
1069	NC_015728	T	6	6	55972	55977	0 %	100 %	0 %	0 %	339501547
1070	NC_015728	TGGG	2	8	55998	56005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015728	TTTGGT	2	12	56038	56049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
1072	NC_015728	TGT	2	6	56069	56074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
1073	NC_015728	GGA	2	6	56125	56130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501548
1074	NC_015728	GCC	2	6	56202	56207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501548
1075	NC_015728	TCA	2	6	56240	56245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501548
1076	NC_015728	TCT	2	6	56342	56347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501548
1077	NC_015728	TTG	2	6	56362	56367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
1078	NC_015728	CGT	2	6	56387	56392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501548
1079	NC_015728	TGGTG	2	10	56408	56417	0 %	40 %	60 %	0 %	339501548
1080	NC_015728	CGA	2	6	56459	56464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501548
1081	NC_015728	GC	3	6	56473	56478	0 %	0 %	50 %	50 %	339501548
1082	NC_015728	ACC	2	6	56538	56543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501548
1083	NC_015728	GGT	2	6	56588	56593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501548
1084	NC_015728	AACCCG	2	12	56613	56624	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501548
1085	NC_015728	TTG	2	6	56638	56643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
1086	NC_015728	CTG	2	6	56674	56679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501548
1087	NC_015728	ATG	2	6	56713	56718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501548
1088	NC_015728	CAT	2	6	56826	56831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501548
1089	NC_015728	TCATC	2	10	56849	56858	20 %	40 %	0 %	40 %	339501548
1090	NC_015728	AATG	2	8	56910	56917	50 %	25 %	25 %	0 %	339501548
1091	NC_015728	TTG	2	6	57019	57024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
1092	NC_015728	CAA	2	6	57146	57151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501548
1093	NC_015728	GTT	2	6	57171	57176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
1094	NC_015728	GCG	2	6	57245	57250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501548
1095	NC_015728	TG	3	6	57256	57261	0 %	50 %	50 %	0 %	339501548
1096	NC_015728	GGA	2	6	57324	57329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501548
1097	NC_015728	AGT	2	6	57361	57366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501548
1098	NC_015728	ATC	2	6	57384	57389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015728	GCC	3	9	57409	57417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1100	NC_015728	GGC	2	6	57418	57423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501549
1101	NC_015728	CCA	2	6	57446	57451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501549
1102	NC_015728	CCG	2	6	57464	57469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1103	NC_015728	GCT	2	6	57524	57529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1104	NC_015728	GACG	2	8	57552	57559	25 %	0 %	50 %	25 %	339501549
1105	NC_015728	CAA	2	6	57565	57570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501549
1106	NC_015728	AAG	2	6	57604	57609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501549
1107	NC_015728	TCC	2	6	57614	57619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501549
1108	NC_015728	CG	3	6	57628	57633	0 %	0 %	50 %	50 %	339501549
1109	NC_015728	GAG	2	6	57677	57682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501549
1110	NC_015728	CGGAC	2	10	57711	57720	20 %	0 %	40 %	40 %	339501549
1111	NC_015728	GCC	2	6	57749	57754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1112	NC_015728	GGTTTC	2	12	57841	57852	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339501549
1113	NC_015728	TGCC	2	8	58192	58199	0 %	25 %	25 %	50 %	339501549
1114	NC_015728	CTT	2	6	58273	58278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501549
1115	NC_015728	CTG	2	6	58287	58292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1116	NC_015728	GCG	2	6	58301	58306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501549
1117	NC_015728	GCCAGC	2	12	58340	58351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339501549
1118	NC_015728	GCT	2	6	58410	58415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1119	NC_015728	CCGATC	2	12	58490	58501	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501549
1120	NC_015728	CTG	2	6	58537	58542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1121	NC_015728	CCG	2	6	58551	58556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1122	NC_015728	TGT	2	6	58596	58601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501549
1123	NC_015728	CTT	2	6	58665	58670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501549
1124	NC_015728	AGC	2	6	58726	58731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1125	NC_015728	TAG	2	6	58810	58815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501549
1126	NC_015728	TTC	2	6	58875	58880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015728	GGTG	2	8	58908	58915	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015728	GCT	2	6	58981	58986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_015728	CAA	2	6	58997	59002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_015728	A	6	6	59060	59065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015728	GTC	2	6	59106	59111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_015728	CCA	2	6	64993	64998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501557
1252	NC_015728	GTCCG	2	10	65018	65027	0 %	20 %	40 %	40 %	339501557
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1254	NC_015728	CAA	2	6	65101	65106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501557
1255	NC_015728	GAT	2	6	65153	65158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501557
1256	NC_015728	CCGAC	2	10	65176	65185	20 %	0 %	20 %	60 %	339501557
1257	NC_015728	CCCG	2	8	65228	65235	0 %	0 %	25 %	75 %	339501557
1258	NC_015728	CCG	2	6	65239	65244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501557
1259	NC_015728	CATCGA	2	12	65383	65394	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501557
1260	NC_015728	CAC	2	6	65407	65412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501557
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1262	NC_015728	CAG	2	6	65447	65452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501557
1263	NC_015728	GAC	2	6	65519	65524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501557
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1284	NC_015728	GAA	2	6	66532	66537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1373	NC_015728	CA	3	6	71460	71465	50 %	0 %	0 %	50 %	339501563
1374	NC_015728	TGCAT	2	10	71486	71495	20 %	40 %	20 %	20 %	339501563
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1378	NC_015728	ATCA	2	8	71595	71602	50 %	25 %	0 %	25 %	339501563
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