MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 1598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015728	CGC	2	6	25346	25351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501519
502	NC_015728	GGC	2	6	25429	25434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501519
503	NC_015728	CGA	2	6	25474	25479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501519
504	NC_015728	CG	3	6	25607	25612	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
505	NC_015728	CGGCG	2	10	25632	25641	0 %	0 %	60 %	40 %	339501519
506	NC_015728	TTC	2	6	25651	25656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501519
507	NC_015728	TGC	2	6	25744	25749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501519
508	NC_015728	CGAG	2	8	25774	25781	25 %	0 %	50 %	25 %	339501519
509	NC_015728	CGG	2	6	25826	25831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501519
510	NC_015728	CGG	2	6	25918	25923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501519
511	NC_015728	ATC	2	6	26010	26015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501519
512	NC_015728	CGA	2	6	26033	26038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501519
513	NC_015728	CCGG	2	8	26045	26052	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
514	NC_015728	AGC	2	6	26107	26112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501519
515	NC_015728	GC	3	6	26132	26137	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
516	NC_015728	GA	3	6	26206	26211	50 %	0 %	50 %	0 %	339501519
517	NC_015728	CAT	2	6	26243	26248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501519
518	NC_015728	CG	3	6	26267	26272	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
519	NC_015728	CCG	2	6	26274	26279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501519
520	NC_015728	CCG	2	6	26371	26376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501519
521	NC_015728	CAGC	2	8	26470	26477	25 %	0 %	25 %	50 %	339501520
522	NC_015728	ACC	2	6	26520	26525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501520
523	NC_015728	CGC	2	6	26540	26545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501520
524	NC_015728	GAT	2	6	26615	26620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501520
525	NC_015728	CTA	2	6	26645	26650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501520
526	NC_015728	CAAG	2	8	26762	26769	50 %	0 %	25 %	25 %	339501520
527	NC_015728	ACGGC	2	10	26872	26881	20 %	0 %	40 %	40 %	339501520
528	NC_015728	TGC	2	6	26957	26962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015728	CCG	2	6	27019	27024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
530	NC_015728	CGG	2	6	27027	27032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
531	NC_015728	CCA	3	9	27074	27082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501521
532	NC_015728	CGA	3	9	27146	27154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
533	NC_015728	GTC	2	6	27249	27254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
534	NC_015728	TCA	2	6	27257	27262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501521
535	NC_015728	CCG	2	6	27272	27277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
536	NC_015728	CGT	2	6	27347	27352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
537	NC_015728	CCA	2	6	27374	27379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501521
538	NC_015728	TTC	2	6	27399	27404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501521
539	NC_015728	TCG	2	6	27448	27453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
540	NC_015728	CGG	2	6	27464	27469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
541	NC_015728	GC	4	8	27475	27482	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
542	NC_015728	GTC	2	6	27609	27614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
543	NC_015728	CAA	2	6	27623	27628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501521
544	NC_015728	TGC	2	6	27632	27637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
545	NC_015728	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
546	NC_015728	CG	3	6	27817	27822	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
547	NC_015728	GC	4	8	27829	27836	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
548	NC_015728	TCCAG	2	10	27859	27868	20 %	20 %	20 %	40 %	339501521
549	NC_015728	TCA	2	6	27878	27883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501521
550	NC_015728	CCG	2	6	27917	27922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
551	NC_015728	GTC	2	6	27976	27981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
552	NC_015728	GCC	2	6	28005	28010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
553	NC_015728	CGA	2	6	28052	28057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
554	NC_015728	CAG	2	6	28104	28109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
555	NC_015728	AAT	2	6	28130	28135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501521
556	NC_015728	C	7	7	28142	28148	0 %	0 %	0 %	100 %	339501521
557	NC_015728	GCG	2	6	28157	28162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
558	NC_015728	GCA	2	6	28163	28168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
559	NC_015728	CCAC	2	8	28226	28233	25 %	0 %	0 %	75 %	339501521
560	NC_015728	GC	3	6	28244	28249	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
561	NC_015728	GAT	2	6	28278	28283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501521
562	NC_015728	GGC	2	6	28305	28310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
563	NC_015728	GC	3	6	28318	28323	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
564	NC_015728	TCG	2	6	28366	28371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
565	NC_015728	CT	3	6	28396	28401	0 %	50 %	0 %	50 %	339501521
566	NC_015728	CGC	2	6	28469	28474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
567	NC_015728	TCA	2	6	28537	28542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501521
568	NC_015728	CGG	2	6	28560	28565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
569	NC_015728	AGCGAG	2	12	28630	28641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339501521
570	NC_015728	AAG	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501521
571	NC_015728	GCC	2	6	28660	28665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
572	NC_015728	CGA	2	6	28703	28708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
573	NC_015728	CAG	2	6	28713	28718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
574	NC_015728	GCC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
575	NC_015728	GAC	2	6	28747	28752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
576	NC_015728	C	8	8	28862	28869	0 %	0 %	0 %	100 %	339501521
577	NC_015728	GAT	2	6	28881	28886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501521
578	NC_015728	GCC	2	6	28914	28919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
579	NC_015728	ACG	2	6	28955	28960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
580	NC_015728	CACG	2	8	28990	28997	25 %	0 %	25 %	50 %	339501521
581	NC_015728	CCG	2	6	29113	29118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
582	NC_015728	CGA	2	6	29129	29134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
583	NC_015728	GCG	2	6	29204	29209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501521
584	NC_015728	GCC	2	6	29238	29243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
585	NC_015728	GCA	2	6	29247	29252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501521
586	NC_015728	GA	3	6	29294	29299	50 %	0 %	50 %	0 %	339501521
587	NC_015728	CGT	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501521
588	NC_015728	GCC	2	6	29326	29331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501521
589	NC_015728	TC	3	6	29338	29343	0 %	50 %	0 %	50 %	339501522
590	NC_015728	TG	3	6	29493	29498	0 %	50 %	50 %	0 %	339501522
591	NC_015728	ACG	2	6	29577	29582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501522
592	NC_015728	AGA	2	6	29678	29683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501522
593	NC_015728	GC	3	6	29745	29750	0 %	0 %	50 %	50 %	339501522
594	NC_015728	AAG	2	6	29773	29778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501522
595	NC_015728	ACC	2	6	29905	29910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501523
596	NC_015728	CAA	2	6	29964	29969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501523
597	NC_015728	GCC	2	6	30169	30174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501523
598	NC_015728	GC	3	6	30196	30201	0 %	0 %	50 %	50 %	339501523
599	NC_015728	GGC	2	6	30337	30342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501523
600	NC_015728	TGAAA	2	10	30418	30427	60 %	20 %	20 %	0 %	339501523
601	NC_015728	CGT	2	6	30431	30436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501523
602	NC_015728	GTG	2	6	30504	30509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015728	TGA	2	6	30583	30588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015728	TGAA	2	8	30687	30694	50 %	25 %	25 %	0 %	339501524
605	NC_015728	GCG	2	6	30704	30709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501524
606	NC_015728	TCG	2	6	30791	30796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501524
607	NC_015728	GAT	2	6	30821	30826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501524
608	NC_015728	CCA	2	6	30901	30906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501524
609	NC_015728	CTG	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501524
610	NC_015728	ACCA	2	8	30997	31004	50 %	0 %	0 %	50 %	339501524
611	NC_015728	GAG	2	6	31006	31011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501524
612	NC_015728	AAG	2	6	31094	31099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501524
613	NC_015728	CAGC	2	8	31101	31108	25 %	0 %	25 %	50 %	339501524
614	NC_015728	CCG	2	6	31124	31129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501524
615	NC_015728	GTT	2	6	31146	31151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501524
616	NC_015728	CTTTC	2	10	31171	31180	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
617	NC_015728	CGG	2	6	31195	31200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015728	CGC	2	6	31229	31234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_015728	CAT	2	6	31359	31364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501525
620	NC_015728	CGG	2	6	31505	31510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501525
621	NC_015728	CAGT	2	8	31595	31602	25 %	25 %	25 %	25 %	339501525
622	NC_015728	ATT	2	6	31643	31648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501526
623	NC_015728	GGCA	2	8	31650	31657	25 %	0 %	50 %	25 %	339501526
624	NC_015728	TGC	2	6	31659	31664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501526
625	NC_015728	GCT	2	6	31673	31678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501526
626	NC_015728	GGAA	2	8	31743	31750	50 %	0 %	50 %	0 %	339501526
627	NC_015728	CAG	2	6	31764	31769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501526
628	NC_015728	CCG	2	6	31786	31791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501526
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880	NC_015728	CGG	2	6	46314	46319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
881	NC_015728	CCGCA	2	10	46335	46344	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
882	NC_015728	CGA	2	6	46472	46477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
883	NC_015728	CCG	2	6	46576	46581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501536
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