MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	TAC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015705	GCC	2	6	203	208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015705	AAT	2	6	350	355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
4	NC_015705	ATA	2	6	393	398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
5	NC_015705	CAA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215038
6	NC_015705	TAA	2	6	760	765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
7	NC_015705	ACC	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215038
8	NC_015705	ATA	2	6	1158	1163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
9	NC_015705	TCA	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215038
10	NC_015705	TCA	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215038
11	NC_015705	AAT	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
12	NC_015705	GCA	2	6	1567	1572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015705	AAG	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015705	GCC	2	6	1893	1898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015705	CGC	2	6	1969	1974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015705	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015705	AAT	2	6	2103	2108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215039
18	NC_015705	CAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215039
19	NC_015705	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215039
20	NC_015705	GTG	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215039
21	NC_015705	GCG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215039
22	NC_015705	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215039
23	NC_015705	TTC	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215039
24	NC_015705	GCC	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215039
25	NC_015705	GCA	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215039
26	NC_015705	TTG	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215040
27	NC_015705	TGA	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215040
28	NC_015705	CAG	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215040
29	NC_015705	TGA	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215040
30	NC_015705	ACG	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215040
31	NC_015705	ACC	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215040
32	NC_015705	TGC	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215040
33	NC_015705	CCA	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215040
34	NC_015705	GCA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215041
35	NC_015705	TGG	2	6	3601	3606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215041
36	NC_015705	TGG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215041
37	NC_015705	CAC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215041
38	NC_015705	CCG	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215041
39	NC_015705	TTC	2	6	3975	3980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015705	ATC	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015705	GCG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015705	CTG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015705	GGC	2	6	4334	4339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015705	GTT	2	6	4390	4395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015705	GCT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015705	TAC	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015705	CTG	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015705	TCT	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015705	TGA	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015705	GCT	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015705	ATT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015705	TAG	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015705	ACA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015705	TAT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015705	AGG	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215042
56	NC_015705	TGA	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215042
57	NC_015705	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215042
58	NC_015705	CCG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215042
59	NC_015705	CCA	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215042
60	NC_015705	GCC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215042
61	NC_015705	GAT	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215042
62	NC_015705	CGG	2	6	5638	5643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215042
63	NC_015705	GAT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215042
64	NC_015705	GGC	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215043
65	NC_015705	GAA	2	6	6020	6025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215043
66	NC_015705	TAC	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015705	TAC	2	6	6216	6221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015705	TGT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015705	AAT	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015705	TAT	2	6	6403	6408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015705	TAC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015705	TAC	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015705	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015705	TAC	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015705	TAC	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015705	TAT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015705	TAC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015705	TAC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015705	AGA	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215044
80	NC_015705	GAA	2	6	6890	6895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215044
81	NC_015705	GGA	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215044
82	NC_015705	TTG	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215044
83	NC_015705	TGA	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215044
84	NC_015705	GAA	2	6	7379	7384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215044
85	NC_015705	GGT	2	6	7402	7407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215044
86	NC_015705	GCA	2	6	7546	7551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215044
87	NC_015705	ATG	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215044
88	NC_015705	GAT	2	6	7660	7665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215044
89	NC_015705	GCA	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215044
90	NC_015705	ACA	2	6	7735	7740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215044
91	NC_015705	TAG	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215044
92	NC_015705	GAT	2	6	7907	7912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215044
93	NC_015705	GGT	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215044
94	NC_015705	AAC	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015705	ACC	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015705	CCA	2	6	8243	8248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015705	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015705	CTT	2	6	8292	8297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015705	CAT	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015705	TAG	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015705	CCG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015705	ATG	2	6	8420	8425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015705	GCC	3	9	8485	8493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015705	TGA	3	9	8507	8515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015705	ATA	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015705	GCT	2	6	8656	8661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215045
107	NC_015705	CGG	2	6	8718	8723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215045
108	NC_015705	CGC	2	6	8908	8913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215045
109	NC_015705	CTT	2	6	8945	8950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215045
110	NC_015705	CCT	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215045
111	NC_015705	TTG	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215045
112	NC_015705	CCG	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215046
113	NC_015705	CTT	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215046
114	NC_015705	CAC	2	6	9373	9378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215046
115	NC_015705	GAT	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215046
116	NC_015705	ACC	2	6	9494	9499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215046
117	NC_015705	AAT	2	6	9647	9652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215047
118	NC_015705	TCA	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215047
119	NC_015705	AGC	2	6	9705	9710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215047
120	NC_015705	CCA	2	6	9801	9806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215047
121	NC_015705	CGA	2	6	9841	9846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215047
122	NC_015705	TCC	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215047
123	NC_015705	GGC	2	6	10075	10080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215047
124	NC_015705	TTG	2	6	10118	10123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215047
125	NC_015705	CGA	2	6	10190	10195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215047
126	NC_015705	TAA	2	6	10231	10236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215048
127	NC_015705	TTG	2	6	10276	10281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215048
128	NC_015705	ATT	2	6	10296	10301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215048
129	NC_015705	CCA	2	6	10741	10746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215048
130	NC_015705	GCC	2	6	10797	10802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215048
131	NC_015705	TTC	2	6	11220	11225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215048
132	NC_015705	GGA	2	6	11328	11333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215048
133	NC_015705	ATA	2	6	11430	11435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215048
134	NC_015705	TCA	2	6	11627	11632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215048
135	NC_015705	TGC	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015705	CAA	2	6	11766	11771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215049
137	NC_015705	TCA	2	6	11849	11854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215049
138	NC_015705	AAG	2	6	11973	11978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215049
139	NC_015705	CCG	2	6	12070	12075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215049
140	NC_015705	TGG	2	6	12167	12172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215049
141	NC_015705	GCG	2	6	12242	12247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215049
142	NC_015705	CAC	2	6	12273	12278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215049
143	NC_015705	ATC	2	6	12313	12318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215049
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145	NC_015705	TTC	2	6	12414	12419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215049
146	NC_015705	GCC	2	6	12524	12529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215049
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157	NC_015705	TGC	2	6	13919	13924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215051
158	NC_015705	GGC	2	6	14038	14043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215051
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160	NC_015705	GGA	2	6	14183	14188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215051
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167	NC_015705	CTT	2	6	14758	14763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215051
168	NC_015705	TCC	2	6	14777	14782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215051
169	NC_015705	CAG	2	6	14851	14856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215051
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176	NC_015705	GAT	2	6	15820	15825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215054
177	NC_015705	TTA	2	6	15980	15985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015705	CAA	2	6	16009	16014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_015705	ACT	2	6	16016	16021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215055
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232	NC_015705	ATT	2	6	20735	20740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215060
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249	NC_015705	GTA	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015705	TTA	2	6	21750	21755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_015705	CAA	2	6	21873	21878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_015705	ATC	2	6	21879	21884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_015705	GAA	2	6	21925	21930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_015705	TCC	2	6	21946	21951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_015705	CGA	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_015705	ATA	2	6	22071	22076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015705	ATG	2	6	22411	22416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015705	ATT	2	6	22774	22779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015705	TAA	2	6	22889	22894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215061
260	NC_015705	TAT	2	6	23008	23013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215061
261	NC_015705	AAT	2	6	23553	23558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215062
262	NC_015705	CAA	2	6	23679	23684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215062
263	NC_015705	GCA	2	6	23744	23749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215062
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265	NC_015705	AAT	2	6	23887	23892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215062
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267	NC_015705	TTA	2	6	24032	24037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215062
268	NC_015705	TGA	2	6	24060	24065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215062
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270	NC_015705	AGT	2	6	24217	24222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015705	TTC	2	6	44603	44608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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