MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015705	A	6	6	26048	26053	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
502	NC_015705	A	7	7	26131	26137	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
503	NC_015705	GCA	2	6	26172	26177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215063
504	NC_015705	TCT	2	6	26285	26290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215063
505	NC_015705	TGG	2	6	26292	26297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215063
506	NC_015705	TAA	2	6	26301	26306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215063
507	NC_015705	CAAT	2	8	26342	26349	50 %	25 %	0 %	25 %	338215063
508	NC_015705	TTC	2	6	26386	26391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215063
509	NC_015705	GGC	2	6	26464	26469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215063
510	NC_015705	TTTC	2	8	26487	26494	0 %	75 %	0 %	25 %	338215063
511	NC_015705	TTC	2	6	26518	26523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215063
512	NC_015705	TCA	2	6	26592	26597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215063
513	NC_015705	TC	3	6	26789	26794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_015705	GGC	2	6	26804	26809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015705	CCT	2	6	26812	26817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015705	TTC	2	6	26824	26829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015705	A	7	7	26847	26853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015705	TCT	2	6	26885	26890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215064
519	NC_015705	TTTG	2	8	26892	26899	0 %	75 %	25 %	0 %	338215064
520	NC_015705	AAC	2	6	26946	26951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215064
521	NC_015705	CCA	2	6	26992	26997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215064
522	NC_015705	CAGCCC	2	12	27029	27040	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338215064
523	NC_015705	CAT	2	6	27216	27221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215064
524	NC_015705	AAAC	2	8	27240	27247	75 %	0 %	0 %	25 %	338215064
525	NC_015705	AAT	2	6	27277	27282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215064
526	NC_015705	ACA	2	6	27311	27316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215064
527	NC_015705	CAA	2	6	27317	27322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215064
528	NC_015705	GATA	2	8	27326	27333	50 %	25 %	25 %	0 %	338215064
529	NC_015705	ATG	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215064
530	NC_015705	CGCC	2	8	27434	27441	0 %	0 %	25 %	75 %	338215064
531	NC_015705	T	6	6	27562	27567	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
532	NC_015705	TTCGT	2	10	27672	27681	0 %	60 %	20 %	20 %	338215064
533	NC_015705	TCA	2	6	27718	27723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215064
534	NC_015705	CTTTG	2	10	27738	27747	0 %	60 %	20 %	20 %	338215064
535	NC_015705	GATA	2	8	27861	27868	50 %	25 %	25 %	0 %	338215064
536	NC_015705	T	6	6	27905	27910	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
537	NC_015705	TAC	2	6	27921	27926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215064
538	NC_015705	A	6	6	27956	27961	100 %	0 %	0 %	0 %	338215064
539	NC_015705	AAG	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215064
540	NC_015705	CTGA	2	8	28124	28131	25 %	25 %	25 %	25 %	338215064
541	NC_015705	TTG	2	6	28132	28137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215064
542	NC_015705	ATTA	2	8	28149	28156	50 %	50 %	0 %	0 %	338215064
543	NC_015705	GCC	2	6	28167	28172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215064
544	NC_015705	A	6	6	28213	28218	100 %	0 %	0 %	0 %	338215064
545	NC_015705	TCC	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215064
546	NC_015705	CTTG	2	8	28226	28233	0 %	50 %	25 %	25 %	338215064
547	NC_015705	GTT	2	6	28242	28247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215064
548	NC_015705	TGA	3	9	28283	28291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215064
549	NC_015705	CGAA	2	8	28467	28474	50 %	0 %	25 %	25 %	338215064
550	NC_015705	T	6	6	28495	28500	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
551	NC_015705	ACC	2	6	28585	28590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215064
552	NC_015705	GCA	2	6	28597	28602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215064
553	NC_015705	TAA	2	6	28635	28640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215064
554	NC_015705	TAC	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215064
555	NC_015705	CAA	2	6	28667	28672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215064
556	NC_015705	GGC	2	6	28719	28724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215064
557	NC_015705	CAC	2	6	28773	28778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215064
558	NC_015705	ATC	2	6	28785	28790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215064
559	NC_015705	TCA	2	6	28829	28834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215064
560	NC_015705	ATA	2	6	28864	28869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215064
561	NC_015705	CCA	2	6	28898	28903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215064
562	NC_015705	CAAC	2	8	28955	28962	50 %	0 %	0 %	50 %	338215064
563	NC_015705	CCA	2	6	29033	29038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215064
564	NC_015705	TCTT	2	8	29191	29198	0 %	75 %	0 %	25 %	338215064
565	NC_015705	ATCA	2	8	29202	29209	50 %	25 %	0 %	25 %	338215064
566	NC_015705	GCC	2	6	29238	29243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215064
567	NC_015705	TTG	2	6	29368	29373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215064
568	NC_015705	TTGA	2	8	29379	29386	25 %	50 %	25 %	0 %	338215064
569	NC_015705	TTC	2	6	29451	29456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215064
570	NC_015705	TAA	2	6	29463	29468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215064
571	NC_015705	AAT	2	6	29508	29513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215064
572	NC_015705	TGAA	2	8	29591	29598	50 %	25 %	25 %	0 %	338215064
573	NC_015705	CGT	2	6	29624	29629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215064
574	NC_015705	AGA	2	6	29739	29744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215064
575	NC_015705	TCT	2	6	29785	29790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215064
576	NC_015705	T	8	8	29792	29799	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
577	NC_015705	TCC	2	6	29916	29921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215064
578	NC_015705	TTTA	2	8	29997	30004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015705	TAT	2	6	30011	30016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215065
580	NC_015705	TGC	2	6	30026	30031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215065
581	NC_015705	CCA	2	6	30072	30077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215065
582	NC_015705	TCT	2	6	30116	30121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215065
583	NC_015705	TGTC	2	8	30141	30148	0 %	50 %	25 %	25 %	338215065
584	NC_015705	TCCC	2	8	30273	30280	0 %	25 %	0 %	75 %	338215065
585	NC_015705	A	6	6	30323	30328	100 %	0 %	0 %	0 %	338215065
586	NC_015705	ATC	2	6	30337	30342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215065
587	NC_015705	CGA	2	6	30475	30480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215065
588	NC_015705	TA	3	6	30550	30555	50 %	50 %	0 %	0 %	338215065
589	NC_015705	T	6	6	30595	30600	0 %	100 %	0 %	0 %	338215065
590	NC_015705	CCG	2	6	30709	30714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215065
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592	NC_015705	TCG	2	6	30761	30766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215065
593	NC_015705	CAAT	2	8	30780	30787	50 %	25 %	0 %	25 %	338215065
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596	NC_015705	CTT	2	6	30864	30869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215065
597	NC_015705	ATC	2	6	30911	30916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215065
598	NC_015705	GCT	2	6	30979	30984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215065
599	NC_015705	TTC	2	6	30988	30993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215065
600	NC_015705	TGA	2	6	31096	31101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215066
601	NC_015705	TTA	2	6	31147	31152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215066
602	NC_015705	AAT	2	6	31202	31207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215066
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604	NC_015705	AAT	2	6	31366	31371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215066
605	NC_015705	GTTTTG	2	12	31379	31390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215066
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607	NC_015705	TAA	2	6	31412	31417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215066
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609	NC_015705	TGT	2	6	31495	31500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215066
610	NC_015705	A	6	6	31509	31514	100 %	0 %	0 %	0 %	338215066
611	NC_015705	GTTGCA	2	12	31597	31608	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338215066
612	NC_015705	GTTT	2	8	31620	31627	0 %	75 %	25 %	0 %	338215066
613	NC_015705	ACT	2	6	31640	31645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215066
614	NC_015705	GAA	2	6	31662	31667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215066
615	NC_015705	AAAAC	2	10	31725	31734	80 %	0 %	0 %	20 %	338215066
616	NC_015705	AT	3	6	31749	31754	50 %	50 %	0 %	0 %	338215066
617	NC_015705	AGA	2	6	31761	31766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215066
618	NC_015705	TTGA	2	8	31868	31875	25 %	50 %	25 %	0 %	338215066
619	NC_015705	CTGC	2	8	31936	31943	0 %	25 %	25 %	50 %	338215066
620	NC_015705	CAT	2	6	31981	31986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215066
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622	NC_015705	C	7	7	32159	32165	0 %	0 %	0 %	100 %	338215066
623	NC_015705	GTA	2	6	32204	32209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215066
624	NC_015705	GTT	2	6	32315	32320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215066
625	NC_015705	CTG	2	6	32404	32409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215066
626	NC_015705	GTA	2	6	32433	32438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215066
627	NC_015705	T	7	7	32443	32449	0 %	100 %	0 %	0 %	338215066
628	NC_015705	T	6	6	32464	32469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015705	TGT	2	6	32589	32594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215067
630	NC_015705	CAT	2	6	32620	32625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215067
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741	NC_015705	T	7	7	37245	37251	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
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757	NC_015705	TAAAA	2	10	38025	38034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
758	NC_015705	ATT	2	6	38039	38044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215075
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