MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 1838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015704	TGC	2	6	26234	26239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215111
502	NC_015704	T	6	6	26244	26249	0 %	100 %	0 %	0 %	338215111
503	NC_015704	CTA	2	6	26276	26281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215111
504	NC_015704	TTC	2	6	26340	26345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215111
505	NC_015704	TTC	2	6	26364	26369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215111
506	NC_015704	CAT	2	6	26457	26462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215111
507	NC_015704	TCG	2	6	26707	26712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215111
508	NC_015704	TAC	2	6	26780	26785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215111
509	NC_015704	T	6	6	26792	26797	0 %	100 %	0 %	0 %	338215111
510	NC_015704	T	6	6	26935	26940	0 %	100 %	0 %	0 %	338215111
511	NC_015704	GTTT	2	8	26972	26979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015704	AAT	2	6	27024	27029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015704	TTAT	2	8	27040	27047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015704	T	7	7	27053	27059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015704	ATTC	2	8	27100	27107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_015704	AATA	2	8	27117	27124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015704	T	8	8	27126	27133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015704	AAC	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015704	A	6	6	27183	27188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015704	TTTTC	2	10	27218	27227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
521	NC_015704	A	7	7	27261	27267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015704	T	6	6	27271	27276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015704	T	6	6	27283	27288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015704	TA	4	8	27311	27318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015704	T	6	6	27320	27325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015704	TAA	2	6	27376	27381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015704	ATTC	2	8	27514	27521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_015704	TG	3	6	27523	27528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015704	AAT	2	6	27537	27542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015704	GAT	2	6	27564	27569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015704	TGT	2	6	27573	27578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015704	A	6	6	27635	27640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015704	AAT	2	6	27675	27680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015704	TCA	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015704	AAT	2	6	27700	27705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015704	AT	3	6	27726	27731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015704	T	7	7	27772	27778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015704	CTGA	2	8	27802	27809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_015704	AGA	2	6	27823	27828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215112
540	NC_015704	AAT	2	6	27858	27863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215112
541	NC_015704	A	6	6	27930	27935	100 %	0 %	0 %	0 %	338215112
542	NC_015704	TA	3	6	27952	27957	50 %	50 %	0 %	0 %	338215112
543	NC_015704	ACC	2	6	28077	28082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215112
544	NC_015704	TTGA	2	8	28104	28111	25 %	50 %	25 %	0 %	338215112
545	NC_015704	CAT	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215112
546	NC_015704	ATT	2	6	28179	28184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215112
547	NC_015704	GCAAA	2	10	28245	28254	60 %	0 %	20 %	20 %	338215112
548	NC_015704	ACT	2	6	28317	28322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215112
549	NC_015704	T	7	7	28343	28349	0 %	100 %	0 %	0 %	338215112
550	NC_015704	AGT	2	6	28350	28355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215112
551	NC_015704	GAA	2	6	28358	28363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215112
552	NC_015704	GTC	2	6	28369	28374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215112
553	NC_015704	AAG	2	6	28452	28457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215112
554	NC_015704	TTG	2	6	28521	28526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215112
555	NC_015704	AAC	2	6	28530	28535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215112
556	NC_015704	A	6	6	28545	28550	100 %	0 %	0 %	0 %	338215112
557	NC_015704	AGA	2	6	28588	28593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215112
558	NC_015704	GAA	2	6	28608	28613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215112
559	NC_015704	TGA	2	6	28712	28717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215112
560	NC_015704	TAA	2	6	28748	28753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215112
561	NC_015704	GAT	2	6	28835	28840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215112
562	NC_015704	CT	3	6	28890	28895	0 %	50 %	0 %	50 %	338215112
563	NC_015704	TCGC	2	8	28901	28908	0 %	25 %	25 %	50 %	338215112
564	NC_015704	AAC	2	6	28936	28941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215112
565	NC_015704	T	6	6	29007	29012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015704	CACC	2	8	29054	29061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
567	NC_015704	ATA	2	6	29106	29111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215113
568	NC_015704	A	6	6	29121	29126	100 %	0 %	0 %	0 %	338215113
569	NC_015704	GCC	2	6	29163	29168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215113
570	NC_015704	AAG	2	6	29203	29208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215113
571	NC_015704	ACA	2	6	29274	29279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215113
572	NC_015704	TGATT	2	10	29318	29327	20 %	60 %	20 %	0 %	338215113
573	NC_015704	AG	3	6	29395	29400	50 %	0 %	50 %	0 %	338215113
574	NC_015704	TCT	2	6	29401	29406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215113
575	NC_015704	T	6	6	29448	29453	0 %	100 %	0 %	0 %	338215113
576	NC_015704	TGC	3	9	29482	29490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215113
577	NC_015704	GCG	2	6	29685	29690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215113
578	NC_015704	GAA	2	6	29730	29735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215113
579	NC_015704	AGCCAA	2	12	29738	29749	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338215113
580	NC_015704	CCT	2	6	29752	29757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215113
581	NC_015704	A	6	6	29965	29970	100 %	0 %	0 %	0 %	338215113
582	NC_015704	GTAG	2	8	30039	30046	25 %	25 %	50 %	0 %	338215113
583	NC_015704	GTG	2	6	30150	30155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215113
584	NC_015704	TGCC	2	8	30254	30261	0 %	25 %	25 %	50 %	338215113
585	NC_015704	TGG	2	6	30298	30303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215113
586	NC_015704	GTAA	2	8	30426	30433	50 %	25 %	25 %	0 %	338215113
587	NC_015704	AG	3	6	30485	30490	50 %	0 %	50 %	0 %	338215113
588	NC_015704	TGT	2	6	30518	30523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215113
589	NC_015704	ACA	2	6	30563	30568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215113
590	NC_015704	TAC	2	6	30621	30626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215113
591	NC_015704	ATGA	2	8	30645	30652	50 %	25 %	25 %	0 %	338215113
592	NC_015704	TAT	2	6	30680	30685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215113
593	NC_015704	CAG	2	6	30808	30813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215113
594	NC_015704	AGC	2	6	30920	30925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215113
595	NC_015704	ACA	3	9	30941	30949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215113
596	NC_015704	TAG	2	6	30958	30963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215113
597	NC_015704	TCA	2	6	31139	31144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215113
598	NC_015704	GCA	2	6	31191	31196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215113
599	NC_015704	A	6	6	31305	31310	100 %	0 %	0 %	0 %	338215113
600	NC_015704	AATC	2	8	31326	31333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_015704	GAA	2	6	31419	31424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215114
602	NC_015704	GAA	2	6	31482	31487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215114
603	NC_015704	GGT	2	6	31514	31519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215114
604	NC_015704	GACT	2	8	31565	31572	25 %	25 %	25 %	25 %	338215115
605	NC_015704	GTT	2	6	31677	31682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215115
606	NC_015704	AAT	2	6	31715	31720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215115
607	NC_015704	AG	3	6	31730	31735	50 %	0 %	50 %	0 %	338215115
608	NC_015704	ATA	2	6	31744	31749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215115
609	NC_015704	ATA	2	6	31762	31767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215115
610	NC_015704	GCTTGG	2	12	31921	31932	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338215115
611	NC_015704	AATTC	2	10	31963	31972	40 %	40 %	0 %	20 %	338215115
612	NC_015704	ACC	2	6	31990	31995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215115
613	NC_015704	TTTCG	2	10	32049	32058	0 %	60 %	20 %	20 %	338215115
614	NC_015704	CGAC	2	8	32141	32148	25 %	0 %	25 %	50 %	338215115
615	NC_015704	CAC	3	9	32166	32174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215115
616	NC_015704	A	7	7	32534	32540	100 %	0 %	0 %	0 %	338215116
617	NC_015704	CTT	2	6	32575	32580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
618	NC_015704	TTC	2	6	32618	32623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
619	NC_015704	TTC	2	6	32652	32657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
620	NC_015704	ACG	2	6	32683	32688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215116
621	NC_015704	TCG	2	6	32706	32711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
622	NC_015704	TGC	2	6	32790	32795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
623	NC_015704	GTC	2	6	32801	32806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
624	NC_015704	CGAC	2	8	32827	32834	25 %	0 %	25 %	50 %	338215116
625	NC_015704	TCG	2	6	32862	32867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
626	NC_015704	CTT	2	6	32986	32991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
627	NC_015704	TTG	2	6	33006	33011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215116
628	NC_015704	GTTG	2	8	33025	33032	0 %	50 %	50 %	0 %	338215116
629	NC_015704	TCG	2	6	33063	33068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
630	NC_015704	A	6	6	33080	33085	100 %	0 %	0 %	0 %	338215116
631	NC_015704	TCAG	2	8	33096	33103	25 %	25 %	25 %	25 %	338215116
632	NC_015704	AT	3	6	33136	33141	50 %	50 %	0 %	0 %	338215116
633	NC_015704	CGG	2	6	33172	33177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215116
634	NC_015704	ATC	2	6	33227	33232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215116
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641	NC_015704	GTC	4	12	33452	33463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
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654	NC_015704	TGC	2	6	34135	34140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
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884	NC_015704	AATA	2	8	45092	45099	75 %	25 %	0 %	0 %	338215122
885	NC_015704	TAA	2	6	45139	45144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215122
886	NC_015704	A	6	6	45215	45220	100 %	0 %	0 %	0 %	338215122
887	NC_015704	CCG	3	9	45234	45242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215122
888	NC_015704	TCA	2	6	45243	45248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215122
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