MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 17016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	CCTA	2	8	546	553	25 %	25 %	0 %	50 %	338209546
2	NC_015703	CGGC	2	8	601	608	0 %	0 %	50 %	50 %	338209546
3	NC_015703	GAGT	2	8	965	972	25 %	25 %	50 %	0 %	338209546
4	NC_015703	AAGA	2	8	1347	1354	75 %	0 %	25 %	0 %	338209546
5	NC_015703	TCAT	2	8	1459	1466	25 %	50 %	0 %	25 %	338209546
6	NC_015703	GGCA	2	8	1694	1701	25 %	0 %	50 %	25 %	338209547
7	NC_015703	GAAA	2	8	1754	1761	75 %	0 %	25 %	0 %	338209547
8	NC_015703	CATC	2	8	1819	1826	25 %	25 %	0 %	50 %	338209547
9	NC_015703	GGCA	2	8	2139	2146	25 %	0 %	50 %	25 %	338209547
10	NC_015703	CTTT	2	8	2736	2743	0 %	75 %	0 %	25 %	338209548
11	NC_015703	CAAT	2	8	2904	2911	50 %	25 %	0 %	25 %	338209548
12	NC_015703	CGGT	2	8	2991	2998	0 %	25 %	50 %	25 %	338209548
13	NC_015703	TCGC	2	8	3241	3248	0 %	25 %	25 %	50 %	338209549
14	NC_015703	TGAA	2	8	3760	3767	50 %	25 %	25 %	0 %	338209549
15	NC_015703	AACC	2	8	3818	3825	50 %	0 %	0 %	50 %	338209549
16	NC_015703	AAAG	2	8	4379	4386	75 %	0 %	25 %	0 %	338209550
17	NC_015703	GGCG	2	8	5124	5131	0 %	0 %	75 %	25 %	338209551
18	NC_015703	TTCC	2	8	5797	5804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015703	TATG	2	8	5835	5842	25 %	50 %	25 %	0 %	338209552
20	NC_015703	TCTT	2	8	5845	5852	0 %	75 %	0 %	25 %	338209552
21	NC_015703	CCGA	2	8	6210	6217	25 %	0 %	25 %	50 %	338209552
22	NC_015703	TGAT	2	8	7132	7139	25 %	50 %	25 %	0 %	338209553
23	NC_015703	TGTA	2	8	7585	7592	25 %	50 %	25 %	0 %	338209553
24	NC_015703	GGAG	2	8	7790	7797	25 %	0 %	75 %	0 %	338209553
25	NC_015703	GGAA	2	8	7814	7821	50 %	0 %	50 %	0 %	338209553
26	NC_015703	GGAA	2	8	7826	7833	50 %	0 %	50 %	0 %	338209553
27	NC_015703	GGAA	2	8	7838	7845	50 %	0 %	50 %	0 %	338209553
28	NC_015703	CATC	2	8	8252	8259	25 %	25 %	0 %	50 %	338209554
29	NC_015703	CCCG	2	8	9017	9024	0 %	0 %	25 %	75 %	338209554
30	NC_015703	CTGC	3	12	9133	9144	0 %	25 %	25 %	50 %	338209554
31	NC_015703	TTCC	2	8	11473	11480	0 %	50 %	0 %	50 %	338209555
32	NC_015703	TGCC	2	8	12304	12311	0 %	25 %	25 %	50 %	338209555
33	NC_015703	TGTT	2	8	12402	12409	0 %	75 %	25 %	0 %	338209555
34	NC_015703	TTCC	2	8	12445	12452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015703	GAAA	2	8	12475	12482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015703	CGGA	2	8	13520	13527	25 %	0 %	50 %	25 %	338209557
37	NC_015703	CAGG	2	8	14602	14609	25 %	0 %	50 %	25 %	338209557
38	NC_015703	GACC	2	8	15300	15307	25 %	0 %	25 %	50 %	338209557
39	NC_015703	TGGA	2	8	15815	15822	25 %	25 %	50 %	0 %	338209557
40	NC_015703	GTGA	2	8	15985	15992	25 %	25 %	50 %	0 %	338209557
41	NC_015703	ATTT	2	8	16680	16687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015703	ACCG	2	8	16880	16887	25 %	0 %	25 %	50 %	338209558
43	NC_015703	TCTT	2	8	17432	17439	0 %	75 %	0 %	25 %	338209559
44	NC_015703	GGCG	2	8	17512	17519	0 %	0 %	75 %	25 %	338209559
45	NC_015703	AAGA	2	8	17630	17637	75 %	0 %	25 %	0 %	338209559
46	NC_015703	CCAA	2	8	17870	17877	50 %	0 %	0 %	50 %	338209559
47	NC_015703	CAAC	2	8	18103	18110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015703	AAAC	2	8	18269	18276	75 %	0 %	0 %	25 %	338209560
49	NC_015703	CAAA	2	8	18567	18574	75 %	0 %	0 %	25 %	338209560
50	NC_015703	CCTT	2	8	18825	18832	0 %	50 %	0 %	50 %	338209560
51	NC_015703	TTGG	2	8	18925	18932	0 %	50 %	50 %	0 %	338209560
52	NC_015703	ACCG	2	8	18948	18955	25 %	0 %	25 %	50 %	338209560
53	NC_015703	TTTG	2	8	19067	19074	0 %	75 %	25 %	0 %	338209560
54	NC_015703	ATTT	2	8	19185	19192	25 %	75 %	0 %	0 %	338209560
55	NC_015703	TACA	2	8	19413	19420	50 %	25 %	0 %	25 %	338209561
56	NC_015703	AACC	2	8	19590	19597	50 %	0 %	0 %	50 %	338209561
57	NC_015703	AAAT	2	8	19842	19849	75 %	25 %	0 %	0 %	338209561
58	NC_015703	GGAA	2	8	20417	20424	50 %	0 %	50 %	0 %	338209561
59	NC_015703	AATG	2	8	20517	20524	50 %	25 %	25 %	0 %	338209561
60	NC_015703	CGGG	2	8	21764	21771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015703	TTAC	2	8	21988	21995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015703	TCAA	2	8	22876	22883	50 %	25 %	0 %	25 %	338209562
63	NC_015703	CGGT	2	8	23899	23906	0 %	25 %	50 %	25 %	338209563
64	NC_015703	AAAC	2	8	24383	24390	75 %	0 %	0 %	25 %	338209563
65	NC_015703	TCAC	2	8	24463	24470	25 %	25 %	0 %	50 %	338209563
66	NC_015703	ACTG	2	8	24473	24480	25 %	25 %	25 %	25 %	338209563
67	NC_015703	AGTG	2	8	24791	24798	25 %	25 %	50 %	0 %	338209564
68	NC_015703	TTGT	2	8	24844	24851	0 %	75 %	25 %	0 %	338209564
69	NC_015703	TATG	2	8	25083	25090	25 %	50 %	25 %	0 %	338209564
70	NC_015703	TTCC	2	8	25179	25186	0 %	50 %	0 %	50 %	338209564
71	NC_015703	GCTT	2	8	25472	25479	0 %	50 %	25 %	25 %	338209564
72	NC_015703	CGGC	2	8	26089	26096	0 %	0 %	50 %	50 %	338209565
73	NC_015703	CAGC	2	8	26723	26730	25 %	0 %	25 %	50 %	338209565
74	NC_015703	GCCT	2	8	27632	27639	0 %	25 %	25 %	50 %	338209565
75	NC_015703	AGGC	2	8	27790	27797	25 %	0 %	50 %	25 %	338209565
76	NC_015703	TTTA	2	8	28472	28479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015703	CCAT	2	8	28833	28840	25 %	25 %	0 %	50 %	338209566
78	NC_015703	GATG	2	8	29254	29261	25 %	25 %	50 %	0 %	338209566
79	NC_015703	TCCA	2	8	29631	29638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015703	CGAT	2	8	30194	30201	25 %	25 %	25 %	25 %	338209567
81	NC_015703	TCGG	2	8	30245	30252	0 %	25 %	50 %	25 %	338209567
82	NC_015703	CATT	2	8	30436	30443	25 %	50 %	0 %	25 %	338209568
83	NC_015703	GCTG	2	8	31063	31070	0 %	25 %	50 %	25 %	338209568
84	NC_015703	GGCG	2	8	31559	31566	0 %	0 %	75 %	25 %	338209568
85	NC_015703	TAAA	2	8	32040	32047	75 %	25 %	0 %	0 %	338209568
86	NC_015703	ACCA	2	8	32144	32151	50 %	0 %	0 %	50 %	338209569
87	NC_015703	CGCC	2	8	32324	32331	0 %	0 %	25 %	75 %	338209569
88	NC_015703	GCGG	2	8	32700	32707	0 %	0 %	75 %	25 %	338209569
89	NC_015703	GCGG	2	8	33541	33548	0 %	0 %	75 %	25 %	338209570
90	NC_015703	GACA	2	8	33591	33598	50 %	0 %	25 %	25 %	338209570
91	NC_015703	TTGG	2	8	33775	33782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015703	TACG	2	8	34214	34221	25 %	25 %	25 %	25 %	338209571
93	NC_015703	CAAA	2	8	34888	34895	75 %	0 %	0 %	25 %	338209571
94	NC_015703	CATG	2	8	35193	35200	25 %	25 %	25 %	25 %	338209572
95	NC_015703	GCTC	2	8	35207	35214	0 %	25 %	25 %	50 %	338209572
96	NC_015703	GTAG	2	8	35386	35393	25 %	25 %	50 %	0 %	338209572
97	NC_015703	GACT	2	8	35450	35457	25 %	25 %	25 %	25 %	338209572
98	NC_015703	CAAC	2	8	35724	35731	50 %	0 %	0 %	50 %	338209572
99	NC_015703	ATTT	2	8	36696	36703	25 %	75 %	0 %	0 %	338209574
100	NC_015703	ACCG	2	8	37008	37015	25 %	0 %	25 %	50 %	338209574
101	NC_015703	TATT	2	8	37324	37331	25 %	75 %	0 %	0 %	338209574
102	NC_015703	TGAA	2	8	38161	38168	50 %	25 %	25 %	0 %	338209575
103	NC_015703	TTTG	2	8	38275	38282	0 %	75 %	25 %	0 %	338209575
104	NC_015703	CCAT	2	8	38405	38412	25 %	25 %	0 %	50 %	338209575
105	NC_015703	ATTG	2	8	38657	38664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015703	ATCC	2	8	39668	39675	25 %	25 %	0 %	50 %	338209576
107	NC_015703	AGCA	2	8	40227	40234	50 %	0 %	25 %	25 %	338209577
108	NC_015703	GCGA	2	8	40273	40280	25 %	0 %	50 %	25 %	338209577
109	NC_015703	GCCC	2	8	40289	40296	0 %	0 %	25 %	75 %	338209577
110	NC_015703	CAGG	2	8	40916	40923	25 %	0 %	50 %	25 %	338209577
111	NC_015703	GCAG	2	8	40963	40970	25 %	0 %	50 %	25 %	338209577
112	NC_015703	AGCG	2	8	41012	41019	25 %	0 %	50 %	25 %	338209577
113	NC_015703	GAAT	2	8	41086	41093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015703	TTCT	2	8	41515	41522	0 %	75 %	0 %	25 %	338209578
115	NC_015703	CGGG	2	8	41642	41649	0 %	0 %	75 %	25 %	338209578
116	NC_015703	TGTT	2	8	41894	41901	0 %	75 %	25 %	0 %	338209578
117	NC_015703	TATT	2	8	42176	42183	25 %	75 %	0 %	0 %	338209578
118	NC_015703	ATTG	2	8	42411	42418	25 %	50 %	25 %	0 %	338209578
119	NC_015703	TTTG	2	8	42444	42451	0 %	75 %	25 %	0 %	338209578
120	NC_015703	ATCA	2	8	42527	42534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015703	TCGT	2	8	42768	42775	0 %	50 %	25 %	25 %	338209579
122	NC_015703	AGGA	2	8	42852	42859	50 %	0 %	50 %	0 %	338209579
123	NC_015703	AGCG	2	8	42941	42948	25 %	0 %	50 %	25 %	338209579
124	NC_015703	GGTA	2	8	43396	43403	25 %	25 %	50 %	0 %	338209579
125	NC_015703	TTGA	2	8	43544	43551	25 %	50 %	25 %	0 %	338209579
126	NC_015703	GCCG	2	8	43624	43631	0 %	0 %	50 %	50 %	338209579
127	NC_015703	TTAC	2	8	44189	44196	25 %	50 %	0 %	25 %	338209580
128	NC_015703	TCTG	2	8	44297	44304	0 %	50 %	25 %	25 %	338209580
129	NC_015703	ATTC	2	8	44538	44545	25 %	50 %	0 %	25 %	338209580
130	NC_015703	AATG	2	8	46151	46158	50 %	25 %	25 %	0 %	338209580
131	NC_015703	CGGC	2	8	46510	46517	0 %	0 %	50 %	50 %	338209581
132	NC_015703	GGCT	2	8	47499	47506	0 %	25 %	50 %	25 %	338209581
133	NC_015703	TACC	2	8	47528	47535	25 %	25 %	0 %	50 %	338209581
134	NC_015703	CTGG	2	8	47915	47922	0 %	25 %	50 %	25 %	338209581
135	NC_015703	ACCA	2	8	47934	47941	50 %	0 %	0 %	50 %	338209581
136	NC_015703	CCGG	2	8	48072	48079	0 %	0 %	50 %	50 %	338209581
137	NC_015703	AATC	2	8	48102	48109	50 %	25 %	0 %	25 %	338209581
138	NC_015703	TATT	2	8	48363	48370	25 %	75 %	0 %	0 %	338209581
139	NC_015703	TCGC	2	8	48675	48682	0 %	25 %	25 %	50 %	338209581
140	NC_015703	CCAA	2	8	48826	48833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_015703	TTTC	2	8	50177	50184	0 %	75 %	0 %	25 %	338209583
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