MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 80311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	TGT	2	6	152	157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209546
2	NC_015703	TTC	2	6	282	287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209546
3	NC_015703	GAA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209546
4	NC_015703	TGC	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209546
5	NC_015703	CAT	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
6	NC_015703	GGT	2	6	390	395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209546
7	NC_015703	ACC	2	6	429	434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209546
8	NC_015703	GCC	2	6	447	452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
9	NC_015703	TCG	2	6	519	524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209546
10	NC_015703	CCT	2	6	637	642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209546
11	NC_015703	GTT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209546
12	NC_015703	CGG	2	6	662	667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209546
13	NC_015703	CCA	3	9	722	730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209546
14	NC_015703	TTC	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209546
15	NC_015703	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209546
16	NC_015703	ATC	2	6	939	944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
17	NC_015703	CCG	2	6	956	961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
18	NC_015703	CAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
19	NC_015703	ATC	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
20	NC_015703	CGC	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
21	NC_015703	TGA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209546
22	NC_015703	CCG	2	6	1252	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
23	NC_015703	TAT	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209546
24	NC_015703	GAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209546
25	NC_015703	TCA	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015703	CGC	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209547
27	NC_015703	CGC	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209547
28	NC_015703	ACA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209547
29	NC_015703	GCT	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209547
30	NC_015703	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209547
31	NC_015703	CCA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209547
32	NC_015703	CAA	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209547
33	NC_015703	AGG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209547
34	NC_015703	GTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209547
35	NC_015703	GCC	2	6	2290	2295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209547
36	NC_015703	AAC	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209547
37	NC_015703	TCA	2	6	2688	2693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209548
38	NC_015703	ATA	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209548
39	NC_015703	TGT	3	9	2787	2795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209548
40	NC_015703	TTG	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209548
41	NC_015703	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015703	ATC	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015703	CTT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209549
44	NC_015703	TTA	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209549
45	NC_015703	GTT	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209549
46	NC_015703	CAA	2	6	3425	3430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209549
47	NC_015703	GGC	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209549
48	NC_015703	GGT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209549
49	NC_015703	TCA	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209549
50	NC_015703	GTG	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209549
51	NC_015703	CAT	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209549
52	NC_015703	CTT	2	6	4079	4084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209549
53	NC_015703	ACT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209549
54	NC_015703	ACG	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209550
55	NC_015703	CCG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209550
56	NC_015703	ACA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209550
57	NC_015703	ACA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209550
58	NC_015703	TCA	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209551
59	NC_015703	AAG	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209551
60	NC_015703	TCG	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209551
61	NC_015703	GTT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209551
62	NC_015703	ACG	3	9	5009	5017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209551
63	NC_015703	GGT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209551
64	NC_015703	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209551
65	NC_015703	GAT	2	6	5274	5279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209551
66	NC_015703	GCC	2	6	5373	5378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209551
67	NC_015703	ACA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209551
68	NC_015703	CGA	2	6	5493	5498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209551
69	NC_015703	CAA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209551
70	NC_015703	ATT	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209551
71	NC_015703	GCC	2	6	5589	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209551
72	NC_015703	TAA	2	6	5632	5637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209551
73	NC_015703	CTC	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015703	CGG	2	6	5914	5919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209552
75	NC_015703	CAT	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209552
76	NC_015703	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209552
77	NC_015703	ATG	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209552
78	NC_015703	AGC	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
79	NC_015703	TGC	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209552
80	NC_015703	GAC	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
81	NC_015703	AGA	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209552
82	NC_015703	GCC	2	6	6549	6554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209552
83	NC_015703	GCA	3	9	6625	6633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
84	NC_015703	GCC	2	6	6711	6716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209552
85	NC_015703	TCA	2	6	6823	6828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209552
86	NC_015703	CAT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209552
87	NC_015703	CGA	3	9	6899	6907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
88	NC_015703	CAA	2	6	6923	6928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209552
89	NC_015703	ACG	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
90	NC_015703	AAC	2	6	7165	7170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209553
91	NC_015703	CTT	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209553
92	NC_015703	AAG	2	6	7450	7455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
93	NC_015703	GAA	3	9	7551	7559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
94	NC_015703	GAA	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
95	NC_015703	GAA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
96	NC_015703	TGC	2	6	7945	7950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209553
97	NC_015703	TAA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
98	NC_015703	GCC	2	6	8024	8029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
99	NC_015703	ATA	2	6	8042	8047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
100	NC_015703	GCC	2	6	8066	8071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
101	NC_015703	TTG	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209554
102	NC_015703	CAT	2	6	8287	8292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209554
103	NC_015703	CTT	2	6	8296	8301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209554
104	NC_015703	GCT	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209554
105	NC_015703	GTA	2	6	8531	8536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209554
106	NC_015703	CCA	2	6	8548	8553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209554
107	NC_015703	GCC	2	6	8786	8791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
108	NC_015703	CGC	2	6	8806	8811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
109	NC_015703	ATG	2	6	8879	8884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209554
110	NC_015703	CCG	2	6	8905	8910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
111	NC_015703	AAT	2	6	8938	8943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
112	NC_015703	AAT	2	6	9070	9075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
113	NC_015703	TTG	2	6	9237	9242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209554
114	NC_015703	GCC	2	6	9276	9281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
115	NC_015703	GTT	2	6	9523	9528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209554
116	NC_015703	TAG	2	6	9537	9542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209554
117	NC_015703	ATT	2	6	9575	9580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209554
118	NC_015703	ACG	2	6	9743	9748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209554
119	NC_015703	GAT	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209554
120	NC_015703	TGG	2	6	10219	10224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209554
121	NC_015703	ACC	2	6	10413	10418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209554
122	NC_015703	TCC	2	6	10419	10424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209554
123	NC_015703	TTC	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015703	AAC	2	6	10626	10631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209555
125	NC_015703	TTG	2	6	10647	10652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209555
126	NC_015703	GTT	2	6	10660	10665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209555
127	NC_015703	AAT	2	6	10848	10853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209555
128	NC_015703	GCC	2	6	10933	10938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209555
129	NC_015703	CTG	2	6	10946	10951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209555
130	NC_015703	GTT	2	6	11024	11029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209555
131	NC_015703	TCA	3	9	11071	11079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209555
132	NC_015703	AAT	2	6	11199	11204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209555
133	NC_015703	GGT	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209555
134	NC_015703	GAA	2	6	11417	11422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209555
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139	NC_015703	CTT	2	6	11725	11730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209555
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148	NC_015703	TGA	2	6	12214	12219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209555
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151	NC_015703	GAC	2	6	12514	12519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015703	AAT	2	6	12565	12570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015703	CTT	2	6	12652	12657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209556
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160	NC_015703	CAA	2	6	12925	12930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015703	TTG	2	6	13310	13315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_015703	ATC	2	6	18147	18152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209560
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242	NC_015703	TAT	2	6	19744	19749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209561
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250	NC_015703	GCA	2	6	20177	20182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209561
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252	NC_015703	ACC	2	6	20318	20323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209561
253	NC_015703	CAC	2	6	20544	20549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209561
254	NC_015703	ACG	2	6	20656	20661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209561
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256	NC_015703	ACG	3	9	20981	20989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209561
257	NC_015703	GGC	2	6	21091	21096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209561
258	NC_015703	GTC	2	6	21154	21159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209561
259	NC_015703	TCA	2	6	21185	21190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209561
260	NC_015703	ACG	2	6	21220	21225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209561
261	NC_015703	TAT	2	6	21276	21281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209561
262	NC_015703	GGC	2	6	21340	21345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209561
263	NC_015703	CGG	2	6	21459	21464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209561
264	NC_015703	GCA	2	6	21679	21684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_015703	CGA	2	6	21708	21713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_015703	CTG	2	6	21772	21777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_015703	CAG	3	9	21869	21877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_015703	CGA	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_015703	ACT	2	6	21921	21926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015703	CCA	2	6	22029	22034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_015703	ATC	2	6	22065	22070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209562
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275	NC_015703	CTT	2	6	22421	22426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209562
276	NC_015703	TGT	2	6	22445	22450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209562
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278	NC_015703	ACC	3	9	22474	22482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209562
279	NC_015703	CGG	2	6	22529	22534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209562
280	NC_015703	TAA	2	6	22585	22590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209562
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291	NC_015703	TAT	2	6	23471	23476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015703	TTG	2	6	23577	23582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_015703	CCA	2	6	23610	23615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_015703	CCA	2	6	23672	23677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209563
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302	NC_015703	GAG	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015703	CCG	2	6	24726	24731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209564
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