MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 2070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015693	TGA	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209391
502	NC_015693	TTCG	2	8	24073	24080	0 %	50 %	25 %	25 %	338209391
503	NC_015693	T	6	6	24154	24159	0 %	100 %	0 %	0 %	338209391
504	NC_015693	TGC	2	6	24183	24188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209391
505	NC_015693	CGAGT	2	10	24211	24220	20 %	20 %	40 %	20 %	338209391
506	NC_015693	T	6	6	24271	24276	0 %	100 %	0 %	0 %	338209391
507	NC_015693	TCACC	2	10	24283	24292	20 %	20 %	0 %	60 %	338209391
508	NC_015693	TCT	3	9	24408	24416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209391
509	NC_015693	CAC	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209391
510	NC_015693	TGT	2	6	24510	24515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209391
511	NC_015693	A	6	6	24518	24523	100 %	0 %	0 %	0 %	338209391
512	NC_015693	CAC	2	6	24542	24547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209391
513	NC_015693	TGGGT	2	10	24577	24586	0 %	40 %	60 %	0 %	338209391
514	NC_015693	CGGT	2	8	24651	24658	0 %	25 %	50 %	25 %	338209391
515	NC_015693	ACAA	2	8	24696	24703	75 %	0 %	0 %	25 %	338209391
516	NC_015693	T	6	6	24709	24714	0 %	100 %	0 %	0 %	338209391
517	NC_015693	A	7	7	24755	24761	100 %	0 %	0 %	0 %	338209391
518	NC_015693	CCAATT	2	12	24783	24794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015693	T	8	8	24810	24817	0 %	100 %	0 %	0 %	338209392
520	NC_015693	CTT	2	6	24932	24937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209392
521	NC_015693	ATG	2	6	25084	25089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209392
522	NC_015693	GTC	2	6	25101	25106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209392
523	NC_015693	GTG	2	6	25107	25112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209392
524	NC_015693	T	6	6	25163	25168	0 %	100 %	0 %	0 %	338209392
525	NC_015693	AAG	2	6	25177	25182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015693	TCA	2	6	25208	25213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209393
527	NC_015693	TTTC	2	8	25221	25228	0 %	75 %	0 %	25 %	338209393
528	NC_015693	CCG	2	6	25318	25323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209393
529	NC_015693	TTG	2	6	25383	25388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209393
530	NC_015693	GCCGA	2	10	25407	25416	20 %	0 %	40 %	40 %	338209393
531	NC_015693	TGCC	2	8	25429	25436	0 %	25 %	25 %	50 %	338209393
532	NC_015693	T	6	6	25487	25492	0 %	100 %	0 %	0 %	338209393
533	NC_015693	GTCGAG	2	12	25541	25552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209393
534	NC_015693	CATAC	2	10	25691	25700	40 %	20 %	0 %	40 %	338209393
535	NC_015693	GAC	2	6	25712	25717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209393
536	NC_015693	TAG	2	6	25819	25824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015693	GAT	2	6	25928	25933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209394
538	NC_015693	TGT	2	6	25962	25967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209394
539	NC_015693	T	6	6	25974	25979	0 %	100 %	0 %	0 %	338209394
540	NC_015693	CAT	2	6	26014	26019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209394
541	NC_015693	AACC	2	8	26031	26038	50 %	0 %	0 %	50 %	338209394
542	NC_015693	AGC	2	6	26083	26088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209394
543	NC_015693	GAG	2	6	26098	26103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209394
544	NC_015693	CTGC	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	338209394
545	NC_015693	AACC	2	8	26131	26138	50 %	0 %	0 %	50 %	338209394
546	NC_015693	GT	3	6	26186	26191	0 %	50 %	50 %	0 %	338209394
547	NC_015693	TA	3	6	26211	26216	50 %	50 %	0 %	0 %	338209394
548	NC_015693	A	7	7	26221	26227	100 %	0 %	0 %	0 %	338209394
549	NC_015693	CGA	2	6	26244	26249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209394
550	NC_015693	TTC	2	6	26290	26295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209394
551	NC_015693	CAG	2	6	26311	26316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209394
552	NC_015693	TAG	2	6	26340	26345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209394
553	NC_015693	CGG	2	6	26402	26407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209394
554	NC_015693	CCA	2	6	26427	26432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209394
555	NC_015693	GCGT	2	8	26450	26457	0 %	25 %	50 %	25 %	338209394
556	NC_015693	TCG	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209395
557	NC_015693	CGT	2	6	26771	26776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209395
558	NC_015693	CACG	2	8	26792	26799	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
559	NC_015693	GTC	2	6	26841	26846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209395
560	NC_015693	GTG	2	6	26920	26925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209395
561	NC_015693	ATC	2	6	26937	26942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209395
562	NC_015693	A	6	6	26967	26972	100 %	0 %	0 %	0 %	338209395
563	NC_015693	TAG	2	6	27016	27021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
564	NC_015693	TCCA	2	8	27099	27106	25 %	25 %	0 %	50 %	338209395
565	NC_015693	TGA	2	6	27149	27154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
566	NC_015693	GTG	2	6	27307	27312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209395
567	NC_015693	TTGG	2	8	27336	27343	0 %	50 %	50 %	0 %	338209395
568	NC_015693	CGCC	2	8	27360	27367	0 %	0 %	25 %	75 %	338209395
569	NC_015693	CCAAA	2	10	27470	27479	60 %	0 %	0 %	40 %	338209395
570	NC_015693	AGTAA	2	10	27547	27556	60 %	20 %	20 %	0 %	338209395
571	NC_015693	TGA	2	6	27587	27592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
572	NC_015693	TGG	2	6	27605	27610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209395
573	NC_015693	GCT	2	6	27676	27681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209395
574	NC_015693	ATA	2	6	27684	27689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209395
575	NC_015693	AGCC	2	8	27702	27709	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
576	NC_015693	ATC	2	6	27732	27737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209395
577	NC_015693	CTGTAC	2	12	27738	27749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209395
578	NC_015693	GTA	2	6	27805	27810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
579	NC_015693	GAA	2	6	27816	27821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209395
580	NC_015693	ACCT	2	8	27879	27886	25 %	25 %	0 %	50 %	338209395
581	NC_015693	AGT	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
582	NC_015693	TA	3	6	27965	27970	50 %	50 %	0 %	0 %	338209395
583	NC_015693	GCA	2	6	28040	28045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209395
584	NC_015693	AGT	2	6	28052	28057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
585	NC_015693	GCCA	2	8	28151	28158	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
586	NC_015693	A	7	7	28212	28218	100 %	0 %	0 %	0 %	338209395
587	NC_015693	T	6	6	28243	28248	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
588	NC_015693	T	6	6	28338	28343	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
589	NC_015693	TGA	2	6	28346	28351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209395
590	NC_015693	CAC	2	6	28356	28361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209395
591	NC_015693	C	8	8	28361	28368	0 %	0 %	0 %	100 %	338209395
592	NC_015693	GGC	2	6	28469	28474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209395
593	NC_015693	AG	3	6	28588	28593	50 %	0 %	50 %	0 %	338209395
594	NC_015693	T	7	7	28599	28605	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
595	NC_015693	T	6	6	28667	28672	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
596	NC_015693	CGTTAC	2	12	28710	28721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209395
597	NC_015693	TTC	2	6	28722	28727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209395
598	NC_015693	T	6	6	28757	28762	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
599	NC_015693	A	6	6	28809	28814	100 %	0 %	0 %	0 %	338209395
600	NC_015693	A	7	7	28893	28899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015693	TCA	2	6	28911	28916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209396
602	NC_015693	CCA	2	6	29051	29056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209396
603	NC_015693	CAA	2	6	29100	29105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209396
604	NC_015693	GCT	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
605	NC_015693	AGA	2	6	29146	29151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209396
606	NC_015693	TTC	2	6	29179	29184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209396
607	NC_015693	TGG	2	6	29196	29201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209396
608	NC_015693	TGC	2	6	29275	29280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
609	NC_015693	AAAAG	2	10	29291	29300	80 %	0 %	20 %	0 %	338209396
610	NC_015693	CAA	2	6	29386	29391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209396
611	NC_015693	ATT	2	6	29392	29397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209396
612	NC_015693	C	6	6	29418	29423	0 %	0 %	0 %	100 %	338209396
613	NC_015693	AGC	2	6	29528	29533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209396
614	NC_015693	AAT	2	6	29541	29546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209396
615	NC_015693	GTT	2	6	29592	29597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
616	NC_015693	CAC	2	6	29622	29627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209396
617	NC_015693	T	6	6	29751	29756	0 %	100 %	0 %	0 %	338209396
618	NC_015693	AGTC	2	8	29967	29974	25 %	25 %	25 %	25 %	338209396
619	NC_015693	GTT	2	6	30090	30095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
620	NC_015693	GTT	2	6	30151	30156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
621	NC_015693	CGG	2	6	30500	30505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209396
622	NC_015693	TAG	2	6	30531	30536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209396
623	NC_015693	AATA	2	8	30548	30555	75 %	25 %	0 %	0 %	338209396
624	NC_015693	AGAAA	2	10	30638	30647	80 %	0 %	20 %	0 %	338209396
625	NC_015693	CCAAC	2	10	30679	30688	40 %	0 %	0 %	60 %	338209396
626	NC_015693	GTC	2	6	30700	30705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
627	NC_015693	ACG	2	6	30730	30735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209396
628	NC_015693	CGG	2	6	30738	30743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209396
629	NC_015693	CAA	2	6	30761	30766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209396
630	NC_015693	GCC	2	6	30785	30790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209396
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896	NC_015693	TCA	2	6	43621	43626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209409
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899	NC_015693	C	6	6	43719	43724	0 %	0 %	0 %	100 %	338209409
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908	NC_015693	CAAT	2	8	44089	44096	50 %	25 %	0 %	25 %	338209409
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960	NC_015693	ATA	2	6	47152	47157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209410
961	NC_015693	CGG	2	6	47247	47252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209410
962	NC_015693	ACC	2	6	47405	47410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209410
963	NC_015693	CCTT	2	8	47418	47425	0 %	50 %	0 %	50 %	338209410
964	NC_015693	ATG	2	6	47449	47454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209410
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966	NC_015693	CTT	2	6	47483	47488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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972	NC_015693	CTT	2	6	47686	47691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209411
973	NC_015693	TGC	2	6	47893	47898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209411
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977	NC_015693	A	6	6	48045	48050	100 %	0 %	0 %	0 %	338209411
978	NC_015693	CAT	2	6	48062	48067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209411
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983	NC_015693	GATT	2	8	48350	48357	25 %	50 %	25 %	0 %	338209412
984	NC_015693	CG	4	8	48467	48474	0 %	0 %	50 %	50 %	338209412
985	NC_015693	AGC	2	6	48529	48534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209412
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987	NC_015693	GTTG	2	8	48569	48576	0 %	50 %	50 %	0 %	338209412
988	NC_015693	CCA	2	6	48657	48662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209412
989	NC_015693	T	7	7	48670	48676	0 %	100 %	0 %	0 %	338209412
990	NC_015693	TAA	2	6	48682	48687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209412
991	NC_015693	AAG	2	6	48727	48732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209412
992	NC_015693	AGA	2	6	48742	48747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209412
993	NC_015693	GTG	2	6	48801	48806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209412
994	NC_015693	C	6	6	48817	48822	0 %	0 %	0 %	100 %	338209412
995	NC_015693	ACGG	2	8	48870	48877	25 %	0 %	50 %	25 %	338209412
996	NC_015693	CATC	2	8	48893	48900	25 %	25 %	0 %	50 %	338209412
997	NC_015693	CGC	2	6	48921	48926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209412
998	NC_015693	T	6	6	49060	49065	0 %	100 %	0 %	0 %	338209412
999	NC_015693	TCTTTG	2	12	49105	49116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338209412
1000	NC_015693	CCCA	2	8	49148	49155	25 %	0 %	0 %	75 %	338209412

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