MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 2631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015063	CCAGGC	2	12	127275	127286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322836487
2502	NC_015063	GGC	3	9	127288	127296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836487
2503	NC_015063	GC	3	6	127396	127401	0 %	0 %	50 %	50 %	322836488
2504	NC_015063	GAG	2	6	127413	127418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836488
2505	NC_015063	GCCA	2	8	127445	127452	25 %	0 %	25 %	50 %	322836488
2506	NC_015063	GCCAGA	2	12	127464	127475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2507	NC_015063	GCC	2	6	127493	127498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836488
2508	NC_015063	CGAA	2	8	127522	127529	50 %	0 %	25 %	25 %	322836488
2509	NC_015063	GCCGC	2	10	127533	127542	0 %	0 %	40 %	60 %	322836488
2510	NC_015063	CCA	3	9	127666	127674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836488
2511	NC_015063	CAG	2	6	127679	127684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2512	NC_015063	GCC	2	6	127691	127696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836488
2513	NC_015063	C	6	6	127704	127709	0 %	0 %	0 %	100 %	322836488
2514	NC_015063	GCC	2	6	127731	127736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836488
2515	NC_015063	CAG	2	6	127742	127747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2516	NC_015063	GC	3	6	127813	127818	0 %	0 %	50 %	50 %	322836488
2517	NC_015063	CGG	2	6	127837	127842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836488
2518	NC_015063	CAG	2	6	127843	127848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2519	NC_015063	GGCCGA	2	12	127849	127860	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322836488
2520	NC_015063	GCA	2	6	127963	127968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2521	NC_015063	GCG	2	6	127969	127974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836488
2522	NC_015063	AGCG	2	8	127977	127984	25 %	0 %	50 %	25 %	322836488
2523	NC_015063	CAG	2	6	127985	127990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2524	NC_015063	CGC	2	6	128075	128080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836488
2525	NC_015063	CAG	2	6	128081	128086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2526	NC_015063	GTCG	2	8	128105	128112	0 %	25 %	50 %	25 %	322836488
2527	NC_015063	CAG	2	6	128144	128149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2528	NC_015063	ATG	2	6	128184	128189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836488
2529	NC_015063	CGT	2	6	128252	128257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2530	NC_015063	CAG	2	6	128285	128290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2531	NC_015063	CGT	2	6	128294	128299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2532	NC_015063	GCC	2	6	128313	128318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836488
2533	NC_015063	CAG	2	6	128342	128347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2534	NC_015063	GC	3	6	128351	128356	0 %	0 %	50 %	50 %	322836488
2535	NC_015063	CAGC	2	8	128380	128387	25 %	0 %	25 %	50 %	322836488
2536	NC_015063	CAG	2	6	128396	128401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2537	NC_015063	GC	3	6	128425	128430	0 %	0 %	50 %	50 %	322836488
2538	NC_015063	CGG	2	6	128446	128451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836488
2539	NC_015063	AGC	2	6	128490	128495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2540	NC_015063	GCC	3	9	128535	128543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836488
2541	NC_015063	AGC	2	6	128544	128549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836488
2542	NC_015063	ACTC	2	8	128612	128619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_015063	TGCTT	2	10	128632	128641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2544	NC_015063	TGCAC	2	10	128651	128660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2545	NC_015063	TGCAG	2	10	128688	128697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2546	NC_015063	CA	3	6	128719	128724	50 %	0 %	0 %	50 %	322836489
2547	NC_015063	TCG	2	6	128741	128746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836489
2548	NC_015063	GCG	2	6	128777	128782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836489
2549	NC_015063	AGG	2	6	128883	128888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836489
2550	NC_015063	CG	3	6	128896	128901	0 %	0 %	50 %	50 %	322836489
2551	NC_015063	GGCCGA	2	12	128998	129009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322836489
2552	NC_015063	TCGCAG	2	12	129045	129056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322836489
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2554	NC_015063	CGAT	2	8	129084	129091	25 %	25 %	25 %	25 %	322836489
2555	NC_015063	GC	4	8	129117	129124	0 %	0 %	50 %	50 %	322836489
2556	NC_015063	CTT	2	6	129145	129150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836489
2557	NC_015063	GC	3	6	129184	129189	0 %	0 %	50 %	50 %	322836489
2558	NC_015063	CGC	2	6	129244	129249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836489
2559	NC_015063	CGA	2	6	129271	129276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836489
2560	NC_015063	GCT	2	6	129498	129503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836490
2561	NC_015063	GCC	2	6	129543	129548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836490
2562	NC_015063	GGGCT	2	10	129610	129619	0 %	20 %	60 %	20 %	322836490
2563	NC_015063	TGC	2	6	129641	129646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836490
2564	NC_015063	CCCG	2	8	129659	129666	0 %	0 %	25 %	75 %	322836490
2565	NC_015063	CTG	2	6	129700	129705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836490
2566	NC_015063	TGG	2	6	129761	129766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836490
2567	NC_015063	CGGGCG	2	12	129792	129803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836490
2568	NC_015063	CG	3	6	129802	129807	0 %	0 %	50 %	50 %	322836490
2569	NC_015063	TGAC	2	8	129829	129836	25 %	25 %	25 %	25 %	322836490
2570	NC_015063	CAT	2	6	129858	129863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_015063	CAT	2	6	129896	129901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836491
2572	NC_015063	TCA	2	6	130007	130012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836491
2573	NC_015063	GGC	2	6	130064	130069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836491
2574	NC_015063	TCG	2	6	130108	130113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836491
2575	NC_015063	AG	3	6	130202	130207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_015063	GGC	2	6	130250	130255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836492
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2578	NC_015063	GAG	2	6	130320	130325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836492
2579	NC_015063	TCC	2	6	130339	130344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836492
2580	NC_015063	ACT	2	6	130447	130452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836492
2581	NC_015063	CTG	2	6	130515	130520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836492
2582	NC_015063	A	6	6	130557	130562	100 %	0 %	0 %	0 %	322836492
2583	NC_015063	TGA	2	6	130639	130644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836492
2584	NC_015063	AG	3	6	130715	130720	50 %	0 %	50 %	0 %	322836492
2585	NC_015063	CCT	2	6	130729	130734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836492
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2587	NC_015063	CGAT	2	8	130882	130889	25 %	25 %	25 %	25 %	322836492
2588	NC_015063	ATG	2	6	130909	130914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836492
2589	NC_015063	CG	3	6	131106	131111	0 %	0 %	50 %	50 %	322836492
2590	NC_015063	CCT	2	6	131184	131189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836493
2591	NC_015063	GGTT	2	8	131234	131241	0 %	50 %	50 %	0 %	322836493
2592	NC_015063	CGA	2	6	131252	131257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836493
2593	NC_015063	GTC	2	6	131297	131302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836493
2594	NC_015063	CT	3	6	131309	131314	0 %	50 %	0 %	50 %	322836493
2595	NC_015063	TCC	2	6	131320	131325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836493
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2597	NC_015063	CAT	2	6	131518	131523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836493
2598	NC_015063	C	6	6	131658	131663	0 %	0 %	0 %	100 %	322836493
2599	NC_015063	CAC	2	6	131686	131691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836493
2600	NC_015063	TCAG	2	8	131706	131713	25 %	25 %	25 %	25 %	322836493
2601	NC_015063	AGA	2	6	131790	131795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836493
2602	NC_015063	TTC	2	6	131849	131854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836493
2603	NC_015063	ACG	2	6	131901	131906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836493
2604	NC_015063	AG	3	6	131948	131953	50 %	0 %	50 %	0 %	322836493
2605	NC_015063	GATA	2	8	132056	132063	50 %	25 %	25 %	0 %	322836493
2606	NC_015063	CTTC	2	8	132088	132095	0 %	50 %	0 %	50 %	322836493
2607	NC_015063	AAC	2	6	132099	132104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836493
2608	NC_015063	GAAG	2	8	132191	132198	50 %	0 %	50 %	0 %	322836493
2609	NC_015063	T	6	6	132299	132304	0 %	100 %	0 %	0 %	322836493
2610	NC_015063	GCA	2	6	132372	132377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836493
2611	NC_015063	TCAG	2	8	132561	132568	25 %	25 %	25 %	25 %	322836493
2612	NC_015063	AAT	2	6	132623	132628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836493
2613	NC_015063	T	6	6	132632	132637	0 %	100 %	0 %	0 %	322836493
2614	NC_015063	TGT	2	6	132652	132657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836493
2615	NC_015063	ATAA	2	8	132678	132685	75 %	25 %	0 %	0 %	322836494
2616	NC_015063	ATG	2	6	132748	132753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836494
2617	NC_015063	CAA	2	6	132815	132820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836494
2618	NC_015063	CTC	2	6	132835	132840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836494
2619	NC_015063	GTA	2	6	132867	132872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836494
2620	NC_015063	CTG	2	6	132966	132971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836494
2621	NC_015063	GCC	2	6	132972	132977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836494
2622	NC_015063	CGC	2	6	133004	133009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836494
2623	NC_015063	TCA	2	6	133073	133078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836494
2624	NC_015063	GGA	2	6	133087	133092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836494
2625	NC_015063	CGT	2	6	133094	133099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836494
2626	NC_015063	CGT	2	6	133122	133127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836494
2627	NC_015063	CGC	2	6	133173	133178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836494
2628	NC_015063	CCTT	2	8	133285	133292	0 %	50 %	0 %	50 %	322836494
2629	NC_015063	TGC	2	6	133299	133304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836494
2630	NC_015063	AGC	2	6	133413	133418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836494
2631	NC_015063	TCA	2	6	133454	133459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836494

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