MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 2631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015063	GACA	2	8	52215	52222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_015063	GA	4	8	52234	52241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015063	AGA	2	6	52251	52256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015063	TGA	2	6	52275	52280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015063	A	9	9	52402	52410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015063	C	6	6	52417	52422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_015063	ATG	2	6	52435	52440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015063	GT	3	6	52493	52498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015063	AACAG	2	10	52541	52550	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_015063	AGC	2	6	52575	52580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015063	AC	3	6	52602	52607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_015063	ATG	2	6	52621	52626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015063	ACA	2	6	52641	52646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015063	ATG	2	6	52711	52716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015063	TGT	2	6	52762	52767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015063	GACG	2	8	52775	52782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_015063	TACG	2	8	52805	52812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_015063	ATG	2	6	52839	52844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015063	GCA	2	6	52982	52987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015063	AT	3	6	53020	53025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015063	AGAT	2	8	53087	53094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015063	ATG	2	6	53134	53139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015063	A	6	6	53215	53220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015063	A	6	6	53290	53295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015063	GAAC	2	8	53418	53425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_015063	GTG	2	6	53475	53480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015063	GCT	2	6	53570	53575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015063	GCC	2	6	53602	53607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_015063	CAC	2	6	53636	53641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015063	ATG	2	6	53650	53655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015063	TTA	2	6	53673	53678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015063	GAT	2	6	53757	53762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015063	ATTT	2	8	53774	53781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015063	CAA	2	6	53892	53897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015063	TGC	2	6	53930	53935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015063	GGA	2	6	53958	53963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015063	TGA	2	6	54011	54016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015063	CAAA	2	8	54062	54069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_015063	GAA	2	6	54081	54086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015063	TCA	2	6	54100	54105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015063	ATG	2	6	54118	54123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015063	CAAA	2	8	54140	54147	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_015063	TTA	2	6	54175	54180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015063	GAC	2	6	54246	54251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015063	ACG	2	6	54277	54282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015063	C	6	6	54321	54326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_015063	AAT	2	6	54384	54389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015063	GAC	2	6	54392	54397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015063	GCA	2	6	54421	54426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015063	AT	3	6	54512	54517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015063	CTG	2	6	54519	54524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015063	ACG	2	6	54580	54585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015063	TGG	2	6	54661	54666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015063	GTTG	2	8	54719	54726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015063	CCA	2	6	54805	54810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015063	A	6	6	55013	55018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015063	AT	3	6	55037	55042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015063	AGG	2	6	55109	55114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015063	ATC	2	6	55279	55284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015063	TGC	2	6	55315	55320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015063	GGT	2	6	55362	55367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015063	GCC	2	6	55500	55505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_015063	TGC	3	9	55508	55516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015063	CGG	2	6	55528	55533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015063	TCA	2	6	55542	55547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015063	G	6	6	55568	55573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015063	TCG	2	6	55641	55646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015063	GATG	2	8	55654	55661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015063	TC	3	6	55886	55891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_015063	CTT	2	6	55947	55952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015063	AATATT	2	12	55974	55985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015063	TGG	2	6	56063	56068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015063	TGC	2	6	56078	56083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015063	ATT	2	6	56176	56181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015063	GGC	2	6	56220	56225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015063	AGA	3	9	56307	56315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015063	ATT	2	6	56377	56382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015063	ATT	2	6	56423	56428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836422
1079	NC_015063	CTA	2	6	56460	56465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836422
1080	NC_015063	T	6	6	56470	56475	0 %	100 %	0 %	0 %	322836422
1081	NC_015063	ATA	2	6	56491	56496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836422
1082	NC_015063	GCCACG	2	12	56558	56569	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322836423
1083	NC_015063	ACA	3	9	56621	56629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836423
1084	NC_015063	ATC	2	6	56762	56767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836423
1085	NC_015063	TGC	2	6	56798	56803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836423
1086	NC_015063	GGT	2	6	56845	56850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836423
1087	NC_015063	ATT	2	6	56967	56972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836423
1088	NC_015063	TAT	2	6	56988	56993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836423
1089	NC_015063	CAG	2	6	57005	57010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836423
1090	NC_015063	TGG	2	6	57090	57095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836423
1091	NC_015063	ACC	2	6	57114	57119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836423
1092	NC_015063	GATGGG	3	18	57165	57182	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	322836423
1093	NC_015063	GCC	2	6	57208	57213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836423
1094	NC_015063	CTG	2	6	57221	57226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836423
1095	NC_015063	TAT	2	6	57271	57276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836423
1096	NC_015063	AGA	3	9	57286	57294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836423
1097	NC_015063	GGC	2	6	57324	57329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836423
1098	NC_015063	AAG	2	6	57330	57335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836423
1099	NC_015063	CGG	2	6	57357	57362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836423
1100	NC_015063	ATA	3	9	57449	57457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836423
1101	NC_015063	CGG	2	6	57512	57517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836423
1102	NC_015063	AG	3	6	57520	57525	50 %	0 %	50 %	0 %	322836423
1103	NC_015063	ATA	2	6	57553	57558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836423
1104	NC_015063	TGG	2	6	57591	57596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836423
1105	NC_015063	TAA	2	6	57747	57752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015063	ATG	2	6	57840	57845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015063	GGC	2	6	57934	57939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015063	GTCT	2	8	58002	58009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_015063	ACC	2	6	58024	58029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015063	GAC	2	6	58030	58035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015063	AT	3	6	58082	58087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015063	TTG	2	6	58161	58166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015063	TGT	2	6	58176	58181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015063	TGC	2	6	58192	58197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015063	ATC	2	6	58271	58276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015063	GCC	2	6	58387	58392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836424
1117	NC_015063	GCT	2	6	58393	58398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836424
1118	NC_015063	AGA	2	6	58452	58457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836424
1119	NC_015063	AAAGA	2	10	58521	58530	80 %	0 %	20 %	0 %	322836424
1120	NC_015063	AT	3	6	58556	58561	50 %	50 %	0 %	0 %	322836424
1121	NC_015063	A	6	6	58563	58568	100 %	0 %	0 %	0 %	322836424
1122	NC_015063	TG	3	6	58649	58654	0 %	50 %	50 %	0 %	322836425
1123	NC_015063	GCA	2	6	58675	58680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836425
1124	NC_015063	GGC	2	6	58693	58698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836425
1125	NC_015063	CAG	2	6	58774	58779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836425
1126	NC_015063	CAC	2	6	58805	58810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836425
1127	NC_015063	CAA	2	6	58840	58845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836425
1128	NC_015063	AAG	2	6	58899	58904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836425
1129	NC_015063	GTA	2	6	59031	59036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836425
1130	NC_015063	CAG	2	6	59186	59191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836425
1131	NC_015063	TTC	2	6	59280	59285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836425
1132	NC_015063	AGCCA	2	10	59334	59343	40 %	0 %	20 %	40 %	322836425
1133	NC_015063	CAGC	2	8	59378	59385	25 %	0 %	25 %	50 %	322836425
1134	NC_015063	TCA	2	6	59393	59398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836425
1135	NC_015063	TGG	2	6	59405	59410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836425
1136	NC_015063	GAAT	2	8	59420	59427	50 %	25 %	25 %	0 %	322836425
1137	NC_015063	TTG	2	6	59471	59476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836425
1138	NC_015063	AT	3	6	59480	59485	50 %	50 %	0 %	0 %	322836426
1139	NC_015063	TAT	2	6	59569	59574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836426
1140	NC_015063	AGA	2	6	59644	59649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836426
1141	NC_015063	CAG	2	6	59858	59863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836426
1142	NC_015063	AAC	2	6	59883	59888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836426
1143	NC_015063	TTA	2	6	60024	60029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836426
1144	NC_015063	AAAC	2	8	60046	60053	75 %	0 %	0 %	25 %	322836426
1145	NC_015063	GAA	2	6	60089	60094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836426
1146	NC_015063	AAC	2	6	60116	60121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836426
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1148	NC_015063	GGTC	2	8	60133	60140	0 %	25 %	50 %	25 %	322836426
1149	NC_015063	ACA	2	6	60149	60154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836426
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1152	NC_015063	AAC	2	6	60305	60310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836426
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1156	NC_015063	ACA	2	6	60639	60644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836426
1157	NC_015063	AGA	2	6	60645	60650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836426
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1162	NC_015063	AGG	2	6	60783	60788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836426
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1167	NC_015063	TTA	2	6	60884	60889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836427
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1173	NC_015063	CTT	2	6	61147	61152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836427
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1192	NC_015063	CCTGAC	2	12	61921	61932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1221	NC_015063	CAA	2	6	63147	63152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1222	NC_015063	AAC	2	6	63204	63209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1223	NC_015063	AAG	2	6	63234	63239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1227	NC_015063	T	7	7	63376	63382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1228	NC_015063	CGG	2	6	63484	63489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836430
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1234	NC_015063	GCG	2	6	63958	63963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836430
1235	NC_015063	CTT	3	9	64006	64014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836430
1236	NC_015063	ACC	2	6	64032	64037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836430
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1240	NC_015063	AAT	2	6	64327	64332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836430
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1242	NC_015063	ACA	2	6	64413	64418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1243	NC_015063	CAT	2	6	64461	64466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836431
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1249	NC_015063	CGACCG	2	12	64864	64875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322836431
1250	NC_015063	CG	3	6	64874	64879	0 %	0 %	50 %	50 %	322836431
1251	NC_015063	GCT	2	6	64883	64888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836431
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1253	NC_015063	AAAG	2	8	64995	65002	75 %	0 %	25 %	0 %	322836431
1254	NC_015063	CAG	2	6	65031	65036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836431
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1256	NC_015063	CAT	2	6	65168	65173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836431
1257	NC_015063	TGCGCA	2	12	65265	65276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_015063	CAC	2	6	65294	65299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1259	NC_015063	CGC	2	6	65327	65332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1261	NC_015063	CCG	2	6	65371	65376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1393	NC_015063	CGCT	2	8	70635	70642	0 %	25 %	25 %	50 %	322836435
1394	NC_015063	GAT	2	6	70790	70795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836435
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1397	NC_015063	GGC	2	6	70943	70948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836435
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1479	NC_015063	T	6	6	75437	75442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_015063	GAA	2	6	75615	75620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1483	NC_015063	ATG	2	6	75631	75636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1484	NC_015063	T	6	6	75646	75651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1485	NC_015063	TA	4	8	75682	75689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1488	NC_015063	TGG	2	6	75759	75764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_015063	ATT	2	6	75772	75777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_015063	TA	3	6	76225	76230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_015063	AAT	2	6	76231	76236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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