MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 2631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015063	CCA	2	6	25229	25234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836401
502	NC_015063	T	6	6	25303	25308	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
503	NC_015063	CAC	2	6	25428	25433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836401
504	NC_015063	AGA	2	6	25491	25496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836401
505	NC_015063	T	7	7	25531	25537	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
506	NC_015063	GCT	2	6	25595	25600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836401
507	NC_015063	TCA	2	6	25726	25731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836401
508	NC_015063	TAT	2	6	25763	25768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836401
509	NC_015063	T	6	6	25785	25790	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
510	NC_015063	TGTCTC	2	12	25808	25819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322836401
511	NC_015063	T	6	6	25835	25840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015063	AT	3	6	25845	25850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015063	A	6	6	25857	25862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015063	GAT	2	6	25876	25881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015063	CAC	2	6	25938	25943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015063	AAT	2	6	26008	26013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015063	TATT	2	8	26087	26094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015063	GAA	2	6	26108	26113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015063	TTC	2	6	26116	26121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015063	TGGT	2	8	26423	26430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015063	AGAA	2	8	26441	26448	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015063	ACT	2	6	26504	26509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015063	TA	3	6	26515	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015063	TTC	2	6	26580	26585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015063	C	6	6	26602	26607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
526	NC_015063	AGC	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015063	A	6	6	26638	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015063	TTG	2	6	26666	26671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015063	TAC	2	6	26700	26705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015063	ATA	2	6	26718	26723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015063	ATA	2	6	26933	26938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836402
532	NC_015063	CAG	2	6	26993	26998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836402
533	NC_015063	CAT	2	6	27105	27110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836402
534	NC_015063	GTG	2	6	27329	27334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836402
535	NC_015063	AG	3	6	27378	27383	50 %	0 %	50 %	0 %	322836403
536	NC_015063	A	6	6	27409	27414	100 %	0 %	0 %	0 %	322836403
537	NC_015063	TGC	2	6	27425	27430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836403
538	NC_015063	AAGC	2	8	27440	27447	50 %	0 %	25 %	25 %	322836403
539	NC_015063	TG	3	6	27544	27549	0 %	50 %	50 %	0 %	322836403
540	NC_015063	AGA	2	6	27550	27555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836403
541	NC_015063	AGTG	2	8	27618	27625	25 %	25 %	50 %	0 %	322836403
542	NC_015063	ACC	2	6	27741	27746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_015063	GCT	2	6	27761	27766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015063	AAT	2	6	27775	27780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015063	ATG	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015063	TTTC	2	8	27876	27883	0 %	75 %	0 %	25 %	322836404
547	NC_015063	CTG	2	6	27925	27930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836404
548	NC_015063	GTCG	2	8	28153	28160	0 %	25 %	50 %	25 %	322836404
549	NC_015063	CG	3	6	28218	28223	0 %	0 %	50 %	50 %	322836404
550	NC_015063	GGC	2	6	28308	28313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836404
551	NC_015063	CGGCG	2	10	28320	28329	0 %	0 %	60 %	40 %	322836404
552	NC_015063	CAC	2	6	28348	28353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836404
553	NC_015063	CCGC	2	8	28414	28421	0 %	0 %	25 %	75 %	322836404
554	NC_015063	AGT	2	6	28470	28475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836404
555	NC_015063	CG	3	6	28555	28560	0 %	0 %	50 %	50 %	322836404
556	NC_015063	TCT	2	6	28568	28573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836404
557	NC_015063	TCA	2	6	28667	28672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015063	A	7	7	28681	28687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015063	A	6	6	28707	28712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015063	CA	3	6	28747	28752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_015063	TC	3	6	28803	28808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015063	AAT	2	6	28897	28902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015063	TAA	2	6	28970	28975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015063	GAT	3	9	28982	28990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015063	A	6	6	29000	29005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015063	AGA	2	6	29085	29090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015063	AATA	2	8	29207	29214	75 %	25 %	0 %	0 %	322836405
568	NC_015063	GGA	2	6	29276	29281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836405
569	NC_015063	TAAA	2	8	29386	29393	75 %	25 %	0 %	0 %	322836405
570	NC_015063	TGA	2	6	29405	29410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836405
571	NC_015063	A	6	6	29524	29529	100 %	0 %	0 %	0 %	322836405
572	NC_015063	CTA	2	6	29545	29550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836405
573	NC_015063	TCCA	2	8	29576	29583	25 %	25 %	0 %	50 %	322836405
574	NC_015063	TGC	2	6	29600	29605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836405
575	NC_015063	TTC	2	6	29612	29617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836405
576	NC_015063	TCA	2	6	29664	29669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836405
577	NC_015063	ATC	2	6	29736	29741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836405
578	NC_015063	TTG	2	6	29790	29795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836405
579	NC_015063	TAG	2	6	29822	29827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836405
580	NC_015063	GA	3	6	30029	30034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015063	CATTT	2	10	30039	30048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_015063	TAT	2	6	30121	30126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015063	TG	3	6	30152	30157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015063	AAGA	2	8	30158	30165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015063	TAC	2	6	30176	30181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015063	AGAAA	2	10	30248	30257	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015063	TGA	2	6	30260	30265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015063	A	6	6	30265	30270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015063	ATAA	2	8	30503	30510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015063	TGA	2	6	30513	30518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015063	TAT	2	6	30519	30524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015063	AAG	2	6	30528	30533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015063	C	11	11	30561	30571	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
594	NC_015063	CA	3	6	30586	30591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015063	ACA	2	6	30714	30719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015063	GTG	2	6	30725	30730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015063	A	6	6	30746	30751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015063	A	6	6	30777	30782	100 %	0 %	0 %	0 %	322836406
599	NC_015063	CTT	2	6	30793	30798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836406
600	NC_015063	GTT	2	6	30809	30814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836406
601	NC_015063	TC	4	8	30822	30829	0 %	50 %	0 %	50 %	322836406
602	NC_015063	AGG	2	6	30839	30844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836406
603	NC_015063	ATCA	2	8	30884	30891	50 %	25 %	0 %	25 %	322836406
604	NC_015063	GCA	2	6	30933	30938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836406
605	NC_015063	GTTG	3	12	31052	31063	0 %	50 %	50 %	0 %	322836406
606	NC_015063	CGA	2	6	31096	31101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836406
607	NC_015063	TTC	2	6	31136	31141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836406
608	NC_015063	ACC	2	6	31152	31157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836406
609	NC_015063	CAGC	2	8	31188	31195	25 %	0 %	25 %	50 %	322836406
610	NC_015063	TAA	2	6	31226	31231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836406
611	NC_015063	TGG	2	6	31253	31258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836406
612	NC_015063	GGA	2	6	31462	31467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015063	CTG	2	6	31518	31523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836407
614	NC_015063	CTTGC	2	10	31524	31533	0 %	40 %	20 %	40 %	322836407
615	NC_015063	CAT	2	6	31558	31563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836407
616	NC_015063	AGC	2	6	31640	31645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836407
617	NC_015063	TGA	2	6	31675	31680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836407
618	NC_015063	CGC	2	6	31710	31715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836407
619	NC_015063	ATGT	2	8	31757	31764	25 %	50 %	25 %	0 %	322836407
620	NC_015063	CT	3	6	31794	31799	0 %	50 %	0 %	50 %	322836407
621	NC_015063	AAG	2	6	31835	31840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836407
622	NC_015063	ATGCTG	2	12	31859	31870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322836407
623	NC_015063	GCT	2	6	31871	31876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836407
624	NC_015063	TTA	2	6	31996	32001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836407
625	NC_015063	TGCG	2	8	32154	32161	0 %	25 %	50 %	25 %	322836407
626	NC_015063	AGT	2	6	32195	32200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015063	TAA	2	6	32233	32238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836408
628	NC_015063	AGC	2	6	32284	32289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836408
629	NC_015063	TGG	2	6	32376	32381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836408
630	NC_015063	TCC	2	6	32462	32467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836408
631	NC_015063	TGA	2	6	32518	32523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836408
632	NC_015063	ATA	2	6	32562	32567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836408
633	NC_015063	GCCT	2	8	32579	32586	0 %	25 %	25 %	50 %	322836408
634	NC_015063	AGA	2	6	32653	32658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836408
635	NC_015063	AT	3	6	32680	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	322836408
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