MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015062	A	6	6	123977	123982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_015062	T	7	7	123995	124001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_015062	AATT	2	8	124005	124012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_015062	TAT	2	6	124036	124041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015062	T	6	6	124044	124049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_015062	ATTT	2	8	124129	124136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015062	T	6	6	124134	124139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_015062	CTG	2	6	124209	124214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_015062	TA	3	6	124234	124239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_015062	GT	3	6	124257	124262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_015062	CGC	2	6	124265	124270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_015062	TGC	2	6	124309	124314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_015062	CAC	2	6	124335	124340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_015062	ATT	2	6	124358	124363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_015062	AC	3	6	124380	124385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_015062	ATT	2	6	124431	124436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015062	TAAG	2	8	124523	124530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015062	GC	3	6	124572	124577	0 %	0 %	50 %	50 %	322835245
2519	NC_015062	AC	3	6	124598	124603	50 %	0 %	0 %	50 %	322835245
2520	NC_015062	GGC	2	6	124605	124610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835245
2521	NC_015062	AGA	2	6	124615	124620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835245
2522	NC_015062	CCGT	2	8	124679	124686	0 %	25 %	25 %	50 %	322835245
2523	NC_015062	TAA	2	6	124712	124717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835245
2524	NC_015062	GAA	2	6	124800	124805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835245
2525	NC_015062	TC	3	6	124810	124815	0 %	50 %	0 %	50 %	322835245
2526	NC_015062	AATGA	2	10	124824	124833	60 %	20 %	20 %	0 %	322835245
2527	NC_015062	GC	3	6	124877	124882	0 %	0 %	50 %	50 %	322835245
2528	NC_015062	TTA	2	6	124902	124907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835245
2529	NC_015062	GTCA	2	8	125073	125080	25 %	25 %	25 %	25 %	322835246
2530	NC_015062	CTT	2	6	125093	125098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835246
2531	NC_015062	CCAG	2	8	125099	125106	25 %	0 %	25 %	50 %	322835246
2532	NC_015062	CGGTA	2	10	125133	125142	20 %	20 %	40 %	20 %	322835246
2533	NC_015062	ATC	2	6	125333	125338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835246
2534	NC_015062	CTG	2	6	125482	125487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2535	NC_015062	GAC	2	6	125500	125505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2536	NC_015062	ATC	2	6	125536	125541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835246
2537	NC_015062	GCG	2	6	125591	125596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835246
2538	NC_015062	CTG	2	6	125656	125661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2539	NC_015062	TCG	2	6	125702	125707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2540	NC_015062	TTC	2	6	125725	125730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835246
2541	NC_015062	GAA	2	6	125746	125751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835246
2542	NC_015062	GGC	2	6	125754	125759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835246
2543	NC_015062	ACT	2	6	125777	125782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835246
2544	NC_015062	CG	3	6	125858	125863	0 %	0 %	50 %	50 %	322835246
2545	NC_015062	GAA	2	6	125923	125928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835246
2546	NC_015062	TCA	2	6	126005	126010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835246
2547	NC_015062	GT	3	6	126021	126026	0 %	50 %	50 %	0 %	322835246
2548	NC_015062	GGCG	2	8	126045	126052	0 %	0 %	75 %	25 %	322835246
2549	NC_015062	TGA	2	6	126125	126130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835246
2550	NC_015062	GAATTT	2	12	126145	126156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	322835246
2551	NC_015062	TAC	2	6	126184	126189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835246
2552	NC_015062	CTT	2	6	126210	126215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835246
2553	NC_015062	CAC	2	6	126360	126365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835246
2554	NC_015062	CGT	2	6	126373	126378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2555	NC_015062	CTG	2	6	126379	126384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2556	NC_015062	GAACTG	2	12	126385	126396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322835246
2557	NC_015062	TGAC	2	8	126428	126435	25 %	25 %	25 %	25 %	322835246
2558	NC_015062	CGA	2	6	126441	126446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835246
2559	NC_015062	CTT	2	6	126513	126518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835246
2560	NC_015062	AAAGCG	2	12	126598	126609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322835246
2561	NC_015062	CAG	2	6	126676	126681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2562	NC_015062	CAG	3	9	126685	126693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2563	NC_015062	GTT	2	6	126739	126744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835247
2564	NC_015062	TGA	2	6	126774	126779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835247
2565	NC_015062	GATA	2	8	126846	126853	50 %	25 %	25 %	0 %	322835247
2566	NC_015062	AGC	2	6	126859	126864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2567	NC_015062	TCT	2	6	126867	126872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835247
2568	NC_015062	C	6	6	126873	126878	0 %	0 %	0 %	100 %	322835247
2569	NC_015062	CAG	2	6	126960	126965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2570	NC_015062	GAA	2	6	127051	127056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835247
2571	NC_015062	AGAAC	2	10	127104	127113	60 %	0 %	20 %	20 %	322835247
2572	NC_015062	GGC	2	6	127162	127167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835247
2573	NC_015062	TCC	2	6	127191	127196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835247
2574	NC_015062	TCA	2	6	127215	127220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835247
2575	NC_015062	CA	3	6	127251	127256	50 %	0 %	0 %	50 %	322835247
2576	NC_015062	CGC	3	9	127270	127278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835247
2577	NC_015062	GCT	2	6	127350	127355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2578	NC_015062	CTG	2	6	127459	127464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2579	NC_015062	AGCC	2	8	127569	127576	25 %	0 %	25 %	50 %	322835247
2580	NC_015062	CG	3	6	127583	127588	0 %	0 %	50 %	50 %	322835247
2581	NC_015062	CAG	2	6	127621	127626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835247
2582	NC_015062	AAT	2	6	127762	127767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835247
2583	NC_015062	GAAAT	2	10	127978	127987	60 %	20 %	20 %	0 %	322835248
2584	NC_015062	TGA	2	6	127994	127999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835248
2585	NC_015062	AGA	2	6	128054	128059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835248
2586	NC_015062	CT	3	6	128276	128281	0 %	50 %	0 %	50 %	322835248
2587	NC_015062	CAGG	2	8	128283	128290	25 %	0 %	50 %	25 %	322835248
2588	NC_015062	TGC	2	6	128320	128325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835248
2589	NC_015062	CGC	2	6	128441	128446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835248
2590	NC_015062	CGGG	2	8	128453	128460	0 %	0 %	75 %	25 %	322835248
2591	NC_015062	GTG	2	6	128475	128480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835248
2592	NC_015062	ATT	2	6	128528	128533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835248
2593	NC_015062	TGG	2	6	128586	128591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835248
2594	NC_015062	TGT	2	6	128714	128719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835249
2595	NC_015062	GCC	2	6	128740	128745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835249
2596	NC_015062	TCA	2	6	128768	128773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835249
2597	NC_015062	ATG	2	6	128816	128821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835249
2598	NC_015062	TCG	2	6	128825	128830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2599	NC_015062	GAC	2	6	128835	128840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2600	NC_015062	TACGG	2	10	128928	128937	20 %	20 %	40 %	20 %	322835249
2601	NC_015062	AGAC	2	8	128963	128970	50 %	0 %	25 %	25 %	322835249
2602	NC_015062	TGCCG	2	10	129088	129097	0 %	20 %	40 %	40 %	322835249
2603	NC_015062	CAG	2	6	129115	129120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2604	NC_015062	GCTG	2	8	129173	129180	0 %	25 %	50 %	25 %	322835249
2605	NC_015062	AACGG	2	10	129181	129190	40 %	0 %	40 %	20 %	322835249
2606	NC_015062	GAC	2	6	129238	129243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2607	NC_015062	CTG	2	6	129259	129264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2608	NC_015062	TGA	2	6	129366	129371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835249
2609	NC_015062	GCA	2	6	129375	129380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2610	NC_015062	TTC	2	6	129404	129409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835249
2611	NC_015062	CCGTGG	2	12	129410	129421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322835249
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2613	NC_015062	AG	3	6	129519	129524	50 %	0 %	50 %	0 %	322835249
2614	NC_015062	GCT	2	6	129561	129566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2615	NC_015062	ATG	2	6	129625	129630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835249
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2618	NC_015062	GCA	2	6	129867	129872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2619	NC_015062	TCC	2	6	129891	129896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835249
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2621	NC_015062	AC	3	6	129924	129929	50 %	0 %	0 %	50 %	322835249
2622	NC_015062	CTCA	2	8	129996	130003	25 %	25 %	0 %	50 %	322835249
2623	NC_015062	GGCT	2	8	130045	130052	0 %	25 %	50 %	25 %	322835249
2624	NC_015062	TGG	2	6	130058	130063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835249
2625	NC_015062	AC	3	6	130068	130073	50 %	0 %	0 %	50 %	322835249
2626	NC_015062	CAA	2	6	130214	130219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835249
2627	NC_015062	CGT	2	6	130249	130254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835249
2628	NC_015062	TCA	2	6	130312	130317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835249
2629	NC_015062	TGAT	2	8	130320	130327	25 %	50 %	25 %	0 %	322835249
2630	NC_015062	GAC	2	6	130389	130394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835250
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2634	NC_015062	CTG	2	6	130609	130614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835250
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2641	NC_015062	CTG	2	6	130877	130882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2642	NC_015062	CAAA	2	8	130917	130924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2643	NC_015062	A	6	6	130997	131002	100 %	0 %	0 %	0 %	322835251
2644	NC_015062	TCAG	2	8	131021	131028	25 %	25 %	25 %	25 %	322835251
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2648	NC_015062	CGC	2	6	131181	131186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835251
2649	NC_015062	CTG	2	6	131220	131225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835251
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2652	NC_015062	CTG	2	6	131358	131363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835251
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2683	NC_015062	TGA	2	6	133204	133209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835251
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2697	NC_015062	TCAG	2	8	134044	134051	25 %	25 %	25 %	25 %	322835252
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2702	NC_015062	GTC	2	6	134372	134377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835252
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2705	NC_015062	AATG	2	8	134572	134579	50 %	25 %	25 %	0 %	322835252
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2708	NC_015062	CTTC	2	8	134654	134661	0 %	50 %	0 %	50 %	322835252
2709	NC_015062	CTG	2	6	134681	134686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835252
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2712	NC_015062	CGA	2	6	134902	134907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835252
2713	NC_015062	CA	3	6	135072	135077	50 %	0 %	0 %	50 %	322835252
2714	NC_015062	CGA	2	6	135091	135096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835252
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2718	NC_015062	AGA	2	6	135319	135324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835252
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2722	NC_015062	AAC	2	6	135722	135727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835252
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2724	NC_015062	A	6	6	135800	135805	100 %	0 %	0 %	0 %	322835252
2725	NC_015062	CGG	3	9	135817	135825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835252
2726	NC_015062	TGG	2	6	135912	135917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835252
2727	NC_015062	GA	3	6	136020	136025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2728	NC_015062	AAAAC	2	10	136125	136134	80 %	0 %	0 %	20 %	322835253
2729	NC_015062	AGA	2	6	136210	136215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835253
2730	NC_015062	AT	3	6	136249	136254	50 %	50 %	0 %	0 %	322835253
2731	NC_015062	A	6	6	136298	136303	100 %	0 %	0 %	0 %	322835253
2732	NC_015062	AAT	2	6	136313	136318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835253
2733	NC_015062	A	7	7	136337	136343	100 %	0 %	0 %	0 %	322835253
2734	NC_015062	AGGA	2	8	136365	136372	50 %	0 %	50 %	0 %	322835253
2735	NC_015062	TAT	2	6	136426	136431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835253
2736	NC_015062	A	7	7	136565	136571	100 %	0 %	0 %	0 %	322835253
2737	NC_015062	CTA	2	6	136648	136653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835254
2738	NC_015062	A	6	6	136702	136707	100 %	0 %	0 %	0 %	322835254
2739	NC_015062	ATT	2	6	136764	136769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835254
2740	NC_015062	CCA	2	6	136773	136778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835254
2741	NC_015062	TTG	2	6	136827	136832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835254
2742	NC_015062	ATA	2	6	136861	136866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835254
2743	NC_015062	ACC	2	6	136893	136898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835254
2744	NC_015062	TGT	2	6	136922	136927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835254
2745	NC_015062	GA	3	6	137077	137082	50 %	0 %	50 %	0 %	322835254
2746	NC_015062	A	7	7	137086	137092	100 %	0 %	0 %	0 %	322835254
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2753	NC_015062	GA	3	6	137575	137580	50 %	0 %	50 %	0 %	322835254
2754	NC_015062	GAAA	2	8	137598	137605	75 %	0 %	25 %	0 %	322835254
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2756	NC_015062	A	6	6	137790	137795	100 %	0 %	0 %	0 %	322835254
2757	NC_015062	ACA	2	6	137850	137855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835254
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2765	NC_015062	A	7	7	138314	138320	100 %	0 %	0 %	0 %	322835254
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2988	NC_015062	GC	3	6	150983	150988	0 %	0 %	50 %	50 %	322835264
2989	NC_015062	GCGCC	2	10	150998	151007	0 %	0 %	40 %	60 %	322835264
2990	NC_015062	CGC	3	9	151068	151076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264
2991	NC_015062	ATC	2	6	151124	151129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835264
2992	NC_015062	CAC	2	6	151149	151154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835264
2993	NC_015062	TCG	2	6	151241	151246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835264
2994	NC_015062	ACC	2	6	151326	151331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835264
2995	NC_015062	CCCGA	2	10	151377	151386	20 %	0 %	20 %	60 %	322835264
2996	NC_015062	CGG	2	6	151454	151459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
2997	NC_015062	CGG	2	6	151503	151508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
2998	NC_015062	ACGGCT	2	12	151511	151522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322835264
2999	NC_015062	CGG	2	6	151569	151574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835264
3000	NC_015062	CGC	3	9	151596	151604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835264

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