MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015062	CTGA	2	8	75358	75365	25 %	25 %	25 %	25 %	322835190
1502	NC_015062	GTTG	2	8	75394	75401	0 %	50 %	50 %	0 %	322835190
1503	NC_015062	TGC	2	6	75514	75519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835190
1504	NC_015062	AACTG	2	10	75526	75535	40 %	20 %	20 %	20 %	322835190
1505	NC_015062	CG	3	6	75551	75556	0 %	0 %	50 %	50 %	322835190
1506	NC_015062	CGC	2	6	75641	75646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835190
1507	NC_015062	TC	3	6	75651	75656	0 %	50 %	0 %	50 %	322835190
1508	NC_015062	CGT	2	6	75670	75675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835190
1509	NC_015062	ATTGA	2	10	75995	76004	40 %	40 %	20 %	0 %	322835190
1510	NC_015062	CAG	2	6	76025	76030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835190
1511	NC_015062	GGT	2	6	76151	76156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835190
1512	NC_015062	CTG	2	6	76219	76224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835190
1513	NC_015062	CCG	2	6	76248	76253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835190
1514	NC_015062	TCT	2	6	76308	76313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835190
1515	NC_015062	TAAA	2	8	76318	76325	75 %	25 %	0 %	0 %	322835190
1516	NC_015062	AGC	2	6	76527	76532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835190
1517	NC_015062	TCCA	2	8	76538	76545	25 %	25 %	0 %	50 %	322835190
1518	NC_015062	ATTG	2	8	76551	76558	25 %	50 %	25 %	0 %	322835190
1519	NC_015062	GCC	3	9	76568	76576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835190
1520	NC_015062	ATC	2	6	76631	76636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835190
1521	NC_015062	GCGT	2	8	76651	76658	0 %	25 %	50 %	25 %	322835190
1522	NC_015062	GAA	2	6	76662	76667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835190
1523	NC_015062	GGTTGC	2	12	76694	76705	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322835190
1524	NC_015062	A	7	7	76720	76726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015062	GCC	2	6	76728	76733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_015062	ATT	2	6	76768	76773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835191
1527	NC_015062	TCT	2	6	76779	76784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835191
1528	NC_015062	CGG	2	6	76795	76800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835191
1529	NC_015062	CGC	2	6	76810	76815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835191
1530	NC_015062	AAG	2	6	76835	76840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835191
1531	NC_015062	CGG	2	6	76930	76935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835191
1532	NC_015062	CGC	2	6	76960	76965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835191
1533	NC_015062	CAC	3	9	76999	77007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835191
1534	NC_015062	CAA	2	6	77029	77034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835191
1535	NC_015062	TTGT	2	8	77056	77063	0 %	75 %	25 %	0 %	322835191
1536	NC_015062	ATC	2	6	77138	77143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835191
1537	NC_015062	TTTC	2	8	77156	77163	0 %	75 %	0 %	25 %	322835191
1538	NC_015062	T	7	7	77191	77197	0 %	100 %	0 %	0 %	322835191
1539	NC_015062	AT	3	6	77208	77213	50 %	50 %	0 %	0 %	322835191
1540	NC_015062	A	7	7	77359	77365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015062	ATTA	2	8	77386	77393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015062	TA	3	6	77448	77453	50 %	50 %	0 %	0 %	322835192
1543	NC_015062	AAT	2	6	77475	77480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835192
1544	NC_015062	ACATT	2	10	77507	77516	40 %	40 %	0 %	20 %	322835192
1545	NC_015062	TTAC	2	8	77524	77531	25 %	50 %	0 %	25 %	322835192
1546	NC_015062	TTA	2	6	77551	77556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835192
1547	NC_015062	GTC	2	6	77604	77609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835192
1548	NC_015062	CCA	3	9	77644	77652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835192
1549	NC_015062	TTGT	2	8	77658	77665	0 %	75 %	25 %	0 %	322835192
1550	NC_015062	T	6	6	77732	77737	0 %	100 %	0 %	0 %	322835192
1551	NC_015062	CTT	2	6	77799	77804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835192
1552	NC_015062	TAAGT	2	10	77820	77829	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015062	CT	3	6	77876	77881	0 %	50 %	0 %	50 %	322835193
1554	NC_015062	GTTC	2	8	77923	77930	0 %	50 %	25 %	25 %	322835193
1555	NC_015062	CCG	2	6	77941	77946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835193
1556	NC_015062	TGG	2	6	78069	78074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835193
1557	NC_015062	CAG	2	6	78106	78111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835193
1558	NC_015062	CAC	2	6	78145	78150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835193
1559	NC_015062	GT	3	6	78186	78191	0 %	50 %	50 %	0 %	322835193
1560	NC_015062	CG	3	6	78272	78277	0 %	0 %	50 %	50 %	322835193
1561	NC_015062	AG	3	6	78615	78620	50 %	0 %	50 %	0 %	322835194
1562	NC_015062	GCC	2	6	78632	78637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835194
1563	NC_015062	GTT	2	6	78650	78655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835194
1564	NC_015062	CGAAG	2	10	78661	78670	40 %	0 %	40 %	20 %	322835194
1565	NC_015062	CGAG	2	8	78706	78713	25 %	0 %	50 %	25 %	322835194
1566	NC_015062	AG	3	6	78811	78816	50 %	0 %	50 %	0 %	322835194
1567	NC_015062	ATC	2	6	78837	78842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835194
1568	NC_015062	GCT	2	6	78863	78868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1569	NC_015062	CCG	2	6	78949	78954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835194
1570	NC_015062	CAC	2	6	79016	79021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835194
1571	NC_015062	CAGT	2	8	79084	79091	25 %	25 %	25 %	25 %	322835194
1572	NC_015062	GCCGCT	2	12	79103	79114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322835194
1573	NC_015062	CCA	2	6	79172	79177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835194
1574	NC_015062	GCAG	2	8	79188	79195	25 %	0 %	50 %	25 %	322835194
1575	NC_015062	TCG	2	6	79203	79208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1576	NC_015062	AT	3	6	79227	79232	50 %	50 %	0 %	0 %	322835194
1577	NC_015062	TGC	2	6	79271	79276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1578	NC_015062	CGG	2	6	79294	79299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835194
1579	NC_015062	AGAC	2	8	79307	79314	50 %	0 %	25 %	25 %	322835194
1580	NC_015062	GCT	2	6	79383	79388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1581	NC_015062	TCG	2	6	79426	79431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1582	NC_015062	GC	3	6	79432	79437	0 %	0 %	50 %	50 %	322835194
1583	NC_015062	TGTTC	2	10	79438	79447	0 %	60 %	20 %	20 %	322835194
1584	NC_015062	TCA	2	6	79492	79497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835194
1585	NC_015062	CAG	2	6	79528	79533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1586	NC_015062	GCC	2	6	79557	79562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835194
1587	NC_015062	ACCC	2	8	79587	79594	25 %	0 %	0 %	75 %	322835194
1588	NC_015062	CAGC	2	8	79597	79604	25 %	0 %	25 %	50 %	322835194
1589	NC_015062	TAA	2	6	79606	79611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835194
1590	NC_015062	GC	3	6	79635	79640	0 %	0 %	50 %	50 %	322835194
1591	NC_015062	TTG	2	6	79679	79684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835194
1592	NC_015062	TCG	2	6	79714	79719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1593	NC_015062	GT	4	8	79802	79809	0 %	50 %	50 %	0 %	322835194
1594	NC_015062	TTG	2	6	79942	79947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835194
1595	NC_015062	GCC	2	6	79970	79975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835194
1596	NC_015062	GC	3	6	80049	80054	0 %	0 %	50 %	50 %	322835194
1597	NC_015062	GCA	2	6	80118	80123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835194
1598	NC_015062	C	6	6	80264	80269	0 %	0 %	0 %	100 %	322835195
1599	NC_015062	TGC	2	6	80403	80408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835195
1600	NC_015062	CTC	2	6	80500	80505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835195
1601	NC_015062	TGGG	2	8	80585	80592	0 %	25 %	75 %	0 %	322835195
1602	NC_015062	CATTG	2	10	80647	80656	20 %	40 %	20 %	20 %	322835196
1603	NC_015062	TCA	2	6	80721	80726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835196
1604	NC_015062	CTCAT	2	10	80735	80744	20 %	40 %	0 %	40 %	322835196
1605	NC_015062	GAT	2	6	80791	80796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835196
1606	NC_015062	TGC	2	6	80818	80823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835196
1607	NC_015062	TGC	2	6	80833	80838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835196
1608	NC_015062	GCC	3	9	80857	80865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835196
1609	NC_015062	CAT	2	6	80893	80898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835196
1610	NC_015062	CCT	2	6	80934	80939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835196
1611	NC_015062	CCG	2	6	80957	80962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835196
1612	NC_015062	CCG	2	6	80990	80995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835196
1613	NC_015062	C	6	6	81008	81013	0 %	0 %	0 %	100 %	322835196
1614	NC_015062	ACC	2	6	81034	81039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835196
1615	NC_015062	AAGC	2	8	81045	81052	50 %	0 %	25 %	25 %	322835196
1616	NC_015062	GCC	2	6	81070	81075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835196
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1618	NC_015062	CCCAT	2	10	81123	81132	20 %	20 %	0 %	60 %	322835196
1619	NC_015062	CTGA	2	8	81135	81142	25 %	25 %	25 %	25 %	322835196
1620	NC_015062	CCA	2	6	81153	81158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835196
1621	NC_015062	TAA	2	6	81189	81194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835196
1622	NC_015062	CTG	2	6	81286	81291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835196
1623	NC_015062	C	6	6	81330	81335	0 %	0 %	0 %	100 %	322835196
1624	NC_015062	TCT	2	6	81377	81382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835196
1625	NC_015062	CAT	2	6	81384	81389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835196
1626	NC_015062	TGT	2	6	81398	81403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835196
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1628	NC_015062	GCC	2	6	81470	81475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835196
1629	NC_015062	GCG	2	6	81521	81526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835196
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1737	NC_015062	GAG	2	6	86113	86118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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