MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015062	CAC	2	6	23303	23308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835146
502	NC_015062	CGG	2	6	23401	23406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835146
503	NC_015062	A	6	6	23542	23547	100 %	0 %	0 %	0 %	322835146
504	NC_015062	TAA	2	6	23554	23559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835146
505	NC_015062	CG	3	6	23589	23594	0 %	0 %	50 %	50 %	322835146
506	NC_015062	GAT	2	6	23705	23710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835146
507	NC_015062	ATC	2	6	23773	23778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835146
508	NC_015062	CGG	2	6	23787	23792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835146
509	NC_015062	TCA	2	6	23819	23824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835146
510	NC_015062	TGC	2	6	23835	23840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835146
511	NC_015062	CTC	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835146
512	NC_015062	CGG	2	6	23927	23932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835146
513	NC_015062	CCG	2	6	23999	24004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835146
514	NC_015062	CGT	2	6	24032	24037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835146
515	NC_015062	GCC	2	6	24054	24059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835146
516	NC_015062	CGC	2	6	24099	24104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835146
517	NC_015062	TGG	2	6	24167	24172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835146
518	NC_015062	TGAC	2	8	24189	24196	25 %	25 %	25 %	25 %	322835146
519	NC_015062	GTT	2	6	24399	24404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835147
520	NC_015062	GTG	2	6	24407	24412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835147
521	NC_015062	GAC	2	6	24472	24477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
522	NC_015062	TTC	2	6	24517	24522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835147
523	NC_015062	GCCC	2	8	24561	24568	0 %	0 %	25 %	75 %	322835147
524	NC_015062	CAC	2	6	24595	24600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835147
525	NC_015062	CAGCGC	2	12	24652	24663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322835147
526	NC_015062	CGA	2	6	24836	24841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
527	NC_015062	CGC	2	6	24903	24908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835147
528	NC_015062	TACCGA	2	12	24912	24923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322835147
529	NC_015062	TGC	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835147
530	NC_015062	GCA	2	6	24984	24989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
531	NC_015062	GCA	2	6	25098	25103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
532	NC_015062	GCT	2	6	25114	25119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835147
533	NC_015062	TCG	2	6	25134	25139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835147
534	NC_015062	GCA	2	6	25149	25154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
535	NC_015062	ATG	2	6	25160	25165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835147
536	NC_015062	CA	3	6	25209	25214	50 %	0 %	0 %	50 %	322835147
537	NC_015062	AC	3	6	25239	25244	50 %	0 %	0 %	50 %	322835147
538	NC_015062	TCT	2	6	25308	25313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835147
539	NC_015062	TCT	2	6	25331	25336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835147
540	NC_015062	AG	3	6	25354	25359	50 %	0 %	50 %	0 %	322835147
541	NC_015062	ACA	2	6	25362	25367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835147
542	NC_015062	CAT	2	6	25669	25674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835147
543	NC_015062	GAA	2	6	25696	25701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835147
544	NC_015062	CGG	3	9	25703	25711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835147
545	NC_015062	GA	3	6	25751	25756	50 %	0 %	50 %	0 %	322835147
546	NC_015062	GAT	2	6	25786	25791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835147
547	NC_015062	AGC	2	6	25823	25828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
548	NC_015062	CAG	2	6	25858	25863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
549	NC_015062	CCG	2	6	25907	25912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835147
550	NC_015062	TAAA	2	8	25932	25939	75 %	25 %	0 %	0 %	322835147
551	NC_015062	AG	3	6	25973	25978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015062	GTTTT	2	10	26000	26009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015062	TA	3	6	26026	26031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015062	ATGA	2	8	26038	26045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015062	CAG	2	6	26074	26079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015062	GGC	2	6	26082	26087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015062	G	6	6	26278	26283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015062	TCA	2	6	26383	26388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835148
559	NC_015062	TGCAC	2	10	26609	26618	20 %	20 %	20 %	40 %	322835148
560	NC_015062	CAG	3	9	26652	26660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835148
561	NC_015062	AAC	2	6	26671	26676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835148
562	NC_015062	GCC	2	6	26742	26747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835148
563	NC_015062	TCC	2	6	26759	26764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835148
564	NC_015062	AGC	2	6	26803	26808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835148
565	NC_015062	TCC	2	6	26812	26817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835148
566	NC_015062	CAC	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835148
567	NC_015062	CAG	2	6	27104	27109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835148
568	NC_015062	GCAC	2	8	27206	27213	25 %	0 %	25 %	50 %	322835148
569	NC_015062	AGA	2	6	27223	27228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835148
570	NC_015062	T	7	7	27254	27260	0 %	100 %	0 %	0 %	322835148
571	NC_015062	TTC	2	6	27267	27272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835148
572	NC_015062	AAT	2	6	27347	27352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015062	TGA	2	6	27496	27501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015062	CAT	2	6	27518	27523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015062	TGA	2	6	27590	27595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015062	CAG	2	6	27601	27606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015062	TGA	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835149
578	NC_015062	ATT	2	6	27629	27634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835149
579	NC_015062	ACT	2	6	27635	27640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835149
580	NC_015062	ACC	2	6	27698	27703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835149
581	NC_015062	CTA	2	6	27715	27720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835149
582	NC_015062	A	6	6	27724	27729	100 %	0 %	0 %	0 %	322835149
583	NC_015062	GCT	2	6	27754	27759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
584	NC_015062	CCA	2	6	27764	27769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835149
585	NC_015062	T	6	6	27790	27795	0 %	100 %	0 %	0 %	322835149
586	NC_015062	GTC	2	6	27822	27827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
587	NC_015062	TGC	2	6	27828	27833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
588	NC_015062	GGC	2	6	27856	27861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835149
589	NC_015062	AGA	2	6	27862	27867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835149
590	NC_015062	GTG	2	6	27885	27890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835149
591	NC_015062	CTG	2	6	27959	27964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
592	NC_015062	ACC	2	6	28067	28072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835149
593	NC_015062	CG	3	6	28255	28260	0 %	0 %	50 %	50 %	322835149
594	NC_015062	TCG	2	6	28263	28268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
595	NC_015062	AGT	2	6	28276	28281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835149
596	NC_015062	AGA	2	6	28333	28338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835149
597	NC_015062	AGC	2	6	28347	28352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835149
598	NC_015062	TC	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015062	T	6	6	28451	28456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015062	ACT	2	6	28573	28578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835150
601	NC_015062	TCA	2	6	28693	28698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835150
602	NC_015062	CCA	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835150
603	NC_015062	GGA	2	6	28819	28824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835150
604	NC_015062	GCGT	2	8	28851	28858	0 %	25 %	50 %	25 %	322835150
605	NC_015062	GAT	2	6	29032	29037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835151
606	NC_015062	CA	3	6	29141	29146	50 %	0 %	0 %	50 %	322835151
607	NC_015062	TTG	2	6	29205	29210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835151
608	NC_015062	GAT	2	6	29321	29326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835151
609	NC_015062	GTT	2	6	29455	29460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835151
610	NC_015062	TTTTTA	2	12	29578	29589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	322835152
611	NC_015062	TAC	2	6	29595	29600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835152
612	NC_015062	CTG	2	6	29601	29606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835152
613	NC_015062	GGCT	2	8	29619	29626	0 %	25 %	50 %	25 %	322835152
614	NC_015062	GATT	2	8	29627	29634	25 %	50 %	25 %	0 %	322835152
615	NC_015062	ATT	2	6	29665	29670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835152
616	NC_015062	TGA	2	6	29680	29685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835152
617	NC_015062	C	7	7	29701	29707	0 %	0 %	0 %	100 %	322835152
618	NC_015062	GAT	2	6	29724	29729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835152
619	NC_015062	TTG	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835152
620	NC_015062	AGGC	2	8	29806	29813	25 %	0 %	50 %	25 %	322835152
621	NC_015062	TTAT	2	8	29898	29905	25 %	75 %	0 %	0 %	322835153
622	NC_015062	GTT	2	6	29933	29938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835153
623	NC_015062	TCA	2	6	30019	30024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835153
624	NC_015062	CTG	2	6	30090	30095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835153
625	NC_015062	CAC	2	6	30096	30101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835153
626	NC_015062	TTGA	2	8	30108	30115	25 %	50 %	25 %	0 %	322835153
627	NC_015062	GC	3	6	30119	30124	0 %	0 %	50 %	50 %	322835153
628	NC_015062	GCCC	2	8	30245	30252	0 %	0 %	25 %	75 %	322835153
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656	NC_015062	CA	3	6	31185	31190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
657	NC_015062	TAA	2	6	31194	31199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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737	NC_015062	GT	3	6	35385	35390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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750	NC_015062	GAT	2	6	36035	36040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835158
751	NC_015062	TCAG	2	8	36157	36164	25 %	25 %	25 %	25 %	322835158
752	NC_015062	CCG	2	6	36181	36186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835158
753	NC_015062	GTG	2	6	36210	36215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835158
754	NC_015062	GCCGT	2	10	36342	36351	0 %	20 %	40 %	40 %	322835158
755	NC_015062	CTG	2	6	36354	36359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835158
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757	NC_015062	CGC	2	6	36460	36465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835158
758	NC_015062	CGT	2	6	36471	36476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835158
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