MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015062	CTGG	2	8	399129	399136	0 %	25 %	50 %	25 %	322835500
8002	NC_015062	GGC	2	6	399241	399246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835500
8003	NC_015062	ACG	2	6	399266	399271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835500
8004	NC_015062	GGC	2	6	399288	399293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835500
8005	NC_015062	GCG	2	6	399440	399445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835500
8006	NC_015062	ACG	2	6	399463	399468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835500
8007	NC_015062	CCA	2	6	399470	399475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835500
8008	NC_015062	CTT	2	6	399504	399509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835500
8009	NC_015062	CTT	2	6	399549	399554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835500
8010	NC_015062	CG	3	6	399569	399574	0 %	0 %	50 %	50 %	322835500
8011	NC_015062	GGC	2	6	399582	399587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835500
8012	NC_015062	GAC	2	6	399610	399615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835500
8013	NC_015062	TTA	2	6	399618	399623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835500
8014	NC_015062	GGCA	2	8	399711	399718	25 %	0 %	50 %	25 %	322835500
8015	NC_015062	GCA	2	6	399722	399727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835500
8016	NC_015062	TCC	2	6	399787	399792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835500
8017	NC_015062	GCG	2	6	399811	399816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835500
8018	NC_015062	GCA	2	6	399827	399832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835500
8019	NC_015062	TCA	2	6	399938	399943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835500
8020	NC_015062	ATT	2	6	399975	399980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835500
8021	NC_015062	TAA	3	9	400207	400215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835500
8022	NC_015062	TTA	2	6	400231	400236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_015062	AAAT	2	8	400263	400270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_015062	ATG	2	6	400293	400298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_015062	CAT	2	6	400325	400330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_015062	TTG	2	6	400343	400348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_015062	TTC	2	6	400352	400357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_015062	CTT	2	6	400384	400389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_015062	CAG	2	6	400405	400410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_015062	ATT	2	6	400420	400425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835501
8031	NC_015062	TTC	2	6	400500	400505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835501
8032	NC_015062	CA	4	8	400558	400565	50 %	0 %	0 %	50 %	322835501
8033	NC_015062	TTCTG	2	10	400568	400577	0 %	60 %	20 %	20 %	322835501
8034	NC_015062	TCG	2	6	400623	400628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835501
8035	NC_015062	GCG	2	6	400678	400683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835501
8036	NC_015062	CCT	2	6	400886	400891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_015062	CGC	3	9	400911	400919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835502
8038	NC_015062	GGTC	2	8	400977	400984	0 %	25 %	50 %	25 %	322835502
8039	NC_015062	GCG	2	6	401053	401058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835502
8040	NC_015062	TGC	2	6	401096	401101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8041	NC_015062	CATC	2	8	401106	401113	25 %	25 %	0 %	50 %	322835502
8042	NC_015062	CGG	2	6	401132	401137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835502
8043	NC_015062	GCC	2	6	401245	401250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835502
8044	NC_015062	AGGC	2	8	401260	401267	25 %	0 %	50 %	25 %	322835502
8045	NC_015062	CA	3	6	401288	401293	50 %	0 %	0 %	50 %	322835502
8046	NC_015062	TGC	2	6	401295	401300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8047	NC_015062	CTG	2	6	401327	401332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8048	NC_015062	GAA	2	6	401368	401373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835502
8049	NC_015062	GCG	2	6	401443	401448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835502
8050	NC_015062	CGA	3	9	401458	401466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8051	NC_015062	CGG	2	6	401472	401477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835502
8052	NC_015062	CGCC	2	8	401547	401554	0 %	0 %	25 %	75 %	322835502
8053	NC_015062	CTG	2	6	401620	401625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8054	NC_015062	GCC	2	6	401679	401684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835502
8055	NC_015062	CCG	2	6	401706	401711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835502
8056	NC_015062	TGT	2	6	401748	401753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835502
8057	NC_015062	CCG	2	6	401754	401759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835502
8058	NC_015062	GCCA	2	8	401831	401838	25 %	0 %	25 %	50 %	322835502
8059	NC_015062	CTG	2	6	401897	401902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8060	NC_015062	CGG	2	6	401913	401918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835502
8061	NC_015062	GCT	3	9	401923	401931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835502
8062	NC_015062	GGC	2	6	402025	402030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835502
8063	NC_015062	CCA	2	6	402084	402089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835502
8064	NC_015062	GC	3	6	402100	402105	0 %	0 %	50 %	50 %	322835502
8065	NC_015062	ATG	2	6	402113	402118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835502
8066	NC_015062	GTG	2	6	402140	402145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835502
8067	NC_015062	GCTG	2	8	402149	402156	0 %	25 %	50 %	25 %	322835502
8068	NC_015062	ATA	2	6	402254	402259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835502
8069	NC_015062	T	6	6	402312	402317	0 %	100 %	0 %	0 %	322835503
8070	NC_015062	GAA	2	6	402327	402332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835503
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8080	NC_015062	GCG	2	6	402733	402738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835503
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8106	NC_015062	GC	3	6	404063	404068	0 %	0 %	50 %	50 %	322835503
8107	NC_015062	CGGG	2	8	404104	404111	0 %	0 %	75 %	25 %	322835503
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8246	NC_015062	AGC	2	6	410041	410046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835508
8247	NC_015062	GCG	2	6	410090	410095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835508
8248	NC_015062	TGCG	2	8	410187	410194	0 %	25 %	50 %	25 %	322835508
8249	NC_015062	AGC	2	6	410292	410297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835509
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8254	NC_015062	GAT	2	6	410507	410512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835509
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8258	NC_015062	ACGGC	2	10	410715	410724	20 %	0 %	40 %	40 %	322835509
8259	NC_015062	CTG	2	6	410801	410806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835509
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8261	NC_015062	ACTG	2	8	411050	411057	25 %	25 %	25 %	25 %	322835510
8262	NC_015062	TGT	2	6	411063	411068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835510
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8267	NC_015062	CTG	3	9	411214	411222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835510
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8278	NC_015062	GAG	2	6	411638	411643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8280	NC_015062	TGT	2	6	411694	411699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8285	NC_015062	CGGT	2	8	411842	411849	0 %	25 %	50 %	25 %	322835511
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8326	NC_015062	TGCA	2	8	414218	414225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8331	NC_015062	A	8	8	414341	414348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8332	NC_015062	GTAC	2	8	414483	414490	25 %	25 %	25 %	25 %	322835512
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8339	NC_015062	ACG	2	6	414775	414780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835512
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8345	NC_015062	AT	3	6	415186	415191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8346	NC_015062	AG	3	6	415215	415220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8347	NC_015062	CGA	2	6	415361	415366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835513
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8351	NC_015062	CGC	2	6	415513	415518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835513
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8355	NC_015062	ATC	2	6	415650	415655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835513
8356	NC_015062	ACC	2	6	415659	415664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835513
8357	NC_015062	CGG	2	6	415705	415710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835513
8358	NC_015062	GGC	2	6	415739	415744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835513
8359	NC_015062	GTGAAA	2	12	415770	415781	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	322835513
8360	NC_015062	GAT	2	6	415806	415811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835513
8361	NC_015062	CGG	2	6	415876	415881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835513
8362	NC_015062	A	6	6	415884	415889	100 %	0 %	0 %	0 %	322835513
8363	NC_015062	CCTGCC	2	12	415898	415909	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	322835513
8364	NC_015062	TAC	2	6	415920	415925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835513
8365	NC_015062	ATT	2	6	415969	415974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835513
8366	NC_015062	TGGAT	2	10	415988	415997	20 %	40 %	40 %	0 %	322835513
8367	NC_015062	TG	3	6	416013	416018	0 %	50 %	50 %	0 %	322835513
8368	NC_015062	ATA	2	6	416029	416034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835513
8369	NC_015062	GAT	2	6	416041	416046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835514
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8371	NC_015062	CTG	2	6	416096	416101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835514
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8491	NC_015062	A	6	6	421865	421870	100 %	0 %	0 %	0 %	322835522
8492	NC_015062	GGC	2	6	421875	421880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835522
8493	NC_015062	ATT	2	6	421891	421896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835522
8494	NC_015062	GTG	2	6	421922	421927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835522
8495	NC_015062	AGAA	2	8	421935	421942	75 %	0 %	25 %	0 %	322835522
8496	NC_015062	TGAG	2	8	421953	421960	25 %	25 %	50 %	0 %	322835522
8497	NC_015062	CG	3	6	422004	422009	0 %	0 %	50 %	50 %	322835522
8498	NC_015062	CTG	2	6	422093	422098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835522
8499	NC_015062	GGC	2	6	422126	422131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835522
8500	NC_015062	CGTC	2	8	422234	422241	0 %	25 %	25 %	50 %	322835522

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