MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015062	CCA	2	6	273261	273266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835393
5502	NC_015062	CCA	2	6	273282	273287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835393
5503	NC_015062	CAC	2	6	273310	273315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835393
5504	NC_015062	ATC	2	6	273320	273325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835393
5505	NC_015062	CCGG	2	8	273342	273349	0 %	0 %	50 %	50 %	322835393
5506	NC_015062	GAT	2	6	273370	273375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835393
5507	NC_015062	ACC	2	6	273416	273421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835393
5508	NC_015062	GGGC	2	8	273627	273634	0 %	0 %	75 %	25 %	322835393
5509	NC_015062	CGG	2	6	273657	273662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835393
5510	NC_015062	CAC	2	6	273702	273707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835393
5511	NC_015062	ATC	3	9	273752	273760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835393
5512	NC_015062	CCA	2	6	273894	273899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835393
5513	NC_015062	CAG	2	6	274068	274073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835393
5514	NC_015062	AGC	2	6	274091	274096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835393
5515	NC_015062	CGC	2	6	274125	274130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835393
5516	NC_015062	CAG	2	6	274153	274158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835393
5517	NC_015062	GCA	2	6	274250	274255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835394
5518	NC_015062	GGC	2	6	274303	274308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835394
5519	NC_015062	CGG	2	6	274346	274351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835394
5520	NC_015062	CG	4	8	274376	274383	0 %	0 %	50 %	50 %	322835394
5521	NC_015062	CAA	2	6	274410	274415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835394
5522	NC_015062	GGT	2	6	274425	274430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835394
5523	NC_015062	CCG	2	6	274525	274530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835394
5524	NC_015062	ATC	2	6	274551	274556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835394
5525	NC_015062	ATG	2	6	274594	274599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835394
5526	NC_015062	CGC	2	6	274610	274615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835394
5527	NC_015062	CG	3	6	274732	274737	0 %	0 %	50 %	50 %	322835394
5528	NC_015062	CAGCGC	2	12	274755	274766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322835394
5529	NC_015062	TC	3	6	274811	274816	0 %	50 %	0 %	50 %	322835394
5530	NC_015062	CGG	2	6	274817	274822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835394
5531	NC_015062	TG	3	6	274916	274921	0 %	50 %	50 %	0 %	322835394
5532	NC_015062	GCCAGC	2	12	275092	275103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322835394
5533	NC_015062	ATG	2	6	275146	275151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835394
5534	NC_015062	TGCG	2	8	275227	275234	0 %	25 %	50 %	25 %	322835395
5535	NC_015062	CGC	2	6	275400	275405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835395
5536	NC_015062	CGT	2	6	275424	275429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835395
5537	NC_015062	CAC	2	6	275665	275670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835395
5538	NC_015062	GCAC	2	8	275739	275746	25 %	0 %	25 %	50 %	322835395
5539	NC_015062	GGT	2	6	275845	275850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835395
5540	NC_015062	GC	4	8	275892	275899	0 %	0 %	50 %	50 %	322835395
5541	NC_015062	AGC	2	6	275900	275905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835395
5542	NC_015062	TGA	2	6	275909	275914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835395
5543	NC_015062	CA	3	6	276003	276008	50 %	0 %	0 %	50 %	322835395
5544	NC_015062	GCG	2	6	276036	276041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835395
5545	NC_015062	CGA	2	6	276042	276047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835395
5546	NC_015062	CGT	2	6	276069	276074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835395
5547	NC_015062	CG	3	6	276157	276162	0 %	0 %	50 %	50 %	322835396
5548	NC_015062	GCG	2	6	276182	276187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835396
5549	NC_015062	CGC	2	6	276392	276397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835396
5550	NC_015062	GCAG	2	8	276411	276418	25 %	0 %	50 %	25 %	322835396
5551	NC_015062	TG	3	6	276422	276427	0 %	50 %	50 %	0 %	322835396
5552	NC_015062	TGCG	2	8	276457	276464	0 %	25 %	50 %	25 %	322835396
5553	NC_015062	ACA	2	6	276476	276481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835396
5554	NC_015062	CCGG	2	8	276483	276490	0 %	0 %	50 %	50 %	322835396
5555	NC_015062	CAGG	2	8	276551	276558	25 %	0 %	50 %	25 %	322835396
5556	NC_015062	AAT	2	6	276638	276643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835396
5557	NC_015062	GC	3	6	276710	276715	0 %	0 %	50 %	50 %	322835396
5558	NC_015062	AGCG	2	8	276719	276726	25 %	0 %	50 %	25 %	322835396
5559	NC_015062	TGG	3	9	276749	276757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835396
5560	NC_015062	GTT	2	6	276827	276832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835396
5561	NC_015062	GCG	2	6	276869	276874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835396
5562	NC_015062	GCC	2	6	276942	276947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835396
5563	NC_015062	AC	3	6	276977	276982	50 %	0 %	0 %	50 %	322835396
5564	NC_015062	AAG	2	6	276989	276994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835396
5565	NC_015062	TC	4	8	277003	277010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_015062	ACT	2	6	277020	277025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_015062	TACT	2	8	277089	277096	25 %	50 %	0 %	25 %	322835397
5568	NC_015062	AAC	2	6	277186	277191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835397
5569	NC_015062	TCG	2	6	277261	277266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835397
5570	NC_015062	GCA	2	6	277283	277288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835397
5571	NC_015062	CCG	2	6	277336	277341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835397
5572	NC_015062	CGC	2	6	277401	277406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835397
5573	NC_015062	ACG	2	6	277474	277479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835397
5574	NC_015062	ATG	2	6	277714	277719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835397
5575	NC_015062	T	6	6	277776	277781	0 %	100 %	0 %	0 %	322835397
5576	NC_015062	TGC	2	6	277790	277795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835397
5577	NC_015062	GGCT	2	8	277886	277893	0 %	25 %	50 %	25 %	322835397
5578	NC_015062	CCCG	2	8	277907	277914	0 %	0 %	25 %	75 %	322835397
5579	NC_015062	GCC	2	6	277963	277968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835397
5580	NC_015062	ACG	2	6	278056	278061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835397
5581	NC_015062	GCCGG	2	10	278153	278162	0 %	0 %	60 %	40 %	322835397
5582	NC_015062	GTT	2	6	278184	278189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835397
5583	NC_015062	TAA	2	6	278193	278198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835397
5584	NC_015062	T	6	6	278296	278301	0 %	100 %	0 %	0 %	322835397
5585	NC_015062	GGT	2	6	278400	278405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835397
5586	NC_015062	TGA	2	6	278411	278416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835397
5587	NC_015062	TGT	2	6	278449	278454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835397
5588	NC_015062	CCG	2	6	278512	278517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835397
5589	NC_015062	CAG	2	6	278573	278578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835397
5590	NC_015062	TCAT	2	8	278648	278655	25 %	50 %	0 %	25 %	322835397
5591	NC_015062	ATT	2	6	278666	278671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015062	CCG	3	9	278853	278861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
5593	NC_015062	ATG	2	6	278867	278872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835398
5594	NC_015062	GACG	2	8	278948	278955	25 %	0 %	50 %	25 %	322835398
5595	NC_015062	CG	3	6	278967	278972	0 %	0 %	50 %	50 %	322835398
5596	NC_015062	CGA	2	6	279043	279048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835398
5597	NC_015062	GCG	2	6	279092	279097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835398
5598	NC_015062	GCC	2	6	279127	279132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
5599	NC_015062	ACG	2	6	279182	279187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835398
5600	NC_015062	ACG	2	6	279219	279224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835398
5601	NC_015062	TGCCGT	2	12	279289	279300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835398
5602	NC_015062	CAC	2	6	279306	279311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835398
5603	NC_015062	GTC	2	6	279335	279340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835398
5604	NC_015062	TAT	2	6	279370	279375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835398
5605	NC_015062	CGC	2	6	279390	279395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
5606	NC_015062	TGA	2	6	279417	279422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835398
5607	NC_015062	GCC	2	6	279423	279428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
5608	NC_015062	TA	3	6	279435	279440	50 %	50 %	0 %	0 %	322835398
5609	NC_015062	TTG	2	6	279472	279477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835398
5610	NC_015062	TG	3	6	279476	279481	0 %	50 %	50 %	0 %	322835398
5611	NC_015062	AAT	2	6	279491	279496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835398
5612	NC_015062	GTG	2	6	279509	279514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835398
5613	NC_015062	TCA	2	6	279519	279524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835398
5614	NC_015062	CGC	2	6	279603	279608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
5615	NC_015062	TGG	2	6	279627	279632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835398
5616	NC_015062	TTTAT	2	10	279833	279842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015062	ATAA	2	8	279874	279881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015062	TAATC	2	10	279882	279891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5619	NC_015062	TAA	2	6	279894	279899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015062	TAA	2	6	279988	279993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015062	GGT	2	6	279996	280001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015062	TCA	2	6	280022	280027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015062	CAA	3	9	280081	280089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835399
5624	NC_015062	CTC	2	6	280107	280112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835399
5625	NC_015062	GTC	2	6	280134	280139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835399
5626	NC_015062	GGT	2	6	280161	280166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835399
5627	NC_015062	AGG	2	6	280184	280189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835399
5628	NC_015062	CTG	2	6	280203	280208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835399
5629	NC_015062	CCG	2	6	280231	280236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835399
5630	NC_015062	TAT	2	6	280298	280303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835399
5631	NC_015062	TGG	2	6	280381	280386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835399
5632	NC_015062	CG	3	6	280413	280418	0 %	0 %	50 %	50 %	322835399
5633	NC_015062	TGG	2	6	280423	280428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835399
5634	NC_015062	GGC	2	6	280454	280459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835399
5635	NC_015062	ATC	2	6	280515	280520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835399
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5637	NC_015062	TGC	2	6	280619	280624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835399
5638	NC_015062	GATCA	2	10	280629	280638	40 %	20 %	20 %	20 %	322835399
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5640	NC_015062	TG	3	6	280760	280765	0 %	50 %	50 %	0 %	322835399
5641	NC_015062	GGGCT	2	10	280866	280875	0 %	20 %	60 %	20 %	322835399
5642	NC_015062	GCC	2	6	280890	280895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835399
5643	NC_015062	GCG	2	6	280905	280910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835399
5644	NC_015062	CTG	3	9	280930	280938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835399
5645	NC_015062	GCT	2	6	280956	280961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835399
5646	NC_015062	CGG	2	6	281012	281017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835399
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5652	NC_015062	CTT	2	6	281456	281461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835399
5653	NC_015062	CGG	2	6	281462	281467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835399
5654	NC_015062	TTC	2	6	281498	281503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835399
5655	NC_015062	TGT	2	6	281504	281509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835399
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5665	NC_015062	CGGT	2	8	282223	282230	0 %	25 %	50 %	25 %	322835399
5666	NC_015062	CTG	2	6	282327	282332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835399
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5669	NC_015062	CAT	3	9	282470	282478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835399
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5671	NC_015062	CGG	2	6	282592	282597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5672	NC_015062	T	8	8	282600	282607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5673	NC_015062	TAT	2	6	282693	282698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835400
5674	NC_015062	T	6	6	282728	282733	0 %	100 %	0 %	0 %	322835400
5675	NC_015062	TCA	2	6	282746	282751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835400
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5677	NC_015062	CGT	2	6	282792	282797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835400
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5687	NC_015062	T	6	6	283442	283447	0 %	100 %	0 %	0 %	322835400
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5691	NC_015062	TCG	2	6	283664	283669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835400
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5694	NC_015062	TAATGA	2	12	283779	283790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	322835400
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5700	NC_015062	TCC	2	6	284173	284178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5701	NC_015062	TAAAAT	2	12	284242	284253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5702	NC_015062	ATA	2	6	284268	284273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5703	NC_015062	CCT	2	6	284332	284337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5704	NC_015062	CACG	2	8	284357	284364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5705	NC_015062	A	7	7	284379	284385	100 %	0 %	0 %	0 %	322835402
5706	NC_015062	CCG	2	6	284454	284459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835402
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5710	NC_015062	GCA	2	6	284687	284692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835402
5711	NC_015062	GAT	2	6	284712	284717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835402
5712	NC_015062	GCG	2	6	284741	284746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835402
5713	NC_015062	CAGC	2	8	284750	284757	25 %	0 %	25 %	50 %	322835402
5714	NC_015062	TGCC	2	8	284785	284792	0 %	25 %	25 %	50 %	322835402
5715	NC_015062	AGA	2	6	284815	284820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835402
5716	NC_015062	CATTC	2	10	284829	284838	20 %	40 %	0 %	40 %	322835402
5717	NC_015062	A	6	6	284937	284942	100 %	0 %	0 %	0 %	322835402
5718	NC_015062	GCC	2	6	284949	284954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835402
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5720	NC_015062	ATT	2	6	285025	285030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835402
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5726	NC_015062	CTG	2	6	285265	285270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835403
5727	NC_015062	CCG	2	6	285440	285445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835403
5728	NC_015062	GCG	2	6	285478	285483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835403
5729	NC_015062	TAA	2	6	285486	285491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835403
5730	NC_015062	CCG	2	6	285507	285512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835403
5731	NC_015062	ATT	2	6	285514	285519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835403
5732	NC_015062	AAT	2	6	285521	285526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835403
5733	NC_015062	GCCA	2	8	285569	285576	25 %	0 %	25 %	50 %	322835403
5734	NC_015062	CGG	2	6	285589	285594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835403
5735	NC_015062	CTG	2	6	285655	285660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835403
5736	NC_015062	CTGATC	2	12	285757	285768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322835403
5737	NC_015062	CCG	2	6	285780	285785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835403
5738	NC_015062	CCG	2	6	285821	285826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835403
5739	NC_015062	CAGC	2	8	285864	285871	25 %	0 %	25 %	50 %	322835403
5740	NC_015062	TTC	2	6	285895	285900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835403
5741	NC_015062	GAT	2	6	285963	285968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835403
5742	NC_015062	CAT	3	9	286072	286080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835403
5743	NC_015062	CCA	2	6	286143	286148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835403
5744	NC_015062	GCT	2	6	286170	286175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835403
5745	NC_015062	ACC	2	6	286226	286231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835403
5746	NC_015062	TAA	2	6	286307	286312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5747	NC_015062	GGC	2	6	286338	286343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5748	NC_015062	A	6	6	286445	286450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5749	NC_015062	ATG	2	6	286466	286471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5751	NC_015062	CTC	2	6	286554	286559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5752	NC_015062	AAT	2	6	286575	286580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5753	NC_015062	T	6	6	286584	286589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5754	NC_015062	AAT	2	6	286617	286622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835404
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5992	NC_015062	TGA	2	6	299137	299142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5993	NC_015062	TGC	2	6	299249	299254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_015062	ATG	2	6	299345	299350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5995	NC_015062	AGT	2	6	299364	299369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_015062	GAT	2	6	299387	299392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_015062	TCA	2	6	299472	299477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5998	NC_015062	TACA	2	8	299560	299567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5999	NC_015062	CAG	2	6	299679	299684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6000	NC_015062	TTA	2	6	299698	299703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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