MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015061	CCG	2	6	142611	142616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830859
3002	NC_015061	A	6	6	142731	142736	100 %	0 %	0 %	0 %	322830859
3003	NC_015061	GCG	2	6	142751	142756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830859
3004	NC_015061	AAC	2	6	142836	142841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830859
3005	NC_015061	AAT	2	6	142864	142869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830859
3006	NC_015061	T	6	6	142897	142902	0 %	100 %	0 %	0 %	322830860
3007	NC_015061	CAG	2	6	142917	142922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830860
3008	NC_015061	CAT	2	6	142948	142953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830860
3009	NC_015061	GAA	2	6	142973	142978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830860
3010	NC_015061	GCA	2	6	143035	143040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830860
3011	NC_015061	ATG	2	6	143130	143135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830860
3012	NC_015061	CAT	2	6	143237	143242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830860
3013	NC_015061	GAG	2	6	143300	143305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830860
3014	NC_015061	TG	3	6	143330	143335	0 %	50 %	50 %	0 %	322830860
3015	NC_015061	AT	3	6	143341	143346	50 %	50 %	0 %	0 %	322830860
3016	NC_015061	A	8	8	143356	143363	100 %	0 %	0 %	0 %	322830860
3017	NC_015061	TA	3	6	143372	143377	50 %	50 %	0 %	0 %	322830860
3018	NC_015061	AT	3	6	143429	143434	50 %	50 %	0 %	0 %	322830860
3019	NC_015061	GCC	2	6	143632	143637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830860
3020	NC_015061	T	6	6	143644	143649	0 %	100 %	0 %	0 %	322830860
3021	NC_015061	GGA	2	6	143665	143670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830860
3022	NC_015061	TTA	2	6	143699	143704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830860
3023	NC_015061	GCG	2	6	143739	143744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830860
3024	NC_015061	AAAG	2	8	143843	143850	75 %	0 %	25 %	0 %	322830860
3025	NC_015061	CTG	2	6	143876	143881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830860
3026	NC_015061	GAT	2	6	143888	143893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830860
3027	NC_015061	TTTTA	2	10	143945	143954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015061	CCA	2	6	144207	144212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_015061	CGC	2	6	144213	144218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_015061	GGCA	2	8	144280	144287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_015061	GTCA	2	8	144297	144304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_015061	AAAAT	2	10	144305	144314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015061	T	7	7	144335	144341	0 %	100 %	0 %	0 %	322830861
3034	NC_015061	A	6	6	144352	144357	100 %	0 %	0 %	0 %	322830861
3035	NC_015061	ATT	2	6	144413	144418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830861
3036	NC_015061	CATC	2	8	144457	144464	25 %	25 %	0 %	50 %	322830861
3037	NC_015061	ACC	2	6	144470	144475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830861
3038	NC_015061	GACCG	2	10	144476	144485	20 %	0 %	40 %	40 %	322830861
3039	NC_015061	ATTA	2	8	144491	144498	50 %	50 %	0 %	0 %	322830861
3040	NC_015061	CGG	2	6	144572	144577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830861
3041	NC_015061	TGT	2	6	144591	144596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830861
3042	NC_015061	CGG	2	6	144616	144621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830861
3043	NC_015061	CGAA	2	8	144707	144714	50 %	0 %	25 %	25 %	322830861
3044	NC_015061	GAA	2	6	144720	144725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830861
3045	NC_015061	TTTC	2	8	144744	144751	0 %	75 %	0 %	25 %	322830861
3046	NC_015061	TGG	2	6	144771	144776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830861
3047	NC_015061	TGAG	2	8	144832	144839	25 %	25 %	50 %	0 %	322830861
3048	NC_015061	GGA	2	6	144901	144906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830862
3049	NC_015061	CTT	3	9	144946	144954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830862
3050	NC_015061	CAT	2	6	145135	145140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830862
3051	NC_015061	GAA	2	6	145199	145204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830862
3052	NC_015061	GTG	2	6	145234	145239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830862
3053	NC_015061	TTG	2	6	145286	145291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830862
3054	NC_015061	A	6	6	145325	145330	100 %	0 %	0 %	0 %	322830862
3055	NC_015061	CTT	2	6	145425	145430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830862
3056	NC_015061	GAA	2	6	145433	145438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830862
3057	NC_015061	A	6	6	145453	145458	100 %	0 %	0 %	0 %	322830862
3058	NC_015061	GCT	2	6	145546	145551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830862
3059	NC_015061	GAT	2	6	145553	145558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830862
3060	NC_015061	ATT	2	6	145610	145615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830862
3061	NC_015061	TAA	2	6	145657	145662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830862
3062	NC_015061	CGG	2	6	145693	145698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830862
3063	NC_015061	TGG	2	6	145788	145793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830862
3064	NC_015061	GGC	2	6	145835	145840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830862
3065	NC_015061	GAG	2	6	145859	145864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830862
3066	NC_015061	TGA	2	6	145909	145914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830862
3067	NC_015061	TTCCC	2	10	145986	145995	0 %	40 %	0 %	60 %	322830862
3068	NC_015061	CAG	2	6	146099	146104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830862
3069	NC_015061	TGC	2	6	146131	146136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830862
3070	NC_015061	CTGG	2	8	146167	146174	0 %	25 %	50 %	25 %	322830862
3071	NC_015061	CAGT	2	8	146197	146204	25 %	25 %	25 %	25 %	322830862
3072	NC_015061	GCTG	2	8	146343	146350	0 %	25 %	50 %	25 %	322830862
3073	NC_015061	GAT	2	6	146351	146356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830862
3074	NC_015061	TGC	2	6	146365	146370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830862
3075	NC_015061	CCG	2	6	146416	146421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830862
3076	NC_015061	GCT	2	6	146489	146494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830862
3077	NC_015061	GCC	2	6	146506	146511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830862
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3079	NC_015061	AGA	2	6	146599	146604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830862
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3081	NC_015061	CGG	2	6	146656	146661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015061	TCA	2	6	146662	146667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015061	GCC	2	6	146669	146674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_015061	T	6	6	146695	146700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015061	T	7	7	146844	146850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015061	T	6	6	146865	146870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015061	CAT	2	6	146903	146908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_015061	A	6	6	146912	146917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015061	T	7	7	146944	146950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015061	CAA	2	6	146974	146979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015061	AACAG	2	10	146988	146997	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3092	NC_015061	AGA	2	6	147090	147095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830863
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3095	NC_015061	TGC	2	6	147483	147488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830863
3096	NC_015061	GTT	2	6	147504	147509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830863
3097	NC_015061	ATGG	2	8	147568	147575	25 %	25 %	50 %	0 %	322830863
3098	NC_015061	CAC	2	6	147609	147614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830863
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3100	NC_015061	GTG	2	6	147787	147792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830863
3101	NC_015061	GCGG	2	8	147817	147824	0 %	0 %	75 %	25 %	322830863
3102	NC_015061	GCT	2	6	147837	147842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830863
3103	NC_015061	CGG	2	6	147876	147881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830863
3104	NC_015061	CGG	2	6	147891	147896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830863
3105	NC_015061	GC	3	6	147971	147976	0 %	0 %	50 %	50 %	322830863
3106	NC_015061	ATT	2	6	148009	148014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830863
3107	NC_015061	CTG	2	6	148030	148035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830863
3108	NC_015061	TTTG	2	8	148092	148099	0 %	75 %	25 %	0 %	322830863
3109	NC_015061	CGC	2	6	148209	148214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830863
3110	NC_015061	TCA	2	6	148286	148291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830863
3111	NC_015061	A	6	6	148291	148296	100 %	0 %	0 %	0 %	322830863
3112	NC_015061	CGG	2	6	148308	148313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830863
3113	NC_015061	GTG	2	6	148336	148341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830863
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3115	NC_015061	ATG	2	6	148411	148416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830863
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3117	NC_015061	ATC	2	6	148483	148488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830863
3118	NC_015061	GCT	2	6	148539	148544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830863
3119	NC_015061	GAT	2	6	148581	148586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830863
3120	NC_015061	CAC	2	6	148587	148592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830863
3121	NC_015061	T	7	7	148731	148737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015061	TCTT	2	8	148801	148808	0 %	75 %	0 %	25 %	322830864
3123	NC_015061	GCG	2	6	148853	148858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830864
3124	NC_015061	CCA	2	6	148914	148919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830864
3125	NC_015061	AAC	2	6	148933	148938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830864
3126	NC_015061	CCG	2	6	148945	148950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830864
3127	NC_015061	ATA	2	6	148972	148977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830864
3128	NC_015061	CGA	2	6	149039	149044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830864
3129	NC_015061	ATA	2	6	149128	149133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830864
3130	NC_015061	GCG	2	6	149138	149143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830864
3131	NC_015061	GCA	2	6	149144	149149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830864
3132	NC_015061	CGC	2	6	149259	149264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830864
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3134	NC_015061	TCA	2	6	149417	149422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830864
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3136	NC_015061	GCC	2	6	149475	149480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830864
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3140	NC_015061	GCC	2	6	149595	149600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830864
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3147	NC_015061	CAGCG	2	10	149745	149754	20 %	0 %	40 %	40 %	322830864
3148	NC_015061	CAG	3	9	149781	149789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830864
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3153	NC_015061	AGC	2	6	149959	149964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830864
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3155	NC_015061	AGTA	2	8	149993	150000	50 %	25 %	25 %	0 %	322830864
3156	NC_015061	GCC	2	6	150024	150029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830864
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3158	NC_015061	GAT	2	6	150096	150101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830864
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3163	NC_015061	T	7	7	150313	150319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_015061	ATT	2	6	150320	150325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830865
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3208	NC_015061	TGACG	2	10	152533	152542	20 %	20 %	40 %	20 %	322830866
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3233	NC_015061	GA	3	6	153859	153864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_015061	A	6	6	153924	153929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_015061	A	6	6	153931	153936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3242	NC_015061	GAC	2	6	154336	154341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830867
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3246	NC_015061	TTG	2	6	154549	154554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830867
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3365	NC_015061	T	6	6	160541	160546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3370	NC_015061	CGC	2	6	160916	160921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830871
3371	NC_015061	AGC	2	6	161048	161053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830871
3372	NC_015061	CAT	2	6	161066	161071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830871
3373	NC_015061	CGA	2	6	161087	161092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830871
3374	NC_015061	ATC	2	6	161212	161217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830871
3375	NC_015061	TAA	2	6	161299	161304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_015061	TGAG	2	8	161340	161347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_015061	TC	3	6	161377	161382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3378	NC_015061	TC	3	6	161416	161421	0 %	50 %	0 %	50 %	322830872
3379	NC_015061	GC	3	6	161660	161665	0 %	0 %	50 %	50 %	322830872
3380	NC_015061	TGC	2	6	161714	161719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3381	NC_015061	A	6	6	161777	161782	100 %	0 %	0 %	0 %	322830872
3382	NC_015061	GGC	2	6	161808	161813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
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3384	NC_015061	GCA	2	6	161879	161884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
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3389	NC_015061	GCC	2	6	162130	162135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3390	NC_015061	GCA	2	6	162186	162191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
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3393	NC_015061	CAG	2	6	162322	162327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
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3396	NC_015061	GC	3	6	162443	162448	0 %	0 %	50 %	50 %	322830872
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3399	NC_015061	CAG	2	6	162535	162540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3400	NC_015061	GAC	2	6	162565	162570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
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3402	NC_015061	ATT	2	6	162752	162757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830872
3403	NC_015061	ATA	2	6	162767	162772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830872
3404	NC_015061	GGC	3	9	162775	162783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
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3430	NC_015061	CTGG	2	8	164255	164262	0 %	25 %	50 %	25 %	322830873
3431	NC_015061	GCCA	2	8	164292	164299	25 %	0 %	25 %	50 %	322830873
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3437	NC_015061	GAACTG	2	12	164421	164432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322830873
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3440	NC_015061	CGG	2	6	164533	164538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3441	NC_015061	GGC	2	6	164564	164569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3442	NC_015061	CGG	3	9	164687	164695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3443	NC_015061	ACGA	2	8	164725	164732	50 %	0 %	25 %	25 %	322830873
3444	NC_015061	GAG	2	6	164756	164761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3445	NC_015061	ACA	2	6	164835	164840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830874
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3450	NC_015061	TTAT	2	8	165197	165204	25 %	75 %	0 %	0 %	322830874
3451	NC_015061	GC	3	6	165209	165214	0 %	0 %	50 %	50 %	322830874
3452	NC_015061	T	7	7	165316	165322	0 %	100 %	0 %	0 %	322830874
3453	NC_015061	ACC	2	6	165409	165414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830874
3454	NC_015061	GCTG	2	8	165415	165422	0 %	25 %	50 %	25 %	322830874
3455	NC_015061	GCG	2	6	165431	165436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830874
3456	NC_015061	GCTGT	2	10	165506	165515	0 %	40 %	40 %	20 %	322830874
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3462	NC_015061	CA	3	6	165623	165628	50 %	0 %	0 %	50 %	322830875
3463	NC_015061	CGG	2	6	165800	165805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3464	NC_015061	GAT	2	6	165825	165830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830875
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3468	NC_015061	TGTTT	2	10	165869	165878	0 %	80 %	20 %	0 %	322830875
3469	NC_015061	GCT	2	6	165885	165890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830875
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3474	NC_015061	GA	3	6	165994	165999	50 %	0 %	50 %	0 %	322830875
3475	NC_015061	ACC	2	6	166021	166026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830875
3476	NC_015061	TGC	2	6	166037	166042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3477	NC_015061	GAC	2	6	166061	166066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3478	NC_015061	CTGTTC	2	12	166122	166133	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322830875
3479	NC_015061	GCG	2	6	166139	166144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3480	NC_015061	GCA	2	6	166223	166228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3481	NC_015061	GCCA	2	8	166243	166250	25 %	0 %	25 %	50 %	322830875
3482	NC_015061	CGA	2	6	166260	166265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3483	NC_015061	T	6	6	166322	166327	0 %	100 %	0 %	0 %	322830875
3484	NC_015061	AGC	2	6	166393	166398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3485	NC_015061	CAG	2	6	166407	166412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3486	NC_015061	GCC	2	6	166518	166523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830875
3487	NC_015061	ACT	2	6	166530	166535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830875
3488	NC_015061	GCA	2	6	166586	166591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3489	NC_015061	GAT	2	6	166592	166597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830875
3490	NC_015061	TCAG	2	8	166603	166610	25 %	25 %	25 %	25 %	322830875
3491	NC_015061	GGC	2	6	166690	166695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3492	NC_015061	CAT	2	6	166747	166752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_015061	A	6	6	166782	166787	100 %	0 %	0 %	0 %	322830876
3494	NC_015061	AG	3	6	166798	166803	50 %	0 %	50 %	0 %	322830876
3495	NC_015061	GCG	2	6	166850	166855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830876
3496	NC_015061	GAA	2	6	166866	166871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830876
3497	NC_015061	TTA	2	6	166938	166943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830877
3498	NC_015061	ATC	2	6	166967	166972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830877
3499	NC_015061	T	7	7	167001	167007	0 %	100 %	0 %	0 %	322830877
3500	NC_015061	TGCG	2	8	167034	167041	0 %	25 %	50 %	25 %	322830877

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