MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2004	NC_015061	CAC	2	6	92829	92834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830822
2005	NC_015061	CA	3	6	92866	92871	50 %	0 %	0 %	50 %	322830822
2006	NC_015061	GTT	2	6	92927	92932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830822
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2129	NC_015061	ACA	2	6	99204	99209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830826
2130	NC_015061	GAC	2	6	99242	99247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830826
2131	NC_015061	CGG	2	6	99304	99309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830826
2132	NC_015061	GGCATG	2	12	99329	99340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322830826
2133	NC_015061	GAC	2	6	99371	99376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830826
2134	NC_015061	ACA	2	6	99471	99476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830826
2135	NC_015061	TCT	2	6	99624	99629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830826
2136	NC_015061	GAA	2	6	99724	99729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830826
2137	NC_015061	GCCTG	2	10	99757	99766	0 %	20 %	40 %	40 %	322830826
2138	NC_015061	GAA	2	6	99796	99801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830826
2139	NC_015061	A	6	6	99851	99856	100 %	0 %	0 %	0 %	322830826
2140	NC_015061	CAT	2	6	99859	99864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830826
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2142	NC_015061	ACA	2	6	99930	99935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830826
2143	NC_015061	GCT	2	6	99979	99984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830826
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2145	NC_015061	ACGC	2	8	100059	100066	25 %	0 %	25 %	50 %	322830826
2146	NC_015061	TGA	2	6	100182	100187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830826
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2149	NC_015061	ACT	2	6	100269	100274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830826
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2151	NC_015061	CAG	2	6	100358	100363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830826
2152	NC_015061	ATC	2	6	100400	100405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830826
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2154	NC_015061	GTC	2	6	100454	100459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830826
2155	NC_015061	TG	3	6	100534	100539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2156	NC_015061	GCCT	2	8	100555	100562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2157	NC_015061	CTC	2	6	100586	100591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2158	NC_015061	AAGA	2	8	100631	100638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_015061	AG	3	6	100691	100696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2160	NC_015061	GTTA	2	8	100734	100741	25 %	50 %	25 %	0 %	322830827
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2202	NC_015061	TGG	2	6	102905	102910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830829
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2220	NC_015061	CTG	2	6	103548	103553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830829
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2235	NC_015061	TCAGCG	2	12	104166	104177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2236	NC_015061	CGTG	2	8	104256	104263	0 %	25 %	50 %	25 %	322830830
2237	NC_015061	TGA	2	6	104279	104284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830830
2238	NC_015061	GCA	2	6	104292	104297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2239	NC_015061	CGT	2	6	104340	104345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2240	NC_015061	GTGATG	2	12	104365	104376	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322830830
2241	NC_015061	CCAT	2	8	104433	104440	25 %	25 %	0 %	50 %	322830830
2242	NC_015061	TGT	2	6	104453	104458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830830
2243	NC_015061	CGC	2	6	104465	104470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830830
2244	NC_015061	GCC	2	6	104567	104572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830830
2245	NC_015061	TCG	2	6	104630	104635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2246	NC_015061	ACG	2	6	104668	104673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2247	NC_015061	CCG	2	6	104702	104707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2248	NC_015061	TAA	2	6	104735	104740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_015061	TTTC	2	8	104784	104791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2250	NC_015061	ATC	2	6	104800	104805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2375	NC_015061	CGG	2	6	111501	111506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830836
2376	NC_015061	CGG	2	6	111560	111565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830836
2377	NC_015061	CTG	2	6	111573	111578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830836
2378	NC_015061	GCA	2	6	111581	111586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830836
2379	NC_015061	GC	3	6	111626	111631	0 %	0 %	50 %	50 %	322830836
2380	NC_015061	TTG	2	6	111636	111641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830836
2381	NC_015061	GCG	2	6	111666	111671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830836
2382	NC_015061	CGCA	2	8	111681	111688	25 %	0 %	25 %	50 %	322830836
2383	NC_015061	GGCT	2	8	111692	111699	0 %	25 %	50 %	25 %	322830836
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2400	NC_015061	CGG	2	6	112482	112487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830836
2401	NC_015061	ACTG	2	8	112568	112575	25 %	25 %	25 %	25 %	322830836
2402	NC_015061	CAG	2	6	112650	112655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830836
2403	NC_015061	GTC	2	6	112683	112688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830836
2404	NC_015061	AAC	2	6	112723	112728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830836
2405	NC_015061	TGG	2	6	112745	112750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830836
2406	NC_015061	GGT	2	6	112764	112769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830836
2407	NC_015061	TTC	2	6	112843	112848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830836
2408	NC_015061	CGC	2	6	112879	112884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2409	NC_015061	TTGTTT	2	12	112906	112917	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2410	NC_015061	GAC	2	6	112962	112967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830837
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2412	NC_015061	CAT	2	6	113062	113067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830837
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2415	NC_015061	CTG	2	6	113209	113214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830837
2416	NC_015061	TCGG	2	8	113375	113382	0 %	25 %	50 %	25 %	322830837
2417	NC_015061	CTG	2	6	113437	113442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830837
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2429	NC_015061	GTT	2	6	114262	114267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830837
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2438	NC_015061	CGC	2	6	114822	114827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830837
2439	NC_015061	TGC	2	6	114831	114836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830837
2440	NC_015061	ACT	2	6	114953	114958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830837
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2442	NC_015061	GCC	2	6	115000	115005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830837
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2444	NC_015061	CGG	2	6	115231	115236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830837
2445	NC_015061	CTG	2	6	115319	115324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830837
2446	NC_015061	CAA	3	9	115330	115338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830837
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2449	NC_015061	TGG	2	6	115439	115444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830838
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2453	NC_015061	CGG	2	6	115545	115550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830838
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2478	NC_015061	AT	3	6	116965	116970	50 %	50 %	0 %	0 %	322830838
2479	NC_015061	GCC	2	6	117070	117075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830838
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2481	NC_015061	GTG	2	6	117148	117153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830838
2482	NC_015061	GGT	2	6	117192	117197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830838
2483	NC_015061	CAA	2	6	117213	117218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830838
2484	NC_015061	TTG	2	6	117275	117280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830838
2485	NC_015061	CAT	2	6	117330	117335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830838
2486	NC_015061	ATG	2	6	117343	117348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830838
2487	NC_015061	CAC	2	6	117354	117359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830838
2488	NC_015061	ATG	3	9	117454	117462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830838
2489	NC_015061	CTG	2	6	117464	117469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830838
2490	NC_015061	GCA	3	9	117476	117484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830838
2491	NC_015061	AAG	2	6	117492	117497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830838
2492	NC_015061	TAA	2	6	117550	117555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2493	NC_015061	GCG	2	6	117571	117576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830839
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2495	NC_015061	T	6	6	117621	117626	0 %	100 %	0 %	0 %	322830839
2496	NC_015061	AAT	2	6	117675	117680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2497	NC_015061	CA	3	6	117708	117713	50 %	0 %	0 %	50 %	322830839
2498	NC_015061	TAA	2	6	117735	117740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2499	NC_015061	CGG	2	6	117793	117798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830839
2500	NC_015061	AAC	2	6	117813	117818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830839

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