MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015061	TGAAC	2	10	556650	556659	40 %	20 %	20 %	20 %	322831250
11502	NC_015061	GTG	2	6	556684	556689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831250
11503	NC_015061	GCA	2	6	556724	556729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11504	NC_015061	GCTG	2	8	556814	556821	0 %	25 %	50 %	25 %	322831250
11505	NC_015061	ATG	2	6	556834	556839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831250
11506	NC_015061	TGG	2	6	556888	556893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831250
11507	NC_015061	TGC	2	6	556943	556948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11508	NC_015061	GAT	2	6	556950	556955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831250
11509	NC_015061	TGA	2	6	557136	557141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831250
11510	NC_015061	TGC	2	6	557144	557149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11511	NC_015061	CTG	2	6	557194	557199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11512	NC_015061	TGTC	2	8	557291	557298	0 %	50 %	25 %	25 %	322831250
11513	NC_015061	GTC	3	9	557296	557304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11514	NC_015061	GC	3	6	557342	557347	0 %	0 %	50 %	50 %	322831250
11515	NC_015061	GAA	2	6	557350	557355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831250
11516	NC_015061	TGC	2	6	557414	557419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11517	NC_015061	GC	3	6	557422	557427	0 %	0 %	50 %	50 %	322831250
11518	NC_015061	CCG	2	6	557430	557435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831250
11519	NC_015061	CAG	2	6	557455	557460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11520	NC_015061	CGCA	2	8	557503	557510	25 %	0 %	25 %	50 %	322831250
11521	NC_015061	GCACC	2	10	557585	557594	20 %	0 %	20 %	60 %	322831250
11522	NC_015061	TGG	2	6	557657	557662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831250
11523	NC_015061	CGT	2	6	557703	557708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11524	NC_015061	CTG	2	6	557746	557751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11525	NC_015061	ACG	2	6	557867	557872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11526	NC_015061	CTGCG	2	10	557876	557885	0 %	20 %	40 %	40 %	322831250
11527	NC_015061	GCG	2	6	557887	557892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831250
11528	NC_015061	AAG	2	6	557933	557938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831250
11529	NC_015061	ATT	2	6	557947	557952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831250
11530	NC_015061	CTG	2	6	557953	557958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11531	NC_015061	A	6	6	557960	557965	100 %	0 %	0 %	0 %	322831250
11532	NC_015061	CTG	2	6	558124	558129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11533	NC_015061	TTC	2	6	558247	558252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831250
11534	NC_015061	TGG	2	6	558298	558303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831250
11535	NC_015061	GTT	2	6	558336	558341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831250
11536	NC_015061	GCT	2	6	558366	558371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11537	NC_015061	CG	3	6	558430	558435	0 %	0 %	50 %	50 %	322831250
11538	NC_015061	CAT	2	6	558450	558455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831250
11539	NC_015061	TGG	2	6	558464	558469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831250
11540	NC_015061	GTT	2	6	558723	558728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831251
11541	NC_015061	ACG	2	6	558741	558746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11542	NC_015061	CAG	2	6	558765	558770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11543	NC_015061	TGA	2	6	558773	558778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831251
11544	NC_015061	AGC	3	9	558835	558843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11545	NC_015061	CGCC	2	8	558911	558918	0 %	0 %	25 %	75 %	322831251
11546	NC_015061	CG	3	6	558933	558938	0 %	0 %	50 %	50 %	322831251
11547	NC_015061	GGT	2	6	558987	558992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831251
11548	NC_015061	CCA	2	6	559046	559051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831251
11549	NC_015061	CAA	2	6	559065	559070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831251
11550	NC_015061	TGC	2	6	559145	559150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11551	NC_015061	CAGC	2	8	559152	559159	25 %	0 %	25 %	50 %	322831251
11552	NC_015061	ATC	2	6	559162	559167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831251
11553	NC_015061	TCT	3	9	559189	559197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831251
11554	NC_015061	CAG	2	6	559227	559232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11555	NC_015061	CCAG	2	8	559274	559281	25 %	0 %	25 %	50 %	322831251
11556	NC_015061	CAG	2	6	559428	559433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11557	NC_015061	TGG	2	6	559451	559456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831251
11558	NC_015061	ACC	2	6	559499	559504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831251
11559	NC_015061	GC	3	6	559583	559588	0 %	0 %	50 %	50 %	322831251
11560	NC_015061	CAG	2	6	559605	559610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831251
11561	NC_015061	TCA	2	6	559679	559684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831251
11562	NC_015061	A	6	6	559699	559704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_015061	A	8	8	559709	559716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_015061	T	6	6	559747	559752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_015061	CGA	2	6	559899	559904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_015061	CGA	2	6	560018	560023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831252
11567	NC_015061	CAG	3	9	560028	560036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831252
11568	NC_015061	TATCG	2	10	560088	560097	20 %	40 %	20 %	20 %	322831252
11569	NC_015061	GGC	2	6	560248	560253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831252
11570	NC_015061	GCGTCA	2	12	560336	560347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831252
11571	NC_015061	TGA	2	6	560419	560424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831252
11572	NC_015061	CCG	2	6	560480	560485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831252
11573	NC_015061	CTT	2	6	560486	560491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831252
11574	NC_015061	TGC	2	6	560519	560524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831252
11575	NC_015061	CGC	2	6	560543	560548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831252
11576	NC_015061	CGG	2	6	560559	560564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831252
11577	NC_015061	CAC	2	6	560598	560603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831252
11578	NC_015061	CTG	2	6	560604	560609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831252
11579	NC_015061	ACG	2	6	560661	560666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831252
11580	NC_015061	CTGG	2	8	560712	560719	0 %	25 %	50 %	25 %	322831252
11581	NC_015061	ATC	2	6	560725	560730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831252
11582	NC_015061	GAC	2	6	560794	560799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831253
11583	NC_015061	ATC	2	6	561077	561082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831253
11584	NC_015061	CGC	2	6	561118	561123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831253
11585	NC_015061	AAC	2	6	561168	561173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831253
11586	NC_015061	TAA	2	6	561195	561200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831253
11587	NC_015061	GC	3	6	561337	561342	0 %	0 %	50 %	50 %	322831253
11588	NC_015061	CAC	2	6	561395	561400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831253
11589	NC_015061	GTT	2	6	561401	561406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831253
11590	NC_015061	AAC	2	6	561495	561500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831253
11591	NC_015061	ATCA	2	8	561548	561555	50 %	25 %	0 %	25 %	322831253
11592	NC_015061	GGC	2	6	561563	561568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831253
11593	NC_015061	GGC	2	6	561683	561688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831253
11594	NC_015061	ATT	3	9	561761	561769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831254
11595	NC_015061	TGA	2	6	561829	561834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831254
11596	NC_015061	TGT	2	6	561875	561880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831254
11597	NC_015061	TTCTTT	2	12	561882	561893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	322831254
11598	NC_015061	CAC	2	6	561912	561917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831254
11599	NC_015061	GC	3	6	561941	561946	0 %	0 %	50 %	50 %	322831254
11600	NC_015061	GCC	2	6	561993	561998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831254
11601	NC_015061	TCA	2	6	562040	562045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831254
11602	NC_015061	A	6	6	562376	562381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_015061	GAG	2	6	562431	562436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_015061	GAAACC	2	12	562454	562465	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322831255
11605	NC_015061	GGT	2	6	562466	562471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831255
11606	NC_015061	GAA	2	6	562508	562513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831255
11607	NC_015061	CTG	2	6	562556	562561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831255
11608	NC_015061	GCT	2	6	562597	562602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831255
11609	NC_015061	GGC	2	6	562738	562743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831255
11610	NC_015061	AGC	2	6	562748	562753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831255
11611	NC_015061	ATC	2	6	562787	562792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831255
11612	NC_015061	CTG	2	6	562814	562819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831255
11613	NC_015061	AAC	3	9	562821	562829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831255
11614	NC_015061	GTG	2	6	562847	562852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831255
11615	NC_015061	GACC	2	8	562935	562942	25 %	0 %	25 %	50 %	322831255
11616	NC_015061	A	6	6	562961	562966	100 %	0 %	0 %	0 %	322831255
11617	NC_015061	CGG	2	6	563086	563091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831255
11618	NC_015061	TCG	2	6	563226	563231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831255
11619	NC_015061	AAC	2	6	563318	563323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831255
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11624	NC_015061	TCG	2	6	563469	563474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831255
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11683	NC_015061	TTA	2	6	565862	565867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11733	NC_015061	T	6	6	568191	568196	0 %	100 %	0 %	0 %	322831258
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11982	NC_015061	TGC	2	6	580919	580924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831264
11983	NC_015061	TCT	2	6	581015	581020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831264
11984	NC_015061	GGCT	2	8	581071	581078	0 %	25 %	50 %	25 %	322831264
11985	NC_015061	CAA	2	6	581138	581143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831264
11986	NC_015061	CGA	2	6	581260	581265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11987	NC_015061	ATT	2	6	581269	581274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11988	NC_015061	A	6	6	581317	581322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11989	NC_015061	AAGC	2	8	581421	581428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11990	NC_015061	CAT	2	6	581430	581435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11991	NC_015061	AAATCA	2	12	581436	581447	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11992	NC_015061	A	6	6	581455	581460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_015061	GGT	2	6	581524	581529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11994	NC_015061	A	7	7	581619	581625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11995	NC_015061	GGC	2	6	581626	581631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11996	NC_015061	GCC	2	6	581639	581644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11997	NC_015061	GCC	2	6	581721	581726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831265
11998	NC_015061	CCAG	2	8	581729	581736	25 %	0 %	25 %	50 %	322831265
11999	NC_015061	CCG	2	6	581756	581761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831265
12000	NC_015061	GCC	2	6	581788	581793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831265

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