MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015061	TAAA	2	8	287914	287921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015061	TCA	2	6	287928	287933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015061	TGGTT	2	10	288047	288056	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015061	ATTC	2	8	288058	288065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_015061	TGG	2	6	288077	288082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015061	AAATA	2	10	288101	288110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015061	TAT	2	6	288126	288131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015061	GAT	2	6	288185	288190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830981
6009	NC_015061	AACC	2	8	288278	288285	50 %	0 %	0 %	50 %	322830981
6010	NC_015061	AGA	2	6	288295	288300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830981
6011	NC_015061	CTC	2	6	288301	288306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830981
6012	NC_015061	TTG	2	6	288312	288317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830981
6013	NC_015061	AT	3	6	288361	288366	50 %	50 %	0 %	0 %	322830981
6014	NC_015061	CTGT	2	8	288378	288385	0 %	50 %	25 %	25 %	322830981
6015	NC_015061	TGG	2	6	288466	288471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830982
6016	NC_015061	CTGA	2	8	288513	288520	25 %	25 %	25 %	25 %	322830982
6017	NC_015061	TATC	2	8	288634	288641	25 %	50 %	0 %	25 %	322830982
6018	NC_015061	CGT	2	6	288645	288650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830982
6019	NC_015061	ATC	2	6	288678	288683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830982
6020	NC_015061	GAA	2	6	288702	288707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830982
6021	NC_015061	CGA	2	6	288740	288745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830982
6022	NC_015061	CTG	2	6	288777	288782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830982
6023	NC_015061	GCG	2	6	288803	288808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830982
6024	NC_015061	GTG	2	6	288931	288936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830982
6025	NC_015061	TGA	2	6	288997	289002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830982
6026	NC_015061	CGT	2	6	289068	289073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830982
6027	NC_015061	AGA	3	9	289079	289087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830982
6028	NC_015061	TTA	2	6	289208	289213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830983
6029	NC_015061	GAC	2	6	289243	289248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6030	NC_015061	TGG	2	6	289254	289259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830983
6031	NC_015061	GCA	2	6	289288	289293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6032	NC_015061	TGA	2	6	289329	289334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830983
6033	NC_015061	TCG	2	6	289387	289392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6034	NC_015061	GAG	2	6	289442	289447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830983
6035	NC_015061	GCA	2	6	289465	289470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6036	NC_015061	TCAG	2	8	289482	289489	25 %	25 %	25 %	25 %	322830983
6037	NC_015061	GCA	2	6	289498	289503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6038	NC_015061	GGT	2	6	289508	289513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830983
6039	NC_015061	GGT	2	6	289552	289557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830983
6040	NC_015061	TC	3	6	289629	289634	0 %	50 %	0 %	50 %	322830983
6041	NC_015061	TGG	2	6	289675	289680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830983
6042	NC_015061	GCG	2	6	289733	289738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830983
6043	NC_015061	CGC	3	9	289764	289772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830983
6044	NC_015061	CTG	2	6	289844	289849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6045	NC_015061	GGCG	2	8	289873	289880	0 %	0 %	75 %	25 %	322830983
6046	NC_015061	CGC	2	6	289899	289904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830983
6047	NC_015061	ATG	2	6	289931	289936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830983
6048	NC_015061	ATT	2	6	289997	290002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830983
6049	NC_015061	CCGA	2	8	290042	290049	25 %	0 %	25 %	50 %	322830983
6050	NC_015061	GTG	2	6	290180	290185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830983
6051	NC_015061	TGG	2	6	290190	290195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830983
6052	NC_015061	GCC	2	6	290201	290206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830983
6053	NC_015061	AGT	2	6	290234	290239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830983
6054	NC_015061	GAC	2	6	290276	290281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830983
6055	NC_015061	ATT	2	6	290393	290398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830983
6056	NC_015061	GC	3	6	290631	290636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_015061	G	6	6	290658	290663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015061	GTGG	2	8	290691	290698	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015061	AAC	2	6	290712	290717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015061	TTC	2	6	290737	290742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830984
6061	NC_015061	TCA	2	6	290747	290752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830984
6062	NC_015061	ATA	2	6	290754	290759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830984
6063	NC_015061	CTT	2	6	290768	290773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830984
6064	NC_015061	GTG	2	6	290783	290788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830984
6065	NC_015061	CCG	2	6	290792	290797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830984
6066	NC_015061	TAAC	2	8	290810	290817	50 %	25 %	0 %	25 %	322830984
6067	NC_015061	GT	3	6	290827	290832	0 %	50 %	50 %	0 %	322830984
6068	NC_015061	GCC	2	6	290926	290931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830984
6069	NC_015061	GC	3	6	290963	290968	0 %	0 %	50 %	50 %	322830984
6070	NC_015061	TCA	2	6	291011	291016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830984
6071	NC_015061	TG	3	6	291118	291123	0 %	50 %	50 %	0 %	322830984
6072	NC_015061	GCA	2	6	291146	291151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830984
6073	NC_015061	ATC	2	6	291175	291180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830984
6074	NC_015061	GAT	2	6	291204	291209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830984
6075	NC_015061	GAA	2	6	291246	291251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830985
6076	NC_015061	CTT	3	9	291328	291336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830985
6077	NC_015061	GCC	2	6	291357	291362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830985
6078	NC_015061	AAT	2	6	291372	291377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830985
6079	NC_015061	CAT	3	9	291385	291393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830985
6080	NC_015061	TCG	2	6	291412	291417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830985
6081	NC_015061	CTC	2	6	291428	291433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_015061	GCTGG	2	10	291463	291472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_015061	A	6	6	291480	291485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_015061	CAG	2	6	291518	291523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_015061	GCG	2	6	291553	291558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830986
6086	NC_015061	ATAA	2	8	291595	291602	75 %	25 %	0 %	0 %	322830986
6087	NC_015061	CAT	2	6	291740	291745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830986
6088	NC_015061	ATA	2	6	291772	291777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830986
6089	NC_015061	CCAG	2	8	291819	291826	25 %	0 %	25 %	50 %	322830986
6090	NC_015061	GCA	2	6	291899	291904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830986
6091	NC_015061	CGC	2	6	291912	291917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830986
6092	NC_015061	GCAG	2	8	291924	291931	25 %	0 %	50 %	25 %	322830986
6093	NC_015061	CGG	2	6	292038	292043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830986
6094	NC_015061	TGC	2	6	292166	292171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830986
6095	NC_015061	AGC	2	6	292292	292297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830986
6096	NC_015061	TCA	2	6	292339	292344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830986
6097	NC_015061	GGT	2	6	292380	292385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830986
6098	NC_015061	GA	3	6	292399	292404	50 %	0 %	50 %	0 %	322830986
6099	NC_015061	GCA	2	6	292478	292483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830986
6100	NC_015061	TTC	2	6	292510	292515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830986
6101	NC_015061	CCG	2	6	292522	292527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830986
6102	NC_015061	GCC	2	6	292536	292541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830986
6103	NC_015061	TCA	2	6	292637	292642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830986
6104	NC_015061	TGCC	2	8	292713	292720	0 %	25 %	25 %	50 %	322830986
6105	NC_015061	TAA	2	6	292733	292738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830986
6106	NC_015061	AAAC	2	8	292791	292798	75 %	0 %	0 %	25 %	322830986
6107	NC_015061	GCT	2	6	292811	292816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830986
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6109	NC_015061	GTG	2	6	292915	292920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830986
6110	NC_015061	TCA	2	6	292921	292926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830986
6111	NC_015061	AT	3	6	292933	292938	50 %	50 %	0 %	0 %	322830986
6112	NC_015061	TCT	2	6	293041	293046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830986
6113	NC_015061	TGG	2	6	293092	293097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830986
6114	NC_015061	CGG	2	6	293120	293125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830986
6115	NC_015061	TA	3	6	293209	293214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015061	TGA	2	6	293278	293283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015061	A	6	6	293325	293330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015061	GT	3	6	293363	293368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015061	CGC	2	6	293407	293412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830987
6120	NC_015061	AAT	2	6	293464	293469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830987
6121	NC_015061	CAG	2	6	293534	293539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830987
6122	NC_015061	GCT	2	6	293541	293546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830987
6123	NC_015061	TGA	2	6	293616	293621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830987
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6138	NC_015061	CTG	2	6	294170	294175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830987
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6245	NC_015061	CGCA	2	8	299724	299731	25 %	0 %	25 %	50 %	322830993
6246	NC_015061	CGCA	2	8	299733	299740	25 %	0 %	25 %	50 %	322830993
6247	NC_015061	CAC	2	6	299745	299750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830993
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6253	NC_015061	CGT	2	6	300020	300025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830993
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6273	NC_015061	GTA	2	6	301379	301384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6274	NC_015061	TTTA	2	8	301416	301423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6275	NC_015061	AGGT	2	8	301469	301476	25 %	25 %	50 %	0 %	322830994
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6348	NC_015061	CGAT	2	8	304751	304758	25 %	25 %	25 %	25 %	322830997
6349	NC_015061	A	6	6	304788	304793	100 %	0 %	0 %	0 %	322830997
6350	NC_015061	CGG	2	6	304812	304817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830997
6351	NC_015061	A	6	6	304838	304843	100 %	0 %	0 %	0 %	322830997
6352	NC_015061	GGT	2	6	304878	304883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830997
6353	NC_015061	GCG	2	6	304920	304925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830997
6354	NC_015061	TCA	2	6	304940	304945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830997
6355	NC_015061	GACA	2	8	305115	305122	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6356	NC_015061	GCG	2	6	305152	305157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6357	NC_015061	T	7	7	305206	305212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6358	NC_015061	CGC	2	6	305256	305261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6359	NC_015061	GGCGG	2	10	305272	305281	0 %	0 %	80 %	20 %	322830998
6360	NC_015061	ATC	2	6	305285	305290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830998
6361	NC_015061	ATTTG	2	10	305469	305478	20 %	60 %	20 %	0 %	322830998
6362	NC_015061	CCGCGA	2	12	305496	305507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322830998
6363	NC_015061	GTC	2	6	305617	305622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830998
6364	NC_015061	AAC	2	6	305645	305650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830998
6365	NC_015061	A	6	6	305671	305676	100 %	0 %	0 %	0 %	322830998
6366	NC_015061	ATT	2	6	305682	305687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830998
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6368	NC_015061	CCG	2	6	305701	305706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830998
6369	NC_015061	GA	3	6	305730	305735	50 %	0 %	50 %	0 %	322830998
6370	NC_015061	GAT	2	6	305782	305787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830998
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6373	NC_015061	AAG	2	6	305878	305883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6374	NC_015061	TGC	2	6	305949	305954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830999
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6394	NC_015061	ATG	2	6	306995	307000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6472	NC_015061	GCCCGT	2	12	311425	311436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322831004
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6490	NC_015061	ACC	2	6	312231	312236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831005
6491	NC_015061	AAT	2	6	312345	312350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831005
6492	NC_015061	GAT	3	9	312409	312417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831005
6493	NC_015061	CCA	2	6	312431	312436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831005
6494	NC_015061	CCGC	2	8	312489	312496	0 %	0 %	25 %	75 %	322831005
6495	NC_015061	GCA	2	6	312550	312555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831005
6496	NC_015061	CG	3	6	312558	312563	0 %	0 %	50 %	50 %	322831005
6497	NC_015061	CCG	2	6	312579	312584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831005
6498	NC_015061	ATC	2	6	312597	312602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831005
6499	NC_015061	CGG	2	6	312678	312683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831005
6500	NC_015061	CCA	2	6	312757	312762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831005

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