MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015061	GAG	2	6	261907	261912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830961
5502	NC_015061	ACTGAT	2	12	261926	261937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322830961
5503	NC_015061	GC	3	6	261967	261972	0 %	0 %	50 %	50 %	322830962
5504	NC_015061	GTC	2	6	262085	262090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5505	NC_015061	CTG	2	6	262116	262121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5506	NC_015061	GCA	2	6	262155	262160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5507	NC_015061	GCT	2	6	262187	262192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5508	NC_015061	AGA	2	6	262210	262215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830962
5509	NC_015061	CTG	3	9	262247	262255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5510	NC_015061	GGT	2	6	262262	262267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830962
5511	NC_015061	AGG	2	6	262278	262283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830962
5512	NC_015061	CGC	2	6	262318	262323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830962
5513	NC_015061	TTG	2	6	262326	262331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830962
5514	NC_015061	CGT	2	6	262360	262365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5515	NC_015061	GTTG	2	8	262376	262383	0 %	50 %	50 %	0 %	322830962
5516	NC_015061	GCC	2	6	262403	262408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830962
5517	NC_015061	CCGT	2	8	262513	262520	0 %	25 %	25 %	50 %	322830962
5518	NC_015061	TTG	2	6	262566	262571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830962
5519	NC_015061	TGAA	2	8	262593	262600	50 %	25 %	25 %	0 %	322830962
5520	NC_015061	TTA	2	6	262623	262628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830962
5521	NC_015061	ATT	2	6	262668	262673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830962
5522	NC_015061	GCA	2	6	262705	262710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830962
5523	NC_015061	GGA	2	6	262747	262752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830962
5524	NC_015061	CAGC	2	8	262781	262788	25 %	0 %	25 %	50 %	322830963
5525	NC_015061	ATGA	2	8	262876	262883	50 %	25 %	25 %	0 %	322830963
5526	NC_015061	GTG	2	6	262906	262911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830963
5527	NC_015061	GCGG	2	8	262942	262949	0 %	0 %	75 %	25 %	322830963
5528	NC_015061	ACG	2	6	262994	262999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830963
5529	NC_015061	CGC	2	6	263077	263082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830963
5530	NC_015061	GAA	2	6	263083	263088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830963
5531	NC_015061	GGT	2	6	263160	263165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830963
5532	NC_015061	AAC	2	6	263245	263250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830963
5533	NC_015061	TGA	2	6	263255	263260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830963
5534	NC_015061	CCG	2	6	263282	263287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830963
5535	NC_015061	CCA	2	6	263333	263338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830963
5536	NC_015061	CCG	2	6	263341	263346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830963
5537	NC_015061	CTG	2	6	263383	263388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830963
5538	NC_015061	CGA	2	6	263430	263435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830963
5539	NC_015061	ACGC	2	8	263477	263484	25 %	0 %	25 %	50 %	322830963
5540	NC_015061	AAG	2	6	263486	263491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830963
5541	NC_015061	CAG	2	6	263551	263556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830963
5542	NC_015061	AAC	2	6	263581	263586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_015061	CTG	2	6	263675	263680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_015061	A	7	7	263706	263712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015061	T	6	6	263742	263747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_015061	TCA	2	6	263805	263810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830964
5547	NC_015061	TGG	2	6	263844	263849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830964
5548	NC_015061	CTG	2	6	263901	263906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830964
5549	NC_015061	GGGC	2	8	263937	263944	0 %	0 %	75 %	25 %	322830964
5550	NC_015061	A	6	6	264035	264040	100 %	0 %	0 %	0 %	322830964
5551	NC_015061	GCG	2	6	264053	264058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830964
5552	NC_015061	TGA	2	6	264186	264191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830964
5553	NC_015061	TCTG	2	8	264198	264205	0 %	50 %	25 %	25 %	322830964
5554	NC_015061	GTG	2	6	264237	264242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830964
5555	NC_015061	A	6	6	264296	264301	100 %	0 %	0 %	0 %	322830964
5556	NC_015061	GTT	2	6	264472	264477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830964
5557	NC_015061	TG	3	6	264482	264487	0 %	50 %	50 %	0 %	322830964
5558	NC_015061	TGA	2	6	264573	264578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830964
5559	NC_015061	TTC	2	6	264596	264601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830964
5560	NC_015061	CTG	2	6	264656	264661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830964
5561	NC_015061	TGCAT	2	10	264715	264724	20 %	40 %	20 %	20 %	322830964
5562	NC_015061	AAG	2	6	264731	264736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015061	TG	3	6	264746	264751	0 %	50 %	50 %	0 %	322830965
5564	NC_015061	CGA	2	6	264804	264809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830965
5565	NC_015061	GCC	3	9	264931	264939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830965
5566	NC_015061	CGG	3	9	264950	264958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830965
5567	NC_015061	GTC	2	6	264967	264972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830965
5568	NC_015061	ATGC	2	8	265135	265142	25 %	25 %	25 %	25 %	322830965
5569	NC_015061	AC	3	6	265175	265180	50 %	0 %	0 %	50 %	322830965
5570	NC_015061	CGC	2	6	265259	265264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830965
5571	NC_015061	G	6	6	265266	265271	0 %	0 %	100 %	0 %	322830965
5572	NC_015061	CAT	2	6	265305	265310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830965
5573	NC_015061	AAG	2	6	265382	265387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_015061	TGC	2	6	265448	265453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830966
5575	NC_015061	CTG	2	6	265525	265530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830966
5576	NC_015061	CG	3	6	265561	265566	0 %	0 %	50 %	50 %	322830966
5577	NC_015061	CGG	3	9	265670	265678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830966
5578	NC_015061	TGG	2	6	265814	265819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830966
5579	NC_015061	GCT	2	6	265989	265994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830966
5580	NC_015061	GCG	2	6	266005	266010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830966
5581	NC_015061	CCCG	2	8	266045	266052	0 %	0 %	25 %	75 %	322830966
5582	NC_015061	AAC	2	6	266073	266078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830966
5583	NC_015061	GT	3	6	266084	266089	0 %	50 %	50 %	0 %	322830966
5584	NC_015061	A	6	6	266102	266107	100 %	0 %	0 %	0 %	322830966
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5586	NC_015061	GCC	2	6	266205	266210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830966
5587	NC_015061	CGC	2	6	266236	266241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830966
5588	NC_015061	AACG	2	8	266323	266330	50 %	0 %	25 %	25 %	322830966
5589	NC_015061	T	6	6	266392	266397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015061	TAC	2	6	266445	266450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830967
5591	NC_015061	T	6	6	266467	266472	0 %	100 %	0 %	0 %	322830967
5592	NC_015061	CAT	2	6	266507	266512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830967
5593	NC_015061	AGAA	2	8	266532	266539	75 %	0 %	25 %	0 %	322830967
5594	NC_015061	TTC	2	6	266584	266589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830967
5595	NC_015061	TAAC	2	8	266619	266626	50 %	25 %	0 %	25 %	322830967
5596	NC_015061	GAAT	2	8	266656	266663	50 %	25 %	25 %	0 %	322830967
5597	NC_015061	TGA	2	6	266687	266692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830968
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5600	NC_015061	GT	3	6	267086	267091	0 %	50 %	50 %	0 %	322830969
5601	NC_015061	CAGC	2	8	267215	267222	25 %	0 %	25 %	50 %	322830969
5602	NC_015061	TCT	2	6	267233	267238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830969
5603	NC_015061	GCG	2	6	267295	267300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830969
5604	NC_015061	TTG	2	6	267421	267426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830969
5605	NC_015061	CCAGTT	2	12	267437	267448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322830969
5606	NC_015061	CGG	2	6	267551	267556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830969
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5608	NC_015061	GCAG	2	8	267631	267638	25 %	0 %	50 %	25 %	322830969
5609	NC_015061	GCA	2	6	267641	267646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830969
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5611	NC_015061	ACGCTG	2	12	267715	267726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830969
5612	NC_015061	GTT	2	6	267737	267742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830969
5613	NC_015061	CAG	2	6	267743	267748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830969
5614	NC_015061	GAG	2	6	267847	267852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_015061	TGA	2	6	267853	267858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_015061	TCA	2	6	267975	267980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830970
5617	NC_015061	GCCC	2	8	268083	268090	0 %	0 %	25 %	75 %	322830970
5618	NC_015061	TCATC	2	10	268129	268138	20 %	40 %	0 %	40 %	322830970
5619	NC_015061	ACA	2	6	268171	268176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830971
5620	NC_015061	GCC	2	6	268178	268183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830971
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5622	NC_015061	GCC	2	6	268313	268318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830971
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5736	NC_015061	GC	5	10	273703	273712	0 %	0 %	50 %	50 %	322830974
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5743	NC_015061	TGC	2	6	274174	274179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5745	NC_015061	TAA	2	6	274243	274248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5746	NC_015061	CAA	2	6	274310	274315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5747	NC_015061	TTA	2	6	274322	274327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830975
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5750	NC_015061	CCTG	2	8	274448	274455	0 %	25 %	25 %	50 %	322830975
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5853	NC_015061	TGA	2	6	280306	280311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830975
5854	NC_015061	A	6	6	280325	280330	100 %	0 %	0 %	0 %	322830975
5855	NC_015061	CGC	2	6	280350	280355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5859	NC_015061	GAT	2	6	280467	280472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830976
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5990	NC_015061	CTG	2	6	287341	287346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830980
5991	NC_015061	GAT	2	6	287432	287437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830980
5992	NC_015061	TCA	2	6	287514	287519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830980
5993	NC_015061	AATCA	2	10	287540	287549	60 %	20 %	0 %	20 %	322830980
5994	NC_015061	GAG	2	6	287593	287598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830980
5995	NC_015061	GACAG	2	10	287618	287627	40 %	0 %	40 %	20 %	322830980
5996	NC_015061	GA	4	8	287659	287666	50 %	0 %	50 %	0 %	322830980
5997	NC_015061	GCT	2	6	287688	287693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830980
5998	NC_015061	CAA	2	6	287752	287757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830980
5999	NC_015061	ATCG	2	8	287783	287790	25 %	25 %	25 %	25 %	322830980
6000	NC_015061	T	6	6	287854	287859	0 %	100 %	0 %	0 %	322830980

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