MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_014834	GAT	2	6	133516	133521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931515
3503	NC_014834	GTT	2	6	133610	133615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931515
3504	NC_014834	GTT	2	6	133619	133624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931515
3505	NC_014834	TTG	2	6	133662	133667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931515
3506	NC_014834	GGC	2	6	133668	133673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931515
3507	NC_014834	GGT	2	6	133682	133687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931515
3508	NC_014834	CGC	2	6	133700	133705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931515
3509	NC_014834	CAC	2	6	133730	133735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931515
3510	NC_014834	GGC	2	6	133742	133747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931515
3511	NC_014834	ACG	2	6	133782	133787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931515
3512	NC_014834	GCC	2	6	133790	133795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931515
3513	NC_014834	GCCG	2	8	133804	133811	0 %	0 %	50 %	50 %	316931515
3514	NC_014834	GAC	2	6	133820	133825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931515
3515	NC_014834	CCG	2	6	133860	133865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931515
3516	NC_014834	GGT	2	6	133874	133879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931515
3517	NC_014834	CTT	2	6	133880	133885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931515
3518	NC_014834	GCCG	2	8	133922	133929	0 %	0 %	50 %	50 %	316931515
3519	NC_014834	GC	3	6	133938	133943	0 %	0 %	50 %	50 %	316931515
3520	NC_014834	GCC	2	6	133970	133975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931515
3521	NC_014834	GGCG	2	8	133987	133994	0 %	0 %	75 %	25 %	316931515
3522	NC_014834	TCG	2	6	134046	134051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931515
3523	NC_014834	GCC	2	6	134066	134071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931515
3524	NC_014834	GC	3	6	134072	134077	0 %	0 %	50 %	50 %	316931515
3525	NC_014834	CTT	2	6	134162	134167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931515
3526	NC_014834	GGT	2	6	134192	134197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931515
3527	NC_014834	GTT	2	6	134204	134209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931515
3528	NC_014834	CGC	2	6	134215	134220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931515
3529	NC_014834	TGG	2	6	134325	134330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931515
3530	NC_014834	GCG	2	6	134377	134382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931515
3531	NC_014834	GCA	2	6	134467	134472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931515
3532	NC_014834	TTC	2	6	134549	134554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931515
3533	NC_014834	GCA	2	6	134602	134607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931515
3534	NC_014834	CTG	3	9	134618	134626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931515
3535	NC_014834	GCG	2	6	134664	134669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931515
3536	NC_014834	GTTGG	2	10	134698	134707	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014834	GCG	2	6	134745	134750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3538	NC_014834	CGA	3	9	134768	134776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931516
3539	NC_014834	TGA	2	6	134783	134788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931516
3540	NC_014834	CGG	2	6	134798	134803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3541	NC_014834	GCG	3	9	134861	134869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3542	NC_014834	GCTG	2	8	134879	134886	0 %	25 %	50 %	25 %	316931516
3543	NC_014834	AAT	2	6	134909	134914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316931516
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3545	NC_014834	GCA	2	6	134975	134980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931516
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3547	NC_014834	GAA	2	6	135057	135062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931516
3548	NC_014834	GC	3	6	135131	135136	0 %	0 %	50 %	50 %	316931516
3549	NC_014834	GCA	3	9	135146	135154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931516
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3551	NC_014834	GGC	2	6	135258	135263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3552	NC_014834	ATG	2	6	135384	135389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931516
3553	NC_014834	GCG	2	6	135496	135501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3554	NC_014834	TCG	2	6	135528	135533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931516
3555	NC_014834	GGC	2	6	135563	135568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931517
3556	NC_014834	ACC	2	6	135615	135620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931517
3557	NC_014834	CGG	2	6	135628	135633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931517
3558	NC_014834	GAA	2	6	135647	135652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931517
3559	NC_014834	GCCC	2	8	135706	135713	0 %	0 %	25 %	75 %	316931517
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3561	NC_014834	CA	4	8	135941	135948	50 %	0 %	0 %	50 %	316931517
3562	NC_014834	GCG	2	6	135988	135993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931517
3563	NC_014834	GCA	2	6	136042	136047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931517
3564	NC_014834	GCCGAG	2	12	136157	136168	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931517
3565	NC_014834	CAC	2	6	136184	136189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931517
3566	NC_014834	ACG	2	6	136282	136287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931517
3567	NC_014834	CAG	2	6	136343	136348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931517
3568	NC_014834	CAT	2	6	136355	136360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931517
3569	NC_014834	GC	3	6	136431	136436	0 %	0 %	50 %	50 %	316931517
3570	NC_014834	CGG	2	6	136471	136476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931517
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3572	NC_014834	TGC	2	6	136610	136615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931518
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3580	NC_014834	CG	3	6	136916	136921	0 %	0 %	50 %	50 %	316931518
3581	NC_014834	CGC	2	6	136964	136969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931518
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3583	NC_014834	CCGG	2	8	136986	136993	0 %	0 %	50 %	50 %	316931518
3584	NC_014834	CGTG	2	8	137018	137025	0 %	25 %	50 %	25 %	316931518
3585	NC_014834	GC	3	6	137074	137079	0 %	0 %	50 %	50 %	316931518
3586	NC_014834	TCG	2	6	137119	137124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931518
3587	NC_014834	ACC	2	6	137184	137189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931518
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3589	NC_014834	GCGAC	2	10	137237	137246	20 %	0 %	40 %	40 %	316931518
3590	NC_014834	GCA	2	6	137294	137299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931518
3591	NC_014834	CAG	2	6	137307	137312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931518
3592	NC_014834	GC	4	8	137315	137322	0 %	0 %	50 %	50 %	316931518
3593	NC_014834	TGT	2	6	137363	137368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931518
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3597	NC_014834	GCG	2	6	137692	137697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_014834	GC	3	6	137799	137804	0 %	0 %	50 %	50 %	316931519
3599	NC_014834	GCG	2	6	137847	137852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931519
3600	NC_014834	CGG	2	6	137870	137875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931519
3601	NC_014834	CCA	2	6	137981	137986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931519
3602	NC_014834	GAG	2	6	138037	138042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931519
3603	NC_014834	CGG	2	6	138048	138053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931519
3604	NC_014834	TCG	2	6	138167	138172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931519
3605	NC_014834	GGT	2	6	138177	138182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931519
3606	NC_014834	TGC	2	6	138206	138211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931519
3607	NC_014834	GCCG	2	8	138219	138226	0 %	0 %	50 %	50 %	316931519
3608	NC_014834	CCG	2	6	138228	138233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931519
3609	NC_014834	CCG	2	6	138237	138242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931519
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3612	NC_014834	GC	3	6	138375	138380	0 %	0 %	50 %	50 %	316931519
3613	NC_014834	AAG	2	6	138589	138594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931519
3614	NC_014834	GGC	2	6	138596	138601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931519
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3617	NC_014834	CGC	3	9	138638	138646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931519
3618	NC_014834	GTGA	2	8	138647	138654	25 %	25 %	50 %	0 %	316931519
3619	NC_014834	GGC	2	6	138672	138677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931520
3620	NC_014834	GGC	2	6	138749	138754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931520
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3622	NC_014834	GGCGA	2	10	138768	138777	20 %	0 %	60 %	20 %	316931520
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3737	NC_014834	CAGGA	2	10	142864	142873	40 %	0 %	40 %	20 %	316931523
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3740	NC_014834	CTGG	2	8	142953	142960	0 %	25 %	50 %	25 %	316931523
3741	NC_014834	GAC	2	6	143017	143022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3742	NC_014834	AGC	2	6	143037	143042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3743	NC_014834	GGC	2	6	143068	143073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931524
3744	NC_014834	CGA	2	6	143175	143180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3745	NC_014834	CAT	2	6	143191	143196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931524
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3747	NC_014834	GTC	2	6	143266	143271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3748	NC_014834	GC	3	6	143278	143283	0 %	0 %	50 %	50 %	316931524
3749	NC_014834	CGG	2	6	143295	143300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931524
3750	NC_014834	CGGT	2	8	143381	143388	0 %	25 %	50 %	25 %	316931524
3751	NC_014834	CTG	2	6	143452	143457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3752	NC_014834	ACCG	2	8	143519	143526	25 %	0 %	25 %	50 %	316931524
3753	NC_014834	CCGC	2	8	143527	143534	0 %	0 %	25 %	75 %	316931524
3754	NC_014834	GCTC	2	8	143544	143551	0 %	25 %	25 %	50 %	316931524
3755	NC_014834	GCGG	2	8	143647	143654	0 %	0 %	75 %	25 %	316931524
3756	NC_014834	CGGC	2	8	143673	143680	0 %	0 %	50 %	50 %	316931524
3757	NC_014834	GCG	2	6	143695	143700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931524
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3763	NC_014834	CTG	2	6	143911	143916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3764	NC_014834	CG	3	6	143938	143943	0 %	0 %	50 %	50 %	316931524
3765	NC_014834	CG	4	8	143949	143956	0 %	0 %	50 %	50 %	316931524
3766	NC_014834	TCG	2	6	143963	143968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
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3772	NC_014834	GCA	3	9	144141	144149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931524
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3784	NC_014834	CA	3	6	144615	144620	50 %	0 %	0 %	50 %	316931524
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3790	NC_014834	TCG	2	6	144926	144931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
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3800	NC_014834	ACCG	2	8	145304	145311	25 %	0 %	25 %	50 %	316931525
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3986	NC_014834	GGA	2	6	152518	152523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931528
3987	NC_014834	CGC	2	6	152596	152601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931528
3988	NC_014834	CG	3	6	152628	152633	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3989	NC_014834	GCT	2	6	152689	152694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3990	NC_014834	CGG	2	6	152700	152705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931528
3991	NC_014834	GCT	2	6	152722	152727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3992	NC_014834	GC	3	6	152772	152777	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3993	NC_014834	GCG	2	6	152865	152870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931528
3994	NC_014834	GC	3	6	152872	152877	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3995	NC_014834	CGTG	2	8	152878	152885	0 %	25 %	50 %	25 %	316931528
3996	NC_014834	CTGGC	2	10	152927	152936	0 %	20 %	40 %	40 %	316931528
3997	NC_014834	GCCG	2	8	152959	152966	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3998	NC_014834	GTG	2	6	152990	152995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931528
3999	NC_014834	CGGC	2	8	153024	153031	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
4000	NC_014834	GCC	2	6	153082	153087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931528

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