MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014834	GATC	2	8	95884	95891	25 %	25 %	25 %	25 %	316931480
2502	NC_014834	GTC	2	6	95942	95947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931480
2503	NC_014834	CGA	2	6	95974	95979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931480
2504	NC_014834	GTC	2	6	95990	95995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931480
2505	NC_014834	CG	3	6	96011	96016	0 %	0 %	50 %	50 %	316931480
2506	NC_014834	GGC	2	6	96019	96024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931480
2507	NC_014834	GGC	2	6	96089	96094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931480
2508	NC_014834	GCC	2	6	96116	96121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931480
2509	NC_014834	AGC	2	6	96132	96137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931480
2510	NC_014834	GTC	2	6	96149	96154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931480
2511	NC_014834	CGG	2	6	96158	96163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931480
2512	NC_014834	ATC	2	6	96177	96182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931480
2513	NC_014834	GCC	2	6	96206	96211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931480
2514	NC_014834	TCA	2	6	96226	96231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931480
2515	NC_014834	CGGC	2	8	96240	96247	0 %	0 %	50 %	50 %	316931480
2516	NC_014834	CGT	2	6	96262	96267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931480
2517	NC_014834	GC	3	6	96354	96359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_014834	GCC	2	6	96381	96386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_014834	CGG	2	6	96400	96405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_014834	CGG	2	6	96410	96415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_014834	GC	3	6	96424	96429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_014834	ACG	2	6	96490	96495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_014834	GCCGGC	2	12	96496	96507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_014834	CGC	2	6	96525	96530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_014834	CCG	2	6	96614	96619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931481
2526	NC_014834	CG	3	6	96657	96662	0 %	0 %	50 %	50 %	316931481
2527	NC_014834	TCG	2	6	96706	96711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931481
2528	NC_014834	CGGC	2	8	96743	96750	0 %	0 %	50 %	50 %	316931481
2529	NC_014834	GC	3	6	96749	96754	0 %	0 %	50 %	50 %	316931481
2530	NC_014834	CTG	2	6	96762	96767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931481
2531	NC_014834	GCG	2	6	96781	96786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931481
2532	NC_014834	TGC	2	6	96790	96795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931481
2533	NC_014834	CAGCG	2	10	96873	96882	20 %	0 %	40 %	40 %	316931481
2534	NC_014834	GTG	2	6	96903	96908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931481
2535	NC_014834	GCT	2	6	97103	97108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931481
2536	NC_014834	CG	4	8	97164	97171	0 %	0 %	50 %	50 %	316931481
2537	NC_014834	CCGA	2	8	97221	97228	25 %	0 %	25 %	50 %	316931481
2538	NC_014834	CGG	2	6	97286	97291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931481
2539	NC_014834	GCG	2	6	97321	97326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931481
2540	NC_014834	GCG	2	6	97390	97395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931481
2541	NC_014834	GAC	2	6	97493	97498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_014834	CGCA	2	8	97528	97535	25 %	0 %	25 %	50 %	316931482
2543	NC_014834	GAC	2	6	97545	97550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2544	NC_014834	GCC	2	6	97639	97644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931482
2545	NC_014834	GCG	2	6	97646	97651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931482
2546	NC_014834	CCG	2	6	97664	97669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931482
2547	NC_014834	CCA	2	6	97676	97681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931482
2548	NC_014834	CGT	2	6	97695	97700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2549	NC_014834	GCCG	2	8	97791	97798	0 %	0 %	50 %	50 %	316931482
2550	NC_014834	GAGT	2	8	97799	97806	25 %	25 %	50 %	0 %	316931482
2551	NC_014834	GTG	2	6	97819	97824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931482
2552	NC_014834	GCCGC	2	10	97828	97837	0 %	0 %	40 %	60 %	316931482
2553	NC_014834	CCG	2	6	97897	97902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931482
2554	NC_014834	GCA	2	6	97940	97945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2555	NC_014834	TGC	2	6	97964	97969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2556	NC_014834	CAA	2	6	98000	98005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931482
2557	NC_014834	GACA	2	8	98011	98018	50 %	0 %	25 %	25 %	316931482
2558	NC_014834	CGA	2	6	98063	98068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2559	NC_014834	CTT	2	6	98091	98096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931482
2560	NC_014834	GCG	3	9	98099	98107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931482
2561	NC_014834	GGCC	2	8	98108	98115	0 %	0 %	50 %	50 %	316931482
2562	NC_014834	CCGG	2	8	98122	98129	0 %	0 %	50 %	50 %	316931482
2563	NC_014834	CCA	2	6	98156	98161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931482
2564	NC_014834	AGC	2	6	98209	98214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2565	NC_014834	CTT	2	6	98253	98258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931482
2566	NC_014834	GAA	2	6	98283	98288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931482
2567	NC_014834	GCT	2	6	98327	98332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2568	NC_014834	CCT	2	6	98372	98377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931482
2569	NC_014834	GGA	2	6	98412	98417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931482
2570	NC_014834	GCC	2	6	98430	98435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931482
2571	NC_014834	CTG	2	6	98448	98453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2572	NC_014834	CCA	2	6	98504	98509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931482
2573	NC_014834	GC	3	6	98538	98543	0 %	0 %	50 %	50 %	316931482
2574	NC_014834	CGC	3	9	98541	98549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931482
2575	NC_014834	TGGT	2	8	98602	98609	0 %	50 %	50 %	0 %	316931482
2576	NC_014834	ATC	2	6	98632	98637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931482
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2578	NC_014834	GC	3	6	98795	98800	0 %	0 %	50 %	50 %	316931482
2579	NC_014834	GCC	2	6	98806	98811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931482
2580	NC_014834	GGC	2	6	98817	98822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931482
2581	NC_014834	CGA	2	6	98828	98833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931482
2582	NC_014834	CAGC	2	8	98843	98850	25 %	0 %	25 %	50 %	316931482
2583	NC_014834	CG	3	6	98950	98955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2584	NC_014834	CGCC	2	8	98962	98969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2585	NC_014834	CGT	2	6	99012	99017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_014834	TGAAG	2	10	99044	99053	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_014834	GAA	2	6	99080	99085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931483
2588	NC_014834	TGC	2	6	99111	99116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931483
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2591	NC_014834	TGG	2	6	99165	99170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931483
2592	NC_014834	CGG	2	6	99178	99183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931483
2593	NC_014834	GC	3	6	99189	99194	0 %	0 %	50 %	50 %	316931483
2594	NC_014834	GCC	2	6	99215	99220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931483
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2597	NC_014834	ATC	2	6	99284	99289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931483
2598	NC_014834	GTG	2	6	99368	99373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931483
2599	NC_014834	CGG	2	6	99418	99423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931483
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2601	NC_014834	AACGC	2	10	99564	99573	40 %	0 %	20 %	40 %	316931483
2602	NC_014834	CCG	3	9	99617	99625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931483
2603	NC_014834	GCTCG	2	10	99682	99691	0 %	20 %	40 %	40 %	316931483
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2608	NC_014834	GCT	3	9	99869	99877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_014834	CCA	2	6	99891	99896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_014834	GAA	2	6	99949	99954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_014834	GCG	2	6	99963	99968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_014834	CGG	2	6	99973	99978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_014834	GCAC	2	8	100052	100059	25 %	0 %	25 %	50 %	316931484
2614	NC_014834	CGG	2	6	100065	100070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931484
2615	NC_014834	CTGG	2	8	100073	100080	0 %	25 %	50 %	25 %	316931484
2616	NC_014834	TGT	2	6	100087	100092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931484
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2622	NC_014834	GCCG	2	8	100217	100224	0 %	0 %	50 %	50 %	316931484
2623	NC_014834	CCG	2	6	100247	100252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931484
2624	NC_014834	TGG	2	6	100255	100260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931484
2625	NC_014834	CCA	2	6	100294	100299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931484
2626	NC_014834	CTG	3	9	100344	100352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931484
2627	NC_014834	GTCC	2	8	100390	100397	0 %	25 %	25 %	50 %	316931484
2628	NC_014834	CCG	2	6	100426	100431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931484
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2630	NC_014834	ACA	2	6	100471	100476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931484
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2632	NC_014834	CGG	2	6	100495	100500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931484
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2669	NC_014834	CGG	2	6	101718	101723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2670	NC_014834	ACT	2	6	101782	101787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931485
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2691	NC_014834	CG	4	8	102674	102681	0 %	0 %	50 %	50 %	316931487
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2732	NC_014834	TAAA	2	8	104188	104195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2733	NC_014834	GTTTA	2	10	104203	104212	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2734	NC_014834	TGA	2	6	104284	104289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931490
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2736	NC_014834	CG	3	6	104369	104374	0 %	0 %	50 %	50 %	316931490
2737	NC_014834	TCGC	2	8	104422	104429	0 %	25 %	25 %	50 %	316931490
2738	NC_014834	GCT	2	6	104483	104488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931490
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2740	NC_014834	CTTT	2	8	104605	104612	0 %	75 %	0 %	25 %	316931490
2741	NC_014834	CGA	2	6	104615	104620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931490
2742	NC_014834	TGA	2	6	104647	104652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931490
2743	NC_014834	CG	3	6	104660	104665	0 %	0 %	50 %	50 %	316931490
2744	NC_014834	GGC	2	6	104693	104698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931490
2745	NC_014834	GCCGC	2	10	104702	104711	0 %	0 %	40 %	60 %	316931490
2746	NC_014834	CCGCG	2	10	104738	104747	0 %	0 %	40 %	60 %	316931490
2747	NC_014834	GCA	2	6	104753	104758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931490
2748	NC_014834	TGC	2	6	104761	104766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931490
2749	NC_014834	CGC	2	6	104786	104791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931490
2750	NC_014834	CGGC	2	8	104849	104856	0 %	0 %	50 %	50 %	316931490
2751	NC_014834	GAC	2	6	104865	104870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931490
2752	NC_014834	CGC	2	6	104909	104914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931490
2753	NC_014834	AAC	2	6	104942	104947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931490
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2779	NC_014834	CCT	2	6	105931	105936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2869	NC_014834	CCG	2	6	109146	109151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931493
2870	NC_014834	CGG	2	6	109194	109199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931493
2871	NC_014834	CGC	3	9	109228	109236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931493
2872	NC_014834	GCT	2	6	109249	109254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931493
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2877	NC_014834	GC	3	6	109449	109454	0 %	0 %	50 %	50 %	316931493
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2963	NC_014834	ATC	2	6	113058	113063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931497
2964	NC_014834	GCCGAG	2	12	113090	113101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931497
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2971	NC_014834	TGA	2	6	113239	113244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931497
2972	NC_014834	GC	3	6	113274	113279	0 %	0 %	50 %	50 %	316931497
2973	NC_014834	GCCGC	2	10	113284	113293	0 %	0 %	40 %	60 %	316931497
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2982	NC_014834	CG	3	6	113519	113524	0 %	0 %	50 %	50 %	316931497
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2985	NC_014834	CGA	2	6	113614	113619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931497
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2987	NC_014834	CAG	3	9	113678	113686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931497
2988	NC_014834	TGA	2	6	113716	113721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931497
2989	NC_014834	GATC	2	8	113847	113854	25 %	25 %	25 %	25 %	316931498
2990	NC_014834	GGC	2	6	113884	113889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931498
2991	NC_014834	ATCGA	2	10	113951	113960	40 %	20 %	20 %	20 %	316931498
2992	NC_014834	GCC	2	6	113967	113972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931498
2993	NC_014834	CCA	2	6	114000	114005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931498
2994	NC_014834	CGA	2	6	114042	114047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931498
2995	NC_014834	CAC	2	6	114094	114099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931498
2996	NC_014834	GC	4	8	114119	114126	0 %	0 %	50 %	50 %	316931498
2997	NC_014834	CGA	2	6	114192	114197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931498
2998	NC_014834	GCA	2	6	114222	114227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931498
2999	NC_014834	CAG	2	6	114328	114333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931498
3000	NC_014834	CAG	3	9	114337	114345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931498

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