MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014834	GGT	3	9	58536	58544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931448
1502	NC_014834	CGG	2	6	58554	58559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931448
1503	NC_014834	CAT	2	6	58575	58580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931448
1504	NC_014834	TCG	2	6	58584	58589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931448
1505	NC_014834	GATC	2	8	58611	58618	25 %	25 %	25 %	25 %	316931448
1506	NC_014834	CCG	2	6	58723	58728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_014834	CGG	2	6	58734	58739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_014834	GCC	2	6	58760	58765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_014834	GCA	2	6	58896	58901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_014834	TGA	2	6	58918	58923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931449
1511	NC_014834	AAG	2	6	58980	58985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931449
1512	NC_014834	ACC	2	6	59082	59087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931449
1513	NC_014834	CG	3	6	59156	59161	0 %	0 %	50 %	50 %	316931449
1514	NC_014834	CGAT	2	8	59173	59180	25 %	25 %	25 %	25 %	316931449
1515	NC_014834	CTG	3	9	59220	59228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931449
1516	NC_014834	GGGC	2	8	59239	59246	0 %	0 %	75 %	25 %	316931449
1517	NC_014834	GCT	2	6	59282	59287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931449
1518	NC_014834	A	6	6	59307	59312	100 %	0 %	0 %	0 %	316931449
1519	NC_014834	GCC	2	6	59360	59365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931449
1520	NC_014834	CGG	2	6	59371	59376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931449
1521	NC_014834	CGA	2	6	59387	59392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_014834	TCG	2	6	59464	59469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_014834	GCG	2	6	59471	59476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_014834	GTC	2	6	59480	59485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014834	CGC	2	6	59524	59529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_014834	TTGC	2	8	59541	59548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_014834	TGA	2	6	59549	59554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014834	CGCGT	2	10	59621	59630	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1529	NC_014834	CGC	2	6	59700	59705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931450
1530	NC_014834	CTG	2	6	59710	59715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931450
1531	NC_014834	GTA	2	6	59899	59904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931450
1532	NC_014834	CTC	2	6	59927	59932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_014834	ATT	2	6	59967	59972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316931451
1534	NC_014834	GCTCCG	2	12	60006	60017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931451
1535	NC_014834	GATCA	2	10	60022	60031	40 %	20 %	20 %	20 %	316931451
1536	NC_014834	TTC	2	6	60047	60052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931451
1537	NC_014834	CG	3	6	60110	60115	0 %	0 %	50 %	50 %	316931451
1538	NC_014834	CTG	2	6	60154	60159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931451
1539	NC_014834	CCGC	2	8	60160	60167	0 %	0 %	25 %	75 %	316931451
1540	NC_014834	TGT	2	6	60285	60290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931451
1541	NC_014834	TCG	2	6	60344	60349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931451
1542	NC_014834	CAG	2	6	60355	60360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931451
1543	NC_014834	GCCG	2	8	60460	60467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_014834	AAG	2	6	60504	60509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014834	CGG	3	9	60558	60566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931452
1546	NC_014834	CGG	2	6	60571	60576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931452
1547	NC_014834	CGG	3	9	60593	60601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931452
1548	NC_014834	CCGTAA	2	12	60604	60615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316931452
1549	NC_014834	GCC	2	6	60636	60641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
1550	NC_014834	GCCG	2	8	60671	60678	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1551	NC_014834	ACC	3	9	60693	60701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931452
1552	NC_014834	CCG	2	6	60802	60807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
1553	NC_014834	CGG	2	6	60860	60865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931452
1554	NC_014834	CGA	2	6	60940	60945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931452
1555	NC_014834	GGT	2	6	60947	60952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931452
1556	NC_014834	GCCG	2	8	60954	60961	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1557	NC_014834	TCA	2	6	61009	61014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931452
1558	NC_014834	CCA	2	6	61015	61020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931452
1559	NC_014834	GGT	2	6	61073	61078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931452
1560	NC_014834	TCG	2	6	61155	61160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931452
1561	NC_014834	GCC	2	6	61220	61225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
1562	NC_014834	CGAGC	2	10	61256	61265	20 %	0 %	40 %	40 %	316931452
1563	NC_014834	GC	3	6	61274	61279	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1564	NC_014834	CGGC	2	8	61411	61418	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1565	NC_014834	GCC	2	6	61439	61444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
1566	NC_014834	GATCTC	2	12	61445	61456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316931452
1567	NC_014834	CCA	2	6	61483	61488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931452
1568	NC_014834	GCA	2	6	61492	61497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931452
1569	NC_014834	ACC	2	6	61586	61591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931452
1570	NC_014834	GAA	2	6	61615	61620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931452
1571	NC_014834	CCA	2	6	61653	61658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931453
1572	NC_014834	CAC	3	9	61687	61695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931453
1573	NC_014834	CGG	2	6	61702	61707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931453
1574	NC_014834	CAC	2	6	61735	61740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931453
1575	NC_014834	ATC	2	6	61772	61777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931453
1576	NC_014834	GTC	2	6	61807	61812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1577	NC_014834	GTG	2	6	61817	61822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931453
1578	NC_014834	CAG	2	6	61825	61830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1579	NC_014834	GCC	2	6	61880	61885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931453
1580	NC_014834	GCA	2	6	61905	61910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1581	NC_014834	AGA	2	6	61920	61925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931453
1582	NC_014834	GAA	2	6	61987	61992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931453
1583	NC_014834	CGA	2	6	62076	62081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1584	NC_014834	GCA	2	6	62115	62120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1585	NC_014834	TGA	2	6	62127	62132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931453
1586	NC_014834	AGA	2	6	62142	62147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931453
1587	NC_014834	GTG	2	6	62279	62284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931453
1588	NC_014834	CGA	2	6	62295	62300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1589	NC_014834	GCCC	2	8	62331	62338	0 %	0 %	25 %	75 %	316931453
1590	NC_014834	GCA	2	6	62454	62459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931453
1591	NC_014834	CGA	2	6	62507	62512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1592	NC_014834	GCC	2	6	62589	62594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931454
1593	NC_014834	GCC	2	6	62649	62654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931454
1594	NC_014834	GAT	2	6	62670	62675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931454
1595	NC_014834	GAA	2	6	62688	62693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931454
1596	NC_014834	GAC	2	6	62700	62705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1597	NC_014834	GAC	2	6	62709	62714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1598	NC_014834	GAA	2	6	62721	62726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931454
1599	NC_014834	ACA	2	6	62738	62743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931454
1600	NC_014834	GAT	2	6	62751	62756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931454
1601	NC_014834	CGC	2	6	62793	62798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931454
1602	NC_014834	GAT	2	6	62886	62891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931454
1603	NC_014834	CGC	2	6	62898	62903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931454
1604	NC_014834	TGA	2	6	62905	62910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931454
1605	NC_014834	GC	4	8	62942	62949	0 %	0 %	50 %	50 %	316931454
1606	NC_014834	CGAG	2	8	62969	62976	25 %	0 %	50 %	25 %	316931454
1607	NC_014834	ACC	2	6	63007	63012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931454
1608	NC_014834	CAG	2	6	63039	63044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1609	NC_014834	CAG	3	9	63093	63101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1610	NC_014834	AGCGAC	2	12	63106	63117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1611	NC_014834	GGC	2	6	63159	63164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931454
1612	NC_014834	AGT	2	6	63167	63172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931454
1613	NC_014834	GGCC	3	12	63269	63280	0 %	0 %	50 %	50 %	316931454
1614	NC_014834	AGA	2	6	63284	63289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931454
1615	NC_014834	CAC	2	6	63297	63302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931454
1616	NC_014834	CAG	2	6	63321	63326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931454
1617	NC_014834	GCT	2	6	63375	63380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_014834	GCA	2	6	63563	63568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931455
1619	NC_014834	GCG	2	6	63589	63594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931455
1620	NC_014834	CTT	2	6	63602	63607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931455
1621	NC_014834	TCT	2	6	63614	63619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931455
1622	NC_014834	TCGG	2	8	63703	63710	0 %	25 %	50 %	25 %	316931455
1623	NC_014834	TTG	2	6	63715	63720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931455
1624	NC_014834	GCT	2	6	63752	63757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931455
1625	NC_014834	GCC	2	6	63793	63798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931455
1626	NC_014834	CGGT	2	8	63844	63851	0 %	25 %	50 %	25 %	316931455
1627	NC_014834	CTC	2	6	63891	63896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931455
1628	NC_014834	GCC	2	6	63906	63911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931455
1629	NC_014834	GCC	2	6	63930	63935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931455
1630	NC_014834	GAT	2	6	63936	63941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931455
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1639	NC_014834	CGA	3	9	64413	64421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931455
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1642	NC_014834	CAT	2	6	64560	64565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931455
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1649	NC_014834	GC	3	6	64899	64904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1650	NC_014834	AGC	2	6	64908	64913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1651	NC_014834	GCG	2	6	64997	65002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1652	NC_014834	CGC	2	6	65011	65016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1653	NC_014834	GCG	2	6	65044	65049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1654	NC_014834	GTC	2	6	65135	65140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931456
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1658	NC_014834	ATCGG	2	10	65230	65239	20 %	20 %	40 %	20 %	316931456
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1661	NC_014834	ACCGG	2	10	65328	65337	20 %	0 %	40 %	40 %	316931456
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1689	NC_014834	CGGG	2	8	66448	66455	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1709	NC_014834	ACC	2	6	67147	67152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1743	NC_014834	CGA	2	6	68415	68420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931458
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1745	NC_014834	GAT	2	6	68460	68465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931458
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1747	NC_014834	CGA	2	6	68523	68528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931459
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1749	NC_014834	GCG	2	6	68549	68554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931459
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