MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014834	CGG	2	6	512431	512436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931863
13502	NC_014834	CGGC	2	8	512444	512451	0 %	0 %	50 %	50 %	316931863
13503	NC_014834	GCC	2	6	512462	512467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931863
13504	NC_014834	TCG	2	6	512483	512488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931863
13505	NC_014834	GGC	2	6	512590	512595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931863
13506	NC_014834	CTG	2	6	512668	512673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931863
13507	NC_014834	CTG	2	6	512689	512694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931863
13508	NC_014834	CGC	2	6	512701	512706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931863
13509	NC_014834	TGC	2	6	512723	512728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931863
13510	NC_014834	GCG	2	6	512792	512797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931863
13511	NC_014834	GCC	2	6	512839	512844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931863
13512	NC_014834	CGC	2	6	512845	512850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931863
13513	NC_014834	CAG	2	6	512856	512861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931863
13514	NC_014834	ACA	2	6	512862	512867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931863
13515	NC_014834	TGCA	2	8	512926	512933	25 %	25 %	25 %	25 %	316931863
13516	NC_014834	GAT	2	6	512962	512967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931864
13517	NC_014834	TCG	2	6	512986	512991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931864
13518	NC_014834	CAG	2	6	513014	513019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931864
13519	NC_014834	GTCC	2	8	513100	513107	0 %	25 %	25 %	50 %	316931864
13520	NC_014834	CCG	2	6	513111	513116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931864
13521	NC_014834	TGC	2	6	513181	513186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931864
13522	NC_014834	TCG	2	6	513204	513209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931864
13523	NC_014834	TCC	2	6	513261	513266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931864
13524	NC_014834	ATC	2	6	513350	513355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931864
13525	NC_014834	CG	4	8	513360	513367	0 %	0 %	50 %	50 %	316931864
13526	NC_014834	ATC	2	6	513423	513428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931864
13527	NC_014834	CTC	2	6	513468	513473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13528	NC_014834	CGT	2	6	513488	513493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_014834	GCCGC	2	10	513496	513505	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13530	NC_014834	C	6	6	513505	513510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13531	NC_014834	ACG	2	6	513618	513623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931865
13532	NC_014834	CGC	2	6	513625	513630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931865
13533	NC_014834	GCG	2	6	513678	513683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931865
13534	NC_014834	GAC	2	6	513707	513712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931865
13535	NC_014834	GCT	2	6	513752	513757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931865
13536	NC_014834	GAC	2	6	513758	513763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931865
13537	NC_014834	TTC	2	6	513812	513817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931865
13538	NC_014834	GTC	2	6	513827	513832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_014834	CCTTT	2	10	514016	514025	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13540	NC_014834	GCC	2	6	514120	514125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13541	NC_014834	GCGCC	2	10	514163	514172	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13542	NC_014834	TCA	2	6	514192	514197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931866
13543	NC_014834	GAT	2	6	514284	514289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931866
13544	NC_014834	CGT	2	6	514297	514302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931866
13545	NC_014834	GCC	2	6	514352	514357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931866
13546	NC_014834	GC	3	6	514361	514366	0 %	0 %	50 %	50 %	316931866
13547	NC_014834	CGG	2	6	514375	514380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931866
13548	NC_014834	CGG	2	6	514407	514412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931866
13549	NC_014834	CTG	2	6	514417	514422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931866
13550	NC_014834	CTG	2	6	514426	514431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931866
13551	NC_014834	AGCG	2	8	514479	514486	25 %	0 %	50 %	25 %	316931866
13552	NC_014834	GCG	2	6	514595	514600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931866
13553	NC_014834	CCA	2	6	514666	514671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931866
13554	NC_014834	CG	3	6	514714	514719	0 %	0 %	50 %	50 %	316931866
13555	NC_014834	GCG	2	6	514731	514736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931866
13556	NC_014834	GCC	2	6	514747	514752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931866
13557	NC_014834	AGC	2	6	514754	514759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931866
13558	NC_014834	CGG	2	6	514783	514788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931866
13559	NC_014834	CG	3	6	514792	514797	0 %	0 %	50 %	50 %	316931866
13560	NC_014834	GC	3	6	514798	514803	0 %	0 %	50 %	50 %	316931866
13561	NC_014834	CGG	2	6	514833	514838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_014834	CGG	2	6	514841	514846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_014834	GGT	2	6	514891	514896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931867
13564	NC_014834	GCT	2	6	514899	514904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931867
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13568	NC_014834	CGG	2	6	515046	515051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931867
13569	NC_014834	CGA	2	6	515067	515072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931867
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13573	NC_014834	TCG	2	6	515183	515188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931867
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13577	NC_014834	CAG	2	6	515311	515316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931867
13578	NC_014834	GCCGC	2	10	515324	515333	0 %	0 %	40 %	60 %	316931867
13579	NC_014834	GCG	2	6	515344	515349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931867
13580	NC_014834	CG	3	6	515466	515471	0 %	0 %	50 %	50 %	316931867
13581	NC_014834	CCA	2	6	515472	515477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931867
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13586	NC_014834	CGG	2	6	515712	515717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931867
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13588	NC_014834	CGA	2	6	515748	515753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931867
13589	NC_014834	TCGGG	2	10	515826	515835	0 %	20 %	60 %	20 %	316931867
13590	NC_014834	CAC	2	6	515845	515850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931867
13591	NC_014834	CG	3	6	515879	515884	0 %	0 %	50 %	50 %	316931867
13592	NC_014834	GCGTCA	2	12	515886	515897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931867
13593	NC_014834	GGT	2	6	515917	515922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931867
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13596	NC_014834	TTC	2	6	516020	516025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931867
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13599	NC_014834	CGCGG	2	10	516058	516067	0 %	0 %	60 %	40 %	316931867
13600	NC_014834	CGG	2	6	516071	516076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931867
13601	NC_014834	GGTC	2	8	516081	516088	0 %	25 %	50 %	25 %	316931867
13602	NC_014834	CGT	2	6	516094	516099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931867
13603	NC_014834	AGG	2	6	516181	516186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_014834	AGG	2	6	516254	516259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_014834	CGA	2	6	516285	516290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931868
13606	NC_014834	TCG	2	6	516305	516310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931868
13607	NC_014834	CCG	2	6	516341	516346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931868
13608	NC_014834	CGT	2	6	516351	516356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931868
13609	NC_014834	GC	3	6	516382	516387	0 %	0 %	50 %	50 %	316931868
13610	NC_014834	CGGGC	2	10	516438	516447	0 %	0 %	60 %	40 %	316931868
13611	NC_014834	GAG	2	6	516448	516453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931868
13612	NC_014834	TGC	2	6	516510	516515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931868
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13614	NC_014834	AGC	2	6	516522	516527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931868
13615	NC_014834	TCG	2	6	516547	516552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_014834	CG	4	8	516563	516570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13617	NC_014834	GCT	2	6	516620	516625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_014834	CGG	2	6	516689	516694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_014834	TCT	2	6	516747	516752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_014834	ACC	2	6	516853	516858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931869
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13980	NC_014834	AACGGC	2	12	529865	529876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931882
13981	NC_014834	GCA	2	6	529911	529916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13982	NC_014834	GCCG	2	8	529961	529968	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
13983	NC_014834	CGT	3	9	529972	529980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931883
13984	NC_014834	CG	3	6	530112	530117	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
13985	NC_014834	GCG	2	6	530145	530150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931883
13986	NC_014834	GC	3	6	530182	530187	0 %	0 %	50 %	50 %	316931883
13987	NC_014834	CAT	2	6	530242	530247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931883
13988	NC_014834	ATC	2	6	530289	530294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931883
13989	NC_014834	GTG	2	6	530318	530323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931883
13990	NC_014834	GTC	2	6	530389	530394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931883
13991	NC_014834	TCG	2	6	530436	530441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931883
13992	NC_014834	GCC	2	6	530500	530505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931883
13993	NC_014834	CGG	2	6	530587	530592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931883
13994	NC_014834	CTGG	2	8	530611	530618	0 %	25 %	50 %	25 %	316931883
13995	NC_014834	CGG	2	6	530620	530625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931883
13996	NC_014834	CGTGC	2	10	530626	530635	0 %	20 %	40 %	40 %	316931883
13997	NC_014834	GTC	2	6	530698	530703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931883
13998	NC_014834	ATC	2	6	530705	530710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931883
13999	NC_014834	TCG	2	6	530727	530732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931883
14000	NC_014834	TGG	2	6	530754	530759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931883

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