MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_014834	GCAC	2	8	3960096	3960103	25 %	0 %	25 %	50 %	316935020
104002	NC_014834	CGG	2	6	3960109	3960114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935020
104003	NC_014834	CG	3	6	3960142	3960147	0 %	0 %	50 %	50 %	316935020
104004	NC_014834	CGG	2	6	3960236	3960241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935020
104005	NC_014834	CTT	2	6	3960245	3960250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935020
104006	NC_014834	CAG	2	6	3960308	3960313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935020
104007	NC_014834	GAA	2	6	3960377	3960382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935020
104008	NC_014834	ACCG	2	8	3960391	3960398	25 %	0 %	25 %	50 %	316935020
104009	NC_014834	GCT	2	6	3960430	3960435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935020
104010	NC_014834	AGCA	2	8	3960441	3960448	50 %	0 %	25 %	25 %	316935020
104011	NC_014834	CGA	2	6	3960457	3960462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935020
104012	NC_014834	AC	3	6	3960535	3960540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104013	NC_014834	ACGA	2	8	3960558	3960565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104014	NC_014834	TGT	2	6	3960566	3960571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104015	NC_014834	GCC	2	6	3960621	3960626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104016	NC_014834	TCGGGC	2	12	3960674	3960685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104017	NC_014834	CCCG	2	8	3960696	3960703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104018	NC_014834	G	6	6	3960703	3960708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104019	NC_014834	CGGG	2	8	3960714	3960721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104020	NC_014834	GGT	2	6	3960784	3960789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104021	NC_014834	CG	3	6	3960856	3960861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104022	NC_014834	CGC	2	6	3960897	3960902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104023	NC_014834	AGGC	2	8	3960953	3960960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104024	NC_014834	GCG	2	6	3960979	3960984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104025	NC_014834	GCA	2	6	3961041	3961046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935021
104026	NC_014834	CAC	2	6	3961049	3961054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935021
104027	NC_014834	GCCG	2	8	3961078	3961085	0 %	0 %	50 %	50 %	316935021
104028	NC_014834	ACCCC	2	10	3961143	3961152	20 %	0 %	0 %	80 %	316935021
104029	NC_014834	ACC	3	9	3961164	3961172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935021
104030	NC_014834	CGG	2	6	3961204	3961209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935021
104031	NC_014834	CG	3	6	3961240	3961245	0 %	0 %	50 %	50 %	316935021
104032	NC_014834	CGG	3	9	3961253	3961261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935021
104033	NC_014834	CAC	2	6	3961274	3961279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935021
104034	NC_014834	GCCC	2	8	3961282	3961289	0 %	0 %	25 %	75 %	316935021
104035	NC_014834	CGG	2	6	3961310	3961315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935021
104036	NC_014834	CGC	2	6	3961349	3961354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935021
104037	NC_014834	G	7	7	3961359	3961365	0 %	0 %	100 %	0 %	316935021
104038	NC_014834	CCGCGG	2	12	3961400	3961411	0 %	0 %	50 %	50 %	316935021
104039	NC_014834	GTC	2	6	3961412	3961417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935021
104040	NC_014834	GGC	2	6	3961418	3961423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935021
104041	NC_014834	GCA	2	6	3961480	3961485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935021
104042	NC_014834	A	6	6	3961544	3961549	100 %	0 %	0 %	0 %	316935021
104043	NC_014834	CG	3	6	3961560	3961565	0 %	0 %	50 %	50 %	316935021
104044	NC_014834	CGA	2	6	3961640	3961645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935021
104045	NC_014834	TTC	2	6	3961688	3961693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935021
104046	NC_014834	CGG	2	6	3961752	3961757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935021
104047	NC_014834	CGG	2	6	3961780	3961785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935021
104048	NC_014834	GCA	2	6	3961795	3961800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935021
104049	NC_014834	GCT	2	6	3961825	3961830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935021
104050	NC_014834	CAT	2	6	3961853	3961858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935021
104051	NC_014834	GCCG	2	8	3961876	3961883	0 %	0 %	50 %	50 %	316935022
104052	NC_014834	GCA	2	6	3961887	3961892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935022
104053	NC_014834	TTTC	2	8	3961903	3961910	0 %	75 %	0 %	25 %	316935022
104054	NC_014834	CGA	2	6	3961953	3961958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935022
104055	NC_014834	CTT	2	6	3961968	3961973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935022
104056	NC_014834	GTA	2	6	3961990	3961995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935022
104057	NC_014834	CGA	2	6	3962004	3962009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935022
104058	NC_014834	TC	3	6	3962010	3962015	0 %	50 %	0 %	50 %	316935022
104059	NC_014834	CTT	2	6	3962068	3962073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935022
104060	NC_014834	CGG	2	6	3962115	3962120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935022
104061	NC_014834	GCG	2	6	3962149	3962154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935022
104062	NC_014834	CAG	2	6	3962191	3962196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935022
104063	NC_014834	GCC	2	6	3962238	3962243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935022
104064	NC_014834	GTTC	2	8	3962286	3962293	0 %	50 %	25 %	25 %	316935022
104065	NC_014834	TCG	2	6	3962396	3962401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935022
104066	NC_014834	CGGCC	2	10	3962446	3962455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104067	NC_014834	CCA	2	6	3962504	3962509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104068	NC_014834	CCGGCG	2	12	3962520	3962531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104069	NC_014834	CA	3	6	3962633	3962638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104070	NC_014834	GCA	2	6	3962645	3962650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104071	NC_014834	GCCG	3	12	3962698	3962709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104072	NC_014834	GAC	2	6	3962856	3962861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104073	NC_014834	CGGC	2	8	3962885	3962892	0 %	0 %	50 %	50 %	316935023
104074	NC_014834	CGC	2	6	3962948	3962953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935023
104075	NC_014834	CTG	2	6	3962958	3962963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935023
104076	NC_014834	GCG	2	6	3963019	3963024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935023
104077	NC_014834	GCA	2	6	3963034	3963039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935023
104078	NC_014834	ATC	2	6	3963129	3963134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935023
104079	NC_014834	GCC	2	6	3963141	3963146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935023
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104081	NC_014834	TCG	2	6	3963187	3963192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935023
104082	NC_014834	GC	3	6	3963212	3963217	0 %	0 %	50 %	50 %	316935023
104083	NC_014834	CGG	2	6	3963222	3963227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935023
104084	NC_014834	CTG	2	6	3963252	3963257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935023
104085	NC_014834	CGC	2	6	3963316	3963321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935023
104086	NC_014834	CTG	2	6	3963339	3963344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935023
104087	NC_014834	GAG	2	6	3963456	3963461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316935023
104088	NC_014834	CGA	2	6	3963473	3963478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935023
104089	NC_014834	CGC	2	6	3963539	3963544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935023
104090	NC_014834	GATC	2	8	3963575	3963582	25 %	25 %	25 %	25 %	316935023
104091	NC_014834	CGA	2	6	3963629	3963634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935023
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104095	NC_014834	GGACT	2	10	3963789	3963798	20 %	20 %	40 %	20 %	316935023
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104098	NC_014834	CGG	2	6	3963920	3963925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935023
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104101	NC_014834	CGGC	2	8	3964005	3964012	0 %	0 %	50 %	50 %	316935024
104102	NC_014834	CGA	2	6	3964025	3964030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935024
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104104	NC_014834	CGG	2	6	3964106	3964111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935024
104105	NC_014834	ACG	2	6	3964123	3964128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935024
104106	NC_014834	CGA	2	6	3964145	3964150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935024
104107	NC_014834	CCTG	2	8	3964159	3964166	0 %	25 %	25 %	50 %	316935024
104108	NC_014834	TGC	2	6	3964195	3964200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935024
104109	NC_014834	GCC	2	6	3964229	3964234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935024
104110	NC_014834	ATC	2	6	3964239	3964244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935024
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104112	NC_014834	AGC	2	6	3964303	3964308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935024
104113	NC_014834	CGA	2	6	3964310	3964315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935024
104114	NC_014834	CAG	2	6	3964350	3964355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935024
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104116	NC_014834	CGC	2	6	3964377	3964382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935024
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104346	NC_014834	GC	3	6	3973130	3973135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104347	NC_014834	CG	3	6	3973143	3973148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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