MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014834	CAC	2	6	19828	19833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931412
502	NC_014834	GCC	2	6	19839	19844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931412
503	NC_014834	TCA	2	6	19853	19858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931412
504	NC_014834	CGA	2	6	19877	19882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931412
505	NC_014834	CAG	2	6	19884	19889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931412
506	NC_014834	ATA	2	6	19899	19904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316931412
507	NC_014834	GAA	2	6	19932	19937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931412
508	NC_014834	GTT	2	6	19947	19952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931412
509	NC_014834	GC	3	6	19982	19987	0 %	0 %	50 %	50 %	316931412
510	NC_014834	TCT	3	9	20099	20107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931412
511	NC_014834	CGT	3	9	20126	20134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931412
512	NC_014834	GC	3	6	20152	20157	0 %	0 %	50 %	50 %	316931412
513	NC_014834	GC	3	6	20220	20225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_014834	CG	3	6	20262	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_014834	GCG	2	6	20277	20282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014834	GCC	3	9	20290	20298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931413
517	NC_014834	GAT	2	6	20398	20403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931413
518	NC_014834	TCG	2	6	20411	20416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931413
519	NC_014834	GC	3	6	20451	20456	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
520	NC_014834	CGT	2	6	20478	20483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931413
521	NC_014834	CCGG	2	8	20544	20551	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
522	NC_014834	CGA	2	6	20592	20597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931413
523	NC_014834	CGT	3	9	20655	20663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931413
524	NC_014834	CG	3	6	20672	20677	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
525	NC_014834	GCC	2	6	20713	20718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931413
526	NC_014834	GTC	3	9	20728	20736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931413
527	NC_014834	GCC	2	6	20758	20763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931413
528	NC_014834	GGC	2	6	20764	20769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931413
529	NC_014834	GC	3	6	20787	20792	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
530	NC_014834	ACC	2	6	20807	20812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931413
531	NC_014834	GCCAGC	2	12	20828	20839	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931413
532	NC_014834	TTC	2	6	20849	20854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931413
533	NC_014834	TCT	2	6	20892	20897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931413
534	NC_014834	CGC	2	6	20898	20903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931413
535	NC_014834	CGA	2	6	20947	20952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931413
536	NC_014834	GAT	2	6	21028	21033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931413
537	NC_014834	CCA	2	6	21055	21060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931413
538	NC_014834	GCG	2	6	21069	21074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931413
539	NC_014834	GGT	2	6	21109	21114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931413
540	NC_014834	TCG	2	6	21204	21209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931414
541	NC_014834	CGA	2	6	21253	21258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931414
542	NC_014834	GCG	2	6	21274	21279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931414
543	NC_014834	CCA	2	6	21281	21286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931414
544	NC_014834	GGT	2	6	21287	21292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931414
545	NC_014834	TGT	2	6	21310	21315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931414
546	NC_014834	GAT	2	6	21323	21328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931414
547	NC_014834	CGC	2	6	21340	21345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_014834	CGT	2	6	21367	21372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931415
549	NC_014834	CGA	2	6	21415	21420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
550	NC_014834	TCGG	2	8	21432	21439	0 %	25 %	50 %	25 %	316931415
551	NC_014834	ACC	2	6	21468	21473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931415
552	NC_014834	CGC	2	6	21545	21550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931415
553	NC_014834	GAT	2	6	21604	21609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931415
554	NC_014834	TTC	2	6	21693	21698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931415
555	NC_014834	GTC	2	6	21716	21721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931415
556	NC_014834	GCC	2	6	21731	21736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931415
557	NC_014834	CCG	2	6	21802	21807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931415
558	NC_014834	AGT	2	6	21814	21819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931415
559	NC_014834	TCG	2	6	21837	21842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931415
560	NC_014834	CGGA	2	8	21848	21855	25 %	0 %	50 %	25 %	316931415
561	NC_014834	GCG	2	6	21976	21981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931415
562	NC_014834	GCC	2	6	21995	22000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931415
563	NC_014834	ACG	2	6	22008	22013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
564	NC_014834	CGA	2	6	22024	22029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
565	NC_014834	GAC	2	6	22034	22039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
566	NC_014834	TTGC	2	8	22081	22088	0 %	50 %	25 %	25 %	316931415
567	NC_014834	GC	3	6	22183	22188	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
568	NC_014834	CCG	3	9	22203	22211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
569	NC_014834	GCG	2	6	22212	22217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
570	NC_014834	CGAC	2	8	22246	22253	25 %	0 %	25 %	50 %	316931416
571	NC_014834	CGAG	2	8	22279	22286	25 %	0 %	50 %	25 %	316931416
572	NC_014834	GCT	2	6	22405	22410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931416
573	NC_014834	GC	3	6	22444	22449	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
574	NC_014834	GC	3	6	22477	22482	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
575	NC_014834	CAT	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
576	NC_014834	CGAC	2	8	22585	22592	25 %	0 %	25 %	50 %	316931416
577	NC_014834	ACC	2	6	22593	22598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
578	NC_014834	GCA	2	6	22606	22611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
579	NC_014834	TCA	2	6	22651	22656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
580	NC_014834	GCC	2	6	22670	22675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
581	NC_014834	GGT	2	6	22753	22758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931416
582	NC_014834	GAT	2	6	22802	22807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
583	NC_014834	CCGC	2	8	22837	22844	0 %	0 %	25 %	75 %	316931416
584	NC_014834	AGT	2	6	22855	22860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
585	NC_014834	ATG	2	6	22863	22868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
586	NC_014834	CGG	2	6	22879	22884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
587	NC_014834	GAA	2	6	22889	22894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931416
588	NC_014834	ACC	2	6	22915	22920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
589	NC_014834	TTG	2	6	22998	23003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931416
590	NC_014834	GCA	2	6	23011	23016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
591	NC_014834	TGA	3	9	23026	23034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
592	NC_014834	TCA	2	6	23083	23088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
593	NC_014834	CAG	2	6	23105	23110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
594	NC_014834	GAA	2	6	23219	23224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931416
595	NC_014834	GC	3	6	23270	23275	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
596	NC_014834	TCT	2	6	23284	23289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931416
597	NC_014834	ACG	2	6	23292	23297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
598	NC_014834	CAG	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
599	NC_014834	GCC	2	6	23324	23329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
600	NC_014834	GCCG	2	8	23368	23375	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
601	NC_014834	CGG	2	6	23437	23442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
602	NC_014834	GCG	2	6	23530	23535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
603	NC_014834	GAT	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
604	NC_014834	CGAG	2	8	23602	23609	25 %	0 %	50 %	25 %	316931416
605	NC_014834	CGC	2	6	23645	23650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
606	NC_014834	ACC	2	6	23693	23698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
607	NC_014834	CGG	2	6	23758	23763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014834	T	6	6	23848	23853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014834	GCG	2	6	23920	23925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_014834	CGG	2	6	23934	23939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_014834	CGG	2	6	23951	23956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_014834	CGC	2	6	23959	23964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_014834	CAC	2	6	24040	24045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931417
614	NC_014834	GCT	2	6	24095	24100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931417
615	NC_014834	GCGG	2	8	24133	24140	0 %	0 %	75 %	25 %	316931417
616	NC_014834	CAG	2	6	24144	24149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931417
617	NC_014834	GAT	2	6	24228	24233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931417
618	NC_014834	TTC	2	6	24253	24258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931417
619	NC_014834	CG	3	6	24269	24274	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
620	NC_014834	CGC	2	6	24321	24326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931417
621	NC_014834	GCC	2	6	24336	24341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931417
622	NC_014834	GAA	2	6	24366	24371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931417
623	NC_014834	TCCCG	2	10	24412	24421	0 %	20 %	20 %	60 %	316931417
624	NC_014834	GGT	2	6	24474	24479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931417
625	NC_014834	GCG	2	6	24533	24538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931417
626	NC_014834	GCGTCG	2	12	24544	24555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931417
627	NC_014834	CG	3	6	24601	24606	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
628	NC_014834	GCC	2	6	24615	24620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931417
629	NC_014834	GGC	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931417
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663	NC_014834	CAT	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931419
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752	NC_014834	GCG	2	6	28715	28720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931421
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756	NC_014834	CGGGT	2	10	28962	28971	0 %	20 %	60 %	20 %	316931421
757	NC_014834	CCGT	2	8	28975	28982	0 %	25 %	25 %	50 %	316931421
758	NC_014834	TG	3	6	28996	29001	0 %	50 %	50 %	0 %	316931421
759	NC_014834	G	6	6	29009	29014	0 %	0 %	100 %	0 %	316931421
760	NC_014834	ATCG	2	8	29028	29035	25 %	25 %	25 %	25 %	316931421
761	NC_014834	GCC	4	12	29076	29087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931421
762	NC_014834	GC	3	6	29098	29103	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
763	NC_014834	ATCG	2	8	29145	29152	25 %	25 %	25 %	25 %	316931421
764	NC_014834	CCA	3	9	29210	29218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931421
765	NC_014834	CG	3	6	29252	29257	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
766	NC_014834	CAC	2	6	29301	29306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931421
767	NC_014834	CAGCAC	2	12	29307	29318	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931421
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770	NC_014834	GCG	2	6	29382	29387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_014834	GGAA	2	8	29457	29464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
772	NC_014834	GTC	2	6	29471	29476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931422
773	NC_014834	GCG	2	6	29565	29570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931422
774	NC_014834	CAC	2	6	29591	29596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931422
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777	NC_014834	CGG	2	6	29768	29773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931422
778	NC_014834	GATCG	2	10	29783	29792	20 %	20 %	40 %	20 %	316931422
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813	NC_014834	GGA	2	6	30973	30978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
814	NC_014834	CG	3	6	30982	30987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
815	NC_014834	TGC	2	6	30998	31003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
816	NC_014834	GCC	2	6	31018	31023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
817	NC_014834	GGC	2	6	31030	31035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
818	NC_014834	T	6	6	31036	31041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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848	NC_014834	CTGA	2	8	32284	32291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
849	NC_014834	TCG	2	6	32430	32435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931424
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