MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014834	CGC	2	6	207595	207600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5502	NC_014834	GC	3	6	207613	207618	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5503	NC_014834	TGG	3	9	207651	207659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5504	NC_014834	CGA	2	6	207664	207669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5505	NC_014834	ATCA	2	8	207698	207705	50 %	25 %	0 %	25 %	316931579
5506	NC_014834	GGC	2	6	207712	207717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5507	NC_014834	ATC	2	6	207728	207733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5508	NC_014834	CAA	2	6	207742	207747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931579
5509	NC_014834	CTG	2	6	207791	207796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5510	NC_014834	GCG	2	6	207825	207830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5511	NC_014834	TGT	2	6	207832	207837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931579
5512	NC_014834	GCT	2	6	207880	207885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5513	NC_014834	GAT	2	6	207889	207894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931579
5514	NC_014834	CCG	2	6	207942	207947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5515	NC_014834	CCGCGG	2	12	207976	207987	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5516	NC_014834	CAT	2	6	208036	208041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5517	NC_014834	CG	3	6	208070	208075	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5518	NC_014834	GCCC	2	8	208149	208156	0 %	0 %	25 %	75 %	316931579
5519	NC_014834	GGT	2	6	208177	208182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5520	NC_014834	CG	3	6	208220	208225	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5521	NC_014834	GA	3	6	208236	208241	50 %	0 %	50 %	0 %	316931579
5522	NC_014834	CCA	2	6	208251	208256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931579
5523	NC_014834	GCTC	2	8	208272	208279	0 %	25 %	25 %	50 %	316931579
5524	NC_014834	GAT	2	6	208285	208290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931579
5525	NC_014834	CGA	2	6	208396	208401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5526	NC_014834	CGC	2	6	208405	208410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5527	NC_014834	CGG	2	6	208432	208437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5528	NC_014834	CAA	2	6	208507	208512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931579
5529	NC_014834	GCC	2	6	208526	208531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5530	NC_014834	CTA	2	6	208555	208560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5531	NC_014834	CAT	2	6	208564	208569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5532	NC_014834	TGG	2	6	208578	208583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5533	NC_014834	AAG	2	6	208592	208597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931579
5534	NC_014834	GCG	2	6	208728	208733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5535	NC_014834	CGT	2	6	208759	208764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5536	NC_014834	GAAG	2	8	208813	208820	50 %	0 %	50 %	0 %	316931579
5537	NC_014834	TCG	2	6	208821	208826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5538	NC_014834	CAT	2	6	208882	208887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5539	NC_014834	GCC	2	6	208993	208998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_014834	GCT	2	6	209001	209006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_014834	TCA	2	6	209061	209066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_014834	GAG	2	6	209084	209089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_014834	AGA	2	6	209159	209164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931580
5544	NC_014834	CGG	2	6	209175	209180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931580
5545	NC_014834	CGCT	2	8	209188	209195	0 %	25 %	25 %	50 %	316931580
5546	NC_014834	G	6	6	209244	209249	0 %	0 %	100 %	0 %	316931580
5547	NC_014834	CGA	2	6	209324	209329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5548	NC_014834	CGG	2	6	209346	209351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931580
5549	NC_014834	CGA	2	6	209355	209360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5550	NC_014834	GCG	2	6	209405	209410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931580
5551	NC_014834	CGA	2	6	209463	209468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5552	NC_014834	GCCGAG	2	12	209476	209487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931580
5553	NC_014834	GCT	2	6	209499	209504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5554	NC_014834	ACC	2	6	209565	209570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931581
5555	NC_014834	TTGC	2	8	209580	209587	0 %	50 %	25 %	25 %	316931581
5556	NC_014834	ACG	2	6	209593	209598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5557	NC_014834	GCA	2	6	209600	209605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5558	NC_014834	CGC	3	9	209609	209617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931581
5559	NC_014834	CG	3	6	209647	209652	0 %	0 %	50 %	50 %	316931581
5560	NC_014834	ACA	2	6	209653	209658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931581
5561	NC_014834	CGG	2	6	209672	209677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931581
5562	NC_014834	CGG	3	9	209681	209689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931581
5563	NC_014834	AGC	2	6	209692	209697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5564	NC_014834	CGC	2	6	209700	209705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931581
5565	NC_014834	GTG	2	6	209730	209735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931581
5566	NC_014834	GGT	2	6	209777	209782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931581
5567	NC_014834	CGGG	2	8	209842	209849	0 %	0 %	75 %	25 %	316931581
5568	NC_014834	CCA	2	6	209872	209877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931581
5569	NC_014834	CGA	2	6	209951	209956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5570	NC_014834	CCG	2	6	209998	210003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931581
5571	NC_014834	CTG	2	6	210018	210023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5572	NC_014834	CCG	2	6	210054	210059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931581
5573	NC_014834	GGT	2	6	210119	210124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931581
5574	NC_014834	GCCC	2	8	210135	210142	0 %	0 %	25 %	75 %	316931581
5575	NC_014834	CG	3	6	210231	210236	0 %	0 %	50 %	50 %	316931581
5576	NC_014834	GCT	2	6	210257	210262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5577	NC_014834	GCG	2	6	210290	210295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931581
5578	NC_014834	GGTC	2	8	210302	210309	0 %	25 %	50 %	25 %	316931581
5579	NC_014834	CGA	2	6	210314	210319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5580	NC_014834	GAA	2	6	210339	210344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931581
5581	NC_014834	GCT	2	6	210398	210403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5582	NC_014834	GAC	2	6	210423	210428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5583	NC_014834	TTG	2	6	210489	210494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931581
5584	NC_014834	AAAG	2	8	210639	210646	75 %	0 %	25 %	0 %	316931581
5585	NC_014834	TCA	2	6	210687	210692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931582
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5587	NC_014834	CCG	2	6	210841	210846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931582
5588	NC_014834	AAG	3	9	210866	210874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931582
5589	NC_014834	GCT	2	6	210895	210900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931582
5590	NC_014834	GTC	2	6	210933	210938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_014834	CGA	2	6	210960	210965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_014834	CCG	2	6	211014	211019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_014834	CGG	2	6	211044	211049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_014834	CG	3	6	211079	211084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_014834	GCT	2	6	211172	211177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_014834	AAG	2	6	211257	211262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_014834	GGGC	2	8	211301	211308	0 %	0 %	75 %	25 %	316931583
5598	NC_014834	CG	3	6	211337	211342	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5599	NC_014834	CGT	2	6	211358	211363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5600	NC_014834	GTG	2	6	211383	211388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931583
5601	NC_014834	CGT	2	6	211397	211402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5602	NC_014834	CGC	2	6	211403	211408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5603	NC_014834	CG	3	6	211417	211422	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5604	NC_014834	CGGC	2	8	211474	211481	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5605	NC_014834	CGG	2	6	211490	211495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5606	NC_014834	CCGA	2	8	211518	211525	25 %	0 %	25 %	50 %	316931583
5607	NC_014834	CGC	2	6	211664	211669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5608	NC_014834	CGG	2	6	211672	211677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5609	NC_014834	TCA	2	6	211735	211740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931583
5610	NC_014834	ACG	2	6	211741	211746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5611	NC_014834	CGA	2	6	211769	211774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5612	NC_014834	TGG	3	9	211798	211806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931583
5613	NC_014834	CCG	2	6	211813	211818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5614	NC_014834	ATC	2	6	211923	211928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931583
5615	NC_014834	GCC	2	6	211944	211949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5616	NC_014834	CG	3	6	211957	211962	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5617	NC_014834	GATCGA	2	12	211967	211978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316931583
5618	NC_014834	GCG	2	6	211983	211988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5619	NC_014834	GC	3	6	212027	212032	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5620	NC_014834	CTT	2	6	212105	212110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931583
5621	NC_014834	TGC	2	6	212269	212274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5622	NC_014834	GTC	2	6	212325	212330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5623	NC_014834	CTG	2	6	212400	212405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5624	NC_014834	C	7	7	212417	212423	0 %	0 %	0 %	100 %	316931583
5625	NC_014834	TCGG	2	8	212427	212434	0 %	25 %	50 %	25 %	316931583
5626	NC_014834	GCC	2	6	212443	212448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5627	NC_014834	CGG	2	6	212450	212455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5628	NC_014834	TGGCG	2	10	212488	212497	0 %	20 %	60 %	20 %	316931583
5629	NC_014834	CG	3	6	212496	212501	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5630	NC_014834	ATCC	2	8	212502	212509	25 %	25 %	0 %	50 %	316931583
5631	NC_014834	TGC	2	6	212512	212517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5632	NC_014834	CGC	2	6	212518	212523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5633	NC_014834	CGT	2	6	212549	212554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5634	NC_014834	GCG	2	6	212602	212607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5635	NC_014834	GATG	2	8	212621	212628	25 %	25 %	50 %	0 %	316931583
5636	NC_014834	CGA	2	6	212720	212725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5638	NC_014834	GGCCA	2	10	212841	212850	20 %	0 %	40 %	40 %	316931583
5639	NC_014834	CCGCGC	2	12	212897	212908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
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5641	NC_014834	CGAC	2	8	212953	212960	25 %	0 %	25 %	50 %	316931583
5642	NC_014834	CGG	2	6	212984	212989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5643	NC_014834	TCG	2	6	213007	213012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5644	NC_014834	GAC	2	6	213042	213047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5645	NC_014834	CGT	2	6	213155	213160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5650	NC_014834	CGT	2	6	213263	213268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5652	NC_014834	CAAGGT	2	12	213281	213292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316931583
5653	NC_014834	GCT	2	6	213296	213301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5654	NC_014834	CGA	2	6	213308	213313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5658	NC_014834	GCG	2	6	213444	213449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5659	NC_014834	GCA	2	6	213459	213464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5660	NC_014834	GGC	2	6	213485	213490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5661	NC_014834	TGTT	2	8	213505	213512	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5662	NC_014834	CGG	2	6	213534	213539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5663	NC_014834	CG	3	6	213601	213606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5664	NC_014834	CGGC	2	8	213613	213620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5665	NC_014834	GCCGTT	2	12	213621	213632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5666	NC_014834	GGA	2	6	213635	213640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5667	NC_014834	TGA	2	6	213670	213675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931584
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5672	NC_014834	GCC	2	6	213767	213772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931584
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5693	NC_014834	GTTCTC	2	12	214881	214892	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	316931585
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5742	NC_014834	GC	3	6	216874	216879	0 %	0 %	50 %	50 %	316931586
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5989	NC_014834	ACCCC	2	10	225414	225423	20 %	0 %	0 %	80 %	316931593
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5991	NC_014834	GAT	2	6	225457	225462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931593
5992	NC_014834	ACC	2	6	225479	225484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931593
5993	NC_014834	CGC	2	6	225496	225501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931593
5994	NC_014834	GC	3	6	225546	225551	0 %	0 %	50 %	50 %	316931593
5995	NC_014834	GCC	2	6	225554	225559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931593
5996	NC_014834	CCG	2	6	225612	225617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931593
5997	NC_014834	GTC	2	6	225629	225634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931593
5998	NC_014834	CGG	2	6	225646	225651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931593
5999	NC_014834	GCC	2	6	225699	225704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931593
6000	NC_014834	TTG	2	6	225757	225762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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