MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014834	CGC	2	6	171985	171990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
4502	NC_014834	GAT	2	6	172022	172027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931546
4503	NC_014834	GCC	2	6	172048	172053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
4504	NC_014834	CGG	2	6	172058	172063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931546
4505	NC_014834	GCCG	2	8	172067	172074	0 %	0 %	50 %	50 %	316931546
4506	NC_014834	AAGG	2	8	172173	172180	50 %	0 %	50 %	0 %	316931546
4507	NC_014834	GCC	2	6	172191	172196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931546
4508	NC_014834	ACC	2	6	172213	172218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931546
4509	NC_014834	CAC	2	6	172448	172453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931546
4510	NC_014834	TGG	2	6	172480	172485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931546
4511	NC_014834	CG	3	6	172576	172581	0 %	0 %	50 %	50 %	316931546
4512	NC_014834	TCG	2	6	172614	172619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931546
4513	NC_014834	GTG	2	6	172626	172631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931546
4514	NC_014834	CGA	2	6	172685	172690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931546
4515	NC_014834	CG	3	6	172772	172777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_014834	GCA	2	6	172794	172799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_014834	ACT	2	6	172811	172816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_014834	CTCG	2	8	172820	172827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_014834	GCT	2	6	172832	172837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4520	NC_014834	CG	3	6	172842	172847	0 %	0 %	50 %	50 %	316931547
4521	NC_014834	GCG	2	6	172862	172867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
4522	NC_014834	GTC	2	6	172885	172890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4523	NC_014834	CAG	2	6	172891	172896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4524	NC_014834	GCC	2	6	172932	172937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4525	NC_014834	CGG	2	6	172944	172949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
4526	NC_014834	CGG	2	6	172953	172958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
4527	NC_014834	GCC	2	6	172997	173002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4528	NC_014834	GCCG	2	8	173015	173022	0 %	0 %	50 %	50 %	316931547
4529	NC_014834	CTG	2	6	173044	173049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4530	NC_014834	GCC	2	6	173143	173148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4531	NC_014834	TCG	2	6	173168	173173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4532	NC_014834	GCG	2	6	173174	173179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
4533	NC_014834	GTCC	2	8	173184	173191	0 %	25 %	25 %	50 %	316931547
4534	NC_014834	GGT	2	6	173215	173220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931547
4535	NC_014834	CAC	2	6	173221	173226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931547
4536	NC_014834	CCA	2	6	173259	173264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931547
4537	NC_014834	CGC	2	6	173272	173277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4538	NC_014834	GCC	2	6	173284	173289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4539	NC_014834	TCACCA	2	12	173298	173309	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	316931547
4540	NC_014834	CCG	2	6	173373	173378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4541	NC_014834	CAGCGT	2	12	173380	173391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4542	NC_014834	CCG	2	6	173460	173465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931547
4543	NC_014834	CAA	2	6	173467	173472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931547
4544	NC_014834	GTCG	2	8	173512	173519	0 %	25 %	50 %	25 %	316931547
4545	NC_014834	TGC	2	6	173540	173545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4546	NC_014834	GCA	2	6	173562	173567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931547
4547	NC_014834	CGG	2	6	173632	173637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931547
4548	NC_014834	CGG	2	6	173650	173655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_014834	GCC	2	6	173729	173734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_014834	CAT	2	6	173744	173749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_014834	C	6	6	173781	173786	0 %	0 %	0 %	100 %	316931548
4552	NC_014834	CTG	2	6	173793	173798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4553	NC_014834	GTC	2	6	173817	173822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4554	NC_014834	CGC	3	9	173854	173862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931548
4555	NC_014834	GAA	2	6	173915	173920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931548
4556	NC_014834	GGC	2	6	173964	173969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931548
4557	NC_014834	GCCGAG	2	12	174003	174014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931548
4558	NC_014834	CGG	2	6	174017	174022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931548
4559	NC_014834	CAA	2	6	174101	174106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931548
4560	NC_014834	GCT	2	6	174113	174118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4561	NC_014834	TTC	2	6	174138	174143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931548
4562	NC_014834	CAA	2	6	174182	174187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931548
4563	NC_014834	GGT	2	6	174194	174199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931548
4564	NC_014834	CGC	2	6	174206	174211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931548
4565	NC_014834	AAGG	2	8	174306	174313	50 %	0 %	50 %	0 %	316931548
4566	NC_014834	TCA	2	6	174400	174405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931548
4567	NC_014834	GCC	2	6	174465	174470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931548
4568	NC_014834	TGC	3	9	174487	174495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4569	NC_014834	CGC	2	6	174540	174545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931548
4570	NC_014834	TCG	2	6	174583	174588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4571	NC_014834	TCG	2	6	174598	174603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4572	NC_014834	ATT	2	6	174613	174618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316931548
4573	NC_014834	CCG	2	6	174634	174639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931548
4574	NC_014834	GAT	2	6	174647	174652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931548
4575	NC_014834	CGA	2	6	174677	174682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931548
4576	NC_014834	CG	3	6	174773	174778	0 %	0 %	50 %	50 %	316931548
4577	NC_014834	GC	3	6	174822	174827	0 %	0 %	50 %	50 %	316931548
4578	NC_014834	CAA	2	6	174866	174871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931548
4579	NC_014834	TCG	2	6	174923	174928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4580	NC_014834	CGC	2	6	174980	174985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931549
4581	NC_014834	GCT	2	6	175063	175068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4582	NC_014834	GAT	2	6	175105	175110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931549
4583	NC_014834	CTT	2	6	175128	175133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931549
4584	NC_014834	CGC	2	6	175161	175166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931549
4585	NC_014834	CGG	2	6	175292	175297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931549
4586	NC_014834	CGA	2	6	175300	175305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4587	NC_014834	GGC	2	6	175364	175369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931549
4588	NC_014834	GC	4	8	175391	175398	0 %	0 %	50 %	50 %	316931549
4589	NC_014834	CTG	2	6	175421	175426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4590	NC_014834	CGC	2	6	175441	175446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931549
4591	NC_014834	CGA	2	6	175450	175455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4592	NC_014834	GAC	2	6	175478	175483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4593	NC_014834	CTG	2	6	175484	175489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4594	NC_014834	GTG	2	6	175517	175522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931549
4595	NC_014834	GTG	3	9	175568	175576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931549
4596	NC_014834	CGC	2	6	175581	175586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931549
4597	NC_014834	GGCCG	2	10	175587	175596	0 %	0 %	60 %	40 %	316931549
4598	NC_014834	CGC	2	6	175600	175605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931549
4599	NC_014834	CG	3	6	175691	175696	0 %	0 %	50 %	50 %	316931549
4600	NC_014834	CGT	2	6	175701	175706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931549
4601	NC_014834	CGAG	2	8	175707	175714	25 %	0 %	50 %	25 %	316931549
4602	NC_014834	CG	3	6	175717	175722	0 %	0 %	50 %	50 %	316931549
4603	NC_014834	GTG	2	6	175807	175812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931550
4604	NC_014834	CGTGG	2	10	175842	175851	0 %	20 %	60 %	20 %	316931550
4605	NC_014834	TGG	2	6	175856	175861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931550
4606	NC_014834	GCT	2	6	175953	175958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4607	NC_014834	CAC	2	6	175959	175964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931550
4608	NC_014834	TCG	2	6	175988	175993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4609	NC_014834	CGGC	2	8	176000	176007	0 %	0 %	50 %	50 %	316931550
4610	NC_014834	GCT	2	6	176022	176027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4611	NC_014834	GCT	2	6	176043	176048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4612	NC_014834	GGT	2	6	176073	176078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931550
4613	NC_014834	GATCGC	2	12	176097	176108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4614	NC_014834	TGC	2	6	176114	176119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4615	NC_014834	ATCT	2	8	176122	176129	25 %	50 %	0 %	25 %	316931550
4616	NC_014834	TTC	2	6	176173	176178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931550
4617	NC_014834	GCT	2	6	176271	176276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931550
4618	NC_014834	CGG	2	6	176313	176318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931550
4619	NC_014834	CGG	2	6	176331	176336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931550
4620	NC_014834	GTG	2	6	176356	176361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931550
4621	NC_014834	CGC	2	6	176370	176375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931550
4622	NC_014834	CGGC	2	8	176381	176388	0 %	0 %	50 %	50 %	316931550
4623	NC_014834	GCA	2	6	176455	176460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931550
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4630	NC_014834	CGAT	2	8	176596	176603	25 %	25 %	25 %	25 %	316931551
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4674	NC_014834	GTA	2	6	178245	178250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4676	NC_014834	GCCG	2	8	178321	178328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4677	NC_014834	CCT	2	6	178344	178349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4679	NC_014834	GGT	2	6	178392	178397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931553
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4690	NC_014834	TCGCC	2	10	178788	178797	0 %	20 %	20 %	60 %	316931553
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4719	NC_014834	GCC	2	6	179866	179871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4720	NC_014834	CAT	2	6	179886	179891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931554
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4735	NC_014834	TCG	2	6	180526	180531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931554
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4744	NC_014834	ATC	2	6	180838	180843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931554
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4863	NC_014834	GGC	2	6	185133	185138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4864	NC_014834	GC	3	6	185152	185157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4983	NC_014834	GCA	2	6	189373	189378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4984	NC_014834	GC	4	8	189395	189402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4989	NC_014834	TGC	2	6	189561	189566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4990	NC_014834	GC	3	6	189622	189627	0 %	0 %	50 %	50 %	316931561
4991	NC_014834	CCG	2	6	189642	189647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931561
4992	NC_014834	TGCTGG	2	12	189777	189788	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	316931561
4993	NC_014834	CGG	2	6	189789	189794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931561
4994	NC_014834	ACG	2	6	189795	189800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4995	NC_014834	CCGGTG	2	12	189857	189868	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931561
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4998	NC_014834	C	6	6	189923	189928	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4999	NC_014834	AC	3	6	190015	190020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5000	NC_014834	CGA	2	6	190044	190049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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