MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL04

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014827	ATA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133711
2	NC_014827	CTT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133711
3	NC_014827	AGA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133711
4	NC_014827	GTT	2	6	260	265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133711
5	NC_014827	GAT	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133712
6	NC_014827	TAA	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133712
7	NC_014827	GCA	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014827	ATT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133713
9	NC_014827	GCC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133713
10	NC_014827	CAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133713
11	NC_014827	TTC	2	6	965	970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133713
12	NC_014827	ATA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133714
13	NC_014827	CTT	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
14	NC_014827	TTC	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
15	NC_014827	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
16	NC_014827	TTA	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
17	NC_014827	TCA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133714
18	NC_014827	CAC	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014827	GCA	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014827	GCA	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014827	ACT	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014827	GCG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014827	CTA	2	6	2030	2035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014827	GGC	2	6	2053	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014827	AGA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014827	GCT	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014827	TGC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014827	GCA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014827	GAA	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014827	AAT	2	6	2395	2400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014827	AGC	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014827	CAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014827	CAG	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014827	AAC	2	6	2495	2500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014827	GAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014827	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014827	AAC	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014827	CAG	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014827	AAG	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014827	AGC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014827	GCA	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014827	AGC	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014827	AGC	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014827	GAA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014827	GAA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014827	AGC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014827	AGC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014827	GCA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014827	AGA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014827	GCG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014827	ATA	2	6	3086	3091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014827	AGC	3	9	3117	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014827	ATC	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014827	GCA	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014827	TTA	2	6	3414	3419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014827	TGT	3	9	3430	3438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014827	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014827	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014827	TGA	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014827	GCA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014827	TAA	2	6	3712	3717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014827	TTC	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014827	TCT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014827	ATG	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014827	GCT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133715
66	NC_014827	CGC	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133715
67	NC_014827	GCA	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
68	NC_014827	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
69	NC_014827	TGA	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
70	NC_014827	GCA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
71	NC_014827	CGG	2	6	4827	4832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133715
72	NC_014827	GTT	3	9	4966	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133715
73	NC_014827	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
74	NC_014827	AAG	3	9	5017	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133715
75	NC_014827	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
76	NC_014827	GAT	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
77	NC_014827	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133715
78	NC_014827	TAA	2	6	5319	5324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133715
79	NC_014827	AGC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
80	NC_014827	GCA	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
81	NC_014827	TGG	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
82	NC_014827	GAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
83	NC_014827	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
84	NC_014827	ATG	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133716
85	NC_014827	ATA	2	6	5950	5955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133716
86	NC_014827	TTA	2	6	5961	5966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133716
87	NC_014827	CAG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
88	NC_014827	AGC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
89	NC_014827	TGG	2	6	6066	6071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133716
90	NC_014827	GAA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133717
91	NC_014827	CTG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133717
92	NC_014827	TGG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133717
93	NC_014827	AGG	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133717
94	NC_014827	GAA	2	6	6341	6346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133718
95	NC_014827	TCT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133718
96	NC_014827	ACA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133718
97	NC_014827	GCT	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133718
98	NC_014827	ATG	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133718
99	NC_014827	AGC	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133718
100	NC_014827	TAC	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133718
101	NC_014827	TCT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133718
102	NC_014827	TAC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133718
103	NC_014827	TAC	2	6	6869	6874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014827	TTA	2	6	6876	6881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014827	TGT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014827	ATT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014827	TAT	2	6	7282	7287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.