MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL03

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014826	GCGG	2	8	23	30	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014826	GATC	2	8	169	176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014826	GGCT	2	8	571	578	0 %	25 %	50 %	25 %	315630410
4	NC_014826	TTGA	2	8	964	971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014826	GTTT	2	8	1136	1143	0 %	75 %	25 %	0 %	315630411
6	NC_014826	TCTT	2	8	1459	1466	0 %	75 %	0 %	25 %	315630413
7	NC_014826	AAAG	2	8	1803	1810	75 %	0 %	25 %	0 %	315630413
8	NC_014826	TAAA	2	8	1868	1875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014826	TAAA	2	8	2014	2021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014826	TATT	2	8	2460	2467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014826	TGGC	2	8	3377	3384	0 %	25 %	50 %	25 %	315630414
12	NC_014826	AACG	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014826	ATTT	2	8	3785	3792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014826	AGCA	2	8	3964	3971	50 %	0 %	25 %	25 %	315630415
15	NC_014826	AGAT	2	8	4403	4410	50 %	25 %	25 %	0 %	315630415
16	NC_014826	CCAG	2	8	4924	4931	25 %	0 %	25 %	50 %	315630416
17	NC_014826	TTGA	2	8	5507	5514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014826	ATTA	2	8	5998	6005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014826	AAGA	2	8	6271	6278	75 %	0 %	25 %	0 %	315630417
20	NC_014826	ACTC	2	8	6906	6913	25 %	25 %	0 %	50 %	315630418
21	NC_014826	AATT	2	8	6980	6987	50 %	50 %	0 %	0 %	315630418
22	NC_014826	TCAG	2	8	7034	7041	25 %	25 %	25 %	25 %	315630418
23	NC_014826	TATT	2	8	7271	7278	25 %	75 %	0 %	0 %	315630418
24	NC_014826	TCTG	2	8	7532	7539	0 %	50 %	25 %	25 %	315630418
25	NC_014826	AATA	2	8	7689	7696	75 %	25 %	0 %	0 %	315630418
26	NC_014826	AAGC	2	8	7838	7845	50 %	0 %	25 %	25 %	315630418
27	NC_014826	CAGG	2	8	7848	7855	25 %	0 %	50 %	25 %	315630418
28	NC_014826	AATA	2	8	8096	8103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014826	AAAG	2	8	10156	10163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014826	TGGA	2	8	10969	10976	25 %	25 %	50 %	0 %	315630423
31	NC_014826	GAAA	2	8	11375	11382	75 %	0 %	25 %	0 %	315630423
32	NC_014826	TGTT	2	8	11446	11453	0 %	75 %	25 %	0 %	315630423
33	NC_014826	CTGA	2	8	11936	11943	25 %	25 %	25 %	25 %	315630424
34	NC_014826	TGTC	2	8	11965	11972	0 %	50 %	25 %	25 %	315630424
35	NC_014826	TCAA	2	8	12755	12762	50 %	25 %	0 %	25 %	315630424
36	NC_014826	TGGA	2	8	13957	13964	25 %	25 %	50 %	0 %	315630425
37	NC_014826	GTAA	2	8	14131	14138	50 %	25 %	25 %	0 %	315630426
38	NC_014826	GACA	2	8	15208	15215	50 %	0 %	25 %	25 %	315630427
39	NC_014826	AAAC	2	8	15726	15733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.