MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014825	TTTAGC	2	12	139	150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788692
2	NC_014825	CAGCGT	2	12	482	493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319788692
3	NC_014825	TGTTCG	2	12	2586	2597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319788694
4	NC_014825	GTATGG	2	12	3497	3508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319788694
5	NC_014825	AAGGAG	2	12	6583	6594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014825	TACCAT	2	12	7755	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788699
7	NC_014825	CAGACC	2	12	11262	11273	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319788702
8	NC_014825	TATCTT	2	12	19991	20002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319788710
9	NC_014825	CATATA	2	12	22020	22031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014825	GTCATT	2	12	27745	27756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788717
11	NC_014825	CAAGGT	2	12	29357	29368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319788719
12	NC_014825	CGGTAT	2	12	29783	29794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319788719
13	NC_014825	TTTGTT	2	12	31112	31123	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319788721
14	NC_014825	TTCAGC	2	12	34723	34734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788725
15	NC_014825	CAGCCG	2	12	37445	37456	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319788726
16	NC_014825	CGGTAA	2	12	43399	43410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319788731
17	NC_014825	TCAGTA	2	12	43530	43541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319788731
18	NC_014825	GCTTAT	2	12	43562	43573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788731
19	NC_014825	GCTCAT	2	12	44324	44335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788731
20	NC_014825	AGATCA	2	12	48392	48403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788732
21	NC_014825	ATCTCG	2	12	49963	49974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788733
22	NC_014825	TTGAAA	2	12	56967	56978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319788737
23	NC_014825	AACGAA	2	12	57475	57486	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014825	TATGCC	2	12	64643	64654	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788745
25	NC_014825	GTTATT	2	12	65955	65966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319788746
26	NC_014825	TTATAT	2	12	67204	67215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788746
27	NC_014825	CCCTCA	2	12	68227	68238	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	319788747
28	NC_014825	TACCTG	2	12	70039	70050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788748
29	NC_014825	AACTTC	2	12	72040	72051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788750
30	NC_014825	CTGAAA	2	12	73577	73588	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788753
31	NC_014825	AAACTG	2	12	73993	74004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788754
32	NC_014825	CATCAG	2	12	76916	76927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319788757
33	NC_014825	TTTCAT	2	12	77140	77151	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014825	CTACCT	2	12	78872	78883	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319788760
35	NC_014825	GAAATC	2	12	81527	81538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788762
36	NC_014825	GCTGAA	2	12	83693	83704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319788763
37	NC_014825	CATCAG	2	12	99930	99941	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319788778
38	NC_014825	AAAAGC	2	12	106132	106143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014825	GACAGC	2	12	113253	113264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788791
40	NC_014825	CGACAG	2	12	113539	113550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788792
41	NC_014825	ATTTGA	2	12	115027	115038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014825	CAACTA	2	12	115439	115450	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014825	TTTTGA	2	12	118934	118945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319788796
44	NC_014825	TGATGC	2	12	121199	121210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319788797
45	NC_014825	ATCCCG	2	12	124684	124695	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319788802
46	NC_014825	TCATAC	2	12	128430	128441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788807
47	NC_014825	GGAGAA	2	12	143179	143190	50 %	0 %	50 %	0 %	319788825
48	NC_014825	GGAGCA	2	12	146334	146345	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319788828
49	NC_014825	CCGCTG	2	12	148409	148420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319788829
50	NC_014825	AACTGA	2	12	148773	148784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788829
51	NC_014825	ATGGTA	2	12	148886	148897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788829
52	NC_014825	TGATTT	2	12	150132	150143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319788829
53	NC_014825	GATACT	2	12	151585	151596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319788829
54	NC_014825	ATACTA	2	12	153398	153409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319788829
55	NC_014825	AGCCAA	2	12	159183	159194	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014825	TGTTTT	2	12	159887	159898	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319788833
57	NC_014825	GGCAGC	2	12	164252	164263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014825	TCTCAT	2	12	165527	165538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319788836
59	NC_014825	GGCAGC	2	12	167057	167068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014825	TCAAAA	2	12	167739	167750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319788838
61	NC_014825	CTGCCT	2	12	173641	173652	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319788843
62	NC_014825	CAAAGG	2	12	177530	177541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014825	TTGGAG	2	12	181983	181994	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319788850
64	NC_014825	TCATAA	2	12	184022	184033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319788852
65	NC_014825	TGTACT	2	12	187241	187252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788855
66	NC_014825	GGATTT	2	12	188723	188734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319788857
67	NC_014825	TTGCAG	2	12	190814	190825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319788858
68	NC_014825	CTCATT	2	12	190971	190982	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319788858
69	NC_014825	TATCGC	2	12	192382	192393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788860
70	NC_014825	CAAGGT	2	12	193677	193688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319788863
71	NC_014825	TAAAAG	2	12	196789	196800	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319788864
72	NC_014825	CCGAGC	2	12	198120	198131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319788866
73	NC_014825	CGTAGC	2	12	202342	202353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319788867
74	NC_014825	TTCTGT	2	12	204125	204136	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	319788869
75	NC_014825	GACAGC	2	12	207681	207692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788872
76	NC_014825	CGTTGC	2	12	207853	207864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788872
77	NC_014825	TTAGCC	2	12	208348	208359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788873
78	NC_014825	ACATCA	2	12	209753	209764	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319788873
79	NC_014825	TTCGGG	2	12	211034	211045	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319788873
80	NC_014825	GGCTCC	2	12	214810	214821	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319788873
81	NC_014825	CTCGGG	2	12	214977	214988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319788873
82	NC_014825	CCTGCT	2	12	215627	215638	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319788873
83	NC_014825	CCTCGA	2	12	218193	218204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319788875
84	NC_014825	TCTTGA	2	12	225581	225592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788877
85	NC_014825	TTTCTT	2	12	231113	231124	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319788881
86	NC_014825	GCCTGC	2	12	231195	231206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319788881
87	NC_014825	GTTTCA	2	12	232125	232136	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788882
88	NC_014825	ATGAGA	2	12	233473	233484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319788885
89	NC_014825	ACCTTG	2	12	236287	236298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788887
90	NC_014825	GTAACA	2	12	238011	238022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788888
91	NC_014825	CTTTTC	2	12	238479	238490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788889
92	NC_014825	AAATTC	2	12	238962	238973	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014825	TACGGT	2	12	240784	240795	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319788892
94	NC_014825	TAAGAA	2	12	243922	243933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319788896
95	NC_014825	TATCCT	2	12	247898	247909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319788900
96	NC_014825	TCACCG	2	12	249657	249668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319788901
97	NC_014825	GAAGTT	2	12	259122	259133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014825	ACCACA	2	12	259557	259568	50 %	0 %	0 %	50 %	319788906
99	NC_014825	TGGTGA	2	12	259997	260008	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319788906
100	NC_014825	CGATGC	2	12	269500	269511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319788914
101	NC_014825	CGATGA	2	12	273329	273340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319788916
102	NC_014825	CCTGTT	2	12	289166	289177	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319788925
103	NC_014825	TGTACT	2	12	289627	289638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788925
104	NC_014825	CATTAT	2	12	289800	289811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319788925
105	NC_014825	TGTATC	2	12	291115	291126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788925
106	NC_014825	ATCACC	2	12	293416	293427	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319788927
107	NC_014825	ACCCAA	2	12	293913	293924	50 %	0 %	0 %	50 %	319788928
108	NC_014825	CCCGAA	2	12	298339	298350	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319788932
109	NC_014825	TTTACC	2	12	298490	298501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319788932
110	NC_014825	GATAAA	2	12	300526	300537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319788934
111	NC_014825	AGATAA	2	12	300561	300572	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319788934
112	NC_014825	GATGAG	2	12	300580	300591	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319788934
113	NC_014825	GATAAA	3	18	300592	300609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319788934
114	NC_014825	TGCGGA	2	12	304587	304598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319788936
115	NC_014825	TACCCT	2	12	305629	305640	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319788937
116	NC_014825	TGATAT	2	12	305812	305823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319788937
117	NC_014825	TGCACC	2	12	306338	306349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319788937
118	NC_014825	TACTCA	2	12	311069	311080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788941
119	NC_014825	TATTTT	2	12	311176	311187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014825	ATACCC	2	12	318177	318188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319788948
121	NC_014825	CGATAC	2	12	321586	321597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319788951
122	NC_014825	TACAGG	2	12	325566	325577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319788952
123	NC_014825	GCCATA	2	12	326001	326012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319788953
124	NC_014825	GTTGTA	2	12	328336	328347	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319788956
125	NC_014825	TGAACT	2	12	328800	328811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319788956
126	NC_014825	AAGTAC	2	12	330998	331009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319788959
127	NC_014825	AAGAGA	2	12	332119	332130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788960
128	NC_014825	TCAGGC	2	12	334404	334415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319788963
129	NC_014825	ACCTTG	2	12	336710	336721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788965
130	NC_014825	CTGATC	2	12	338925	338936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319788968
131	NC_014825	ATAACT	2	12	350659	350670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319788980

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.