MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 2006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	TTCTG	2	10	3692	3701	0 %	60 %	20 %	20 %	313205517
2	NC_014738	TAGAA	2	10	4752	4761	60 %	20 %	20 %	0 %	313205518
3	NC_014738	CTAGG	2	10	5852	5861	20 %	20 %	40 %	20 %	313205518
4	NC_014738	TATAA	2	10	6363	6372	60 %	40 %	0 %	0 %	313205518
5	NC_014738	TACCA	2	10	6924	6933	40 %	20 %	0 %	40 %	313205518
6	NC_014738	AAATC	2	10	7435	7444	60 %	20 %	0 %	20 %	313205518
7	NC_014738	AAATT	2	10	7586	7595	60 %	40 %	0 %	0 %	313205518
8	NC_014738	TATCA	2	10	11250	11259	40 %	40 %	0 %	20 %	313205521
9	NC_014738	AAAAC	2	10	12686	12695	80 %	0 %	0 %	20 %	313205523
10	NC_014738	TCATT	2	10	12864	12873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014738	AAATA	2	10	14923	14932	80 %	20 %	0 %	0 %	313205525
12	NC_014738	TTTAC	2	10	14994	15003	20 %	60 %	0 %	20 %	313205525
13	NC_014738	AATTT	2	10	15832	15841	40 %	60 %	0 %	0 %	313205527
14	NC_014738	CAAAA	2	10	16166	16175	80 %	0 %	0 %	20 %	313205527
15	NC_014738	TACAA	2	10	16975	16984	60 %	20 %	0 %	20 %	313205528
16	NC_014738	CTTAT	2	10	17479	17488	20 %	60 %	0 %	20 %	313205529
17	NC_014738	AAAAG	2	10	17843	17852	80 %	0 %	20 %	0 %	313205530
18	NC_014738	AAAAT	2	10	20404	20413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014738	ACATC	2	10	20707	20716	40 %	20 %	0 %	40 %	313205533
20	NC_014738	GTAGT	2	10	21860	21869	20 %	40 %	40 %	0 %	313205534
21	NC_014738	TTTGT	2	10	22442	22451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014738	ATTTC	2	10	23691	23700	20 %	60 %	0 %	20 %	313205535
23	NC_014738	GAAAA	2	10	23827	23836	80 %	0 %	20 %	0 %	313205535
24	NC_014738	TACTA	2	10	24028	24037	40 %	40 %	0 %	20 %	313205535
25	NC_014738	GAAAG	2	10	25941	25950	60 %	0 %	40 %	0 %	313205536
26	NC_014738	CTTAT	2	10	26575	26584	20 %	60 %	0 %	20 %	313205536
27	NC_014738	AAAGA	2	10	30493	30502	80 %	0 %	20 %	0 %	313205538
28	NC_014738	AAGTT	2	10	34843	34852	40 %	40 %	20 %	0 %	313205541
29	NC_014738	AATCC	2	10	35732	35741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014738	GAACG	2	10	37568	37577	40 %	0 %	40 %	20 %	313205545
31	NC_014738	CCAAA	2	10	37790	37799	60 %	0 %	0 %	40 %	313205545
32	NC_014738	CATAG	2	10	38302	38311	40 %	20 %	20 %	20 %	313205545
33	NC_014738	TTCTT	2	10	39029	39038	0 %	80 %	0 %	20 %	313205545
34	NC_014738	GTTTT	2	10	40175	40184	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014738	TTTGT	2	10	40712	40721	0 %	80 %	20 %	0 %	313205547
36	NC_014738	AAATA	2	10	41225	41234	80 %	20 %	0 %	0 %	313205547
37	NC_014738	GCCTT	2	10	44233	44242	0 %	40 %	20 %	40 %	313205549
38	NC_014738	ATGAA	2	10	44574	44583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014738	GAAAT	2	10	46950	46959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	ATAAA	2	10	48410	48419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014738	GTAGG	2	10	48860	48869	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014738	AAAAT	2	10	49977	49986	80 %	20 %	0 %	0 %	313205551
43	NC_014738	GATTC	2	10	50790	50799	20 %	40 %	20 %	20 %	313205551
44	NC_014738	CATAT	2	10	53387	53396	40 %	40 %	0 %	20 %	313205555
45	NC_014738	TTTAT	2	10	53581	53590	20 %	80 %	0 %	0 %	313205555
46	NC_014738	ACCCT	2	10	54523	54532	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014738	TAAAA	2	10	55973	55982	80 %	20 %	0 %	0 %	313205558
48	NC_014738	ATTAT	2	10	57493	57502	40 %	60 %	0 %	0 %	313205560
49	NC_014738	TATGA	2	10	57615	57624	40 %	40 %	20 %	0 %	313205560
50	NC_014738	AAGTA	2	10	57725	57734	60 %	20 %	20 %	0 %	313205560
51	NC_014738	AGGTT	2	10	58904	58913	20 %	40 %	40 %	0 %	313205562
52	NC_014738	GATAA	2	10	59903	59912	60 %	20 %	20 %	0 %	313205562
53	NC_014738	TATTT	2	10	59936	59945	20 %	80 %	0 %	0 %	313205562
54	NC_014738	ACCAG	2	10	60204	60213	40 %	0 %	20 %	40 %	313205563
55	NC_014738	ATTAA	2	10	61452	61461	60 %	40 %	0 %	0 %	313205564
56	NC_014738	TATCT	2	10	62129	62138	20 %	60 %	0 %	20 %	313205565
57	NC_014738	ATTTT	2	10	62281	62290	20 %	80 %	0 %	0 %	313205565
58	NC_014738	AAATT	2	10	62911	62920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014738	GAATA	2	10	65330	65339	60 %	20 %	20 %	0 %	313205568
60	NC_014738	AGGCA	2	10	67216	67225	40 %	0 %	40 %	20 %	313205569
61	NC_014738	ATAGA	2	10	67317	67326	60 %	20 %	20 %	0 %	313205569
62	NC_014738	AATGC	2	10	67343	67352	40 %	20 %	20 %	20 %	313205569
63	NC_014738	ACAGG	2	10	68315	68324	40 %	0 %	40 %	20 %	313205569
64	NC_014738	ACGGA	2	10	68772	68781	40 %	0 %	40 %	20 %	313205570
65	NC_014738	TATCA	2	10	70607	70616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014738	ATTCT	2	10	72430	72439	20 %	60 %	0 %	20 %	313205573
67	NC_014738	CTTTA	2	10	72999	73008	20 %	60 %	0 %	20 %	313205574
68	NC_014738	TTTAG	2	10	73497	73506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014738	AAACG	2	10	74961	74970	60 %	0 %	20 %	20 %	313205576
70	NC_014738	AATGA	2	10	75438	75447	60 %	20 %	20 %	0 %	313205577
71	NC_014738	AATAC	2	10	76949	76958	60 %	20 %	0 %	20 %	313205579
72	NC_014738	CAAAA	2	10	77724	77733	80 %	0 %	0 %	20 %	313205579
73	NC_014738	TTCGT	2	10	80271	80280	0 %	60 %	20 %	20 %	313205583
74	NC_014738	ACCAC	2	10	80389	80398	40 %	0 %	0 %	60 %	313205583
75	NC_014738	ACCAT	2	10	81308	81317	40 %	20 %	0 %	40 %	313205584
76	NC_014738	TTTAT	2	10	81584	81593	20 %	80 %	0 %	0 %	313205584
77	NC_014738	AAGCA	2	10	81807	81816	60 %	0 %	20 %	20 %	313205584
78	NC_014738	GGTAA	2	10	82006	82015	40 %	20 %	40 %	0 %	313205585
79	NC_014738	AAATA	3	15	83740	83754	80 %	20 %	0 %	0 %	313205586
80	NC_014738	ATAAA	2	10	84000	84009	80 %	20 %	0 %	0 %	313205586
81	NC_014738	GAAAA	2	10	84031	84040	80 %	0 %	20 %	0 %	313205586
82	NC_014738	TAATT	2	10	85973	85982	40 %	60 %	0 %	0 %	313205589
83	NC_014738	TGAGT	2	10	86471	86480	20 %	40 %	40 %	0 %	313205589
84	NC_014738	ATTGT	2	10	86930	86939	20 %	60 %	20 %	0 %	313205589
85	NC_014738	ATTTT	2	10	89211	89220	20 %	80 %	0 %	0 %	313205591
86	NC_014738	TCATT	2	10	89332	89341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014738	AAAGA	2	10	90146	90155	80 %	0 %	20 %	0 %	313205592
88	NC_014738	TTCCA	2	10	90492	90501	20 %	40 %	0 %	40 %	313205592
89	NC_014738	TAATG	2	10	90508	90517	40 %	40 %	20 %	0 %	313205592
90	NC_014738	CATAA	2	10	91806	91815	60 %	20 %	0 %	20 %	313205595
91	NC_014738	TCTCA	2	10	95346	95355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014738	ACCTG	2	10	97503	97512	20 %	20 %	20 %	40 %	313205598
93	NC_014738	TAAAA	2	10	99398	99407	80 %	20 %	0 %	0 %	313205598
94	NC_014738	CTTAT	2	10	99844	99853	20 %	60 %	0 %	20 %	313205599
95	NC_014738	ATTAA	2	10	101890	101899	60 %	40 %	0 %	0 %	313205601
96	NC_014738	TATTT	2	10	102736	102745	20 %	80 %	0 %	0 %	313205602
97	NC_014738	AAAAT	2	10	104157	104166	80 %	20 %	0 %	0 %	313205603
98	NC_014738	AAGAA	2	10	104929	104938	80 %	0 %	20 %	0 %	313205604
99	NC_014738	TCATT	2	10	105003	105012	20 %	60 %	0 %	20 %	313205604
100	NC_014738	AGGTT	2	10	105020	105029	20 %	40 %	40 %	0 %	313205604
101	NC_014738	AATTT	2	10	105191	105200	40 %	60 %	0 %	0 %	313205604
102	NC_014738	TAGTT	2	10	107780	107789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014738	TAAAT	2	10	107834	107843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014738	CAATG	2	10	110091	110100	40 %	20 %	20 %	20 %	313205608
105	NC_014738	ATTTT	2	10	110125	110134	20 %	80 %	0 %	0 %	313205608
106	NC_014738	AATGT	2	10	111091	111100	40 %	40 %	20 %	0 %	313205608
107	NC_014738	CAATG	2	10	112047	112056	40 %	20 %	20 %	20 %	313205608
108	NC_014738	GTAGA	2	10	112640	112649	40 %	20 %	40 %	0 %	313205608
109	NC_014738	ATTTC	2	10	114318	114327	20 %	60 %	0 %	20 %	313205611
110	NC_014738	ATTTT	2	10	115880	115889	20 %	80 %	0 %	0 %	313205612
111	NC_014738	TTGGT	2	10	116238	116247	0 %	60 %	40 %	0 %	313205613
112	NC_014738	TATTT	2	10	116254	116263	20 %	80 %	0 %	0 %	313205613
113	NC_014738	AAAAT	2	10	118098	118107	80 %	20 %	0 %	0 %	313205615
114	NC_014738	ATTTA	2	10	119410	119419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014738	TTAAA	2	10	121087	121096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014738	GTTTG	2	10	121421	121430	0 %	60 %	40 %	0 %	313205620
117	NC_014738	GGCGT	2	10	122116	122125	0 %	20 %	60 %	20 %	313205621
118	NC_014738	CTTTC	2	10	122282	122291	0 %	60 %	0 %	40 %	313205621
119	NC_014738	TCTTT	2	10	122989	122998	0 %	80 %	0 %	20 %	313205622
120	NC_014738	CATAG	2	10	123462	123471	40 %	20 %	20 %	20 %	313205622
121	NC_014738	TAAAA	2	10	124169	124178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014738	TCTTG	2	10	125076	125085	0 %	60 %	20 %	20 %	313205624
123	NC_014738	TTAAA	2	10	126196	126205	60 %	40 %	0 %	0 %	313205625
124	NC_014738	GCTAA	2	10	128447	128456	40 %	20 %	20 %	20 %	313205627
125	NC_014738	GTTTT	2	10	128889	128898	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014738	GAGTA	2	10	128959	128968	40 %	20 %	40 %	0 %	313205628
127	NC_014738	GTTAA	2	10	132588	132597	40 %	40 %	20 %	0 %	313205632
128	NC_014738	CCTGT	2	10	134420	134429	0 %	40 %	20 %	40 %	313205633
129	NC_014738	TAAAG	2	10	136312	136321	60 %	20 %	20 %	0 %	313205635
130	NC_014738	ATTTT	2	10	136738	136747	20 %	80 %	0 %	0 %	313205635
131	NC_014738	TTATT	2	10	139200	139209	20 %	80 %	0 %	0 %	313205637
132	NC_014738	GTTTT	2	10	140700	140709	0 %	80 %	20 %	0 %	313205639
133	NC_014738	TAAAA	2	10	142639	142648	80 %	20 %	0 %	0 %	313205642
134	NC_014738	AAATT	2	10	143859	143868	60 %	40 %	0 %	0 %	313205643
135	NC_014738	ACTTT	2	10	144990	144999	20 %	60 %	0 %	20 %	313205645
136	NC_014738	GTATT	2	10	145971	145980	20 %	60 %	20 %	0 %	313205645
137	NC_014738	ATTAT	2	10	146887	146896	40 %	60 %	0 %	0 %	313205646
138	NC_014738	TTATC	2	10	150363	150372	20 %	60 %	0 %	20 %	313205650
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