MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 5544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	CATT	2	8	478	485	25 %	50 %	0 %	25 %	313205512
2	NC_014738	ATTG	2	8	1095	1102	25 %	50 %	25 %	0 %	313205512
3	NC_014738	CAAT	2	8	1175	1182	50 %	25 %	0 %	25 %	313205512
4	NC_014738	TTTG	2	8	1604	1611	0 %	75 %	25 %	0 %	313205513
5	NC_014738	GAAG	2	8	1794	1801	50 %	0 %	50 %	0 %	313205513
6	NC_014738	TGTT	2	8	2713	2720	0 %	75 %	25 %	0 %	313205514
7	NC_014738	ATTT	2	8	4225	4232	25 %	75 %	0 %	0 %	313205518
8	NC_014738	AGAA	2	8	4458	4465	75 %	0 %	25 %	0 %	313205518
9	NC_014738	ATTC	2	8	5124	5131	25 %	50 %	0 %	25 %	313205518
10	NC_014738	ATTT	2	8	5828	5835	25 %	75 %	0 %	0 %	313205518
11	NC_014738	CTTC	2	8	6428	6435	0 %	50 %	0 %	50 %	313205518
12	NC_014738	ATCA	2	8	6609	6616	50 %	25 %	0 %	25 %	313205518
13	NC_014738	TTAC	2	8	6793	6800	25 %	50 %	0 %	25 %	313205518
14	NC_014738	TGAT	2	8	7408	7415	25 %	50 %	25 %	0 %	313205518
15	NC_014738	TAAG	2	8	7723	7730	50 %	25 %	25 %	0 %	313205518
16	NC_014738	TTGA	2	8	8268	8275	25 %	50 %	25 %	0 %	313205518
17	NC_014738	GATA	2	8	8436	8443	50 %	25 %	25 %	0 %	313205518
18	NC_014738	GTTT	2	8	8633	8640	0 %	75 %	25 %	0 %	313205518
19	NC_014738	CTTT	2	8	8855	8862	0 %	75 %	0 %	25 %	313205518
20	NC_014738	ATTT	2	8	8883	8890	25 %	75 %	0 %	0 %	313205518
21	NC_014738	GAAG	2	8	10073	10080	50 %	0 %	50 %	0 %	313205520
22	NC_014738	GTTT	2	8	10524	10531	0 %	75 %	25 %	0 %	313205520
23	NC_014738	ATTT	2	8	10720	10727	25 %	75 %	0 %	0 %	313205521
24	NC_014738	AGCA	2	8	10971	10978	50 %	0 %	25 %	25 %	313205521
25	NC_014738	AGAA	3	12	10993	11004	75 %	0 %	25 %	0 %	313205521
26	NC_014738	TGTA	2	8	11145	11152	25 %	50 %	25 %	0 %	313205521
27	NC_014738	AATA	2	8	11178	11185	75 %	25 %	0 %	0 %	313205521
28	NC_014738	AGGT	2	8	11475	11482	25 %	25 %	50 %	0 %	313205521
29	NC_014738	GTTT	2	8	11847	11854	0 %	75 %	25 %	0 %	313205522
30	NC_014738	TGTA	2	8	11983	11990	25 %	50 %	25 %	0 %	313205523
31	NC_014738	AGAT	2	8	13052	13059	50 %	25 %	25 %	0 %	313205524
32	NC_014738	TTTA	2	8	13467	13474	25 %	75 %	0 %	0 %	313205524
33	NC_014738	TAAA	2	8	13667	13674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014738	AGAT	2	8	13875	13882	50 %	25 %	25 %	0 %	313205525
35	NC_014738	ACTT	2	8	14058	14065	25 %	50 %	0 %	25 %	313205525
36	NC_014738	AAGC	2	8	14162	14169	50 %	0 %	25 %	25 %	313205525
37	NC_014738	TCTA	2	8	14192	14199	25 %	50 %	0 %	25 %	313205525
38	NC_014738	TGAT	2	8	15566	15573	25 %	50 %	25 %	0 %	313205526
39	NC_014738	TTAA	2	8	15789	15796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	TCTA	2	8	16026	16033	25 %	50 %	0 %	25 %	313205527
41	NC_014738	AGTA	2	8	16231	16238	50 %	25 %	25 %	0 %	313205527
42	NC_014738	CATT	2	8	17350	17357	25 %	50 %	0 %	25 %	313205529
43	NC_014738	ACCA	2	8	17424	17431	50 %	0 %	0 %	50 %	313205529
44	NC_014738	ATTT	2	8	17963	17970	25 %	75 %	0 %	0 %	313205530
45	NC_014738	ATTT	2	8	18074	18081	25 %	75 %	0 %	0 %	313205530
46	NC_014738	ATTT	2	8	18630	18637	25 %	75 %	0 %	0 %	313205530
47	NC_014738	AAAT	2	8	18934	18941	75 %	25 %	0 %	0 %	313205530
48	NC_014738	ATTT	2	8	19550	19557	25 %	75 %	0 %	0 %	313205531
49	NC_014738	CCAA	2	8	20121	20128	50 %	0 %	0 %	50 %	313205532
50	NC_014738	ATAA	2	8	20462	20469	75 %	25 %	0 %	0 %	313205533
51	NC_014738	ATTC	2	8	20552	20559	25 %	50 %	0 %	25 %	313205533
52	NC_014738	TTGG	2	8	20627	20634	0 %	50 %	50 %	0 %	313205533
53	NC_014738	CTTT	2	8	20825	20832	0 %	75 %	0 %	25 %	313205533
54	NC_014738	ATTT	2	8	21459	21466	25 %	75 %	0 %	0 %	313205534
55	NC_014738	GTTA	2	8	22203	22210	25 %	50 %	25 %	0 %	313205534
56	NC_014738	TAAA	2	8	22404	22411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014738	TAAA	2	8	22535	22542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014738	CTAT	2	8	23033	23040	25 %	50 %	0 %	25 %	313205535
59	NC_014738	AGAA	2	8	23379	23386	75 %	0 %	25 %	0 %	313205535
60	NC_014738	ATGG	2	8	23571	23578	25 %	25 %	50 %	0 %	313205535
61	NC_014738	GAAC	2	8	23804	23811	50 %	0 %	25 %	25 %	313205535
62	NC_014738	TACT	2	8	24064	24071	25 %	50 %	0 %	25 %	313205535
63	NC_014738	AGAT	2	8	24417	24424	50 %	25 %	25 %	0 %	313205535
64	NC_014738	TTCT	2	8	24747	24754	0 %	75 %	0 %	25 %	313205535
65	NC_014738	TAGA	2	8	24809	24816	50 %	25 %	25 %	0 %	313205535
66	NC_014738	TTAA	2	8	25302	25309	50 %	50 %	0 %	0 %	313205535
67	NC_014738	CTAC	2	8	25608	25615	25 %	25 %	0 %	50 %	313205536
68	NC_014738	ATTT	2	8	25873	25880	25 %	75 %	0 %	0 %	313205536
69	NC_014738	ATAG	2	8	26493	26500	50 %	25 %	25 %	0 %	313205536
70	NC_014738	CTTA	2	8	26634	26641	25 %	50 %	0 %	25 %	313205536
71	NC_014738	TAAA	2	8	26644	26651	75 %	25 %	0 %	0 %	313205536
72	NC_014738	CTTT	2	8	27048	27055	0 %	75 %	0 %	25 %	313205537
73	NC_014738	AGAT	2	8	27271	27278	50 %	25 %	25 %	0 %	313205537
74	NC_014738	TTGG	2	8	28159	28166	0 %	50 %	50 %	0 %	313205537
75	NC_014738	AACT	2	8	28307	28314	50 %	25 %	0 %	25 %	313205537
76	NC_014738	AATA	2	8	28350	28357	75 %	25 %	0 %	0 %	313205537
77	NC_014738	AAAT	2	8	29154	29161	75 %	25 %	0 %	0 %	313205537
78	NC_014738	TTAT	2	8	30128	30135	25 %	75 %	0 %	0 %	313205538
79	NC_014738	ATTT	2	8	30180	30187	25 %	75 %	0 %	0 %	313205538
80	NC_014738	AAGA	2	8	31101	31108	75 %	0 %	25 %	0 %	313205538
81	NC_014738	GAAA	2	8	31216	31223	75 %	0 %	25 %	0 %	313205538
82	NC_014738	AGAT	2	8	31807	31814	50 %	25 %	25 %	0 %	313205538
83	NC_014738	TTTA	2	8	32488	32495	25 %	75 %	0 %	0 %	313205538
84	NC_014738	GTAG	2	8	32713	32720	25 %	25 %	50 %	0 %	313205539
85	NC_014738	TAAA	2	8	33043	33050	75 %	25 %	0 %	0 %	313205540
86	NC_014738	GAAG	2	8	34728	34735	50 %	0 %	50 %	0 %	313205541
87	NC_014738	TCTT	3	12	35407	35418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014738	CCAA	2	8	36046	36053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014738	ATAA	2	8	36109	36116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014738	GAAT	2	8	36385	36392	50 %	25 %	25 %	0 %	313205543
91	NC_014738	AAAT	2	8	37959	37966	75 %	25 %	0 %	0 %	313205545
92	NC_014738	TGGT	2	8	38681	38688	0 %	50 %	50 %	0 %	313205545
93	NC_014738	CAAT	2	8	38837	38844	50 %	25 %	0 %	25 %	313205545
94	NC_014738	GAAA	2	8	39103	39110	75 %	0 %	25 %	0 %	313205545
95	NC_014738	AAAG	2	8	39172	39179	75 %	0 %	25 %	0 %	313205545
96	NC_014738	CCTT	2	8	39314	39321	0 %	50 %	0 %	50 %	313205545
97	NC_014738	TCTA	2	8	39954	39961	25 %	50 %	0 %	25 %	313205546
98	NC_014738	AGTA	2	8	41377	41384	50 %	25 %	25 %	0 %	313205547
99	NC_014738	ATTT	2	8	41586	41593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014738	TAAA	2	8	41780	41787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014738	TTCT	2	8	42211	42218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014738	TATC	2	8	42434	42441	25 %	50 %	0 %	25 %	313205548
103	NC_014738	TTTG	2	8	42643	42650	0 %	75 %	25 %	0 %	313205548
104	NC_014738	AAAT	2	8	42869	42876	75 %	25 %	0 %	0 %	313205548
105	NC_014738	AATT	2	8	42907	42914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014738	CTCA	2	8	43349	43356	25 %	25 %	0 %	50 %	313205549
107	NC_014738	CTTT	2	8	43714	43721	0 %	75 %	0 %	25 %	313205549
108	NC_014738	TTTC	2	8	43797	43804	0 %	75 %	0 %	25 %	313205549
109	NC_014738	TACA	2	8	43832	43839	50 %	25 %	0 %	25 %	313205549
110	NC_014738	ATTT	2	8	45245	45252	25 %	75 %	0 %	0 %	313205550
111	NC_014738	TATT	2	8	45831	45838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014738	TCTT	2	8	45849	45856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014738	AAGG	2	8	46030	46037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014738	AGAA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014738	AAAG	2	8	46346	46353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014738	AGAA	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014738	TACT	2	8	46620	46627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014738	TTTA	2	8	46799	46806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014738	GAGG	2	8	47741	47748	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014738	CTAT	2	8	48026	48033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014738	AGAT	2	8	48453	48460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014738	GGGT	2	8	48788	48795	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014738	TGTA	2	8	50326	50333	25 %	50 %	25 %	0 %	313205551
124	NC_014738	AAGC	2	8	51113	51120	50 %	0 %	25 %	25 %	313205551
125	NC_014738	ACAA	2	8	51238	51245	75 %	0 %	0 %	25 %	313205551
126	NC_014738	AAGC	2	8	51675	51682	50 %	0 %	25 %	25 %	313205552
127	NC_014738	AATT	2	8	52165	52172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014738	TATT	2	8	52203	52210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014738	GTAT	2	8	52975	52982	25 %	50 %	25 %	0 %	313205553
130	NC_014738	TAGA	2	8	53010	53017	50 %	25 %	25 %	0 %	313205553
131	NC_014738	TTTC	2	8	53212	53219	0 %	75 %	0 %	25 %	313205554
132	NC_014738	TATT	2	8	53458	53465	25 %	75 %	0 %	0 %	313205555
133	NC_014738	TGGT	2	8	56334	56341	0 %	50 %	50 %	0 %	313205558
134	NC_014738	ATTT	2	8	56810	56817	25 %	75 %	0 %	0 %	313205559
135	NC_014738	TGAT	2	8	57334	57341	25 %	50 %	25 %	0 %	313205560
136	NC_014738	GTAA	2	8	57525	57532	50 %	25 %	25 %	0 %	313205560
137	NC_014738	GAAT	2	8	58261	58268	50 %	25 %	25 %	0 %	313205560
138	NC_014738	TGTC	2	8	58606	58613	0 %	50 %	25 %	25 %	313205561
139	NC_014738	TACA	2	8	58704	58711	50 %	25 %	0 %	25 %	313205562
140	NC_014738	AGAA	2	8	59460	59467	75 %	0 %	25 %	0 %	313205562
141	NC_014738	CTTA	2	8	60033	60040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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143	NC_014738	AATG	2	8	60715	60722	50 %	25 %	25 %	0 %	313205563
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