MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 48122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014738	TAT	2	6	43300	43305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205549
1003	NC_014738	CTCA	2	8	43349	43356	25 %	25 %	0 %	50 %	313205549
1004	NC_014738	AAT	2	6	43645	43650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205549
1005	NC_014738	CTTT	2	8	43714	43721	0 %	75 %	0 %	25 %	313205549
1006	NC_014738	TGT	2	6	43739	43744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205549
1007	NC_014738	CCT	2	6	43780	43785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313205549
1008	NC_014738	TTTC	2	8	43797	43804	0 %	75 %	0 %	25 %	313205549
1009	NC_014738	TACA	2	8	43832	43839	50 %	25 %	0 %	25 %	313205549
1010	NC_014738	ATT	3	9	43850	43858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205549
1011	NC_014738	A	7	7	43969	43975	100 %	0 %	0 %	0 %	313205549
1012	NC_014738	ATT	2	6	44081	44086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205549
1013	NC_014738	GCCTT	2	10	44233	44242	0 %	40 %	20 %	40 %	313205549
1014	NC_014738	AGCTCC	2	12	44285	44296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313205549
1015	NC_014738	ACT	2	6	44307	44312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205549
1016	NC_014738	TTG	2	6	44388	44393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205549
1017	NC_014738	AG	3	6	44403	44408	50 %	0 %	50 %	0 %	313205549
1018	NC_014738	T	7	7	44506	44512	0 %	100 %	0 %	0 %	313205549
1019	NC_014738	TA	3	6	44519	44524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014738	ATGAA	2	10	44574	44583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014738	A	7	7	44582	44588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014738	GTT	2	6	44594	44599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014738	AAC	2	6	44650	44655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205550
1024	NC_014738	AT	3	6	44665	44670	50 %	50 %	0 %	0 %	313205550
1025	NC_014738	T	6	6	44696	44701	0 %	100 %	0 %	0 %	313205550
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1032	NC_014738	TC	3	6	45359	45364	0 %	50 %	0 %	50 %	313205550
1033	NC_014738	CCG	2	6	45446	45451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313205550
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1035	NC_014738	ATC	2	6	45500	45505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205550
1036	NC_014738	TAT	2	6	45516	45521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205550
1037	NC_014738	ATA	2	6	45544	45549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014738	TA	3	6	45572	45577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014738	ATT	2	6	45601	45606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014738	A	6	6	45661	45666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014738	ATG	2	6	45717	45722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014738	AGA	2	6	45779	45784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014738	AGT	2	6	45785	45790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014738	TATT	2	8	45831	45838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014738	TCTT	2	8	45849	45856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_014738	TAT	2	6	45888	45893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1050	NC_014738	AAAG	2	8	46346	46353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014738	AGAA	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014738	ACA	2	6	46418	46423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1055	NC_014738	GAT	2	6	46587	46592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014738	TACT	2	8	46620	46627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1058	NC_014738	AG	3	6	46732	46737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014738	TTG	2	6	46742	46747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014738	TTTA	2	8	46799	46806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_014738	AAT	2	6	46918	46923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014738	AT	3	6	46930	46935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014738	GAAAT	2	10	46950	46959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014738	TAG	2	6	47005	47010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_014738	AGT	2	6	47051	47056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_014738	GGGT	2	8	48788	48795	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014738	TG	3	6	48813	48818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014738	GTAGG	2	10	48860	48869	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014738	TAC	2	6	48964	48969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1106	NC_014738	ACA	2	6	48998	49003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_014738	C	6	6	49008	49013	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1110	NC_014738	A	6	6	49102	49107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014738	AG	3	6	49189	49194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_014738	TCT	2	6	49450	49455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1121	NC_014738	GAA	2	6	49583	49588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_014738	GAT	2	6	49684	49689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014738	TAA	2	6	49695	49700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014738	AAT	2	6	49744	49749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014738	A	6	6	49774	49779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014738	TGTCTG	2	12	49814	49825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1129	NC_014738	AGA	2	6	49852	49857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014738	A	6	6	49958	49963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014738	A	6	6	49968	49973	100 %	0 %	0 %	0 %	313205551
1132	NC_014738	AAAAT	2	10	49977	49986	80 %	20 %	0 %	0 %	313205551
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1138	NC_014738	GGT	2	6	50232	50237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205551
1139	NC_014738	TGA	2	6	50281	50286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205551
1140	NC_014738	TA	3	6	50291	50296	50 %	50 %	0 %	0 %	313205551
1141	NC_014738	ATT	2	6	50307	50312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205551
1142	NC_014738	TGTA	2	8	50326	50333	25 %	50 %	25 %	0 %	313205551
1143	NC_014738	ATA	2	6	50334	50339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205551
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1146	NC_014738	ATT	2	6	50708	50713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205551
1147	NC_014738	ACT	2	6	50729	50734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205551
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1149	NC_014738	ATAGCC	2	12	50811	50822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313205551
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1159	NC_014738	TCT	2	6	51073	51078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205551
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1168	NC_014738	A	6	6	51467	51472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_014738	AAT	2	6	51478	51483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_014738	AAGC	2	8	51675	51682	50 %	0 %	25 %	25 %	313205552
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1185	NC_014738	T	7	7	52103	52109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1186	NC_014738	T	6	6	52150	52155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1188	NC_014738	TATT	2	8	52203	52210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1192	NC_014738	T	7	7	52284	52290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1193	NC_014738	AT	3	6	52313	52318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1194	NC_014738	A	11	11	52337	52347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1195	NC_014738	A	7	7	52358	52364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1196	NC_014738	A	7	7	52396	52402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1222	NC_014738	A	6	6	53286	53291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1246	NC_014738	TTA	2	6	54056	54061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_014738	A	6	6	54160	54165	100 %	0 %	0 %	0 %	313205556
1253	NC_014738	T	7	7	54176	54182	0 %	100 %	0 %	0 %	313205556
1254	NC_014738	T	6	6	54493	54498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_014738	ACCCT	2	10	54523	54532	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1256	NC_014738	CT	3	6	54531	54536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1257	NC_014738	GGT	2	6	54556	54561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_014738	TCT	2	6	54609	54614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_014738	A	7	7	54621	54627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_014738	ATT	2	6	54761	54766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_014738	T	8	8	54765	54772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_014738	TCA	2	6	54810	54815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_014738	A	6	6	54906	54911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_014738	TTA	7	21	54955	54975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205557
1265	NC_014738	CTT	2	6	55001	55006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205557
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1267	NC_014738	CTG	2	6	55146	55151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205557
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