MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 48122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014738	ATC	2	6	21227	21232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205533
502	NC_014738	TGA	2	6	21258	21263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205533
503	NC_014738	TCT	2	6	21279	21284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205533
504	NC_014738	ATT	2	6	21403	21408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014738	ATT	2	6	21422	21427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205534
506	NC_014738	ATTT	2	8	21459	21466	25 %	75 %	0 %	0 %	313205534
507	NC_014738	T	6	6	21464	21469	0 %	100 %	0 %	0 %	313205534
508	NC_014738	TAA	2	6	21518	21523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205534
509	NC_014738	CTT	2	6	21620	21625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205534
510	NC_014738	CCT	2	6	21709	21714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313205534
511	NC_014738	TCA	2	6	21742	21747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205534
512	NC_014738	T	8	8	21773	21780	0 %	100 %	0 %	0 %	313205534
513	NC_014738	GCT	2	6	21814	21819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205534
514	NC_014738	GTAGT	2	10	21860	21869	20 %	40 %	40 %	0 %	313205534
515	NC_014738	TTC	2	6	21893	21898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205534
516	NC_014738	ATG	2	6	21916	21921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205534
517	NC_014738	CTT	2	6	21965	21970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205534
518	NC_014738	TAT	2	6	21980	21985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205534
519	NC_014738	ATC	2	6	22017	22022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205534
520	NC_014738	T	7	7	22044	22050	0 %	100 %	0 %	0 %	313205534
521	NC_014738	TTG	2	6	22063	22068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205534
522	NC_014738	TGT	2	6	22120	22125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205534
523	NC_014738	AGC	2	6	22128	22133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205534
524	NC_014738	TTC	2	6	22140	22145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205534
525	NC_014738	A	7	7	22188	22194	100 %	0 %	0 %	0 %	313205534
526	NC_014738	GTTA	2	8	22203	22210	25 %	50 %	25 %	0 %	313205534
527	NC_014738	TAT	2	6	22211	22216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205534
528	NC_014738	AGA	2	6	22334	22339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014738	T	9	9	22351	22359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014738	AGA	2	6	22369	22374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014738	TAAA	2	8	22404	22411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014738	GA	3	6	22431	22436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014738	TTTGT	2	10	22442	22451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014738	AGT	2	6	22479	22484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014738	ATT	2	6	22487	22492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014738	AT	3	6	22499	22504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014738	TAAA	2	8	22535	22542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014738	T	7	7	22549	22555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014738	ATA	2	6	22556	22561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014738	TAA	2	6	22570	22575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014738	CCAAAA	2	12	22664	22675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205535
542	NC_014738	AGA	2	6	22709	22714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
543	NC_014738	A	6	6	22714	22719	100 %	0 %	0 %	0 %	313205535
544	NC_014738	TCT	2	6	22750	22755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205535
545	NC_014738	ATG	2	6	22766	22771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
546	NC_014738	TCT	2	6	22780	22785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205535
547	NC_014738	AAG	2	6	22872	22877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
548	NC_014738	TTA	2	6	22976	22981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
549	NC_014738	GCA	2	6	23026	23031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205535
550	NC_014738	CTAT	2	8	23033	23040	25 %	50 %	0 %	25 %	313205535
551	NC_014738	ATC	2	6	23065	23070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
552	NC_014738	ATG	2	6	23158	23163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
553	NC_014738	CGG	2	6	23204	23209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313205535
554	NC_014738	AAG	2	6	23249	23254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
555	NC_014738	ATA	2	6	23282	23287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
556	NC_014738	TAT	2	6	23358	23363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
557	NC_014738	TAA	2	6	23370	23375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
558	NC_014738	AGAA	2	8	23379	23386	75 %	0 %	25 %	0 %	313205535
559	NC_014738	ATT	2	6	23415	23420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
560	NC_014738	TAA	2	6	23421	23426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
561	NC_014738	ATG	2	6	23534	23539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
562	NC_014738	ATGG	2	8	23571	23578	25 %	25 %	50 %	0 %	313205535
563	NC_014738	GA	3	6	23637	23642	50 %	0 %	50 %	0 %	313205535
564	NC_014738	ATTTC	2	10	23691	23700	20 %	60 %	0 %	20 %	313205535
565	NC_014738	TCTAAC	2	12	23743	23754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
566	NC_014738	TAC	2	6	23763	23768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
567	NC_014738	CAT	3	9	23783	23791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
568	NC_014738	GAAC	2	8	23804	23811	50 %	0 %	25 %	25 %	313205535
569	NC_014738	GAAAA	2	10	23827	23836	80 %	0 %	20 %	0 %	313205535
570	NC_014738	ATT	2	6	23861	23866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
571	NC_014738	A	6	6	23869	23874	100 %	0 %	0 %	0 %	313205535
572	NC_014738	GTG	2	6	23990	23995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205535
573	NC_014738	TTA	2	6	24016	24021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
574	NC_014738	TACTA	2	10	24028	24037	40 %	40 %	0 %	20 %	313205535
575	NC_014738	TACT	2	8	24064	24071	25 %	50 %	0 %	25 %	313205535
576	NC_014738	TTC	2	6	24096	24101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205535
577	NC_014738	TAA	2	6	24114	24119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
578	NC_014738	GAG	2	6	24215	24220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205535
579	NC_014738	G	6	6	24224	24229	0 %	0 %	100 %	0 %	313205535
580	NC_014738	TA	3	6	24275	24280	50 %	50 %	0 %	0 %	313205535
581	NC_014738	AGAT	2	8	24417	24424	50 %	25 %	25 %	0 %	313205535
582	NC_014738	AGG	2	6	24489	24494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205535
583	NC_014738	AGC	2	6	24648	24653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205535
584	NC_014738	GGT	2	6	24685	24690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205535
585	NC_014738	GGT	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205535
586	NC_014738	TTCT	2	8	24747	24754	0 %	75 %	0 %	25 %	313205535
587	NC_014738	CAG	2	6	24763	24768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205535
588	NC_014738	ATG	2	6	24773	24778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
589	NC_014738	TAGA	2	8	24809	24816	50 %	25 %	25 %	0 %	313205535
590	NC_014738	AATGCT	2	12	24967	24978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313205535
591	NC_014738	ATT	2	6	25079	25084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
592	NC_014738	AGA	2	6	25089	25094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
593	NC_014738	ATA	2	6	25115	25120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
594	NC_014738	GT	3	6	25271	25276	0 %	50 %	50 %	0 %	313205535
595	NC_014738	TTAA	2	8	25302	25309	50 %	50 %	0 %	0 %	313205535
596	NC_014738	AAT	2	6	25334	25339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205536
597	NC_014738	GCT	2	6	25368	25373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
598	NC_014738	TC	3	6	25387	25392	0 %	50 %	0 %	50 %	313205536
599	NC_014738	TAG	2	6	25427	25432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205536
600	NC_014738	AAG	2	6	25522	25527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205536
601	NC_014738	GTG	2	6	25528	25533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205536
602	NC_014738	ACT	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205536
603	NC_014738	CTAC	2	8	25608	25615	25 %	25 %	0 %	50 %	313205536
604	NC_014738	GA	3	6	25637	25642	50 %	0 %	50 %	0 %	313205536
605	NC_014738	TAT	2	6	25707	25712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205536
606	NC_014738	TTA	2	6	25747	25752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205536
607	NC_014738	GAA	2	6	25806	25811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205536
608	NC_014738	T	6	6	25838	25843	0 %	100 %	0 %	0 %	313205536
609	NC_014738	ATTT	2	8	25873	25880	25 %	75 %	0 %	0 %	313205536
610	NC_014738	CCT	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313205536
611	NC_014738	GAAAG	2	10	25941	25950	60 %	0 %	40 %	0 %	313205536
612	NC_014738	ATT	2	6	25994	25999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205536
613	NC_014738	GCT	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
614	NC_014738	TGC	2	6	26053	26058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
615	NC_014738	A	6	6	26098	26103	100 %	0 %	0 %	0 %	313205536
616	NC_014738	AGC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205536
617	NC_014738	T	7	7	26179	26185	0 %	100 %	0 %	0 %	313205536
618	NC_014738	ATA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205536
619	NC_014738	GTA	2	6	26214	26219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205536
620	NC_014738	ACA	2	6	26265	26270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205536
621	NC_014738	TGC	2	6	26282	26287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
622	NC_014738	AGG	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205536
623	NC_014738	GGT	2	6	26328	26333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205536
624	NC_014738	GGA	2	6	26337	26342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205536
625	NC_014738	CTA	2	6	26350	26355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205536
626	NC_014738	TAG	2	6	26362	26367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205536
627	NC_014738	CAT	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205536
628	NC_014738	ATAG	2	8	26493	26500	50 %	25 %	25 %	0 %	313205536
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630	NC_014738	CTTAT	2	10	26575	26584	20 %	60 %	0 %	20 %	313205536
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