MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 3401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014664	CCCTT	2	10	641	650	0 %	40 %	0 %	60 %	312112795
2	NC_014664	GCGCC	2	10	3210	3219	0 %	0 %	40 %	60 %	312112797
3	NC_014664	TTCGC	2	10	3249	3258	0 %	40 %	20 %	40 %	312112797
4	NC_014664	AGGGC	2	10	3411	3420	20 %	0 %	60 %	20 %	312112797
5	NC_014664	TGGCG	2	10	4405	4414	0 %	20 %	60 %	20 %	312112798
6	NC_014664	GTCCG	2	10	4996	5005	0 %	20 %	40 %	40 %	312112798
7	NC_014664	CCGCG	2	10	7794	7803	0 %	0 %	40 %	60 %	312112799
8	NC_014664	GGCAG	2	10	8007	8016	20 %	0 %	60 %	20 %	312112800
9	NC_014664	CGCCC	2	10	9697	9706	0 %	0 %	20 %	80 %	312112802
10	NC_014664	GCCGC	2	10	10216	10225	0 %	0 %	40 %	60 %	312112802
11	NC_014664	GCGTC	2	10	10850	10859	0 %	20 %	40 %	40 %	312112803
12	NC_014664	ACGTC	2	10	11266	11275	20 %	20 %	20 %	40 %	312112804
13	NC_014664	GCGCG	2	10	12902	12911	0 %	0 %	60 %	40 %	312112805
14	NC_014664	ACCGA	2	10	15654	15663	40 %	0 %	20 %	40 %	312112807
15	NC_014664	GAGCG	2	10	16375	16384	20 %	0 %	60 %	20 %	312112807
16	NC_014664	GCGCG	2	10	18059	18068	0 %	0 %	60 %	40 %	312112809
17	NC_014664	CCGCC	2	10	19036	19045	0 %	0 %	20 %	80 %	312112810
18	NC_014664	CCTCG	2	10	20436	20445	0 %	20 %	20 %	60 %	312112811
19	NC_014664	CGGCT	2	10	21001	21010	0 %	20 %	40 %	40 %	312112811
20	NC_014664	CCGCC	2	10	23079	23088	0 %	0 %	20 %	80 %	312112813
21	NC_014664	GAGAA	2	10	23168	23177	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014664	GCCTA	2	10	25895	25904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014664	CGCGA	2	10	28336	28345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014664	GGTCC	2	10	28653	28662	0 %	20 %	40 %	40 %	312112818
25	NC_014664	CGACG	2	10	29049	29058	20 %	0 %	40 %	40 %	312112818
26	NC_014664	AGGCG	2	10	29460	29469	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014664	GTGAA	2	10	30002	30011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014664	GCAAA	2	10	30940	30949	60 %	0 %	20 %	20 %	312112820
29	NC_014664	GAACT	2	10	31453	31462	40 %	20 %	20 %	20 %	312112820
30	NC_014664	CCGTT	2	10	31751	31760	0 %	40 %	20 %	40 %	312112821
31	NC_014664	TTCAC	2	10	32464	32473	20 %	40 %	0 %	40 %	312112821
32	NC_014664	CGGCG	2	10	33859	33868	0 %	0 %	60 %	40 %	312112822
33	NC_014664	CCGAT	2	10	34258	34267	20 %	20 %	20 %	40 %	312112822
34	NC_014664	GCATC	2	10	35235	35244	20 %	20 %	20 %	40 %	312112823
35	NC_014664	GCCGC	2	10	36530	36539	0 %	0 %	40 %	60 %	312112824
36	NC_014664	GCCGC	2	10	36974	36983	0 %	0 %	40 %	60 %	312112824
37	NC_014664	CTTGC	2	10	37720	37729	0 %	40 %	20 %	40 %	312112825
38	NC_014664	CCGCG	2	10	39304	39313	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_014664	CGGCG	2	10	39415	39424	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014664	GCTTC	2	10	39882	39891	0 %	40 %	20 %	40 %	312112827
41	NC_014664	TCGGC	2	10	41265	41274	0 %	20 %	40 %	40 %	312112828
42	NC_014664	CGGGC	2	10	43145	43154	0 %	0 %	60 %	40 %	312112830
43	NC_014664	TCGGC	2	10	44961	44970	0 %	20 %	40 %	40 %	312112831
44	NC_014664	GCTGT	2	10	47797	47806	0 %	40 %	40 %	20 %	312112834
45	NC_014664	GCGAC	2	10	47907	47916	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014664	CGGCC	2	10	48426	48435	0 %	0 %	40 %	60 %	312112836
47	NC_014664	ATCGA	2	10	50370	50379	40 %	20 %	20 %	20 %	312112837
48	NC_014664	CGCGC	2	10	50742	50751	0 %	0 %	40 %	60 %	312112838
49	NC_014664	GTCGA	2	10	50985	50994	20 %	20 %	40 %	20 %	312112838
50	NC_014664	ACGAC	2	10	51058	51067	40 %	0 %	20 %	40 %	312112838
51	NC_014664	CTCGC	2	10	51192	51201	0 %	20 %	20 %	60 %	312112838
52	NC_014664	CGGCG	2	10	51407	51416	0 %	0 %	60 %	40 %	312112838
53	NC_014664	GGGCA	2	10	51804	51813	20 %	0 %	60 %	20 %	312112838
54	NC_014664	AAGGC	2	10	53622	53631	40 %	0 %	40 %	20 %	312112841
55	NC_014664	ATGGG	2	10	55479	55488	20 %	20 %	60 %	0 %	312112843
56	NC_014664	CGGCA	2	10	56172	56181	20 %	0 %	40 %	40 %	312112844
57	NC_014664	CGGCG	2	10	56765	56774	0 %	0 %	60 %	40 %	312112845
58	NC_014664	GTAGC	2	10	59202	59211	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014664	CGCGA	2	10	59869	59878	20 %	0 %	40 %	40 %	312112847
60	NC_014664	TCGCG	2	10	61060	61069	0 %	20 %	40 %	40 %	312112847
61	NC_014664	GGCGA	2	10	63839	63848	20 %	0 %	60 %	20 %	312112848
62	NC_014664	GCGCC	2	10	64015	64024	0 %	0 %	40 %	60 %	312112848
63	NC_014664	TACGG	2	10	66636	66645	20 %	20 %	40 %	20 %	312112850
64	NC_014664	CGCGC	2	10	68292	68301	0 %	0 %	40 %	60 %	312112852
65	NC_014664	ACAGC	2	10	69041	69050	40 %	0 %	20 %	40 %	312112853
66	NC_014664	GGCGG	2	10	69152	69161	0 %	0 %	80 %	20 %	312112853
67	NC_014664	GACCG	2	10	70132	70141	20 %	0 %	40 %	40 %	312112854
68	NC_014664	GCATC	2	10	72707	72716	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014664	GGCGC	2	10	73315	73324	0 %	0 %	60 %	40 %	312112857
70	NC_014664	AACGC	2	10	74015	74024	40 %	0 %	20 %	40 %	312112857
71	NC_014664	GCGCC	2	10	75179	75188	0 %	0 %	40 %	60 %	312112859
72	NC_014664	CGACG	2	10	76262	76271	20 %	0 %	40 %	40 %	312112859
73	NC_014664	TGAAA	2	10	76803	76812	60 %	20 %	20 %	0 %	312112860
74	NC_014664	CCGCG	2	10	78533	78542	0 %	0 %	40 %	60 %	312112861
75	NC_014664	CGCAC	2	10	80190	80199	20 %	0 %	20 %	60 %	312112862
76	NC_014664	CGGAT	2	10	82102	82111	20 %	20 %	40 %	20 %	312112864
77	NC_014664	GCAGC	2	10	82673	82682	20 %	0 %	40 %	40 %	312112864
78	NC_014664	GCCCG	2	10	84142	84151	0 %	0 %	40 %	60 %	312112866
79	NC_014664	GCCCG	2	10	84530	84539	0 %	0 %	40 %	60 %	312112866
80	NC_014664	GCACC	2	10	84894	84903	20 %	0 %	20 %	60 %	312112867
81	NC_014664	CATCT	2	10	84920	84929	20 %	40 %	0 %	40 %	312112867
82	NC_014664	CGGCG	2	10	85728	85737	0 %	0 %	60 %	40 %	312112867
83	NC_014664	CCGCC	2	10	86821	86830	0 %	0 %	20 %	80 %	312112868
84	NC_014664	CGAGG	2	10	87417	87426	20 %	0 %	60 %	20 %	312112868
85	NC_014664	ACCTT	2	10	90463	90472	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014664	GCGCC	2	10	91119	91128	0 %	0 %	40 %	60 %	312112870
87	NC_014664	CATGA	2	10	92011	92020	40 %	20 %	20 %	20 %	312112872
88	NC_014664	CAGCG	2	10	92554	92563	20 %	0 %	40 %	40 %	312112872
89	NC_014664	GCCCA	2	10	94500	94509	20 %	0 %	20 %	60 %	312112873
90	NC_014664	GCGCA	2	10	94797	94806	20 %	0 %	40 %	40 %	312112874
91	NC_014664	CCGCG	2	10	95738	95747	0 %	0 %	40 %	60 %	312112874
92	NC_014664	CGCTG	2	10	96278	96287	0 %	20 %	40 %	40 %	312112875
93	NC_014664	TGCAT	2	10	96757	96766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014664	AGCGC	2	10	99328	99337	20 %	0 %	40 %	40 %	312112879
95	NC_014664	GCGCC	2	10	99346	99355	0 %	0 %	40 %	60 %	312112879
96	NC_014664	AAGGC	2	10	99502	99511	40 %	0 %	40 %	20 %	312112879
97	NC_014664	GCAAA	2	10	100051	100060	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014664	GCGCG	2	10	101761	101770	0 %	0 %	60 %	40 %	312112882
99	NC_014664	CGGCG	2	10	102319	102328	0 %	0 %	60 %	40 %	312112882
100	NC_014664	GCGTC	2	10	103394	103403	0 %	20 %	40 %	40 %	312112883
101	NC_014664	CGTCT	2	10	105710	105719	0 %	40 %	20 %	40 %	312112884
102	NC_014664	CGTCC	2	10	106502	106511	0 %	20 %	20 %	60 %	312112884
103	NC_014664	AAGGG	2	10	107006	107015	40 %	0 %	60 %	0 %	312112885
104	NC_014664	GCTGT	2	10	107452	107461	0 %	40 %	40 %	20 %	312112885
105	NC_014664	TGGCG	2	10	108271	108280	0 %	20 %	60 %	20 %	312112886
106	NC_014664	GCGCA	2	10	108360	108369	20 %	0 %	40 %	40 %	312112886
107	NC_014664	TGCGC	2	10	109213	109222	0 %	20 %	40 %	40 %	312112886
108	NC_014664	GTTCT	2	10	110039	110048	0 %	60 %	20 %	20 %	312112887
109	NC_014664	CAGGA	2	10	110163	110172	40 %	0 %	40 %	20 %	312112888
110	NC_014664	GCCAC	2	10	112151	112160	20 %	0 %	20 %	60 %	312112890
111	NC_014664	GCGCC	2	10	114296	114305	0 %	0 %	40 %	60 %	312112893
112	NC_014664	GCGTC	2	10	115603	115612	0 %	20 %	40 %	40 %	312112894
113	NC_014664	GCGCA	2	10	116189	116198	20 %	0 %	40 %	40 %	312112894
114	NC_014664	ACTAG	2	10	116726	116735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014664	CGGGG	2	10	117058	117067	0 %	0 %	80 %	20 %	312112895
116	NC_014664	CCTCG	2	10	117259	117268	0 %	20 %	20 %	60 %	312112895
117	NC_014664	GTGAG	2	10	117755	117764	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014664	CGAGC	2	10	118040	118049	20 %	0 %	40 %	40 %	312112897
119	NC_014664	CGGCG	2	10	122251	122260	0 %	0 %	60 %	40 %	312112898
120	NC_014664	AGGGC	2	10	122266	122275	20 %	0 %	60 %	20 %	312112898
121	NC_014664	CGGAT	2	10	127214	127223	20 %	20 %	40 %	20 %	312112901
122	NC_014664	GAAAG	2	10	127684	127693	60 %	0 %	40 %	0 %	312112901
123	NC_014664	GGTCG	2	10	128601	128610	0 %	20 %	60 %	20 %	312112902
124	NC_014664	CGTAG	2	10	129158	129167	20 %	20 %	40 %	20 %	312112903
125	NC_014664	GCCGG	2	10	133301	133310	0 %	0 %	60 %	40 %	312112905
126	NC_014664	TGTTC	2	10	134519	134528	0 %	60 %	20 %	20 %	312112906
127	NC_014664	GCGAG	2	10	136887	136896	20 %	0 %	60 %	20 %	312112908
128	NC_014664	GGCGA	2	10	136922	136931	20 %	0 %	60 %	20 %	312112908
129	NC_014664	AGCGC	2	10	137776	137785	20 %	0 %	40 %	40 %	312112909
130	NC_014664	GTTTC	2	10	138775	138784	0 %	60 %	20 %	20 %	312112910
131	NC_014664	GCATC	2	10	139586	139595	20 %	20 %	20 %	40 %	312112911
132	NC_014664	CGGCA	2	10	141599	141608	20 %	0 %	40 %	40 %	312112911
133	NC_014664	TGGAA	2	10	141808	141817	40 %	20 %	40 %	0 %	312112911
134	NC_014664	TCGCC	2	10	141860	141869	0 %	20 %	20 %	60 %	312112911
135	NC_014664	GCCAA	2	10	142458	142467	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014664	GCATT	2	10	142532	142541	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014664	TCGCC	2	10	142700	142709	0 %	20 %	20 %	60 %	312112913
138	NC_014664	GCTCG	2	10	144665	144674	0 %	20 %	40 %	40 %	312112914
139	NC_014664	GCTCG	2	10	145391	145400	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014664	GAAGC	2	10	145610	145619	40 %	0 %	40 %	20 %	312112915
141	NC_014664	TGCCA	2	10	145729	145738	20 %	20 %	20 %	40 %	312112915
142	NC_014664	GCGAG	2	10	145822	145831	20 %	0 %	60 %	20 %	312112915
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151	NC_014664	AGCCG	2	10	160022	160031	20 %	0 %	40 %	40 %	312112926
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153	NC_014664	GGCGC	2	10	163254	163263	0 %	0 %	60 %	40 %	312112929
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155	NC_014664	CGCGC	2	10	167475	167484	0 %	0 %	40 %	60 %	312112933
156	NC_014664	TGATT	2	10	172394	172403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014664	CGCGC	2	10	172714	172723	0 %	0 %	40 %	60 %	312112934
158	NC_014664	GAACC	2	10	173340	173349	40 %	0 %	20 %	40 %	312112934
159	NC_014664	TCGGC	2	10	173369	173378	0 %	20 %	40 %	40 %	312112934
160	NC_014664	CGCGG	2	10	173658	173667	0 %	0 %	60 %	40 %	312112934
161	NC_014664	GCGCG	2	10	173892	173901	0 %	0 %	60 %	40 %	312112934
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165	NC_014664	GAAAC	2	10	182376	182385	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_014664	TGAAA	2	10	183184	183193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_014664	GAACG	2	10	214836	214845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_014664	GCGCG	2	10	217723	217732	0 %	0 %	60 %	40 %	312112973
191	NC_014664	CGAGC	2	10	217926	217935	20 %	0 %	40 %	40 %	312112973
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195	NC_014664	TCCCG	2	10	221230	221239	0 %	20 %	20 %	60 %	312112976
196	NC_014664	CATCG	2	10	223565	223574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_014664	CGATG	2	10	227197	227206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_014664	CGCGC	2	10	227397	227406	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
199	NC_014664	GGGCC	2	10	227724	227733	0 %	0 %	60 %	40 %	312112983
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262	NC_014664	GCGAT	2	10	300537	300546	20 %	20 %	40 %	20 %	312113051
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265	NC_014664	TCGCG	2	10	304076	304085	0 %	20 %	40 %	40 %	312113052
266	NC_014664	CTTAT	2	10	305970	305979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_014664	GTCGA	2	10	305998	306007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_014664	GACGG	2	10	306089	306098	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
269	NC_014664	GGCAT	2	10	306117	306126	20 %	20 %	40 %	20 %	312113054
270	NC_014664	GCCGA	2	10	306876	306885	20 %	0 %	40 %	40 %	312113054
271	NC_014664	TGCGA	2	10	309644	309653	20 %	20 %	40 %	20 %	312113056
272	NC_014664	GCCAG	2	10	311038	311047	20 %	0 %	40 %	40 %	312113056
273	NC_014664	GGAAT	2	10	315156	315165	40 %	20 %	40 %	0 %	312113056
274	NC_014664	CGAGC	2	10	317089	317098	20 %	0 %	40 %	40 %	312113057
275	NC_014664	GAATT	2	10	317379	317388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014664	GAGCC	2	10	317519	317528	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
277	NC_014664	AGCCG	2	10	317540	317549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
278	NC_014664	CGCGC	2	10	318198	318207	0 %	0 %	40 %	60 %	312113058
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283	NC_014664	TTCGC	2	10	325174	325183	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_014664	ACGCG	2	10	326338	326347	20 %	0 %	40 %	40 %	312113067
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368	NC_014664	CGCGG	2	10	426547	426556	0 %	0 %	60 %	40 %	312113150
369	NC_014664	CGAAG	2	10	430349	430358	40 %	0 %	40 %	20 %	312113155
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380	NC_014664	CTTCG	2	10	443577	443586	0 %	40 %	20 %	40 %	312113166
381	NC_014664	CCCGT	2	10	443947	443956	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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392	NC_014664	TTGAA	2	10	452354	452363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_014664	GTGAA	2	10	464829	464838	40 %	20 %	40 %	0 %	312113185
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402	NC_014664	GAACC	2	10	471828	471837	40 %	0 %	20 %	40 %	312113190
403	NC_014664	CGGCG	2	10	472218	472227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
404	NC_014664	GGCTC	2	10	472727	472736	0 %	20 %	40 %	40 %	312113191
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434	NC_014664	CCGCG	2	10	502587	502596	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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438	NC_014664	GGAAC	2	10	508506	508515	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
439	NC_014664	TGAGG	2	10	511000	511009	20 %	20 %	60 %	0 %	312113224
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441	NC_014664	AGGCG	2	10	511749	511758	20 %	0 %	60 %	20 %	312113224
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499	NC_014664	CGGCG	2	10	573207	573216	0 %	0 %	60 %	40 %	312113282
500	NC_014664	AGGGC	2	10	575152	575161	20 %	0 %	60 %	20 %	312113284

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