MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014664	CG	3	6	143932	143937	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3502	NC_014664	CTC	2	6	143955	143960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112914
3503	NC_014664	CAT	2	6	144002	144007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112914
3504	NC_014664	CGA	2	6	144074	144079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3505	NC_014664	GC	3	6	144087	144092	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3506	NC_014664	GCC	2	6	144166	144171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112914
3507	NC_014664	CGT	2	6	144179	144184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3508	NC_014664	CGG	2	6	144194	144199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112914
3509	NC_014664	TGG	2	6	144205	144210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112914
3510	NC_014664	GAA	2	6	144227	144232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112914
3511	NC_014664	TCG	2	6	144270	144275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3512	NC_014664	GCT	2	6	144320	144325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3513	NC_014664	ACC	2	6	144336	144341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112914
3514	NC_014664	AGC	2	6	144403	144408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3515	NC_014664	CG	3	6	144447	144452	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3516	NC_014664	AAG	2	6	144456	144461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112914
3517	NC_014664	ACG	2	6	144493	144498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3518	NC_014664	CTG	2	6	144570	144575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3519	NC_014664	TGG	2	6	144597	144602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112914
3520	NC_014664	GCTCG	2	10	144665	144674	0 %	20 %	40 %	40 %	312112914
3521	NC_014664	CG	4	8	144734	144741	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3522	NC_014664	GC	3	6	144751	144756	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3523	NC_014664	AAC	2	6	144804	144809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112914
3524	NC_014664	CTA	2	6	144851	144856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112914
3525	NC_014664	CCG	2	6	144862	144867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112914
3526	NC_014664	GC	3	6	144909	144914	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3527	NC_014664	CGA	2	6	144917	144922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3528	NC_014664	CAT	2	6	144923	144928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112914
3529	NC_014664	GCT	2	6	145044	145049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3530	NC_014664	TCG	2	6	145108	145113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3531	NC_014664	CCA	2	6	145255	145260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112914
3532	NC_014664	CGA	2	6	145262	145267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3533	NC_014664	CCG	2	6	145291	145296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112914
3534	NC_014664	GCTCG	2	10	145391	145400	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3535	NC_014664	CGGG	2	8	145403	145410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_014664	CAT	2	6	145420	145425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_014664	GCA	2	6	145443	145448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_014664	TGC	2	6	145490	145495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_014664	CCG	3	9	145509	145517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3540	NC_014664	TTC	2	6	145518	145523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3541	NC_014664	GCC	2	6	145526	145531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3542	NC_014664	TTC	2	6	145542	145547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3543	NC_014664	GC	3	6	145599	145604	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3544	NC_014664	GAAGC	2	10	145610	145619	40 %	0 %	40 %	20 %	312112915
3545	NC_014664	CG	4	8	145642	145649	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3546	NC_014664	TCG	2	6	145689	145694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3547	NC_014664	TGCCA	2	10	145729	145738	20 %	20 %	20 %	40 %	312112915
3548	NC_014664	CG	3	6	145780	145785	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3549	NC_014664	GAT	2	6	145792	145797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112915
3550	NC_014664	GCGAG	2	10	145822	145831	20 %	0 %	60 %	20 %	312112915
3551	NC_014664	CGT	2	6	145843	145848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3552	NC_014664	ACGG	2	8	145854	145861	25 %	0 %	50 %	25 %	312112915
3553	NC_014664	GCT	2	6	145876	145881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3554	NC_014664	CCG	2	6	145917	145922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3555	NC_014664	GAT	2	6	145934	145939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112915
3556	NC_014664	CCG	2	6	145957	145962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3557	NC_014664	TTC	2	6	145971	145976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3558	NC_014664	TGA	2	6	146011	146016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112915
3559	NC_014664	TTC	2	6	146055	146060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3560	NC_014664	CTT	2	6	146159	146164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3561	NC_014664	GAC	2	6	146198	146203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3562	NC_014664	TGC	2	6	146265	146270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3563	NC_014664	GCC	2	6	146344	146349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3564	NC_014664	CG	3	6	146404	146409	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3565	NC_014664	GCC	2	6	146411	146416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3566	NC_014664	CGC	2	6	146422	146427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3567	NC_014664	CG	3	6	146458	146463	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3568	NC_014664	CTG	2	6	146489	146494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3569	NC_014664	TCGT	2	8	146610	146617	0 %	50 %	25 %	25 %	312112915
3570	NC_014664	GAA	2	6	146675	146680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112915
3571	NC_014664	CGAC	2	8	146709	146716	25 %	0 %	25 %	50 %	312112915
3572	NC_014664	TCC	3	9	146733	146741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112915
3573	NC_014664	GAT	2	6	146744	146749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112915
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3576	NC_014664	CGG	2	6	146865	146870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112915
3577	NC_014664	TCA	2	6	147052	147057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112915
3578	NC_014664	CGC	2	6	147125	147130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3579	NC_014664	CTTC	2	8	147154	147161	0 %	50 %	0 %	50 %	312112915
3580	NC_014664	TGAA	2	8	147198	147205	50 %	25 %	25 %	0 %	312112915
3581	NC_014664	TGT	2	6	147217	147222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112915
3582	NC_014664	CGA	2	6	147226	147231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112915
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3584	NC_014664	CGCC	2	8	147310	147317	0 %	0 %	25 %	75 %	312112915
3585	NC_014664	TCT	2	6	147346	147351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3586	NC_014664	GCGA	2	8	147390	147397	25 %	0 %	50 %	25 %	312112915
3587	NC_014664	CGT	2	6	147401	147406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3588	NC_014664	GC	3	6	147421	147426	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3589	NC_014664	CG	4	8	147433	147440	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3590	NC_014664	GGTC	2	8	147515	147522	0 %	25 %	50 %	25 %	312112915
3591	NC_014664	CG	4	8	147523	147530	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3592	NC_014664	GTC	2	6	147551	147556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3593	NC_014664	TGC	2	6	147573	147578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
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3595	NC_014664	CGC	2	6	147622	147627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3596	NC_014664	T	6	6	147643	147648	0 %	100 %	0 %	0 %	312112915
3597	NC_014664	CCT	2	6	147710	147715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_014664	TCA	2	6	147776	147781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014664	TAA	2	6	147886	147891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014664	GCG	2	6	147934	147939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014664	ACA	2	6	147962	147967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014664	GAG	2	6	147989	147994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014664	GC	3	6	148046	148051	0 %	0 %	50 %	50 %	312112916
3604	NC_014664	GGC	2	6	148062	148067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112916
3605	NC_014664	CG	4	8	148074	148081	0 %	0 %	50 %	50 %	312112916
3606	NC_014664	AACGG	2	10	148084	148093	40 %	0 %	40 %	20 %	312112916
3607	NC_014664	GCC	2	6	148166	148171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112916
3608	NC_014664	TCG	2	6	148193	148198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112916
3609	NC_014664	GGC	2	6	148221	148226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112916
3610	NC_014664	GAG	2	6	148258	148263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112916
3611	NC_014664	CGC	2	6	148266	148271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112916
3612	NC_014664	GAA	2	6	148311	148316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112916
3613	NC_014664	GCC	2	6	148351	148356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112916
3614	NC_014664	GC	5	10	148398	148407	0 %	0 %	50 %	50 %	312112916
3615	NC_014664	GAAG	2	8	148425	148432	50 %	0 %	50 %	0 %	312112916
3616	NC_014664	AGC	2	6	148451	148456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112916
3617	NC_014664	GCG	2	6	148463	148468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112916
3618	NC_014664	AAG	2	6	148489	148494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112916
3619	NC_014664	CGG	2	6	148521	148526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112916
3620	NC_014664	TCA	2	6	148640	148645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112916
3621	NC_014664	CCGG	2	8	148665	148672	0 %	0 %	50 %	50 %	312112916
3622	NC_014664	CGA	2	6	148683	148688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112916
3623	NC_014664	TCG	2	6	148703	148708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112916
3624	NC_014664	CT	3	6	148710	148715	0 %	50 %	0 %	50 %	312112916
3625	NC_014664	TCG	2	6	148775	148780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112916
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3633	NC_014664	CGG	3	9	149066	149074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112917
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3636	NC_014664	TCG	2	6	149120	149125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112917
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3640	NC_014664	GGCG	2	8	149304	149311	0 %	0 %	75 %	25 %	312112917
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3652	NC_014664	GCT	2	6	149595	149600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112917
3653	NC_014664	GC	3	6	149633	149638	0 %	0 %	50 %	50 %	312112917
3654	NC_014664	GCCGG	2	10	149647	149656	0 %	0 %	60 %	40 %	312112917
3655	NC_014664	GCG	3	9	149668	149676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112917
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3673	NC_014664	CGG	2	6	150259	150264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112918
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3675	NC_014664	GAAG	2	8	150313	150320	50 %	0 %	50 %	0 %	312112918
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3679	NC_014664	GCG	2	6	150571	150576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3703	NC_014664	GCG	3	9	151406	151414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3704	NC_014664	GAG	2	6	151494	151499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3742	NC_014664	GCG	2	6	153197	153202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112920
3743	NC_014664	GC	3	6	153217	153222	0 %	0 %	50 %	50 %	312112920
3744	NC_014664	GAA	2	6	153292	153297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112920
3745	NC_014664	CGC	2	6	153310	153315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112920
3746	NC_014664	GGC	2	6	153317	153322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112920
3747	NC_014664	CGC	2	6	153356	153361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112920
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3763	NC_014664	GC	3	6	153902	153907	0 %	0 %	50 %	50 %	312112920
3764	NC_014664	ATC	2	6	153975	153980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112920
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3777	NC_014664	CG	3	6	154678	154683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3778	NC_014664	CTG	2	6	154765	154770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112921
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3842	NC_014664	GCCCG	2	10	157184	157193	0 %	0 %	40 %	60 %	312112923
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3850	NC_014664	GC	3	6	157617	157622	0 %	0 %	50 %	50 %	312112924
3851	NC_014664	CGA	2	6	157642	157647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112924
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3856	NC_014664	TCG	2	6	157962	157967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112924
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3860	NC_014664	ATA	2	6	158097	158102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312112924
3861	NC_014664	CG	4	8	158151	158158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3862	NC_014664	CCA	2	6	158165	158170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3863	NC_014664	C	6	6	158244	158249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3864	NC_014664	AGA	2	6	158257	158262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3865	NC_014664	AGC	2	6	158279	158284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3866	NC_014664	GGC	2	6	158285	158290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3867	NC_014664	AGGA	2	8	158303	158310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3868	NC_014664	CT	3	6	158328	158333	0 %	50 %	0 %	50 %	312112925
3869	NC_014664	GAGC	2	8	158378	158385	25 %	0 %	50 %	25 %	312112925
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3991	NC_014664	CGC	2	6	163073	163078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112929
3992	NC_014664	TGG	2	6	163153	163158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112929
3993	NC_014664	GCCTCG	2	12	163168	163179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312112929
3994	NC_014664	GGC	2	6	163219	163224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112929
3995	NC_014664	GGCGC	2	10	163254	163263	0 %	0 %	60 %	40 %	312112929
3996	NC_014664	TTC	2	6	163272	163277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112929
3997	NC_014664	TGC	2	6	163303	163308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112929
3998	NC_014664	GGC	2	6	163342	163347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112929
3999	NC_014664	GCG	2	6	163371	163376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112929
4000	NC_014664	GCG	2	6	163408	163413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112929

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