MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014664	GTCC	2	8	225308	225315	0 %	25 %	25 %	50 %	312112981
5502	NC_014664	GCG	2	6	225332	225337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112981
5503	NC_014664	CCT	2	6	225344	225349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112981
5504	NC_014664	GCCC	2	8	225407	225414	0 %	0 %	25 %	75 %	312112981
5505	NC_014664	GCC	3	9	225456	225464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112981
5506	NC_014664	GC	3	6	225586	225591	0 %	0 %	50 %	50 %	312112981
5507	NC_014664	T	6	6	225593	225598	0 %	100 %	0 %	0 %	312112981
5508	NC_014664	GCGTCC	2	12	225631	225642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312112981
5509	NC_014664	CCG	2	6	225698	225703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112981
5510	NC_014664	GTG	2	6	225711	225716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112981
5511	NC_014664	CCG	2	6	225782	225787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112981
5512	NC_014664	TCG	2	6	225790	225795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112981
5513	NC_014664	GCG	2	6	225884	225889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112981
5514	NC_014664	GCG	2	6	225925	225930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112981
5515	NC_014664	CG	3	6	225945	225950	0 %	0 %	50 %	50 %	312112981
5516	NC_014664	CTT	2	6	225987	225992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112981
5517	NC_014664	CGA	2	6	226007	226012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112981
5518	NC_014664	A	6	6	226140	226145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_014664	CTT	2	6	226177	226182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112982
5520	NC_014664	GTC	2	6	226193	226198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5521	NC_014664	CTCGGC	2	12	226204	226215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312112982
5522	NC_014664	GC	3	6	226214	226219	0 %	0 %	50 %	50 %	312112982
5523	NC_014664	GTC	2	6	226221	226226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5524	NC_014664	ACG	2	6	226242	226247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5525	NC_014664	AGC	2	6	226257	226262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5526	NC_014664	ACGAGC	2	12	226269	226280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5527	NC_014664	CA	3	6	226337	226342	50 %	0 %	0 %	50 %	312112982
5528	NC_014664	CGA	2	6	226372	226377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5529	NC_014664	GAG	2	6	226391	226396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112982
5530	NC_014664	CAG	2	6	226397	226402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5531	NC_014664	CG	3	6	226536	226541	0 %	0 %	50 %	50 %	312112982
5532	NC_014664	TGA	2	6	226555	226560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112982
5533	NC_014664	TGA	2	6	226576	226581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112982
5534	NC_014664	CGA	2	6	226603	226608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5535	NC_014664	GCT	2	6	226705	226710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112982
5536	NC_014664	GCC	2	6	226713	226718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112982
5537	NC_014664	GC	3	6	226726	226731	0 %	0 %	50 %	50 %	312112982
5538	NC_014664	CGC	2	6	226792	226797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_014664	CAG	2	6	227028	227033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_014664	GAG	2	6	227070	227075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_014664	GA	3	6	227095	227100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_014664	ATG	2	6	227104	227109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_014664	CGATG	2	10	227197	227206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5544	NC_014664	GCA	2	6	227248	227253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_014664	ATA	2	6	227289	227294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_014664	TAAA	2	8	227303	227310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_014664	CGCGC	2	10	227397	227406	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5548	NC_014664	TC	3	6	227424	227429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_014664	ACT	2	6	227474	227479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_014664	GCC	2	6	227562	227567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112983
5551	NC_014664	GCG	2	6	227571	227576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112983
5552	NC_014664	TCG	2	6	227640	227645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112983
5553	NC_014664	ACG	2	6	227652	227657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112983
5554	NC_014664	CTC	2	6	227664	227669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112983
5555	NC_014664	TCGC	2	8	227706	227713	0 %	25 %	25 %	50 %	312112983
5556	NC_014664	GGGCC	2	10	227724	227733	0 %	0 %	60 %	40 %	312112983
5557	NC_014664	CAC	2	6	227813	227818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112983
5558	NC_014664	GC	3	6	227832	227837	0 %	0 %	50 %	50 %	312112983
5559	NC_014664	GCC	2	6	227861	227866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112983
5560	NC_014664	CGAG	2	8	227953	227960	25 %	0 %	50 %	25 %	312112983
5561	NC_014664	ATG	2	6	227961	227966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112983
5562	NC_014664	CCG	2	6	228080	228085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112984
5563	NC_014664	CCG	2	6	228092	228097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112984
5564	NC_014664	GCA	2	6	228152	228157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5565	NC_014664	CAA	2	6	228164	228169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112984
5566	NC_014664	GAA	2	6	228171	228176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112984
5567	NC_014664	CG	3	6	228185	228190	0 %	0 %	50 %	50 %	312112984
5568	NC_014664	TGA	2	6	228191	228196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112984
5569	NC_014664	AGC	2	6	228202	228207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5570	NC_014664	TGA	2	6	228284	228289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112984
5571	NC_014664	GCCGTA	2	12	228345	228356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5572	NC_014664	GAT	2	6	228363	228368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112984
5573	NC_014664	AGC	2	6	228391	228396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5574	NC_014664	GC	3	6	228395	228400	0 %	0 %	50 %	50 %	312112984
5575	NC_014664	CGA	2	6	228413	228418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5576	NC_014664	GCC	2	6	228420	228425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112984
5577	NC_014664	GAC	2	6	228426	228431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5578	NC_014664	CAC	2	6	228445	228450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112984
5579	NC_014664	CG	3	6	228465	228470	0 %	0 %	50 %	50 %	312112984
5580	NC_014664	GAG	2	6	228498	228503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112984
5581	NC_014664	CGG	2	6	228510	228515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112984
5582	NC_014664	ACGAG	2	10	228542	228551	40 %	0 %	40 %	20 %	312112984
5583	NC_014664	GCCCG	2	10	228657	228666	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5584	NC_014664	CAA	2	6	228730	228735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_014664	CGTG	2	8	228787	228794	0 %	25 %	50 %	25 %	312112985
5586	NC_014664	ATCG	2	8	228805	228812	25 %	25 %	25 %	25 %	312112985
5587	NC_014664	GCG	2	6	228821	228826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5588	NC_014664	TCC	2	6	228885	228890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112985
5589	NC_014664	ACG	2	6	228971	228976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5590	NC_014664	TCG	2	6	229044	229049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5591	NC_014664	CGG	2	6	229084	229089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5592	NC_014664	CG	3	6	229139	229144	0 %	0 %	50 %	50 %	312112985
5593	NC_014664	CGA	2	6	229183	229188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5594	NC_014664	CGC	2	6	229192	229197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112985
5595	NC_014664	CGCGG	2	10	229201	229210	0 %	0 %	60 %	40 %	312112985
5596	NC_014664	GGC	3	9	229217	229225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
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5598	NC_014664	GAC	2	6	229241	229246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5599	NC_014664	GGC	2	6	229381	229386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5600	NC_014664	CGC	2	6	229539	229544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112985
5601	NC_014664	GGC	2	6	229607	229612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5602	NC_014664	GCG	2	6	229660	229665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5603	NC_014664	CTG	2	6	229687	229692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5604	NC_014664	GGC	2	6	229706	229711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5605	NC_014664	CGG	2	6	229774	229779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5606	NC_014664	GGC	2	6	229816	229821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5607	NC_014664	GC	3	6	229832	229837	0 %	0 %	50 %	50 %	312112985
5608	NC_014664	GTG	2	6	229838	229843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112985
5609	NC_014664	AGCG	2	8	229899	229906	25 %	0 %	50 %	25 %	312112986
5610	NC_014664	GAA	2	6	229951	229956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112986
5611	NC_014664	GGC	2	6	230047	230052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112986
5612	NC_014664	TGA	2	6	230090	230095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112986
5613	NC_014664	CGCGGG	2	12	230101	230112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112986
5614	NC_014664	TCG	2	6	230120	230125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112986
5615	NC_014664	GAG	2	6	230128	230133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112986
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5617	NC_014664	CG	3	6	230194	230199	0 %	0 %	50 %	50 %	312112986
5618	NC_014664	GAA	2	6	230272	230277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112986
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5620	NC_014664	CGC	2	6	230307	230312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112986
5621	NC_014664	GCC	2	6	230334	230339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112986
5622	NC_014664	CCA	2	6	230363	230368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112987
5623	NC_014664	GCG	2	6	230390	230395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112987
5624	NC_014664	TTC	2	6	230398	230403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112987
5625	NC_014664	CCA	2	6	230430	230435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112987
5626	NC_014664	CAG	2	6	230440	230445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112987
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5635	NC_014664	TCG	2	6	230651	230656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112987
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5644	NC_014664	CGCC	2	8	230888	230895	0 %	0 %	25 %	75 %	312112987
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5652	NC_014664	CGA	2	6	231191	231196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112987
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5662	NC_014664	AGCC	2	8	231405	231412	25 %	0 %	25 %	50 %	312112988
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5742	NC_014664	GGC	2	6	234403	234408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112989
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5991	NC_014664	CGG	3	9	245136	245144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_014664	AAACG	2	10	245152	245161	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5993	NC_014664	CTT	2	6	245218	245223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_014664	GCG	3	9	245249	245257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5995	NC_014664	GGC	2	6	245278	245283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5996	NC_014664	GCT	2	6	245294	245299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5997	NC_014664	TTC	2	6	245303	245308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5998	NC_014664	TCGTA	2	10	245366	245375	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5999	NC_014664	CAAA	2	8	245376	245383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6000	NC_014664	T	7	7	245424	245430	0 %	100 %	0 %	0 %	312112999

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