MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014664	GGCG	2	8	185138	185145	0 %	0 %	75 %	25 %	312112943
4502	NC_014664	GGA	2	6	185150	185155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112943
4503	NC_014664	TCG	2	6	185177	185182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112943
4504	NC_014664	TCT	2	6	185207	185212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112943
4505	NC_014664	TAT	2	6	185229	185234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312112943
4506	NC_014664	CGGCG	3	15	185288	185302	0 %	0 %	60 %	40 %	312112943
4507	NC_014664	TTG	2	6	185326	185331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112943
4508	NC_014664	TCG	2	6	185368	185373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112943
4509	NC_014664	GCG	2	6	185391	185396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112943
4510	NC_014664	CGG	3	9	185413	185421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112943
4511	NC_014664	CG	3	6	185424	185429	0 %	0 %	50 %	50 %	312112943
4512	NC_014664	CG	3	6	185461	185466	0 %	0 %	50 %	50 %	312112943
4513	NC_014664	CGG	2	6	185505	185510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112943
4514	NC_014664	GC	3	6	185537	185542	0 %	0 %	50 %	50 %	312112943
4515	NC_014664	GC	3	6	185684	185689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_014664	CTCG	2	8	185774	185781	0 %	25 %	25 %	50 %	312112944
4517	NC_014664	CGA	2	6	185785	185790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112944
4518	NC_014664	AAC	2	6	185802	185807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112944
4519	NC_014664	CG	5	10	185833	185842	0 %	0 %	50 %	50 %	312112944
4520	NC_014664	ATGG	2	8	185857	185864	25 %	25 %	50 %	0 %	312112944
4521	NC_014664	CGA	2	6	185956	185961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112944
4522	NC_014664	CGG	2	6	186019	186024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112944
4523	NC_014664	GC	4	8	186041	186048	0 %	0 %	50 %	50 %	312112944
4524	NC_014664	GCC	2	6	186053	186058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112944
4525	NC_014664	GC	3	6	186072	186077	0 %	0 %	50 %	50 %	312112944
4526	NC_014664	GC	3	6	186111	186116	0 %	0 %	50 %	50 %	312112944
4527	NC_014664	CGA	2	6	186124	186129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112944
4528	NC_014664	TGC	2	6	186195	186200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112944
4529	NC_014664	GCT	2	6	186235	186240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112944
4530	NC_014664	GCC	2	6	186287	186292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112944
4531	NC_014664	GAT	2	6	186355	186360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112944
4532	NC_014664	TTG	2	6	186473	186478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112945
4533	NC_014664	CG	3	6	186487	186492	0 %	0 %	50 %	50 %	312112945
4534	NC_014664	GCG	2	6	186495	186500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112945
4535	NC_014664	CTT	3	9	186514	186522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112945
4536	NC_014664	ATG	2	6	186589	186594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112945
4537	NC_014664	GGC	2	6	186615	186620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112945
4538	NC_014664	GGAT	2	8	186638	186645	25 %	25 %	50 %	0 %	312112945
4539	NC_014664	CGA	2	6	186723	186728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112945
4540	NC_014664	GCC	2	6	186745	186750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112945
4541	NC_014664	GAA	2	6	186793	186798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112945
4542	NC_014664	CGT	2	6	186810	186815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112945
4543	NC_014664	TGA	2	6	186845	186850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112945
4544	NC_014664	GCA	2	6	186858	186863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112945
4545	NC_014664	GGA	2	6	186894	186899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112945
4546	NC_014664	GAA	3	9	186919	186927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112945
4547	NC_014664	GAA	2	6	186934	186939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112945
4548	NC_014664	GTT	2	6	186982	186987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014664	GAC	2	6	187002	187007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112946
4550	NC_014664	CCG	2	6	187115	187120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112946
4551	NC_014664	CGC	2	6	187127	187132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112946
4552	NC_014664	CCG	2	6	187157	187162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112946
4553	NC_014664	GGT	2	6	187191	187196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112946
4554	NC_014664	TCG	2	6	187238	187243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112946
4555	NC_014664	GC	3	6	187317	187322	0 %	0 %	50 %	50 %	312112946
4556	NC_014664	ATT	2	6	187329	187334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312112946
4557	NC_014664	GCG	3	9	187360	187368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112946
4558	NC_014664	CG	3	6	187425	187430	0 %	0 %	50 %	50 %	312112946
4559	NC_014664	GTC	2	6	187443	187448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112946
4560	NC_014664	GC	3	6	187510	187515	0 %	0 %	50 %	50 %	312112946
4561	NC_014664	GGC	3	9	187539	187547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112946
4562	NC_014664	TCG	2	6	187666	187671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112946
4563	NC_014664	GAG	2	6	187681	187686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112946
4564	NC_014664	ATC	2	6	187693	187698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112946
4565	NC_014664	GGC	2	6	187752	187757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112946
4566	NC_014664	GCA	2	6	187886	187891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112946
4567	NC_014664	GCC	2	6	187911	187916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112946
4568	NC_014664	AC	3	6	188059	188064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_014664	GC	3	6	188204	188209	0 %	0 %	50 %	50 %	312112947
4570	NC_014664	GGA	2	6	188222	188227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112947
4571	NC_014664	CG	4	8	188255	188262	0 %	0 %	50 %	50 %	312112947
4572	NC_014664	GTC	2	6	188267	188272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112947
4573	NC_014664	GGC	2	6	188293	188298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112947
4574	NC_014664	GCC	2	6	188330	188335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112947
4575	NC_014664	ATCGTC	2	12	188369	188380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312112947
4576	NC_014664	TCG	2	6	188428	188433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4577	NC_014664	TCG	3	9	188485	188493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4578	NC_014664	CGG	2	6	188504	188509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112948
4579	NC_014664	CGG	2	6	188515	188520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112948
4580	NC_014664	CGG	2	6	188579	188584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112948
4581	NC_014664	GC	4	8	188585	188592	0 %	0 %	50 %	50 %	312112948
4582	NC_014664	ACG	2	6	188620	188625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4583	NC_014664	GAG	2	6	188661	188666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112948
4584	NC_014664	AAG	2	6	188685	188690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112948
4585	NC_014664	CTT	3	9	188735	188743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112948
4586	NC_014664	TGA	2	6	188744	188749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112948
4587	NC_014664	CGG	2	6	188771	188776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112948
4588	NC_014664	CGC	2	6	188795	188800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112948
4589	NC_014664	CG	3	6	188818	188823	0 %	0 %	50 %	50 %	312112948
4590	NC_014664	AGC	2	6	188860	188865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4591	NC_014664	CAG	2	6	189012	189017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4592	NC_014664	GCT	2	6	189035	189040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4593	NC_014664	ACG	2	6	189063	189068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4594	NC_014664	GGC	2	6	189126	189131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112948
4595	NC_014664	GAA	2	6	189168	189173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112948
4596	NC_014664	CCG	2	6	189271	189276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112948
4597	NC_014664	GTG	2	6	189282	189287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112948
4598	NC_014664	CGA	2	6	189479	189484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4599	NC_014664	CAA	2	6	189491	189496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112948
4600	NC_014664	GAC	2	6	189510	189515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112948
4601	NC_014664	CGACCG	2	12	189538	189549	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312112948
4602	NC_014664	CGC	2	6	189730	189735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112948
4603	NC_014664	TCGC	2	8	189780	189787	0 %	25 %	25 %	50 %	312112948
4604	NC_014664	CAA	2	6	189824	189829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112948
4605	NC_014664	CG	3	6	189938	189943	0 %	0 %	50 %	50 %	312112948
4606	NC_014664	CGG	2	6	190070	190075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_014664	CG	3	6	190152	190157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_014664	CCTGTT	2	12	190189	190200	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014664	CCG	2	6	190216	190221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_014664	GCC	2	6	190308	190313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112949
4611	NC_014664	GCG	2	6	190326	190331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112949
4612	NC_014664	TGA	2	6	190377	190382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112949
4613	NC_014664	GCGA	2	8	190390	190397	25 %	0 %	50 %	25 %	312112949
4614	NC_014664	GTG	2	6	190433	190438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112949
4615	NC_014664	CTT	3	9	190460	190468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112949
4616	NC_014664	CTT	2	6	190478	190483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112949
4617	NC_014664	CGG	2	6	190489	190494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112949
4618	NC_014664	CGG	2	6	190501	190506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112949
4619	NC_014664	GCG	2	6	190545	190550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112949
4620	NC_014664	CGC	3	9	190604	190612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112949
4621	NC_014664	TGC	2	6	190623	190628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112949
4622	NC_014664	GCT	2	6	190663	190668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112949
4623	NC_014664	CGC	3	9	190721	190729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112949
4624	NC_014664	CTT	2	6	190730	190735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112949
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4633	NC_014664	CGTC	2	8	191038	191045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4634	NC_014664	CGG	2	6	191056	191061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_014664	TCCC	2	8	191093	191100	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4636	NC_014664	C	6	6	191098	191103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4666	NC_014664	GCC	2	6	192297	192302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4691	NC_014664	TA	3	6	193349	193354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4742	NC_014664	ATGG	2	8	195592	195599	25 %	25 %	50 %	0 %	312112955
4743	NC_014664	GTT	2	6	195620	195625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112955
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4869	NC_014664	CGC	3	9	201079	201087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4870	NC_014664	GAC	2	6	201118	201123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112961
4871	NC_014664	GAA	2	6	201163	201168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112961
4872	NC_014664	TCC	2	6	201188	201193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112961
4873	NC_014664	TGG	2	6	201195	201200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112961
4874	NC_014664	ATG	2	6	201230	201235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112961
4875	NC_014664	CGA	2	6	201240	201245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112961
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4878	NC_014664	CGA	2	6	201297	201302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112961
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4884	NC_014664	CGAG	2	8	201723	201730	25 %	0 %	50 %	25 %	312112961
4885	NC_014664	CGC	2	6	201733	201738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112961
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4891	NC_014664	CGG	2	6	201937	201942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4991	NC_014664	CGA	2	6	205877	205882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112964
4992	NC_014664	CG	4	8	205907	205914	0 %	0 %	50 %	50 %	312112964
4993	NC_014664	CTC	2	6	205920	205925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112964
4994	NC_014664	CGA	2	6	206000	206005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112964
4995	NC_014664	TCAA	2	8	206020	206027	50 %	25 %	0 %	25 %	312112964
4996	NC_014664	TCGC	2	8	206110	206117	0 %	25 %	25 %	50 %	312112965
4997	NC_014664	GCG	2	6	206122	206127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112965
4998	NC_014664	GC	5	10	206200	206209	0 %	0 %	50 %	50 %	312112965
4999	NC_014664	ACCCGG	2	12	206213	206224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312112965
5000	NC_014664	CG	3	6	206228	206233	0 %	0 %	50 %	50 %	312112965

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