MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodococcus equi 103S

Total Repeats: 4418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014659	ACCAC	2	10	1457	1466	40 %	0 %	0 %	60 %	312137515
2	NC_014659	CGGCG	2	10	4578	4587	0 %	0 %	60 %	40 %	312137518
3	NC_014659	CGGCG	2	10	4793	4802	0 %	0 %	60 %	40 %	312137518
4	NC_014659	TCGCG	2	10	4884	4893	0 %	20 %	40 %	40 %	312137518
5	NC_014659	CCGGA	2	10	5684	5693	20 %	0 %	40 %	40 %	312137519
6	NC_014659	GCCGA	2	10	5827	5836	20 %	0 %	40 %	40 %	312137519
7	NC_014659	GCACT	2	10	7888	7897	20 %	20 %	20 %	40 %	312137521
8	NC_014659	ACCGC	2	10	13270	13279	20 %	0 %	20 %	60 %	312137524
9	NC_014659	GTGCT	2	10	13494	13503	0 %	40 %	40 %	20 %	312137524
10	NC_014659	TGGTC	2	10	15740	15749	0 %	40 %	40 %	20 %	312137527
11	NC_014659	CGACG	2	10	17392	17401	20 %	0 %	40 %	40 %	312137528
12	NC_014659	GCCGT	2	10	18183	18192	0 %	20 %	40 %	40 %	312137529
13	NC_014659	CCCGG	2	10	22890	22899	0 %	0 %	40 %	60 %	312137535
14	NC_014659	CGGCC	2	10	27016	27025	0 %	0 %	40 %	60 %	312137538
15	NC_014659	GCCCG	2	10	27257	27266	0 %	0 %	40 %	60 %	312137538
16	NC_014659	AGTTC	2	10	27580	27589	20 %	40 %	20 %	20 %	312137538
17	NC_014659	CGTCG	2	10	29862	29871	0 %	20 %	40 %	40 %	312137540
18	NC_014659	GTCCG	2	10	30393	30402	0 %	20 %	40 %	40 %	312137540
19	NC_014659	GCGAC	2	10	30929	30938	20 %	0 %	40 %	40 %	312137540
20	NC_014659	GCGGG	2	10	31410	31419	0 %	0 %	80 %	20 %	312137541
21	NC_014659	GCGCC	2	10	32360	32369	0 %	0 %	40 %	60 %	312137542
22	NC_014659	GTCGT	2	10	35577	35586	0 %	40 %	40 %	20 %	312137545
23	NC_014659	CACTC	2	10	36517	36526	20 %	20 %	0 %	60 %	312137547
24	NC_014659	CGTGC	2	10	38237	38246	0 %	20 %	40 %	40 %	312137549
25	NC_014659	CGGTG	2	10	38729	38738	0 %	20 %	60 %	20 %	312137549
26	NC_014659	CCGCG	2	10	39605	39614	0 %	0 %	40 %	60 %	312137550
27	NC_014659	GGCCT	2	10	43413	43422	0 %	20 %	40 %	40 %	312137554
28	NC_014659	GACCG	2	10	44329	44338	20 %	0 %	40 %	40 %	312137555
29	NC_014659	CCGCT	2	10	49848	49857	0 %	20 %	20 %	60 %	312137557
30	NC_014659	CGGGC	2	10	51534	51543	0 %	0 %	60 %	40 %	312137558
31	NC_014659	TCCGA	2	10	53481	53490	20 %	20 %	20 %	40 %	312137559
32	NC_014659	CCCGA	2	10	55042	55051	20 %	0 %	20 %	60 %	312137560
33	NC_014659	GATCC	2	10	56351	56360	20 %	20 %	20 %	40 %	312137560
34	NC_014659	CGCTC	2	10	56444	56453	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_014659	TCGGT	2	10	56664	56673	0 %	40 %	40 %	20 %	312137561
36	NC_014659	CCGGG	2	10	60730	60739	0 %	0 %	60 %	40 %	312137565
37	NC_014659	GCCGC	2	10	62733	62742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_014659	GCCTG	2	10	64570	64579	0 %	20 %	40 %	40 %	312137568
39	NC_014659	TGACC	2	10	65345	65354	20 %	20 %	20 %	40 %	312137568
40	NC_014659	GCCGG	2	10	65399	65408	0 %	0 %	60 %	40 %	312137568
41	NC_014659	CCGGG	2	10	66982	66991	0 %	0 %	60 %	40 %	312137569
42	NC_014659	CCGTC	2	10	67882	67891	0 %	20 %	20 %	60 %	312137569
43	NC_014659	CGCGG	2	10	67988	67997	0 %	0 %	60 %	40 %	312137569
44	NC_014659	AGCGC	2	10	69598	69607	20 %	0 %	40 %	40 %	312137569
45	NC_014659	CGCGA	2	10	71165	71174	20 %	0 %	40 %	40 %	312137571
46	NC_014659	CCACC	2	10	73656	73665	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
47	NC_014659	CCCGG	2	10	74190	74199	0 %	0 %	40 %	60 %	312137573
48	NC_014659	TTGCG	2	10	74907	74916	0 %	40 %	40 %	20 %	312137574
49	NC_014659	ACCGC	2	10	77333	77342	20 %	0 %	20 %	60 %	312137576
50	NC_014659	GACTG	2	10	77659	77668	20 %	20 %	40 %	20 %	312137576
51	NC_014659	ATCGG	2	10	80508	80517	20 %	20 %	40 %	20 %	312137579
52	NC_014659	CTGCA	2	10	80953	80962	20 %	20 %	20 %	40 %	312137579
53	NC_014659	GGGCC	2	10	81063	81072	0 %	0 %	60 %	40 %	312137579
54	NC_014659	TGGCG	2	10	82564	82573	0 %	20 %	60 %	20 %	312137580
55	NC_014659	CGAAG	2	10	82968	82977	40 %	0 %	40 %	20 %	312137581
56	NC_014659	GACGG	2	10	85956	85965	20 %	0 %	60 %	20 %	312137584
57	NC_014659	CGCGG	2	10	87528	87537	0 %	0 %	60 %	40 %	312137585
58	NC_014659	GACGG	2	10	87740	87749	20 %	0 %	60 %	20 %	312137585
59	NC_014659	CCGGT	2	10	87789	87798	0 %	20 %	40 %	40 %	312137585
60	NC_014659	CGCGC	2	10	90503	90512	0 %	0 %	40 %	60 %	312137588
61	NC_014659	CGCTG	2	10	92094	92103	0 %	20 %	40 %	40 %	312137589
62	NC_014659	CGACG	2	10	92229	92238	20 %	0 %	40 %	40 %	312137589
63	NC_014659	GGGGA	2	10	92263	92272	20 %	0 %	80 %	0 %	312137589
64	NC_014659	TCGGA	2	10	92885	92894	20 %	20 %	40 %	20 %	312137590
65	NC_014659	GCGCG	2	10	93348	93357	0 %	0 %	60 %	40 %	312137590
66	NC_014659	AGCAC	2	10	93796	93805	40 %	0 %	20 %	40 %	312137591
67	NC_014659	GGACC	2	10	94336	94345	20 %	0 %	40 %	40 %	312137592
68	NC_014659	TCCGG	2	10	94413	94422	0 %	20 %	40 %	40 %	312137592
69	NC_014659	GCCGG	2	10	95374	95383	0 %	0 %	60 %	40 %	312137593
70	NC_014659	CGGCG	2	10	96496	96505	0 %	0 %	60 %	40 %	312137594
71	NC_014659	TCCGG	2	10	98391	98400	0 %	20 %	40 %	40 %	312137597
72	NC_014659	CGTCG	2	10	98422	98431	0 %	20 %	40 %	40 %	312137597
73	NC_014659	CCGCA	2	10	98571	98580	20 %	0 %	20 %	60 %	312137597
74	NC_014659	CGGGC	2	10	99982	99991	0 %	0 %	60 %	40 %	312137598
75	NC_014659	CGCGG	2	10	100449	100458	0 %	0 %	60 %	40 %	312137598
76	NC_014659	GATCC	2	10	100941	100950	20 %	20 %	20 %	40 %	312137598
77	NC_014659	GCGCC	2	10	101903	101912	0 %	0 %	40 %	60 %	312137599
78	NC_014659	CCCGG	2	10	102634	102643	0 %	0 %	40 %	60 %	312137599
79	NC_014659	CACGG	2	10	102815	102824	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014659	TCCGC	2	10	103496	103505	0 %	20 %	20 %	60 %	312137600
81	NC_014659	TCGAG	2	10	105113	105122	20 %	20 %	40 %	20 %	312137601
82	NC_014659	GCAGT	2	10	105644	105653	20 %	20 %	40 %	20 %	312137602
83	NC_014659	GCGGT	2	10	108840	108849	0 %	20 %	60 %	20 %	312137605
84	NC_014659	CACCC	2	10	113613	113622	20 %	0 %	0 %	80 %	312137609
85	NC_014659	GCCGC	2	10	113755	113764	0 %	0 %	40 %	60 %	312137609
86	NC_014659	ACCGA	2	10	114082	114091	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014659	CGGCC	2	10	117293	117302	0 %	0 %	40 %	60 %	312137611
88	NC_014659	CCGAG	2	10	124150	124159	20 %	0 %	40 %	40 %	312137617
89	NC_014659	CGGGC	2	10	126235	126244	0 %	0 %	60 %	40 %	312137620
90	NC_014659	CGGCG	2	10	126590	126599	0 %	0 %	60 %	40 %	312137620
91	NC_014659	GGCGC	2	10	128907	128916	0 %	0 %	60 %	40 %	312137624
92	NC_014659	CGGGG	3	15	129358	129372	0 %	0 %	80 %	20 %	312137624
93	NC_014659	CGGCG	2	10	130057	130066	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014659	CGGCC	2	10	130385	130394	0 %	0 %	40 %	60 %	312137626
95	NC_014659	GCGTG	2	10	130967	130976	0 %	20 %	60 %	20 %	312137626
96	NC_014659	GGGAA	2	10	132559	132568	40 %	0 %	60 %	0 %	312137628
97	NC_014659	ATCCG	2	10	137142	137151	20 %	20 %	20 %	40 %	312137633
98	NC_014659	TGCCC	2	10	137451	137460	0 %	20 %	20 %	60 %	312137634
99	NC_014659	GTGCG	2	10	137756	137765	0 %	20 %	60 %	20 %	312137634
100	NC_014659	CCGGC	2	10	138723	138732	0 %	0 %	40 %	60 %	312137636
101	NC_014659	TCGAG	2	10	138849	138858	20 %	20 %	40 %	20 %	312137636
102	NC_014659	CGTGC	2	10	140505	140514	0 %	20 %	40 %	40 %	312137638
103	NC_014659	TCCCG	2	10	140552	140561	0 %	20 %	20 %	60 %	312137639
104	NC_014659	GCCGC	2	10	142668	142677	0 %	0 %	40 %	60 %	312137641
105	NC_014659	GGGCG	2	10	142972	142981	0 %	0 %	80 %	20 %	312137641
106	NC_014659	GTCGC	2	10	146009	146018	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014659	GAATT	2	10	146363	146372	40 %	40 %	20 %	0 %	312137645
108	NC_014659	GGCTG	2	10	148608	148617	0 %	20 %	60 %	20 %	312137647
109	NC_014659	CGGTG	2	10	149264	149273	0 %	20 %	60 %	20 %	312137648
110	NC_014659	GCGCC	2	10	149390	149399	0 %	0 %	40 %	60 %	312137648
111	NC_014659	CCGGA	2	10	149719	149728	20 %	0 %	40 %	40 %	312137648
112	NC_014659	CCTCG	2	10	150849	150858	0 %	20 %	20 %	60 %	312137650
113	NC_014659	GGTGG	2	10	151455	151464	0 %	20 %	80 %	0 %	312137650
114	NC_014659	GATCG	2	10	153209	153218	20 %	20 %	40 %	20 %	312137653
115	NC_014659	CATCG	2	10	156550	156559	20 %	20 %	20 %	40 %	312137657
116	NC_014659	GGGGA	2	10	158074	158083	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014659	GGCCG	2	10	163779	163788	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014659	CGGTC	2	10	164080	164089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014659	TCCGC	2	10	165924	165933	0 %	20 %	20 %	60 %	312137665
120	NC_014659	CCGAG	2	10	166277	166286	20 %	0 %	40 %	40 %	312137666
121	NC_014659	ACGCG	2	10	169458	169467	20 %	0 %	40 %	40 %	312137669
122	NC_014659	AGCCG	2	10	170989	170998	20 %	0 %	40 %	40 %	312137671
123	NC_014659	TGCGG	2	10	172868	172877	0 %	20 %	60 %	20 %	312137672
124	NC_014659	CGGGT	2	10	173772	173781	0 %	20 %	60 %	20 %	312137673
125	NC_014659	GCCAG	2	10	174068	174077	20 %	0 %	40 %	40 %	312137673
126	NC_014659	GTCGC	2	10	174924	174933	0 %	20 %	40 %	40 %	312137674
127	NC_014659	CCGGC	2	10	177148	177157	0 %	0 %	40 %	60 %	312137677
128	NC_014659	GCGTG	2	10	177370	177379	0 %	20 %	60 %	20 %	312137677
129	NC_014659	ACCAC	2	10	178385	178394	40 %	0 %	0 %	60 %	312137678
130	NC_014659	GGGTG	2	10	178811	178820	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014659	TCGCG	2	10	179387	179396	0 %	20 %	40 %	40 %	312137680
132	NC_014659	CCGAA	2	10	180462	180471	40 %	0 %	20 %	40 %	312137681
133	NC_014659	AATTC	2	10	183084	183093	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014659	GCCGA	2	10	183364	183373	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014659	TCCGA	2	10	184633	184642	20 %	20 %	20 %	40 %	312137685
136	NC_014659	GTTCA	2	10	185044	185053	20 %	40 %	20 %	20 %	312137685
137	NC_014659	CTTCG	2	10	185991	186000	0 %	40 %	20 %	40 %	312137685
138	NC_014659	GACCC	2	10	186088	186097	20 %	0 %	20 %	60 %	312137685
139	NC_014659	GTTCA	2	10	188937	188946	20 %	40 %	20 %	20 %	312137686
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238	NC_014659	TCGGT	2	10	316139	316148	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
239	NC_014659	CCGAG	2	10	316521	316530	20 %	0 %	40 %	40 %	312137785
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260	NC_014659	ACGTC	2	10	346731	346740	20 %	20 %	20 %	40 %	312137817
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263	NC_014659	CGGCG	2	10	349996	350005	0 %	0 %	60 %	40 %	312137819
264	NC_014659	GCCTG	2	10	353684	353693	0 %	20 %	40 %	40 %	312137822
265	NC_014659	GCCGA	2	10	353917	353926	20 %	0 %	40 %	40 %	312137822
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399	NC_014659	ACGCC	2	10	505189	505198	20 %	0 %	20 %	60 %	312137956
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