MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 5202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014643	GGGT	2	8	304	311	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014643	AATA	2	8	1411	1418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014643	TTTC	2	8	1523	1530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014643	GCAT	2	8	2218	2225	25 %	25 %	25 %	25 %	311111672
5	NC_014643	CTTG	2	8	2569	2576	0 %	50 %	25 %	25 %	311111672
6	NC_014643	CACC	2	8	3418	3425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014643	TGCG	2	8	3446	3453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014643	CTTA	2	8	3485	3492	25 %	50 %	0 %	25 %	311111673
9	NC_014643	ATGT	2	8	4450	4457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014643	GCCC	2	8	5130	5137	0 %	0 %	25 %	75 %	311111674
11	NC_014643	AAGG	2	8	5302	5309	50 %	0 %	50 %	0 %	311111674
12	NC_014643	AAGG	2	8	6058	6065	50 %	0 %	50 %	0 %	311111674
13	NC_014643	AGTG	2	8	6319	6326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014643	CCTG	2	8	6586	6593	0 %	25 %	25 %	50 %	311111675
15	NC_014643	GCCT	2	8	6901	6908	0 %	25 %	25 %	50 %	311111675
16	NC_014643	CGAA	2	8	7072	7079	50 %	0 %	25 %	25 %	311111675
17	NC_014643	CTTT	2	8	7147	7154	0 %	75 %	0 %	25 %	311111675
18	NC_014643	TGCT	2	8	7309	7316	0 %	50 %	25 %	25 %	311111675
19	NC_014643	CGTG	2	8	7628	7635	0 %	25 %	50 %	25 %	311111675
20	NC_014643	GCTG	2	8	8409	8416	0 %	25 %	50 %	25 %	311111676
21	NC_014643	CGCA	2	8	8971	8978	25 %	0 %	25 %	50 %	311111676
22	NC_014643	CTCG	2	8	9101	9108	0 %	25 %	25 %	50 %	311111676
23	NC_014643	TACC	2	8	9217	9224	25 %	25 %	0 %	50 %	311111676
24	NC_014643	TTCT	2	8	10465	10472	0 %	75 %	0 %	25 %	311111678
25	NC_014643	GGCA	2	8	11225	11232	25 %	0 %	50 %	25 %	311111678
26	NC_014643	GATA	2	8	11292	11299	50 %	25 %	25 %	0 %	311111678
27	NC_014643	TGCA	2	8	11380	11387	25 %	25 %	25 %	25 %	311111678
28	NC_014643	TGTA	2	8	11638	11645	25 %	50 %	25 %	0 %	311111678
29	NC_014643	GCTG	2	8	13039	13046	0 %	25 %	50 %	25 %	311111680
30	NC_014643	ACCT	2	8	13084	13091	25 %	25 %	0 %	50 %	311111680
31	NC_014643	AATA	2	8	14076	14083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014643	TGTC	2	8	14907	14914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014643	AAGC	2	8	16168	16175	50 %	0 %	25 %	25 %	311111683
34	NC_014643	TCGC	2	8	16490	16497	0 %	25 %	25 %	50 %	311111683
35	NC_014643	ACGA	2	8	16957	16964	50 %	0 %	25 %	25 %	311111683
36	NC_014643	TTAT	2	8	17029	17036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014643	CCTT	2	8	17430	17437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014643	AGAA	2	8	17486	17493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014643	AAGT	2	8	17590	17597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014643	GGTA	2	8	18666	18673	25 %	25 %	50 %	0 %	311111685
41	NC_014643	ATTC	2	8	18869	18876	25 %	50 %	0 %	25 %	311111685
42	NC_014643	CCTA	2	8	19049	19056	25 %	25 %	0 %	50 %	311111685
43	NC_014643	GCCC	2	8	19951	19958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_014643	ACCT	2	8	21321	21328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014643	AGCG	2	8	21645	21652	25 %	0 %	50 %	25 %	311111689
46	NC_014643	GCTG	2	8	21883	21890	0 %	25 %	50 %	25 %	311111689
47	NC_014643	AACA	2	8	24218	24225	75 %	0 %	0 %	25 %	311111692
48	NC_014643	GATT	2	8	25618	25625	25 %	50 %	25 %	0 %	311111694
49	NC_014643	AGTT	2	8	25975	25982	25 %	50 %	25 %	0 %	311111694
50	NC_014643	TGCC	2	8	26031	26038	0 %	25 %	25 %	50 %	311111694
51	NC_014643	CGAG	2	8	26392	26399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014643	GTGC	2	8	26860	26867	0 %	25 %	50 %	25 %	311111695
53	NC_014643	TCAT	2	8	27589	27596	25 %	50 %	0 %	25 %	311111695
54	NC_014643	GCTG	2	8	27624	27631	0 %	25 %	50 %	25 %	311111696
55	NC_014643	AGCA	2	8	28625	28632	50 %	0 %	25 %	25 %	311111696
56	NC_014643	ACCC	2	8	29159	29166	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_014643	TTTC	2	8	29948	29955	0 %	75 %	0 %	25 %	311111697
58	NC_014643	CTGC	2	8	31945	31952	0 %	25 %	25 %	50 %	311111697
59	NC_014643	GGTT	2	8	33456	33463	0 %	50 %	50 %	0 %	311111698
60	NC_014643	GAAG	2	8	33534	33541	50 %	0 %	50 %	0 %	311111698
61	NC_014643	TTCC	2	8	33585	33592	0 %	50 %	0 %	50 %	311111698
62	NC_014643	CAGA	2	8	33987	33994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014643	CTTT	2	8	34134	34141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014643	CGAG	2	8	34362	34369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014643	ATAC	2	8	34694	34701	50 %	25 %	0 %	25 %	311111699
66	NC_014643	CTCA	2	8	34869	34876	25 %	25 %	0 %	50 %	311111699
67	NC_014643	TGCT	2	8	35277	35284	0 %	50 %	25 %	25 %	311111700
68	NC_014643	TGCG	2	8	35321	35328	0 %	25 %	50 %	25 %	311111700
69	NC_014643	ACCC	2	8	35582	35589	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_014643	CAGA	2	8	35668	35675	50 %	0 %	25 %	25 %	311111701
71	NC_014643	CATG	2	8	35737	35744	25 %	25 %	25 %	25 %	311111701
72	NC_014643	GATT	2	8	36018	36025	25 %	50 %	25 %	0 %	311111701
73	NC_014643	GGGC	2	8	36873	36880	0 %	0 %	75 %	25 %	311111701
74	NC_014643	ATCC	2	8	37120	37127	25 %	25 %	0 %	50 %	311111702
75	NC_014643	TCGT	2	8	37417	37424	0 %	50 %	25 %	25 %	311111702
76	NC_014643	GAGT	2	8	37712	37719	25 %	25 %	50 %	0 %	311111702
77	NC_014643	GGTA	2	8	37808	37815	25 %	25 %	50 %	0 %	311111702
78	NC_014643	CACT	2	8	37834	37841	25 %	25 %	0 %	50 %	311111702
79	NC_014643	GGGA	2	8	38814	38821	25 %	0 %	75 %	0 %	311111703
80	NC_014643	GCAG	2	8	39040	39047	25 %	0 %	50 %	25 %	311111703
81	NC_014643	ACCC	2	8	42177	42184	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_014643	TCTG	2	8	42700	42707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014643	AGTA	2	8	42764	42771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014643	CCAG	2	8	43179	43186	25 %	0 %	25 %	50 %	311111707
85	NC_014643	GCTT	2	8	43572	43579	0 %	50 %	25 %	25 %	311111708
86	NC_014643	CTTT	2	8	43598	43605	0 %	75 %	0 %	25 %	311111708
87	NC_014643	TCAC	2	8	44455	44462	25 %	25 %	0 %	50 %	311111708
88	NC_014643	ATGT	2	8	45705	45712	25 %	50 %	25 %	0 %	311111711
89	NC_014643	AGCG	2	8	45807	45814	25 %	0 %	50 %	25 %	311111711
90	NC_014643	ATGC	2	8	46130	46137	25 %	25 %	25 %	25 %	311111712
91	NC_014643	ACAG	2	8	46173	46180	50 %	0 %	25 %	25 %	311111712
92	NC_014643	ACTC	2	8	47882	47889	25 %	25 %	0 %	50 %	311111714
93	NC_014643	GAGG	2	8	48814	48821	25 %	0 %	75 %	0 %	311111715
94	NC_014643	ATCC	2	8	48864	48871	25 %	25 %	0 %	50 %	311111715
95	NC_014643	TGGT	2	8	49341	49348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014643	CACC	2	8	50011	50018	25 %	0 %	0 %	75 %	311111716
97	NC_014643	TACC	2	8	50433	50440	25 %	25 %	0 %	50 %	311111717
98	NC_014643	CAGT	2	8	50547	50554	25 %	25 %	25 %	25 %	311111717
99	NC_014643	AAGC	2	8	50801	50808	50 %	0 %	25 %	25 %	311111717
100	NC_014643	CCAC	2	8	50850	50857	25 %	0 %	0 %	75 %	311111717
101	NC_014643	CCCG	2	8	51183	51190	0 %	0 %	25 %	75 %	311111717
102	NC_014643	GTGC	2	8	52149	52156	0 %	25 %	50 %	25 %	311111718
103	NC_014643	GCAG	2	8	53919	53926	25 %	0 %	50 %	25 %	311111719
104	NC_014643	GGTA	2	8	55473	55480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014643	CCGC	2	8	55573	55580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014643	GGCG	2	8	55629	55636	0 %	0 %	75 %	25 %	311111721
107	NC_014643	ACAT	2	8	56593	56600	50 %	25 %	0 %	25 %	311111721
108	NC_014643	GCAC	2	8	56677	56684	25 %	0 %	25 %	50 %	311111721
109	NC_014643	GCTT	2	8	56685	56692	0 %	50 %	25 %	25 %	311111721
110	NC_014643	GATG	2	8	58176	58183	25 %	25 %	50 %	0 %	311111721
111	NC_014643	AAGG	2	8	58686	58693	50 %	0 %	50 %	0 %	311111722
112	NC_014643	TTTC	2	8	58740	58747	0 %	75 %	0 %	25 %	311111722
113	NC_014643	TCAT	2	8	59562	59569	25 %	50 %	0 %	25 %	311111723
114	NC_014643	GTAC	2	8	60552	60559	25 %	25 %	25 %	25 %	311111725
115	NC_014643	GAAG	2	8	61311	61318	50 %	0 %	50 %	0 %	311111725
116	NC_014643	CGTT	2	8	63081	63088	0 %	50 %	25 %	25 %	311111726
117	NC_014643	ATAA	2	8	64674	64681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014643	TCGT	2	8	64861	64868	0 %	50 %	25 %	25 %	311111728
119	NC_014643	AACG	2	8	64947	64954	50 %	0 %	25 %	25 %	311111728
120	NC_014643	ATCC	2	8	65370	65377	25 %	25 %	0 %	50 %	311111729
121	NC_014643	CCGT	2	8	65415	65422	0 %	25 %	25 %	50 %	311111729
122	NC_014643	CATA	2	8	66486	66493	50 %	25 %	0 %	25 %	311111730
123	NC_014643	TGCC	2	8	66670	66677	0 %	25 %	25 %	50 %	311111730
124	NC_014643	ACGG	2	8	67415	67422	25 %	0 %	50 %	25 %	311111731
125	NC_014643	TAAC	2	8	67718	67725	50 %	25 %	0 %	25 %	311111732
126	NC_014643	AGTG	2	8	68419	68426	25 %	25 %	50 %	0 %	311111732
127	NC_014643	CCTG	2	8	68753	68760	0 %	25 %	25 %	50 %	311111732
128	NC_014643	GATG	2	8	69174	69181	25 %	25 %	50 %	0 %	311111732
129	NC_014643	AAGA	2	8	70172	70179	75 %	0 %	25 %	0 %	311111732
130	NC_014643	AGAA	2	8	70380	70387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014643	CTCC	2	8	71450	71457	0 %	25 %	0 %	75 %	311111734
132	NC_014643	GCAA	2	8	71629	71636	50 %	0 %	25 %	25 %	311111734
133	NC_014643	GTTT	2	8	71902	71909	0 %	75 %	25 %	0 %	311111734
134	NC_014643	CGTA	2	8	72087	72094	25 %	25 %	25 %	25 %	311111735
135	NC_014643	CCAT	2	8	72601	72608	25 %	25 %	0 %	50 %	311111735
136	NC_014643	TAAG	2	8	72703	72710	50 %	25 %	25 %	0 %	311111735
137	NC_014643	GTAG	2	8	72712	72719	25 %	25 %	50 %	0 %	311111735
138	NC_014643	CTGC	2	8	74443	74450	0 %	25 %	25 %	50 %	311111736
139	NC_014643	CCAT	2	8	75898	75905	25 %	25 %	0 %	50 %	311111737
140	NC_014643	TGCT	2	8	76537	76544	0 %	50 %	25 %	25 %	311111738
141	NC_014643	CCAT	2	8	77284	77291	25 %	25 %	0 %	50 %	311111738
142	NC_014643	GCCA	2	8	77355	77362	25 %	0 %	25 %	50 %	311111738
143	NC_014643	GCAG	2	8	77833	77840	25 %	0 %	50 %	25 %	311111739
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