MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014643	ACAT	2	8	56593	56600	50 %	25 %	0 %	25 %	311111721
1002	NC_014643	GCAC	2	8	56677	56684	25 %	0 %	25 %	50 %	311111721
1003	NC_014643	GCTT	2	8	56685	56692	0 %	50 %	25 %	25 %	311111721
1004	NC_014643	CAG	2	6	56707	56712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111721
1005	NC_014643	CCA	2	6	56795	56800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111721
1006	NC_014643	AC	3	6	56830	56835	50 %	0 %	0 %	50 %	311111721
1007	NC_014643	CAC	2	6	56859	56864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111721
1008	NC_014643	CCG	2	6	56966	56971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111721
1009	NC_014643	GCC	2	6	57031	57036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111721
1010	NC_014643	CGC	2	6	57040	57045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111721
1011	NC_014643	GC	3	6	57044	57049	0 %	0 %	50 %	50 %	311111721
1012	NC_014643	CTA	2	6	57248	57253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111721
1013	NC_014643	GCA	2	6	57501	57506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111721
1014	NC_014643	AT	3	6	57526	57531	50 %	50 %	0 %	0 %	311111721
1015	NC_014643	ACA	2	6	57579	57584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111721
1016	NC_014643	CGTGC	2	10	57619	57628	0 %	20 %	40 %	40 %	311111721
1017	NC_014643	TTG	2	6	57674	57679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111721
1018	NC_014643	TCA	2	6	57795	57800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111721
1019	NC_014643	ATC	2	6	58025	58030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111721
1020	NC_014643	TCA	2	6	58124	58129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111721
1021	NC_014643	CAG	2	6	58146	58151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111721
1022	NC_014643	GATG	2	8	58176	58183	25 %	25 %	50 %	0 %	311111721
1023	NC_014643	GA	3	6	58199	58204	50 %	0 %	50 %	0 %	311111721
1024	NC_014643	GTT	2	6	58266	58271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111722
1025	NC_014643	TCT	2	6	58368	58373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111722
1026	NC_014643	CA	3	6	58397	58402	50 %	0 %	0 %	50 %	311111722
1027	NC_014643	TGT	2	6	58475	58480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111722
1028	NC_014643	ATC	2	6	58497	58502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111722
1029	NC_014643	AT	3	6	58636	58641	50 %	50 %	0 %	0 %	311111722
1030	NC_014643	TTC	2	6	58675	58680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111722
1031	NC_014643	AAGG	2	8	58686	58693	50 %	0 %	50 %	0 %	311111722
1032	NC_014643	TTTC	2	8	58740	58747	0 %	75 %	0 %	25 %	311111722
1033	NC_014643	CT	3	6	58780	58785	0 %	50 %	0 %	50 %	311111722
1034	NC_014643	GAT	2	6	58875	58880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111722
1035	NC_014643	TA	3	6	58887	58892	50 %	50 %	0 %	0 %	311111722
1036	NC_014643	CAG	2	6	58905	58910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111722
1037	NC_014643	CTT	2	6	58914	58919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111722
1038	NC_014643	TTCCTC	2	12	59249	59260	0 %	50 %	0 %	50 %	311111723
1039	NC_014643	CA	3	6	59336	59341	50 %	0 %	0 %	50 %	311111723
1040	NC_014643	GCA	2	6	59364	59369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111723
1041	NC_014643	AGC	2	6	59426	59431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111723
1042	NC_014643	TGA	2	6	59440	59445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111723
1043	NC_014643	ATG	2	6	59496	59501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111723
1044	NC_014643	ACGAT	2	10	59535	59544	40 %	20 %	20 %	20 %	311111723
1045	NC_014643	TCAT	2	8	59562	59569	25 %	50 %	0 %	25 %	311111723
1046	NC_014643	ACG	2	6	59604	59609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111723
1047	NC_014643	A	6	6	59612	59617	100 %	0 %	0 %	0 %	311111723
1048	NC_014643	TGG	2	6	59680	59685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111723
1049	NC_014643	CTT	2	6	59820	59825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014643	T	7	7	59920	59926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014643	AG	3	6	59943	59948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014643	CAC	2	6	59985	59990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_014643	CA	3	6	60018	60023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014643	AAGTT	2	10	60028	60037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014643	TTG	2	6	60043	60048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014643	AGG	2	6	60094	60099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014643	TGC	2	6	60124	60129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111724
1058	NC_014643	CT	3	6	60183	60188	0 %	50 %	0 %	50 %	311111724
1059	NC_014643	CGT	2	6	60308	60313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111724
1060	NC_014643	CGC	2	6	60328	60333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111724
1061	NC_014643	CCG	2	6	60340	60345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111724
1062	NC_014643	TTC	2	6	60434	60439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014643	ATA	2	6	60480	60485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111725
1064	NC_014643	CG	3	6	60487	60492	0 %	0 %	50 %	50 %	311111725
1065	NC_014643	GTAC	2	8	60552	60559	25 %	25 %	25 %	25 %	311111725
1066	NC_014643	TTC	2	6	60617	60622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111725
1067	NC_014643	TAA	3	9	60658	60666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111725
1068	NC_014643	TAT	2	6	60676	60681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111725
1069	NC_014643	CAA	2	6	60763	60768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111725
1070	NC_014643	GCA	2	6	60873	60878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111725
1071	NC_014643	TCA	2	6	60903	60908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111725
1072	NC_014643	TGCTT	2	10	60996	61005	0 %	60 %	20 %	20 %	311111725
1073	NC_014643	ATT	2	6	61061	61066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111725
1074	NC_014643	TC	3	6	61084	61089	0 %	50 %	0 %	50 %	311111725
1075	NC_014643	TTG	2	6	61093	61098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111725
1076	NC_014643	CGA	2	6	61125	61130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111725
1077	NC_014643	CAC	2	6	61165	61170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111725
1078	NC_014643	AGT	2	6	61187	61192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111725
1079	NC_014643	TCA	2	6	61293	61298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111725
1080	NC_014643	TCC	2	6	61302	61307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111725
1081	NC_014643	GAAG	2	8	61311	61318	50 %	0 %	50 %	0 %	311111725
1082	NC_014643	GC	3	6	61376	61381	0 %	0 %	50 %	50 %	311111725
1083	NC_014643	TAT	2	6	61474	61479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111725
1084	NC_014643	ATC	2	6	61518	61523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111725
1085	NC_014643	TTC	2	6	61556	61561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111725
1086	NC_014643	GAT	2	6	61569	61574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111725
1087	NC_014643	TCT	2	6	61705	61710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111725
1088	NC_014643	TGA	2	6	61776	61781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111725
1089	NC_014643	CCA	2	6	61879	61884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111725
1090	NC_014643	ACA	2	6	61905	61910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111725
1091	NC_014643	AAT	2	6	61934	61939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111725
1092	NC_014643	GAT	2	6	61952	61957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111725
1093	NC_014643	ACC	2	6	61991	61996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111725
1094	NC_014643	CT	3	6	62010	62015	0 %	50 %	0 %	50 %	311111725
1095	NC_014643	AAG	2	6	62038	62043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014643	AT	3	6	62088	62093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014643	CAA	2	6	62227	62232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111726
1098	NC_014643	AGA	2	6	62259	62264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111726
1099	NC_014643	CGTCC	2	10	62377	62386	0 %	20 %	20 %	60 %	311111726
1100	NC_014643	ATA	2	6	62499	62504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111726
1101	NC_014643	AGC	2	6	62555	62560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1102	NC_014643	GCG	2	6	62567	62572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111726
1103	NC_014643	TGC	2	6	62618	62623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1104	NC_014643	AAT	2	6	62633	62638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111726
1105	NC_014643	CAT	2	6	62641	62646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111726
1106	NC_014643	A	6	6	62730	62735	100 %	0 %	0 %	0 %	311111726
1107	NC_014643	ATA	2	6	62741	62746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111726
1108	NC_014643	AAT	2	6	62839	62844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111726
1109	NC_014643	AGA	2	6	62850	62855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111726
1110	NC_014643	CAA	2	6	62992	62997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111726
1111	NC_014643	GTC	2	6	63026	63031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1112	NC_014643	CGTT	2	8	63081	63088	0 %	50 %	25 %	25 %	311111726
1113	NC_014643	GCT	2	6	63097	63102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1114	NC_014643	TGC	2	6	63199	63204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1115	NC_014643	GAG	2	6	63364	63369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111726
1116	NC_014643	CAG	2	6	63394	63399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1117	NC_014643	TCA	2	6	63405	63410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111726
1118	NC_014643	AGT	2	6	63411	63416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111726
1119	NC_014643	CGT	2	6	63697	63702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111726
1120	NC_014643	TGA	2	6	63788	63793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111727
1121	NC_014643	TCA	2	6	63876	63881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111727
1122	NC_014643	GGA	2	6	63986	63991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111727
1123	NC_014643	TAA	2	6	64108	64113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111727
1124	NC_014643	TTC	2	6	64260	64265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111727
1125	NC_014643	ATT	2	6	64289	64294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111727
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1127	NC_014643	TAAGA	2	10	64337	64346	60 %	20 %	20 %	0 %	311111727
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1253	NC_014643	AAGA	2	8	70172	70179	75 %	0 %	25 %	0 %	311111732
1254	NC_014643	TTG	2	6	70200	70205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_014643	ACAGTC	2	12	70290	70301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_014643	ATA	2	6	70330	70335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_014643	ATT	2	6	70336	70341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_014643	AGAA	2	8	70380	70387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_014643	TCTAAA	2	12	70400	70411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1260	NC_014643	TAA	2	6	70419	70424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_014643	GAG	2	6	70426	70431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_014643	GTC	2	6	70433	70438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111733
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1275	NC_014643	ATT	2	6	71201	71206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1283	NC_014643	CTCC	2	8	71450	71457	0 %	25 %	0 %	75 %	311111734
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1361	NC_014643	CCT	2	6	76235	76240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111737
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1365	NC_014643	TAT	2	6	76335	76340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1373	NC_014643	GCC	2	6	77054	77059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111738
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1381	NC_014643	TTCCA	2	10	77308	77317	20 %	40 %	0 %	40 %	311111738
1382	NC_014643	AGT	2	6	77344	77349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111738
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1493	NC_014643	TTAG	2	8	83745	83752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1494	NC_014643	TCAG	2	8	83785	83792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1495	NC_014643	CAG	2	6	83829	83834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1497	NC_014643	TTC	2	6	83853	83858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_014643	CGC	2	6	83867	83872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_014643	CTG	2	6	83981	83986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111746
1500	NC_014643	GCAC	2	8	83992	83999	25 %	0 %	25 %	50 %	311111746

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