MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum str. PSI07 chromosome

Total Repeats: 64446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014311	GCC	2	6	29	34	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014311	CCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014311	CAA	2	6	173	178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014311	GCC	2	6	184	189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014311	ACA	2	6	202	207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014311	CGG	2	6	214	219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014311	CGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014311	GCG	2	6	300	305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689715
9	NC_014311	CAA	2	6	336	341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689715
10	NC_014311	CGA	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689715
11	NC_014311	ACT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689715
12	NC_014311	GCC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689715
13	NC_014311	CGG	2	6	652	657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689715
14	NC_014311	CGC	2	6	728	733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689715
15	NC_014311	GTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689715
16	NC_014311	GCC	2	6	912	917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689715
17	NC_014311	CAA	2	6	929	934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689715
18	NC_014311	CGA	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689715
19	NC_014311	CTA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689715
20	NC_014311	CTG	3	9	1146	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689715
21	NC_014311	CGA	2	6	1157	1162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689715
22	NC_014311	TTC	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689715
23	NC_014311	GAA	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689715
24	NC_014311	TTC	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689715
25	NC_014311	TCA	3	9	1246	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689715
26	NC_014311	CGA	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689715
27	NC_014311	GCC	2	6	1340	1345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689715
28	NC_014311	TGA	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689715
29	NC_014311	GGA	2	6	1409	1414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689715
30	NC_014311	CTT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689715
31	NC_014311	CTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689715
32	NC_014311	AGA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689715
33	NC_014311	ACA	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689715
34	NC_014311	AGA	2	6	1711	1716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689715
35	NC_014311	CGG	2	6	1742	1747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689715
36	NC_014311	TGC	2	6	1765	1770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689715
37	NC_014311	CGA	2	6	1790	1795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689715
38	NC_014311	GCA	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689715
39	NC_014311	GCC	2	6	1882	1887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014311	GGC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014311	ACA	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014311	CTG	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
43	NC_014311	GCC	2	6	2207	2212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689716
44	NC_014311	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
45	NC_014311	CAC	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689716
46	NC_014311	GCG	2	6	2315	2320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689716
47	NC_014311	CCA	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689716
48	NC_014311	GCC	2	6	2470	2475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689716
49	NC_014311	GAA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689716
50	NC_014311	AGA	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689716
51	NC_014311	CTG	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
52	NC_014311	CAG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689716
53	NC_014311	CTA	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689716
54	NC_014311	TGC	2	6	2612	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
55	NC_014311	TGG	3	9	2618	2626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689716
56	NC_014311	GCG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689716
57	NC_014311	CGG	2	6	2712	2717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689716
58	NC_014311	TCA	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689716
59	NC_014311	CTG	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
60	NC_014311	GAT	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689716
61	NC_014311	GCA	2	6	2940	2945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689716
62	NC_014311	ACC	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689716
63	NC_014311	CCA	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689716
64	NC_014311	GAA	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689716
65	NC_014311	GAA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689716
66	NC_014311	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
67	NC_014311	TCA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689716
68	NC_014311	GAC	3	9	3208	3216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689716
69	NC_014311	CGT	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689716
70	NC_014311	CAG	2	6	3398	3403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
71	NC_014311	GCC	2	6	3431	3436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689717
72	NC_014311	CAC	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689717
73	NC_014311	CGA	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
74	NC_014311	CGA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
75	NC_014311	GGC	2	6	3725	3730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
76	NC_014311	GGC	2	6	3761	3766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
77	NC_014311	CTG	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
78	NC_014311	CGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689717
79	NC_014311	CAC	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689717
80	NC_014311	CGA	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
81	NC_014311	AAC	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689717
82	NC_014311	GAA	2	6	4109	4114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689717
83	NC_014311	GCG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
84	NC_014311	TCG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
85	NC_014311	CAA	2	6	4159	4164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689717
86	NC_014311	TGC	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
87	NC_014311	ACG	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
88	NC_014311	CAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689717
89	NC_014311	CGG	2	6	4303	4308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
90	NC_014311	TCA	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689717
91	NC_014311	AAG	2	6	4382	4387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689717
92	NC_014311	CGA	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
93	NC_014311	TCG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
94	NC_014311	TGG	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689717
95	NC_014311	CTG	2	6	4553	4558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
96	NC_014311	ACG	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
97	NC_014311	ATC	2	6	4580	4585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689717
98	NC_014311	TCG	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
99	NC_014311	CGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689717
100	NC_014311	TCG	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
101	NC_014311	GGC	2	6	4757	4762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
102	NC_014311	TCA	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689717
103	NC_014311	GAC	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
104	NC_014311	ACC	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689717
105	NC_014311	CAT	4	12	4948	4959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689717
106	NC_014311	GCT	3	9	4996	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
107	NC_014311	TTC	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689717
108	NC_014311	ATC	2	6	5033	5038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689717
109	NC_014311	GCC	2	6	5065	5070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689717
110	NC_014311	GAC	2	6	5114	5119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
111	NC_014311	GCC	2	6	5129	5134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689717
112	NC_014311	GCT	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
113	NC_014311	CAG	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
114	NC_014311	CGG	2	6	5415	5420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
115	NC_014311	ACG	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
116	NC_014311	CGC	2	6	5474	5479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689717
117	NC_014311	GCG	2	6	5599	5604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
118	NC_014311	AGC	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
119	NC_014311	GCG	2	6	5651	5656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
120	NC_014311	GCT	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689717
121	NC_014311	GCG	2	6	5767	5772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
122	NC_014311	GCG	2	6	5804	5809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
123	NC_014311	TAC	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689717
124	NC_014311	GAC	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689717
125	NC_014311	CGG	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689717
126	NC_014311	TGG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689717
127	NC_014311	TGA	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014311	TTG	2	6	5973	5978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014311	GCC	2	6	6011	6016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014311	GGT	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014311	ACG	2	6	6131	6136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014311	GTC	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014311	ACG	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689718
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135	NC_014311	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689718
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137	NC_014311	CTT	2	6	6469	6474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689718
138	NC_014311	TCA	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689718
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140	NC_014311	CTG	2	6	6777	6782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689718
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142	NC_014311	TTG	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014311	CGC	2	6	7124	7129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014311	AAG	2	6	7187	7192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014311	ATT	2	6	7321	7326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_014311	TTG	2	6	15600	15605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689722
258	NC_014311	TTC	2	6	15672	15677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689722
259	NC_014311	TGC	2	6	15769	15774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689722
260	NC_014311	GCA	2	6	15921	15926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689723
261	NC_014311	TGA	2	6	16071	16076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689723
262	NC_014311	CAC	2	6	16080	16085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689723
263	NC_014311	TCC	2	6	16133	16138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689723
264	NC_014311	CGA	2	6	16182	16187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689723
265	NC_014311	ATG	2	6	16223	16228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689723
266	NC_014311	GTC	2	6	16387	16392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689723
267	NC_014311	ACG	2	6	16400	16405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689723
268	NC_014311	GCG	2	6	16603	16608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689723
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270	NC_014311	GGT	2	6	16729	16734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689723
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272	NC_014311	TCG	2	6	16856	16861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689723
273	NC_014311	CAA	2	6	16920	16925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689723
274	NC_014311	ACA	2	6	17018	17023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689723
275	NC_014311	GCA	2	6	17086	17091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689723
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277	NC_014311	ATG	2	6	17655	17660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014311	TGC	2	6	17717	17722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_014311	CTT	2	6	17857	17862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_014311	GAG	2	6	17864	17869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014311	GGA	2	6	17878	17883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014311	GCC	2	6	17916	17921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_014311	CTG	2	6	18096	18101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689724
284	NC_014311	GAG	2	6	18189	18194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689724
285	NC_014311	GGT	2	6	18232	18237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689724
286	NC_014311	AGT	3	9	18284	18292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689724
287	NC_014311	GTA	2	6	18366	18371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689724
288	NC_014311	CCA	2	6	18395	18400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689724
289	NC_014311	GTG	2	6	18403	18408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689724
290	NC_014311	GAG	2	6	18527	18532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689724
291	NC_014311	CGC	2	6	18723	18728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689724
292	NC_014311	TCT	2	6	18769	18774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689724
293	NC_014311	TGG	2	6	19184	19189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689724
294	NC_014311	GAT	2	6	19203	19208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689724
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297	NC_014311	GTA	2	6	19494	19499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689724
298	NC_014311	ATT	2	6	19675	19680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300689724
299	NC_014311	CGG	2	6	19815	19820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_014311	AGT	2	6	19866	19871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014311	GCC	2	6	19910	19915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_014311	CGG	2	6	19917	19922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_014311	GAG	2	6	20223	20228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014311	CGA	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_014311	AAG	2	6	21071	21076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_014311	GAG	2	6	22239	22244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689728
333	NC_014311	GAA	2	6	22356	22361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689728
334	NC_014311	GCG	2	6	22370	22375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689728
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361	NC_014311	AAG	2	6	24581	24586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
362	NC_014311	AAG	2	6	24612	24617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
363	NC_014311	GAA	2	6	24846	24851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689730
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370	NC_014311	CGT	2	6	25657	25662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689731
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374	NC_014311	GCG	2	6	25973	25978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689731
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376	NC_014311	GCG	2	6	26200	26205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689732
377	NC_014311	TGG	2	6	26213	26218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689732
378	NC_014311	GCC	2	6	26227	26232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689732
379	NC_014311	ATC	2	6	26387	26392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689732
380	NC_014311	TCG	2	6	26422	26427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689732
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382	NC_014311	GGA	2	6	26463	26468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689732
383	NC_014311	CGG	2	6	26520	26525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689732
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387	NC_014311	TGG	2	6	26739	26744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689732
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441	NC_014311	TGG	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014311	TGG	2	6	30308	30313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014311	GAT	2	6	30343	30348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_014311	GCA	2	6	33875	33880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_014311	TAA	2	6	33925	33930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_014311	GCG	2	6	34001	34006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_014311	TGC	2	6	34310	34315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689739
495	NC_014311	TCT	2	6	34367	34372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689739
496	NC_014311	CTG	2	6	34408	34413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689739
497	NC_014311	ACG	2	6	34435	34440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689739
498	NC_014311	CAA	2	6	34488	34493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689739
499	NC_014311	GGC	3	9	34599	34607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689739
500	NC_014311	CAT	2	6	34755	34760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689739

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