MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum str. PSI07 chromosome

Total Repeats: 94220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014311	GCG	2	6	133571	133576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3502	NC_014311	CAT	2	6	133605	133610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689834
3503	NC_014311	TTG	2	6	133716	133721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689834
3504	NC_014311	GTC	2	6	133789	133794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3505	NC_014311	CCG	2	6	133799	133804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3506	NC_014311	GCG	3	9	133811	133819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3507	NC_014311	CGC	2	6	133865	133870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3508	NC_014311	CGGCAT	2	12	133878	133889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3509	NC_014311	CGGGC	2	10	133907	133916	0 %	0 %	60 %	40 %	300689834
3510	NC_014311	GGC	2	6	134007	134012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3511	NC_014311	CG	3	6	134027	134032	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3512	NC_014311	CCG	2	6	134035	134040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3513	NC_014311	GCG	2	6	134107	134112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3514	NC_014311	CG	4	8	134147	134154	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3515	NC_014311	CG	3	6	134164	134169	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3516	NC_014311	GCC	2	6	134175	134180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3517	NC_014311	GC	3	6	134207	134212	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3518	NC_014311	CCGC	2	8	134251	134258	0 %	0 %	25 %	75 %	300689834
3519	NC_014311	GCG	2	6	134267	134272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3520	NC_014311	CG	3	6	134271	134276	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3521	NC_014311	AGA	2	6	134297	134302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689834
3522	NC_014311	CGG	2	6	134310	134315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3523	NC_014311	GGC	3	9	134334	134342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3524	NC_014311	GCGT	2	8	134398	134405	0 %	25 %	50 %	25 %	300689834
3525	NC_014311	GTC	2	6	134437	134442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3526	NC_014311	TGGC	2	8	134480	134487	0 %	25 %	50 %	25 %	300689834
3527	NC_014311	CCG	2	6	134489	134494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3528	NC_014311	GCG	2	6	134500	134505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3529	NC_014311	GTT	2	6	134508	134513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689834
3530	NC_014311	GTT	3	9	134559	134567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689834
3531	NC_014311	GAT	2	6	134568	134573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689834
3532	NC_014311	TTG	2	6	134578	134583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689834
3533	NC_014311	GTT	2	6	134592	134597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689834
3534	NC_014311	ACC	2	6	134599	134604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689834
3535	NC_014311	CCACG	2	10	134685	134694	20 %	0 %	20 %	60 %	300689834
3536	NC_014311	CGC	3	9	134732	134740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3537	NC_014311	CCG	2	6	134743	134748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3538	NC_014311	CCAC	2	8	134749	134756	25 %	0 %	0 %	75 %	300689834
3539	NC_014311	CAC	2	6	134793	134798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689834
3540	NC_014311	CAC	2	6	134815	134820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689834
3541	NC_014311	TCG	2	6	134878	134883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3542	NC_014311	GC	3	6	134956	134961	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3543	NC_014311	CG	3	6	135083	135088	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3544	NC_014311	CCG	2	6	135157	135162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3545	NC_014311	CTG	2	6	135171	135176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3546	NC_014311	CGG	2	6	135179	135184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3547	NC_014311	GCG	2	6	135188	135193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3548	NC_014311	TCG	2	6	135202	135207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3549	NC_014311	GCCGT	2	10	135214	135223	0 %	20 %	40 %	40 %	300689834
3550	NC_014311	GTG	2	6	135244	135249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689834
3551	NC_014311	CCTGGA	2	12	135293	135304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3552	NC_014311	GT	3	6	135317	135322	0 %	50 %	50 %	0 %	300689834
3553	NC_014311	CGG	2	6	135342	135347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3554	NC_014311	GC	3	6	135352	135357	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3555	NC_014311	GTG	2	6	135397	135402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689834
3556	NC_014311	GTC	2	6	135405	135410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3557	NC_014311	GGT	2	6	135513	135518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689834
3558	NC_014311	GGC	3	9	135537	135545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3559	NC_014311	TCG	2	6	135550	135555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689834
3560	NC_014311	GC	3	6	135600	135605	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3561	NC_014311	CG	3	6	135608	135613	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3562	NC_014311	CGG	2	6	135623	135628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689834
3563	NC_014311	GC	3	6	135641	135646	0 %	0 %	50 %	50 %	300689834
3564	NC_014311	CGC	2	6	135675	135680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689834
3565	NC_014311	GA	3	6	135709	135714	50 %	0 %	50 %	0 %	300689834
3566	NC_014311	ATG	2	6	135742	135747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689834
3567	NC_014311	TCG	2	6	135842	135847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_014311	GCG	2	6	135852	135857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_014311	GC	3	6	135863	135868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_014311	CGAT	2	8	135898	135905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_014311	GC	3	6	135906	135911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_014311	A	8	8	135916	135923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014311	CG	3	6	135924	135929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_014311	CG	3	6	135943	135948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_014311	AGGG	2	8	135981	135988	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014311	GGCGA	2	10	136034	136043	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3577	NC_014311	CAA	2	6	136062	136067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_014311	C	6	6	136114	136119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3579	NC_014311	GT	3	6	136133	136138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014311	TG	4	8	136175	136182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014311	CACG	2	8	136226	136233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_014311	TGC	2	6	136262	136267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_014311	GAG	2	6	136320	136325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014311	ATGC	2	8	136327	136334	25 %	25 %	25 %	25 %	300689835
3585	NC_014311	GCG	2	6	136442	136447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3586	NC_014311	CCT	2	6	136454	136459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689835
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3588	NC_014311	ACG	2	6	136695	136700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689835
3589	NC_014311	GCG	2	6	136753	136758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3590	NC_014311	CCG	2	6	136845	136850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689835
3591	NC_014311	CCG	3	9	136860	136868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689835
3592	NC_014311	GGC	2	6	136883	136888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3593	NC_014311	CAGC	2	8	136891	136898	25 %	0 %	25 %	50 %	300689835
3594	NC_014311	GC	3	6	136912	136917	0 %	0 %	50 %	50 %	300689835
3595	NC_014311	AGG	2	6	136929	136934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689835
3596	NC_014311	GCG	2	6	136991	136996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3597	NC_014311	GAC	2	6	137042	137047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689835
3598	NC_014311	GTG	2	6	137072	137077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689835
3599	NC_014311	CTG	2	6	137099	137104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689835
3600	NC_014311	GCG	3	9	137124	137132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3601	NC_014311	CGG	2	6	137154	137159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3602	NC_014311	GGC	2	6	137166	137171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3603	NC_014311	GCG	2	6	137298	137303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689835
3604	NC_014311	GAAGGA	2	12	137308	137319	50 %	0 %	50 %	0 %	300689835
3605	NC_014311	CG	3	6	137417	137422	0 %	0 %	50 %	50 %	300689835
3606	NC_014311	CGA	2	6	137434	137439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689835
3607	NC_014311	TCCT	2	8	137500	137507	0 %	50 %	0 %	50 %	300689836
3608	NC_014311	CGA	2	6	137512	137517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689836
3609	NC_014311	GCT	2	6	137536	137541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689836
3610	NC_014311	CGC	2	6	137574	137579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689836
3611	NC_014311	GC	3	6	137606	137611	0 %	0 %	50 %	50 %	300689836
3612	NC_014311	GCA	2	6	137617	137622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689836
3613	NC_014311	GCA	2	6	137653	137658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689836
3614	NC_014311	CCA	2	6	137712	137717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689836
3615	NC_014311	GCC	3	9	137723	137731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689836
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3618	NC_014311	TGC	2	6	137778	137783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689836
3619	NC_014311	TGGGCG	2	12	137808	137819	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300689836
3620	NC_014311	GC	4	8	137867	137874	0 %	0 %	50 %	50 %	300689836
3621	NC_014311	GC	4	8	137951	137958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_014311	GCC	2	6	137961	137966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_014311	GCG	2	6	137971	137976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_014311	GCC	3	9	138081	138089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689837
3625	NC_014311	GC	3	6	138108	138113	0 %	0 %	50 %	50 %	300689837
3626	NC_014311	ATC	2	6	138124	138129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689837
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3750	NC_014311	CGC	2	6	142382	142387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689841
3751	NC_014311	GCC	2	6	142408	142413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689841
3752	NC_014311	GCT	2	6	142416	142421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689841
3753	NC_014311	CCG	2	6	142487	142492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689841
3754	NC_014311	GC	4	8	142507	142514	0 %	0 %	50 %	50 %	300689841
3755	NC_014311	TGC	2	6	142532	142537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689841
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3759	NC_014311	GCGAT	2	10	142607	142616	20 %	20 %	40 %	20 %	300689841
3760	NC_014311	CGG	3	9	142632	142640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689841
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3762	NC_014311	TGC	2	6	142733	142738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689841
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3764	NC_014311	CGAGAT	2	12	142782	142793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300689841
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3771	NC_014311	GTC	3	9	143004	143012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689841
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3807	NC_014311	CGC	2	6	144370	144375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3808	NC_014311	CGG	2	6	144382	144387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3809	NC_014311	AGG	3	9	144399	144407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3810	NC_014311	GCAT	2	8	144410	144417	25 %	25 %	25 %	25 %	300689844
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3823	NC_014311	CGGG	2	8	144921	144928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3824	NC_014311	GCC	2	6	144973	144978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689845
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3855	NC_014311	TCGGTG	2	12	146091	146102	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300689845
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3858	NC_014311	TGC	2	6	146165	146170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3859	NC_014311	GCA	2	6	146217	146222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3860	NC_014311	GGC	2	6	146223	146228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3861	NC_014311	CG	3	6	146268	146273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3862	NC_014311	GC	3	6	146280	146285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3863	NC_014311	TG	3	6	146328	146333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3864	NC_014311	GACTT	2	10	146349	146358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3865	NC_014311	GCA	2	6	146395	146400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3866	NC_014311	TG	3	6	146454	146459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3867	NC_014311	CAA	2	6	146528	146533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3868	NC_014311	TG	3	6	146548	146553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3869	NC_014311	A	6	6	146563	146568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3870	NC_014311	GTT	2	6	146646	146651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3871	NC_014311	GCC	2	6	146658	146663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3873	NC_014311	CAA	2	6	146702	146707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3995	NC_014311	GC	4	8	151343	151350	0 %	0 %	50 %	50 %	300689847
3996	NC_014311	GCT	2	6	151354	151359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689847
3997	NC_014311	GC	3	6	151363	151368	0 %	0 %	50 %	50 %	300689847
3998	NC_014311	ATC	2	6	151412	151417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689847
3999	NC_014311	CTA	2	6	151483	151488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689847
4000	NC_014311	GCG	2	6	151503	151508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689847

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