MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 62619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014307	AAG	2	6	76	81	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014307	CAA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014307	GCC	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014307	CGG	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014307	GAC	2	6	338	343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014307	GCG	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702375
7	NC_014307	CAA	2	6	432	437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702375
8	NC_014307	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
9	NC_014307	TGC	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702375
10	NC_014307	ACT	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702375
11	NC_014307	GCC	2	6	639	644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
12	NC_014307	GCC	2	6	783	788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
13	NC_014307	GCG	2	6	792	797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702375
14	NC_014307	GCC	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
15	NC_014307	ATG	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702375
16	NC_014307	GAC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
17	NC_014307	GCC	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
18	NC_014307	CAA	2	6	1025	1030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702375
19	NC_014307	CGA	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
20	NC_014307	CTA	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702375
21	NC_014307	CTG	3	9	1242	1250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702375
22	NC_014307	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702375
23	NC_014307	GAA	2	6	1293	1298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
24	NC_014307	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702375
25	NC_014307	TCA	3	9	1342	1350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702375
26	NC_014307	CGA	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
27	NC_014307	GCC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
28	NC_014307	TGA	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702375
29	NC_014307	GGA	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702375
30	NC_014307	CTT	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702375
31	NC_014307	CTG	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702375
32	NC_014307	AGA	2	6	1690	1695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
33	NC_014307	ACA	2	6	1711	1716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702375
34	NC_014307	GAA	2	6	1739	1744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
35	NC_014307	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
36	NC_014307	CGA	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
37	NC_014307	GCA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
38	NC_014307	ACC	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702375
39	NC_014307	GCG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014307	GGC	2	6	1994	1999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014307	CGC	2	6	2018	2023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014307	ACA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014307	CTG	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
44	NC_014307	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702376
45	NC_014307	CTG	2	6	2332	2337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
46	NC_014307	CAC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
47	NC_014307	GCG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702376
48	NC_014307	CCA	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
49	NC_014307	GCC	2	6	2566	2571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702376
50	NC_014307	GAA	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
51	NC_014307	AGA	2	6	2630	2635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
52	NC_014307	CTG	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
53	NC_014307	CAG	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
54	NC_014307	CTA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702376
55	NC_014307	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
56	NC_014307	TGG	3	9	2714	2722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702376
57	NC_014307	GCG	2	6	2774	2779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702376
58	NC_014307	AGC	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
59	NC_014307	CCG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702376
60	NC_014307	TCA	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702376
61	NC_014307	CTG	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
62	NC_014307	GCA	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
63	NC_014307	ACC	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
64	NC_014307	CCA	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
65	NC_014307	GAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
66	NC_014307	GAA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
67	NC_014307	TCA	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702376
68	NC_014307	GAC	3	9	3304	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
69	NC_014307	CGT	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
70	NC_014307	CAG	2	6	3494	3499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
71	NC_014307	AGC	3	9	3524	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
72	NC_014307	GCC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
73	NC_014307	CAC	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
74	NC_014307	CGA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
75	NC_014307	CGA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
76	NC_014307	CGG	2	6	3832	3837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
77	NC_014307	GGC	2	6	3869	3874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
78	NC_014307	CAC	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
79	NC_014307	CTG	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
80	NC_014307	CAC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
81	NC_014307	CGA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
82	NC_014307	AAC	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702377
83	NC_014307	GCG	2	6	4239	4244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
84	NC_014307	TCG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
85	NC_014307	CAA	2	6	4267	4272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702377
86	NC_014307	ACG	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
87	NC_014307	CAA	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702377
88	NC_014307	CGG	2	6	4411	4416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
89	NC_014307	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
90	NC_014307	AAG	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702377
91	NC_014307	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
92	NC_014307	TCC	2	6	4604	4609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702377
93	NC_014307	GAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702377
94	NC_014307	CTG	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
95	NC_014307	ACG	2	6	4677	4682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
96	NC_014307	ATC	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
97	NC_014307	TCG	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
98	NC_014307	GCC	2	6	4712	4717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
99	NC_014307	CGC	2	6	4757	4762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
100	NC_014307	TCG	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
101	NC_014307	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
102	NC_014307	TCA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
103	NC_014307	GAC	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
104	NC_014307	ACC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
105	NC_014307	CAT	4	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
106	NC_014307	GCT	3	9	5104	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
107	NC_014307	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702377
108	NC_014307	ATC	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
109	NC_014307	GCC	2	6	5173	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
110	NC_014307	GAC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
111	NC_014307	CAG	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
112	NC_014307	CGG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
113	NC_014307	ACG	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
114	NC_014307	GCG	2	6	5581	5586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
115	NC_014307	TGC	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
116	NC_014307	GCT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
117	NC_014307	GCG	2	6	5875	5880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
118	NC_014307	CTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
119	NC_014307	GCG	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
120	NC_014307	TAC	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
121	NC_014307	TGA	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702377
122	NC_014307	CGG	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
123	NC_014307	TGG	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702377
124	NC_014307	CAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014307	GTT	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014307	AGA	2	6	6254	6259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702378
127	NC_014307	TGG	3	9	6287	6295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702378
128	NC_014307	TGC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702378
129	NC_014307	CGG	2	6	6362	6367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702378
130	NC_014307	TGC	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702378
131	NC_014307	TTC	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014307	AAG	2	6	6652	6657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014307	GAG	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702379
134	NC_014307	TTC	2	6	6828	6833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702379
135	NC_014307	TGT	3	9	6916	6924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702379
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139	NC_014307	GAT	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014307	TTG	3	9	7016	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014307	AAG	2	6	7260	7265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702380
142	NC_014307	TGG	2	6	7339	7344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702380
143	NC_014307	TGC	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702380
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147	NC_014307	CAT	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702381
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155	NC_014307	GGC	2	6	8736	8741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014307	TCG	2	6	8790	8795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014307	GCA	2	6	8871	8876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014307	ACC	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_014307	GCG	2	6	8968	8973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014307	GGC	2	6	9123	9128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702384
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162	NC_014307	TGT	2	6	9289	9294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702384
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165	NC_014307	CTG	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702384
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184	NC_014307	CAG	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702385
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253	NC_014307	AGG	2	6	15329	15334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702387
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257	NC_014307	GAC	2	6	15675	15680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702387
258	NC_014307	CGA	2	6	15692	15697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702387
259	NC_014307	GTG	2	6	15717	15722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702387
260	NC_014307	GAG	2	6	15855	15860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702387
261	NC_014307	GAA	2	6	15987	15992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702387
262	NC_014307	TTC	2	6	16105	16110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702387
263	NC_014307	GCC	2	6	16142	16147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702387
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265	NC_014307	CTT	2	6	16407	16412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702387
266	NC_014307	AAG	2	6	16671	16676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702387
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279	NC_014307	CGA	2	6	17552	17557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702387
280	NC_014307	ACA	2	6	17626	17631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702387
281	NC_014307	GTT	2	6	17654	17659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702387
282	NC_014307	CTG	2	6	17695	17700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
283	NC_014307	CTG	2	6	17715	17720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
284	NC_014307	GGA	2	6	18040	18045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702387
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332	NC_014307	CGA	2	6	22375	22380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
333	NC_014307	TGC	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702392
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500	NC_014307	TTG	3	9	34404	34412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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