MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 91706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014307	CGGT	2	8	210984	210991	0 %	25 %	50 %	25 %	300702557
5502	NC_014307	GCG	2	6	211065	211070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_014307	CGG	2	6	211074	211079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_014307	CG	3	6	211116	211121	0 %	0 %	50 %	50 %	300702558
5505	NC_014307	GGC	2	6	211158	211163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702558
5506	NC_014307	GCGGTG	2	12	211186	211197	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300702558
5507	NC_014307	GC	3	6	211288	211293	0 %	0 %	50 %	50 %	300702558
5508	NC_014307	GCC	2	6	211341	211346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702558
5509	NC_014307	CAG	2	6	211398	211403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702558
5510	NC_014307	GAT	2	6	211437	211442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702558
5511	NC_014307	TGG	2	6	211457	211462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702558
5512	NC_014307	GCC	2	6	211479	211484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702558
5513	NC_014307	GCA	2	6	211523	211528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702558
5514	NC_014307	CCA	2	6	211556	211561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702558
5515	NC_014307	CGC	2	6	211595	211600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702558
5516	NC_014307	GC	3	6	211625	211630	0 %	0 %	50 %	50 %	300702558
5517	NC_014307	TTG	2	6	211636	211641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702558
5518	NC_014307	GC	3	6	211644	211649	0 %	0 %	50 %	50 %	300702558
5519	NC_014307	TGG	2	6	211661	211666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702558
5520	NC_014307	CGA	3	9	211691	211699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702558
5521	NC_014307	CCT	2	6	211739	211744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702558
5522	NC_014307	GCG	2	6	211793	211798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702558
5523	NC_014307	ATG	2	6	211810	211815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702558
5524	NC_014307	TCC	2	6	211843	211848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702558
5525	NC_014307	CCA	2	6	211877	211882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702558
5526	NC_014307	CGG	2	6	211928	211933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702558
5527	NC_014307	GGCC	2	8	211943	211950	0 %	0 %	50 %	50 %	300702558
5528	NC_014307	ATG	2	6	211963	211968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702558
5529	NC_014307	CGTTT	2	10	212071	212080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5530	NC_014307	TCC	2	6	212084	212089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_014307	GACA	2	8	212132	212139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_014307	GCCA	2	8	212178	212185	25 %	0 %	25 %	50 %	300702559
5533	NC_014307	GCC	2	6	212233	212238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702559
5534	NC_014307	CTG	2	6	212458	212463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702559
5535	NC_014307	CAG	2	6	212515	212520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702559
5536	NC_014307	TCT	2	6	212526	212531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702559
5537	NC_014307	CGG	2	6	212532	212537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702559
5538	NC_014307	CGG	2	6	212547	212552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702559
5539	NC_014307	GCG	2	6	212578	212583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702559
5540	NC_014307	CG	3	6	212582	212587	0 %	0 %	50 %	50 %	300702559
5541	NC_014307	GCA	2	6	212709	212714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702559
5542	NC_014307	GCA	2	6	212763	212768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702559
5543	NC_014307	CGC	2	6	212844	212849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702559
5544	NC_014307	CG	5	10	212857	212866	0 %	0 %	50 %	50 %	300702559
5545	NC_014307	GGC	2	6	212920	212925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702559
5546	NC_014307	CGGGC	2	10	212960	212969	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5547	NC_014307	CCA	3	9	213094	213102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702560
5548	NC_014307	CAG	2	6	213125	213130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702560
5549	NC_014307	ACC	2	6	213204	213209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702560
5550	NC_014307	AGT	2	6	213277	213282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702560
5551	NC_014307	TGCGC	2	10	213295	213304	0 %	20 %	40 %	40 %	300702560
5552	NC_014307	GTT	2	6	213329	213334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702560
5553	NC_014307	CAC	2	6	213335	213340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702560
5554	NC_014307	CGGCCA	2	12	213370	213381	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300702560
5555	NC_014307	CCA	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702560
5556	NC_014307	CCAGC	2	10	213479	213488	20 %	0 %	20 %	60 %	300702560
5557	NC_014307	GGCC	2	8	213490	213497	0 %	0 %	50 %	50 %	300702560
5558	NC_014307	GCG	3	9	213546	213554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702560
5559	NC_014307	CG	3	6	213592	213597	0 %	0 %	50 %	50 %	300702560
5560	NC_014307	GCG	2	6	213662	213667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702560
5561	NC_014307	TGCGCT	2	12	213676	213687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702560
5562	NC_014307	GGC	2	6	213707	213712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702560
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5564	NC_014307	TGC	2	6	213883	213888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702560
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5568	NC_014307	TGA	2	6	214102	214107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702560
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5570	NC_014307	CAG	2	6	214124	214129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702560
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5572	NC_014307	GGC	2	6	214184	214189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702560
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5574	NC_014307	CTG	2	6	214313	214318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702560
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5579	NC_014307	CGGCG	2	10	214627	214636	0 %	0 %	60 %	40 %	300702560
5580	NC_014307	GGC	2	6	214661	214666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702560
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5582	NC_014307	CCTT	2	8	214695	214702	0 %	50 %	0 %	50 %	300702560
5583	NC_014307	CGG	2	6	214717	214722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702560
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5586	NC_014307	TGGG	2	8	214769	214776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_014307	TG	3	6	214868	214873	0 %	50 %	50 %	0 %	300702561
5588	NC_014307	GCA	2	6	214876	214881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702561
5589	NC_014307	CGG	2	6	214928	214933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702561
5590	NC_014307	CGC	2	6	214944	214949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702561
5591	NC_014307	TCGC	2	8	214984	214991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_014307	GC	3	6	214990	214995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_014307	CGG	2	6	215009	215014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_014307	GAT	2	6	215086	215091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_014307	GTG	2	6	215131	215136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702562
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5599	NC_014307	CGGC	2	8	215193	215200	0 %	0 %	50 %	50 %	300702562
5600	NC_014307	GCT	2	6	215235	215240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702562
5601	NC_014307	CGC	2	6	215254	215259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702562
5602	NC_014307	AAG	2	6	215302	215307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702562
5603	NC_014307	CTG	2	6	215335	215340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702562
5604	NC_014307	GGC	2	6	215351	215356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702562
5605	NC_014307	CGG	2	6	215390	215395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702562
5606	NC_014307	GC	3	6	215439	215444	0 %	0 %	50 %	50 %	300702562
5607	NC_014307	GACC	2	8	215475	215482	25 %	0 %	25 %	50 %	300702562
5608	NC_014307	CGG	2	6	215529	215534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702562
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5610	NC_014307	CGCC	2	8	215597	215604	0 %	0 %	25 %	75 %	300702562
5611	NC_014307	CGA	2	6	215637	215642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702562
5612	NC_014307	CAG	2	6	215686	215691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702562
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5614	NC_014307	ACG	2	6	215759	215764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702562
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5616	NC_014307	GCCTGG	2	12	215795	215806	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300702562
5617	NC_014307	GC	3	6	215849	215854	0 %	0 %	50 %	50 %	300702562
5618	NC_014307	TGA	2	6	215855	215860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702562
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5620	NC_014307	GCA	2	6	215913	215918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702562
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5622	NC_014307	TCGA	2	8	216132	216139	25 %	25 %	25 %	25 %	300702563
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5992	NC_014307	GTG	2	6	229426	229431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702578
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5994	NC_014307	GC	3	6	229465	229470	0 %	0 %	50 %	50 %	300702578
5995	NC_014307	GCG	2	6	229478	229483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702578
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5999	NC_014307	GCC	2	6	229763	229768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6000	NC_014307	T	6	6	229777	229782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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