MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014035	CCCG	2	8	476	483	0 %	0 %	25 %	75 %	294679056
2	NC_014035	AGAT	2	8	874	881	50 %	25 %	25 %	0 %	294679057
3	NC_014035	TCGA	2	8	904	911	25 %	25 %	25 %	25 %	294679057
4	NC_014035	CGGG	2	8	1492	1499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014035	GGGC	2	8	2211	2218	0 %	0 %	75 %	25 %	294679058
6	NC_014035	TGCA	2	8	2686	2693	25 %	25 %	25 %	25 %	294679059
7	NC_014035	GCTG	2	8	2738	2745	0 %	25 %	50 %	25 %	294679059
8	NC_014035	GCTC	2	8	3707	3714	0 %	25 %	25 %	50 %	294679060
9	NC_014035	TTTC	2	8	3822	3829	0 %	75 %	0 %	25 %	294679060
10	NC_014035	GCCC	2	8	4751	4758	0 %	0 %	25 %	75 %	294679061
11	NC_014035	TCGA	2	8	4854	4861	25 %	25 %	25 %	25 %	294679061
12	NC_014035	GACG	2	8	4886	4893	25 %	0 %	50 %	25 %	294679061
13	NC_014035	CGCC	2	8	5367	5374	0 %	0 %	25 %	75 %	294679062
14	NC_014035	GCAG	2	8	6428	6435	25 %	0 %	50 %	25 %	294679063
15	NC_014035	CCGC	2	8	7610	7617	0 %	0 %	25 %	75 %	294679064
16	NC_014035	GCGG	2	8	7710	7717	0 %	0 %	75 %	25 %	294679064
17	NC_014035	GCCC	2	8	7929	7936	0 %	0 %	25 %	75 %	294679064
18	NC_014035	TGGG	2	8	8298	8305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014035	AATG	2	8	8317	8324	50 %	25 %	25 %	0 %	294679065
20	NC_014035	CGGG	2	8	8537	8544	0 %	0 %	75 %	25 %	294679066
21	NC_014035	GCGG	2	8	8776	8783	0 %	0 %	75 %	25 %	294679066
22	NC_014035	GGGC	2	8	8870	8877	0 %	0 %	75 %	25 %	294679066
23	NC_014035	CCCG	2	8	9257	9264	0 %	0 %	25 %	75 %	294679066
24	NC_014035	GCAG	2	8	9471	9478	25 %	0 %	50 %	25 %	294679066
25	NC_014035	CGCC	2	8	9600	9607	0 %	0 %	25 %	75 %	294679067
26	NC_014035	GCCC	2	8	9775	9782	0 %	0 %	25 %	75 %	294679067
27	NC_014035	CTGA	2	8	9795	9802	25 %	25 %	25 %	25 %	294679067
28	NC_014035	CCCG	2	8	10091	10098	0 %	0 %	25 %	75 %	294679067
29	NC_014035	CCCG	2	8	10881	10888	0 %	0 %	25 %	75 %	294679068
30	NC_014035	CGGG	2	8	11008	11015	0 %	0 %	75 %	25 %	294679068
31	NC_014035	ATCG	2	8	12200	12207	25 %	25 %	25 %	25 %	294679069
32	NC_014035	AGGT	2	8	12572	12579	25 %	25 %	50 %	0 %	294679070
33	NC_014035	CTCG	2	8	12729	12736	0 %	25 %	25 %	50 %	294679071
34	NC_014035	ACGC	2	8	14868	14875	25 %	0 %	25 %	50 %	294679075
35	NC_014035	CGCC	2	8	14933	14940	0 %	0 %	25 %	75 %	294679075
36	NC_014035	GCGT	2	8	15092	15099	0 %	25 %	50 %	25 %	294679075
37	NC_014035	GCCA	2	8	15445	15452	25 %	0 %	25 %	50 %	294679075
38	NC_014035	CGGG	2	8	17956	17963	0 %	0 %	75 %	25 %	294679080
39	NC_014035	ACGC	2	8	18419	18426	25 %	0 %	25 %	50 %	294679081
40	NC_014035	GGGA	2	8	18466	18473	25 %	0 %	75 %	0 %	294679081
41	NC_014035	GCCA	2	8	18480	18487	25 %	0 %	25 %	50 %	294679081
42	NC_014035	GCCC	3	12	18684	18695	0 %	0 %	25 %	75 %	294679081
43	NC_014035	GCGG	2	8	18794	18801	0 %	0 %	75 %	25 %	294679081
44	NC_014035	GCGG	2	8	19802	19809	0 %	0 %	75 %	25 %	294679083
45	NC_014035	CGCC	2	8	21641	21648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014035	ATCC	2	8	21686	21693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014035	TCGA	3	12	21700	21711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014035	CCCG	2	8	22106	22113	0 %	0 %	25 %	75 %	294679087
49	NC_014035	CCTG	2	8	22251	22258	0 %	25 %	25 %	50 %	294679088
50	NC_014035	CCTG	2	8	22341	22348	0 %	25 %	25 %	50 %	294679088
51	NC_014035	CGCC	2	8	22990	22997	0 %	0 %	25 %	75 %	294679089
52	NC_014035	CCCG	2	8	23590	23597	0 %	0 %	25 %	75 %	294679090
53	NC_014035	CGCC	2	8	23681	23688	0 %	0 %	25 %	75 %	294679091
54	NC_014035	GCCC	2	8	24290	24297	0 %	0 %	25 %	75 %	294679091
55	NC_014035	CAGC	2	8	24323	24330	25 %	0 %	25 %	50 %	294679091
56	NC_014035	CGAG	2	8	24904	24911	25 %	0 %	50 %	25 %	294679092
57	NC_014035	GACC	2	8	25150	25157	25 %	0 %	25 %	50 %	294679093
58	NC_014035	CGCC	2	8	25413	25420	0 %	0 %	25 %	75 %	294679093
59	NC_014035	CCAC	2	8	25448	25455	25 %	0 %	0 %	75 %	294679093
60	NC_014035	CCAT	2	8	25505	25512	25 %	25 %	0 %	50 %	294679093
61	NC_014035	ATCC	2	8	25760	25767	25 %	25 %	0 %	50 %	294679093
62	NC_014035	GGAG	2	8	26111	26118	25 %	0 %	75 %	0 %	294679094
63	NC_014035	TTGC	2	8	26477	26484	0 %	50 %	25 %	25 %	294679095
64	NC_014035	GCAG	2	8	26610	26617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014035	GCCC	2	8	27130	27137	0 %	0 %	25 %	75 %	294679096
66	NC_014035	CCGC	2	8	28198	28205	0 %	0 %	25 %	75 %	294679097
67	NC_014035	GACC	2	8	29717	29724	25 %	0 %	25 %	50 %	294679099
68	NC_014035	CGGA	2	8	29742	29749	25 %	0 %	50 %	25 %	294679099
69	NC_014035	CGCC	2	8	29956	29963	0 %	0 %	25 %	75 %	294679100
70	NC_014035	CATC	2	8	30169	30176	25 %	25 %	0 %	50 %	294679100
71	NC_014035	AGAC	2	8	30192	30199	50 %	0 %	25 %	25 %	294679100
72	NC_014035	GCCG	2	8	30524	30531	0 %	0 %	50 %	50 %	294679100
73	NC_014035	ATCG	2	8	30668	30675	25 %	25 %	25 %	25 %	294679100
74	NC_014035	CATC	2	8	30972	30979	25 %	25 %	0 %	50 %	294679101
75	NC_014035	CATC	2	8	31209	31216	25 %	25 %	0 %	50 %	294679101
76	NC_014035	CTGG	2	8	31959	31966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014035	CCCG	2	8	32020	32027	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_014035	GCCC	2	8	32853	32860	0 %	0 %	25 %	75 %	294679102
79	NC_014035	GCAG	2	8	32871	32878	25 %	0 %	50 %	25 %	294679102
80	NC_014035	TGGT	2	8	33602	33609	0 %	50 %	50 %	0 %	294679103
81	NC_014035	GTCG	2	8	33841	33848	0 %	25 %	50 %	25 %	294679103
82	NC_014035	GCGG	2	8	34087	34094	0 %	0 %	75 %	25 %	294679103
83	NC_014035	CGCC	2	8	34892	34899	0 %	0 %	25 %	75 %	294679104
84	NC_014035	AGGT	2	8	35757	35764	25 %	25 %	50 %	0 %	294679105
85	NC_014035	GGCA	2	8	35837	35844	25 %	0 %	50 %	25 %	294679105
86	NC_014035	CGGG	2	8	36510	36517	0 %	0 %	75 %	25 %	294679106
87	NC_014035	CGGC	2	8	37152	37159	0 %	0 %	50 %	50 %	294679106
88	NC_014035	GCGG	2	8	38075	38082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014035	GACC	2	8	38183	38190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014035	CCGG	2	8	40211	40218	0 %	0 %	50 %	50 %	294679109
91	NC_014035	CATC	2	8	41129	41136	25 %	25 %	0 %	50 %	294679110
92	NC_014035	TGCC	2	8	41590	41597	0 %	25 %	25 %	50 %	294679111
93	NC_014035	GGGC	2	8	41692	41699	0 %	0 %	75 %	25 %	294679111
94	NC_014035	GCCT	2	8	42414	42421	0 %	25 %	25 %	50 %	294679112
95	NC_014035	CGCC	2	8	43115	43122	0 %	0 %	25 %	75 %	294679112
96	NC_014035	GCCA	2	8	43594	43601	25 %	0 %	25 %	50 %	294679113
97	NC_014035	GCCA	2	8	43750	43757	25 %	0 %	25 %	50 %	294679113
98	NC_014035	CTGG	2	8	44138	44145	0 %	25 %	50 %	25 %	294679113
99	NC_014035	GTCA	2	8	44195	44202	25 %	25 %	25 %	25 %	294679113
100	NC_014035	GGAT	2	8	44567	44574	25 %	25 %	50 %	0 %	294679113
101	NC_014035	CCGT	2	8	44781	44788	0 %	25 %	25 %	50 %	294679113
102	NC_014035	ACCG	2	8	45086	45093	25 %	0 %	25 %	50 %	294679113
103	NC_014035	GCCC	2	8	45176	45183	0 %	0 %	25 %	75 %	294679113
104	NC_014035	AAAT	2	8	45510	45517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014035	GCTG	2	8	45545	45552	0 %	25 %	50 %	25 %	294679114
106	NC_014035	CGCT	2	8	45687	45694	0 %	25 %	25 %	50 %	294679114
107	NC_014035	ACCG	2	8	46265	46272	25 %	0 %	25 %	50 %	294679114
108	NC_014035	CCGG	2	8	46302	46309	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
109	NC_014035	GATC	2	8	46358	46365	25 %	25 %	25 %	25 %	294679114
110	NC_014035	AGCG	2	8	46423	46430	25 %	0 %	50 %	25 %	294679114
111	NC_014035	CCGG	2	8	46443	46450	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
112	NC_014035	GGTC	2	8	46610	46617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014035	TGCT	2	8	46980	46987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014035	TTTC	2	8	47040	47047	0 %	75 %	0 %	25 %	294679115
115	NC_014035	GTCG	2	8	47275	47282	0 %	25 %	50 %	25 %	294679115
116	NC_014035	AGGC	2	8	47316	47323	25 %	0 %	50 %	25 %	294679115
117	NC_014035	CATC	2	8	47431	47438	25 %	25 %	0 %	50 %	294679115
118	NC_014035	CCGG	2	8	47663	47670	0 %	0 %	50 %	50 %	294679115
119	NC_014035	CCAG	2	8	47688	47695	25 %	0 %	25 %	50 %	294679115
120	NC_014035	ACCG	2	8	48055	48062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014035	GTCG	2	8	48861	48868	0 %	25 %	50 %	25 %	294679116
122	NC_014035	GCTG	2	8	49226	49233	0 %	25 %	50 %	25 %	294679116
123	NC_014035	CGCC	2	8	50168	50175	0 %	0 %	25 %	75 %	294679116
124	NC_014035	GGCC	2	8	50218	50225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014035	TGGC	2	8	50365	50372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014035	GCGG	2	8	51550	51557	0 %	0 %	75 %	25 %	294679119
127	NC_014035	CGCC	2	8	51943	51950	0 %	0 %	25 %	75 %	294679119
128	NC_014035	CCGC	2	8	51998	52005	0 %	0 %	25 %	75 %	294679119
129	NC_014035	GCCA	2	8	52278	52285	25 %	0 %	25 %	50 %	294679119
130	NC_014035	AAGG	2	8	52639	52646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014035	GGCG	2	8	54475	54482	0 %	0 %	75 %	25 %	294679122
132	NC_014035	GACC	2	8	55078	55085	25 %	0 %	25 %	50 %	294679123
133	NC_014035	CGGG	2	8	55884	55891	0 %	0 %	75 %	25 %	294679124
134	NC_014035	ATCC	2	8	56005	56012	25 %	25 %	0 %	50 %	294679124
135	NC_014035	CTGA	2	8	56176	56183	25 %	25 %	25 %	25 %	294679124
136	NC_014035	GCCC	2	8	56396	56403	0 %	0 %	25 %	75 %	294679125
137	NC_014035	CCGC	2	8	56886	56893	0 %	0 %	25 %	75 %	294679125
138	NC_014035	CGCC	2	8	56942	56949	0 %	0 %	25 %	75 %	294679125
139	NC_014035	GCCA	2	8	57118	57125	25 %	0 %	25 %	50 %	294679125
140	NC_014035	GCCC	2	8	57460	57467	0 %	0 %	25 %	75 %	294679126
141	NC_014035	CGGT	2	8	57483	57490	0 %	25 %	50 %	25 %	294679126
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143	NC_014035	AAAG	2	8	58541	58548	75 %	0 %	25 %	0 %	294679127
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.